Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409XF62

Protein Details
Accession A0A409XF62    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
147-176LPLARHPAHRHCNHRHPPRRAPPERVRSRIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
140-177VRPRGRGLPLARHPAHRHCNHRHPPRRAPPERVRSRIG
Subcellular Location(s) plas 23, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002208  SecY/SEC61-alpha  
IPR023201  SecY_dom_sf  
IPR019561  Translocon_Sec61/SecY_plug_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0015031  P:protein transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF10559  Plug_translocon  
Amino Acid Sequences MHATHILADLIWPCSPILPEVSSPDRKVPSNQKVIWTTLKFLVFLVFSQVPLYGIMSSDSSDPLYWIRVILASNCGTLMELGITLIIALGMIVQLLAGANLFDVGFSPKENRALFSATQKLFALIITLGQATVYGSRPAVRPRGRGLPLARHPAHRHCNHRHPPRRAPPERVRSRIGRHVTHRDQHLQVDQGPVQLKATNMNSSNTPYLLVPLYGIMSSDSSDLLYWIRVILASNRGTLMELGITPIISSLLMGGNLISVYFSVKQGSGLVRCSEILRSHYCPRLIHDLRPHRALKPASIVWKAFSPTTVNIGRGSEIEGALVALFYLLFSWHDKGRALREALWRERLLDLMSVISTEVIFAVIPVKSNRFREQRGAYPIKLFYASDIERFDEQCVHCVTEAADSRVGIFADVRPLFFCHFFHSVPFRIQLLEDSPQLRATGGIGYDMSPPQTLKEAVLDSIHAATYIAFMLSACALFIKT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.15
3 0.14
4 0.16
5 0.16
6 0.18
7 0.24
8 0.31
9 0.36
10 0.37
11 0.42
12 0.43
13 0.43
14 0.5
15 0.55
16 0.57
17 0.61
18 0.62
19 0.63
20 0.62
21 0.65
22 0.65
23 0.56
24 0.5
25 0.45
26 0.43
27 0.36
28 0.32
29 0.3
30 0.21
31 0.19
32 0.22
33 0.17
34 0.16
35 0.16
36 0.16
37 0.14
38 0.14
39 0.15
40 0.08
41 0.08
42 0.09
43 0.09
44 0.1
45 0.1
46 0.11
47 0.11
48 0.1
49 0.11
50 0.11
51 0.13
52 0.12
53 0.12
54 0.11
55 0.12
56 0.13
57 0.13
58 0.17
59 0.16
60 0.16
61 0.15
62 0.15
63 0.13
64 0.12
65 0.11
66 0.06
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.04
71 0.04
72 0.04
73 0.03
74 0.02
75 0.02
76 0.02
77 0.02
78 0.02
79 0.02
80 0.02
81 0.02
82 0.02
83 0.03
84 0.02
85 0.03
86 0.03
87 0.03
88 0.03
89 0.03
90 0.04
91 0.07
92 0.07
93 0.08
94 0.12
95 0.14
96 0.21
97 0.21
98 0.22
99 0.22
100 0.26
101 0.27
102 0.3
103 0.37
104 0.31
105 0.32
106 0.31
107 0.29
108 0.24
109 0.22
110 0.17
111 0.09
112 0.09
113 0.07
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.05
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.11
124 0.14
125 0.18
126 0.27
127 0.3
128 0.32
129 0.36
130 0.44
131 0.45
132 0.49
133 0.48
134 0.48
135 0.5
136 0.56
137 0.53
138 0.5
139 0.53
140 0.55
141 0.61
142 0.58
143 0.61
144 0.6
145 0.7
146 0.74
147 0.81
148 0.82
149 0.81
150 0.85
151 0.86
152 0.89
153 0.84
154 0.83
155 0.82
156 0.83
157 0.83
158 0.77
159 0.71
160 0.66
161 0.65
