Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A409WGW8

Protein Details
Accession A0A409WGW8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
291-310SLRPETKTKLKRFREDLDKSHydrophilic
343-369SAADQKKELEKERKRTLRKSQGKVVRKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
327-369KAAAKRKSEQERIAKLSAADQKKELEKERKRTLRKSQGKVVRK
Subcellular Location(s) cyto 10, cyto_nucl 8, mito 5, nucl 4, extr 3, E.R. 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012879  CCDC47  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0032469  P:endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis  
Pfam View protein in Pfam  
PF07946  CCDC47  
Amino Acid Sequences MATFLTPFLQSITPPPVVTPEHYDGYELKWKALVFRPALLKTEAYLLVAISLYILFAYFGASSNARKAKKWLAVHLPIYERQFSKPQAKGGLISDGHSDFFNFSTGRRNVASLHTIFTFRPRHDFFQWAFQTGRTLVDLHYRPIDDIQLDFKLAPGALADNFVWAVVAKDELMSVKNNRWDLTFPRSSENPTLPPSFVVMTEWADVTENLLKPIGNFSLLTALQDPKILPYFRSLSITDQPRERPLLPLAPEEREKHVILSLSAPSSSHIEDTVPLVNTVFQLVDSLNKISLRPETKTKLKRFREDLDKSLKEDAEKEAKEEAQDAKAAAKRKSEQERIAKLSAADQKKELEKERKRTLRKSQGKVVRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.25
4 0.26
5 0.29
6 0.32
7 0.31
8 0.31
9 0.31
10 0.33
11 0.29
12 0.32
13 0.37
14 0.3
15 0.26
16 0.26
17 0.26
18 0.3
19 0.36
20 0.38
21 0.32
22 0.37
23 0.43
24 0.42
25 0.45
26 0.41
27 0.34
28 0.27
29 0.29
30 0.24
31 0.19
32 0.17
33 0.13
34 0.12
35 0.11
36 0.1
37 0.06
38 0.05
39 0.04
40 0.04
41 0.04
42 0.03
43 0.04
44 0.05
45 0.05
46 0.06
47 0.08
48 0.1
49 0.12
50 0.19
51 0.26
52 0.27
53 0.28
54 0.33
55 0.4
56 0.47
57 0.5
58 0.51
59 0.53
60 0.58
61 0.6
62 0.59
63 0.53
64 0.49
65 0.47
66 0.44
67 0.36
68 0.32
69 0.35
70 0.36
71 0.41
72 0.41
73 0.42
74 0.42
75 0.42
76 0.41
77 0.36
78 0.38
79 0.29
80 0.27
81 0.25
82 0.21
83 0.2
84 0.18
85 0.17
86 0.11
87 0.11
88 0.12
89 0.09
90 0.09
91 0.18
92 0.19
93 0.21
94 0.21
95 0.22
96 0.21
97 0.25
98 0.29
99 0.21
100 0.22
101 0.2
102 0.21
103 0.2
104 0.25
105 0.27
106 0.22
107 0.29
108 0.31
109 0.35
110 0.37
111 0.43
112 0.37
113 0.42
114 0.42
115 0.37
116 0.34
117 0.29
118 0.28
119 0.23
120 0.22
121 0.13
122 0.13
123 0.1
124 0.18
125 0.18
126 0.18
127 0.19
128 0.19
129 0.18
130 0.18
131 0.19
132 0.11
133 0.11
134 0.12
135 0.1
136 0.11
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.08
141 0.07
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.05
153 0.03
154 0.04
155 0.03
156 0.04
157 0.04
158 0.05
159 0.06
160 0.07
161 0.09
162 0.12
163 0.16
164 0.17
165 0.17
166 0.18
167 0.19
168 0.21
169 0.26
170 0.27
171 0.24
172 0.27
173 0.27
174 0.29
175 0.3
176 0.28
177 0.24
178 0.23
179 0.23
180 0.2
181 0.2
182 0.18
183 0.15
184 0.13
185 0.11
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.08
190 0.07
191 0.08
192 0.07
193 0.08
194 0.11
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.12
201 0.11
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.11
206 0.11
207 0.12
208 0.11
209 0.12
210 0.11
211 0.12
212 0.12
213 0.1
214 0.14
215 0.14
216 0.13
217 0.16
218 0.19
219 0.19
220 0.22
221 0.21
222 0.22
223 0.28
224 0.34
225 0.32
226 0.32
227 0.33
228 0.33
229 0.36
230 0.32
231 0.29
232 0.26
233 0.29
234 0.27
235 0.31
236 0.3
237 0.3
238 0.33
239 0.32
240 0.33
241 0.32
242 0.3
243 0.25
244 0.25
245 0.22
246 0.19
247 0.19
248 0.17
249 0.14
250 0.13
251 0.13
252 0.12
253 0.13
254 0.13
255 0.11
256 0.1
257 0.1
258 0.1
259 0.12
260 0.14
261 0.13
262 0.12
263 0.12
264 0.12
265 0.12
266 0.12
267 0.09
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.09
272 0.1
273 0.11
274 0.12
275 0.13
276 0.13
277 0.14
278 0.21
279 0.23
280 0.25
281 0.32
282 0.38
283 0.47
284 0.57
285 0.65
286 0.69
287 0.74
288 0.79
289 0.78
290 0.8
291 0.81
292 0.77
293 0.75
294 0.75
295 0.68
296 0.61
297 0.59
298 0.52
299 0.42
300 0.38
301 0.37
302 0.36
303 0.33
304 0.33
305 0.32
306 0.31
307 0.31
308 0.32
309 0.28
310 0.21
311 0.22
312 0.2
313 0.23
314 0.25
315 0.3
316 0.3
317 0.35
318 0.37
319 0.46
320 0.55
321 0.58
322 0.64
323 0.68
324 0.74
325 0.73
326 0.7
327 0.62
328 0.53
329 0.52
330 0.52
331 0.47
332 0.41
333 0.37
334 0.4
335 0.45
336 0.51
337 0.52
338 0.54
339 0.58
340 0.66
341 0.75
342 0.8
343 0.82
344 0.86
345 0.88
346 0.88
347 0.89
348 0.87
349 0.87