Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K1VJ30

Protein Details
Accession K1VJ30    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-46DDLDRPGPSKKSRKGKDKANGKSVNAHydrophilic
394-418APFPTSWQTHRCRRMRISRQVDDTGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-39GPSKKSRKGKDKA
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10.5, cyto 6.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007198  Ssl1-like  
IPR012170  TFIIH_SSL1/p44  
IPR036465  vWFA_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000439  C:transcription factor TFIIH core complex  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF04056  Ssl1  
Amino Acid Sequences MPADEPYDPAQSPASVLDSDDDLDRPGPSKKSRKGKDKANGKSVNAWEETYKRSWDVVREDETGGLQAAVDQLIARGRRKRAVATITSAAHVRRRRPLGLDERQGLPSHPYLRSFVIEWFDQNPLGQIGIILLRNRLAQTLVPMCGNPQEIIEALADKRKLEPAGEPSLQNGLVMARGGMSHLPSTSSLEVLVLFSAISTADPDGSMNIHQVLDELVSARVRVTIISLSAEIKICKQIAERTGGRFGVAIDEDHYKELLWETIPPPAQTITAPVTANVREALARGGRQAPGAPKRPPPLGDLLVMGFPTRLPGAGESFCACHGLLKRGGYMCPRCGAKLCDVPTDCEVCGLMVVSSPHLARSFWLLFPVSKYDTLGRGVLTKEAVRAECFGCDAPFPTSWQTHRCRRMRISRQVDDTGAPSARTTSAQTVTFRCSQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.14
3 0.14
4 0.14
5 0.14
6 0.14
7 0.15
8 0.14
9 0.12
10 0.13
11 0.14
12 0.15
13 0.19
14 0.25
15 0.33
16 0.43
17 0.52
18 0.62
19 0.71
20 0.79
21 0.83
22 0.86
23 0.87
24 0.87
25 0.87
26 0.87
27 0.83
28 0.75
29 0.75
30 0.68
31 0.63
32 0.54
33 0.46
34 0.39
35 0.36
36 0.38
37 0.33
38 0.32
39 0.28
40 0.29
41 0.3
42 0.33
43 0.36
44 0.38
45 0.39
46 0.4
47 0.39
48 0.36
49 0.34
50 0.28
51 0.21
52 0.15
53 0.1
54 0.07
55 0.07
56 0.06
57 0.06
58 0.05
59 0.06
60 0.1
61 0.14
62 0.19
63 0.25
64 0.29
65 0.35
66 0.38
67 0.42
68 0.45
69 0.5
70 0.48
71 0.47
72 0.48
73 0.43
74 0.41
75 0.39
76 0.33
77 0.33
78 0.34
79 0.33
80 0.37
81 0.41
82 0.43
83 0.46
84 0.53
85 0.56
86 0.6
87 0.62
88 0.56
89 0.54
90 0.52
91 0.48
92 0.4
93 0.33
94 0.29
95 0.27
96 0.25
97 0.24
98 0.25
99 0.26
100 0.27
101 0.25
102 0.23
103 0.21
104 0.2
105 0.2
106 0.19
107 0.18
108 0.17
109 0.15
110 0.14
111 0.11
112 0.1
113 0.09
114 0.07
115 0.06
116 0.08
117 0.1
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.11
122 0.11
123 0.11
124 0.1
125 0.09
126 0.13
127 0.15
128 0.16
129 0.15
130 0.15
131 0.15
132 0.16
133 0.17
134 0.12
135 0.1
136 0.09
137 0.09
138 0.1
139 0.1
140 0.09
141 0.08
142 0.12
143 0.12
144 0.12
145 0.12
146 0.14
147 0.14
148 0.14
149 0.17
150 0.19
151 0.26
152 0.27
153 0.26
154 0.24
155 0.25
156 0.24
157 0.2
158 0.14
159 0.08
160 0.07
161 0.06
162 0.05
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.1
173 0.1
174 0.09
175 0.09
176 0.08
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.04
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.06
197 0.05
198 0.06
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.09
218 0.08
219 0.09
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.11
224 0.14
225 0.16
226 0.22
227 0.23
228 0.23
229 0.26
230 0.25
231 0.23
232 0.2
233 0.17
234 0.13
235 0.12
236 0.09
237 0.08
238 0.11
239 0.11
240 0.11
241 0.11
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.08
246 0.06
247 0.08
248 0.09
249 0.13
250 0.14
251 0.14
252 0.14
253 0.14
254 0.14
255 0.12
256 0.14
257 0.12
258 0.14
259 0.14
260 0.14
261 0.16
262 0.15
263 0.16
264 0.13
265 0.11
266 0.08
267 0.08
268 0.11
269 0.1
270 0.1
271 0.12
272 0.14
273 0.14
274 0.14
275 0.17
276 0.22
277 0.28
278 0.34
279 0.36
280 0.39
281 0.43
282 0.45
283 0.44
284 0.4
285 0.39
286 0.34
287 0.31
288 0.26
289 0.23
290 0.2
291 0.19
292 0.15
293 0.09
294 0.07
295 0.07
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.11
301 0.11
302 0.13
303 0.13
304 0.13
305 0.13
306 0.14
307 0.12
308 0.13
309 0.15
310 0.19
311 0.22
312 0.22
313 0.25
314 0.26
315 0.28
316 0.33
317 0.34
318 0.32
319 0.33
320 0.33
321 0.31
322 0.34
323 0.34
324 0.33
325 0.36
326 0.36
327 0.39
328 0.39
329 0.41
330 0.4
331 0.39
332 0.33
333 0.26
334 0.23
335 0.15
336 0.14
337 0.11
338 0.08
339 0.07
340 0.08
341 0.08
342 0.1
343 0.1
344 0.12
345 0.12
346 0.12
347 0.11
348 0.18
349 0.19
350 0.18
351 0.21
352 0.21
353 0.21
354 0.23
355 0.27
356 0.23
357 0.21
358 0.23
359 0.23
360 0.24
361 0.25
362 0.24
363 0.2
364 0.2
365 0.2
366 0.2
367 0.2
368 0.18
369 0.19
370 0.22
371 0.22
372 0.21
373 0.23
374 0.22
375 0.2
376 0.21
377 0.19
378 0.16
379 0.16
380 0.17
381 0.17
382 0.17
383 0.19
384 0.22
385 0.26
386 0.3
387 0.37
388 0.44
389 0.51
390 0.6
391 0.65
392 0.69
393 0.74
394 0.81
395 0.83
396 0.86
397 0.86
398 0.84
399 0.83
400 0.78
401 0.7
402 0.6
403 0.52
404 0.46
405 0.37
406 0.29
407 0.22
408 0.2
409 0.2
410 0.2
411 0.22
412 0.22
413 0.25
414 0.29
415 0.33
416 0.34