Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409WV28

Protein Details
Accession A0A409WV28    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
229-251QAPQPLPSPKKKRTKAADVSITNHydrophilic
258-282ELDVEVKKTKGKKRKGEPGDALETSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
264-292KKTKGKKRKGEPGDALETSAKKTKKSKVA
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.666, mito_nucl 11.499, cyto_mito 4.499, mito 4, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MSRPSPSPSGSSSSSATPPPQVASKKKTSAKTSAKTKKADTGRNEGVNQNWAYTPPSGAVLVKGDDVNGGEFDWDRINNDEDLELWLIRVPESVKPKYLENLKVDVPSSSASSCIGTLKRKHTAFDIWSVGDDDSQPVGGEEIKSLTCLLPRSSKKGKLYPISKPIAHHIVVTAQPVTPTLPPNGESLQYQNPPRHSYPKEILKHRFMPYGSIVNANNDVTEMEVDAVQAPQPLPSPKKKRTKAADVSITNEETPMAELDVEVKKTKGKKRKGEPGDALETSAKKTKKSKVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.31
3 0.3
4 0.27
5 0.26
6 0.25
7 0.31
8 0.35
9 0.41
10 0.46
11 0.52
12 0.58
13 0.64
14 0.69
15 0.69
16 0.72
17 0.73
18 0.75
19 0.78
20 0.79
21 0.79
22 0.76
23 0.73
24 0.71
25 0.7
26 0.69
27 0.64
28 0.64
29 0.63
30 0.63
31 0.62
32 0.55
33 0.49
34 0.46
35 0.41
36 0.32
37 0.26
38 0.22
39 0.22
40 0.2
41 0.18
42 0.12
43 0.13
44 0.13
45 0.12
46 0.13
47 0.12
48 0.12
49 0.12
50 0.12
51 0.1
52 0.1
53 0.1
54 0.1
55 0.08
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.08
60 0.09
61 0.09
62 0.1
63 0.12
64 0.14
65 0.14
66 0.14
67 0.13
68 0.11
69 0.13
70 0.13
71 0.11
72 0.09
73 0.1
74 0.09
75 0.09
76 0.1
77 0.09
78 0.13
79 0.21
80 0.22
81 0.24
82 0.26
83 0.27
84 0.31
85 0.37
86 0.38
87 0.34
88 0.36
89 0.34
90 0.33
91 0.32
92 0.27
93 0.21
94 0.16
95 0.14
96 0.1
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.09
101 0.11
102 0.13
103 0.17
104 0.22
105 0.27
106 0.34
107 0.34
108 0.35
109 0.35
110 0.37
111 0.33
112 0.33
113 0.3
114 0.22
115 0.22
116 0.22
117 0.19
118 0.14
119 0.12
120 0.08
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.04
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.04
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.07
135 0.08
136 0.1
137 0.17
138 0.19
139 0.26
140 0.32
141 0.38
142 0.41
143 0.46
144 0.51
145 0.51
146 0.54
147 0.54
148 0.56
149 0.53
150 0.5
151 0.45
152 0.43
153 0.38
154 0.34
155 0.27
156 0.19
157 0.18
158 0.17
159 0.17
160 0.14
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.1
165 0.09
166 0.1
167 0.11
168 0.11
169 0.12
170 0.14
171 0.15
172 0.15
173 0.14
174 0.16
175 0.2
176 0.23
177 0.26
178 0.28
179 0.3
180 0.35
181 0.37
182 0.42
183 0.39
184 0.43
185 0.47
186 0.53
187 0.57
188 0.6
189 0.63
190 0.62
191 0.66
192 0.61
193 0.58
194 0.48
195 0.44
196 0.39
197 0.38
198 0.31
199 0.28
200 0.26
201 0.23
202 0.25
203 0.21
204 0.18
205 0.13
206 0.12
207 0.09
208 0.09
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.07
215 0.06
216 0.08
217 0.07
218 0.08
219 0.11
220 0.17
221 0.22
222 0.32
223 0.42
224 0.5
225 0.61
226 0.67
227 0.74
228 0.78
229 0.83
230 0.82
231 0.82
232 0.82
233 0.74
234 0.71
235 0.65
236 0.58
237 0.47
238 0.37
239 0.27
240 0.18
241 0.17
242 0.12
243 0.09
244 0.07
245 0.07
246 0.11
247 0.15
248 0.17
249 0.17
250 0.17
251 0.22
252 0.31
253 0.41
254 0.47
255 0.54
256 0.62
257 0.72
258 0.82
259 0.85
260 0.88
261 0.86
262 0.84
263 0.81
264 0.71
265 0.63
266 0.56
267 0.48
268 0.41
269 0.41
270 0.35
271 0.33
272 0.41