162 0.64
163 0.6
164 0.55
165 0.53
166 0.59
167 0.6
168 0.59
169 0.58
170 0.54
171 0.5
172 0.46
173 0.42
174 0.34
175 0.29
176 0.28
177 0.23
178 0.21
179 0.2
180 0.18
181 0.16
182 0.15
183 0.14
184 0.14
185 0.16
186 0.16
187 0.17
188 0.18
189 0.18
190 0.2
191 0.2
192 0.16
193 0.15
194 0.11
195 0.12
196 0.11
197 0.1
198 0.07
199 0.06
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.06
219 0.11
220 0.11
221 0.12
222 0.12
223 0.12
224 0.12
225 0.12
226 0.1
227 0.05
228 0.04
229 0.05
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.04
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.02
247 0.04
248 0.05
249 0.05
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.09
254 0.11
255 0.11
256 0.12
257 0.12
258 0.12
259 0.13
260 0.13
261 0.13
262 0.13
263 0.15
264 0.18
265 0.22
266 0.26
267 0.29
268 0.31
269 0.29
270 0.31
271 0.38
272 0.37
273 0.37
274 0.42
275 0.47
276 0.48
277 0.54
278 0.52
279 0.43
280 0.47
281 0.43
282 0.36
283 0.32
284 0.32
285 0.31
286 0.33
287 0.32
288 0.26
289 0.27
290 0.26
291 0.2
292 0.18
293 0.16
294 0.14
295 0.19
296 0.19
297 0.18
298 0.18
299 0.18
300 0.18
301 0.15
302 0.17
303 0.12
304 0.11
305 0.1
306 0.08
307 0.08
308 0.07
309 0.06
310 0.04
311 0.02
312 0.02
313 0.02
314 0.02
315 0.03
316 0.04
317 0.06
318 0.08
319 0.1
320 0.12
321 0.13
322 0.16
323 0.21
324 0.26
325 0.26
326 0.3
327 0.37
328 0.43
329 0.45
330 0.48
331 0.44
332 0.39
333 0.38
334 0.33
335 0.26
336 0.19
337 0.15
338 0.1
339 0.1
340 0.08
341 0.08
342 0.07
343 0.06
344 0.05
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.06
350 0.06
351 0.08
352 0.1
353 0.16
354 0.21
355 0.26
356 0.34
357 0.39
358 0.43
359 0.5
360 0.54
361 0.56
362 0.61
363 0.62
364 0.55
365 0.53
366 0.5
367 0.43
368 0.38
369 0.3
370 0.22
371 0.23
372 0.22
373 0.21
374 0.22
375 0.23
376 0.24
377 0.25
378 0.24
379 0.24
380 0.23
381 0.25
382 0.25
383 0.24
384 0.22
385 0.22
386 0.21
387 0.22
388 0.24
389 0.22
390 0.22
391 0.2
392 0.21
393 0.22
394 0.21
395 0.14
396 0.12
397 0.11
398 0.18
399 0.18
400 0.18
401 0.18
402 0.2
403 0.22
404 0.23
405 0.23
406 0.2
407 0.24
408 0.23
409 0.27
410 0.31
411 0.32
412 0.33
413 0.35
414 0.3
415 0.27
416 0.27
417 0.24
418 0.23
419 0.23
420 0.24
421 0.23
422 0.23
423 0.23
424 0.23
425 0.2
426 0.16
427 0.13
428 0.12
429 0.11
430 0.12
431 0.11
432 0.12
433 0.15
434 0.15
435 0.16
436 0.14
437 0.14
438 0.15
439 0.18
440 0.18
441 0.16
442 0.2
443 0.2
444 0.2
445 0.21
446 0.2
447 0.17
448 0.18
449 0.16
450 0.12
451 0.1
452 0.09
453 0.09
454 0.09
455 0.07
456 0.06
457 0.06
458 0.07
459 0.08
460 0.08
461 0.07