Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409X5E7

Protein Details
Accession A0A409X5E7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MDSRRRARRWVLAKHRAERPKIQBasic
45-67LEVGNLTRKKRRREERTVLVGNRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-16RRARRWVLAKHR
53-57KKRRR
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 9, cyto_mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
Amino Acid Sequences MDSRRRARRWVLAKHRAERPKIQQQFADLKHGLSAVTDEEWENILEVGNLTRKKRRREERTVLVGNRGKTEFENVLDPRQQQSGGFETPAESGGLTNFVEIGQAPDKILSLKLDQLSGTATSLSTTNDSHAPGWIAAACLEEHAGRMVAARKIVKMGCKHCPKSEDVWIEAARLHNTEDTKIVLANAVQHVGQSVKIWLAAAALEESLPATKRVLRKALEHIPNSVRLWKETVNLESSTADARILLARAVEVIPLSVELWLALARLENPEKAKKVLNCARKAVPTSHEIWIAAGRLLEQEAESPTCPPASPKQKAKELELVDKTSEGAVRDLRRHQVLLTRKQWLKEAEKCELEGSPRTCEAIVKATVAMDVEEEDRFDTWVDDAEAAEARGRVGVARTVLGYALRVFPGRRALWRKLMIWIQIFHLHLCLHVLSCVYTVGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.86
3 0.85
4 0.81
5 0.8
6 0.79
7 0.79
8 0.78
9 0.75
10 0.67
11 0.66
12 0.69
13 0.61
14 0.61
15 0.5
16 0.42
17 0.38
18 0.36
19 0.28
20 0.19
21 0.18
22 0.11
23 0.11
24 0.12
25 0.11
26 0.12
27 0.13
28 0.12
29 0.11
30 0.1
31 0.09
32 0.08
33 0.08
34 0.1
35 0.16
36 0.2
37 0.24
38 0.33
39 0.41
40 0.51
41 0.61
42 0.69
43 0.73
44 0.79
45 0.85
46 0.86
47 0.89
48 0.88
49 0.79
50 0.78
51 0.72
52 0.62
53 0.56
54 0.47
55 0.38
56 0.3
57 0.34
58 0.27
59 0.24
60 0.29
61 0.26
62 0.31
63 0.33
64 0.34
65 0.31
66 0.3
67 0.29
68 0.22
69 0.25
70 0.25
71 0.22
72 0.21
73 0.19
74 0.18
75 0.18
76 0.18
77 0.14
78 0.09
79 0.08
80 0.08
81 0.09
82 0.08
83 0.07
84 0.07
85 0.06
86 0.07
87 0.06
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.11
94 0.12
95 0.13
96 0.11
97 0.11
98 0.15
99 0.16
100 0.16
101 0.16
102 0.15
103 0.16
104 0.14
105 0.13
106 0.09
107 0.08
108 0.07
109 0.08
110 0.09
111 0.09
112 0.09
113 0.1
114 0.12
115 0.13
116 0.13
117 0.14
118 0.14
119 0.12
120 0.12
121 0.11
122 0.09
123 0.08
124 0.08
125 0.07
126 0.06
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.05
133 0.08
134 0.11
135 0.12
136 0.15
137 0.16
138 0.15
139 0.19
140 0.21
141 0.24
142 0.27
143 0.31
144 0.38
145 0.46
146 0.49
147 0.5
148 0.51
149 0.5
150 0.48
151 0.51
152 0.45
153 0.37
154 0.38
155 0.34
156 0.31
157 0.29
158 0.25
159 0.17
160 0.15
161 0.14
162 0.12
163 0.13
164 0.13
165 0.13
166 0.12
167 0.12
168 0.11
169 0.1
170 0.08
171 0.07
172 0.09
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.07
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.06
181 0.06
182 0.05
183 0.06
184 0.06
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.09
199 0.13
200 0.17
201 0.22
202 0.23
203 0.26
204 0.32
205 0.4
206 0.43
207 0.4
208 0.41
209 0.37
210 0.38
211 0.35
212 0.32
213 0.24
214 0.18
215 0.2
216 0.17
217 0.19
218 0.18
219 0.19
220 0.18
221 0.18
222 0.18
223 0.15
224 0.14
225 0.12
226 0.1
227 0.09
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.03
245 0.03
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.08
253 0.09
254 0.11
255 0.14
256 0.19
257 0.2
258 0.22
259 0.27
260 0.25
261 0.34
262 0.4
263 0.46
264 0.45
265 0.48
266 0.5
267 0.48
268 0.49
269 0.42
270 0.37
271 0.31
272 0.31
273 0.29
274 0.26
275 0.23
276 0.21
277 0.19
278 0.17
279 0.14
280 0.1
281 0.08
282 0.07
283 0.08
284 0.07
285 0.06
286 0.07
287 0.08
288 0.09
289 0.09
290 0.1
291 0.1
292 0.11
293 0.11
294 0.12
295 0.2
296 0.29
297 0.37
298 0.44
299 0.51
300 0.58
301 0.61
302 0.63
303 0.62
304 0.56
305 0.57
306 0.52
307 0.47
308 0.4
309 0.37
310 0.32
311 0.25
312 0.23
313 0.15
314 0.13
315 0.16
316 0.2
317 0.24
318 0.28
319 0.32
320 0.32
321 0.32
322 0.31
323 0.34
324 0.39
325 0.44
326 0.45
327 0.5
328 0.5
329 0.51
330 0.55
331 0.54
332 0.54
333 0.52
334 0.53
335 0.51
336 0.49
337 0.49
338 0.45
339 0.39
340 0.35
341 0.34
342 0.3
343 0.27
344 0.26
345 0.27
346 0.25
347 0.25
348 0.24
349 0.22
350 0.21
351 0.18
352 0.18
353 0.17
354 0.17
355 0.16
356 0.14
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.09
362 0.09
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.09
367 0.08
368 0.1
369 0.11
370 0.1
371 0.1
372 0.11
373 0.11
374 0.11
375 0.12
376 0.1
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.1
382 0.13
383 0.12
384 0.13
385 0.14
386 0.14
387 0.14
388 0.13
389 0.13
390 0.12
391 0.13
392 0.13
393 0.15
394 0.15
395 0.18
396 0.26
397 0.28
398 0.36
399 0.41
400 0.46
401 0.54
402 0.58
403 0.56
404 0.56
405 0.59
406 0.55
407 0.52
408 0.47
409 0.42
410 0.42
411 0.41
412 0.34
413 0.31
414 0.25
415 0.21
416 0.21
417 0.18
418 0.13
419 0.13
420 0.14
421 0.12
422 0.12