Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A409XDP3

Protein Details
Accession A0A409XDP3    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-74LPRLLRNETPKRKSTTQKSRSTNKKSKKSEHKIILQEEKTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
45-63KRKSTTQKSRSTNKKSKKS
Subcellular Location(s) cyto 6.5, extr 6, cyto_nucl 6, nucl 4.5, mito 3, E.R. 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045116  Clp1/Grc3  
IPR032319  CLP1_P  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0051731  F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF16575  CLP1_P  
Amino Acid Sequences MLSAVAARKAALAAQVEQAKDFPIPSGSGTTTPALPRLLRNETPKRKSTTQKSRSTNKKSKKSEHKIILQEEKTVDTFRDQTDIITVESDGDDGSDSAMSGLDAFGQDSLDKNVAGMSTKRAWSPSQPVEDSSDDESVDGDDESANPLDVSSLFPYLSRSLRTPGQTPNDNNVLSTFEPALDQNMFILTEDECHLLGLSGKATLIALDVDDSICVLGICVLVVLHGSISLCGATISGSSAKHRVYAPRSGPLPVIRAGEETGSTSQVDNLPPRLRDALQYRAIVILQELKPDVIGLGRICRTFEGVFEPSRWQKSSVEAPFNIPGLYMIHQQSKECHAFWMPPSWSTALNDLSPNDNMFSGTYIVKGPKNSGKSTFARTLTNHLLSIYKRVAFLECDLGQSEFTPGGMVSLNVVSSPILGPPFTHPTLPNYAHFIGSTTPRSSPSHYLDGVLSLIQAYRLNIQTPAIEIDDDDNDSRISNVIPIVVNTMGWSKGLGFDLTQKIESMLEPTNIFDIHAPVREEYPTSVTPVSIGGQNNGYGAYHDQSTMDATTACVHVLDSVVSSSSVAGYTPADHRALNILSYFHARFPVDAAPGELEQITATEWETSRPLCAEHPYKVDCSIAFDKVVLTGAGSEDVVEEEIGRVLNGAIVGFVRCEPGTMDLDFEPQERSAISTTDIPYTRHLSPPSPLSSTCVGLGLIRGVSSPTVTDSASPQGLSKTFLQLLTPLPHPLLAESRVLVKGEMELPIWGMLDFRNFEGKDVDIGDVADVERDSVPFLQWGKAPDGALGAEKRRVRRNLMRRGQM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.26
3 0.25
4 0.26
5 0.25
6 0.23
7 0.21
8 0.19
9 0.15
10 0.13
11 0.14
12 0.15
13 0.19
14 0.19
15 0.2
16 0.22
17 0.22
18 0.23
19 0.23
20 0.24
21 0.23
22 0.23
23 0.27
24 0.32
25 0.38
26 0.41
27 0.49
28 0.58
29 0.65
30 0.71
31 0.73
32 0.74
33 0.75
34 0.79
35 0.81
36 0.81
37 0.8
38 0.83
39 0.85
40 0.87
41 0.89
42 0.9
43 0.89
44 0.88
45 0.89
46 0.89
47 0.91
48 0.92
49 0.91
50 0.91
51 0.9
52 0.89
53 0.86
54 0.85
55 0.84
56 0.74
57 0.68
58 0.58
59 0.51
60 0.44
61 0.36
62 0.29
63 0.23
64 0.25
65 0.21
66 0.23
67 0.2
68 0.19
69 0.21
70 0.22
71 0.18
72 0.16
73 0.15
74 0.12
75 0.12
76 0.12
77 0.08
78 0.07
79 0.07
80 0.06
81 0.07
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.07
95 0.08
96 0.11
97 0.11
98 0.11
99 0.1
100 0.11
101 0.11
102 0.14
103 0.14
104 0.16
105 0.2
106 0.22
107 0.24
108 0.25
109 0.27
110 0.31
111 0.39
112 0.41
113 0.43
114 0.43
115 0.43
116 0.46
117 0.45
118 0.41
119 0.35
120 0.28
121 0.21
122 0.2
123 0.18
124 0.14
125 0.13
126 0.1
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.09
131 0.09
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.08
136 0.08
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.11
142 0.14
143 0.17
144 0.19
145 0.19
146 0.19
147 0.22
148 0.27
149 0.31
150 0.32
151 0.36
152 0.41
153 0.46
154 0.48
155 0.5
156 0.5
157 0.46
158 0.43
159 0.35
160 0.32
161 0.24
162 0.23
163 0.17
164 0.12
165 0.13
166 0.13
167 0.15
168 0.11
169 0.11
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.06
176 0.08
177 0.09
178 0.1
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.08
183 0.09
184 0.08
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.05
193 0.04
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.05
223 0.07
224 0.08
225 0.1
226 0.14
227 0.14
228 0.17
229 0.19
230 0.25
231 0.27
232 0.35
233 0.36
234 0.38
235 0.39
236 0.38
237 0.38
238 0.33
239 0.31
240 0.25
241 0.24
242 0.18
243 0.18
244 0.17
245 0.15
246 0.13
247 0.13
248 0.11
249 0.11
250 0.11
251 0.1
252 0.11
253 0.12
254 0.14
255 0.14
256 0.19
257 0.21
258 0.21
259 0.23
260 0.25
261 0.23
262 0.26
263 0.29
264 0.31
265 0.32
266 0.32
267 0.31
268 0.28
269 0.28
270 0.22
271 0.18
272 0.18
273 0.13
274 0.14
275 0.14
276 0.13
277 0.13
278 0.13
279 0.12
280 0.05
281 0.07
282 0.06
283 0.1
284 0.11
285 0.12
286 0.12
287 0.12
288 0.15
289 0.13
290 0.14
291 0.15
292 0.16
293 0.16
294 0.18
295 0.22
296 0.23
297 0.26
298 0.26
299 0.23
300 0.22
301 0.25
302 0.33
303 0.34
304 0.35
305 0.32
306 0.34
307 0.33
308 0.32
309 0.28
310 0.19
311 0.14
312 0.1
313 0.11
314 0.12
315 0.13
316 0.16
317 0.17
318 0.17
319 0.19
320 0.23
321 0.24
322 0.21
323 0.2
324 0.17
325 0.19
326 0.2
327 0.25
328 0.2
329 0.19
330 0.2
331 0.2
332 0.2
333 0.19
334 0.2
335 0.14
336 0.14
337 0.15
338 0.14
339 0.14
340 0.14
341 0.13
342 0.11
343 0.09
344 0.09
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.07
349 0.08
350 0.09
351 0.11
352 0.12
353 0.13
354 0.15
355 0.19
356 0.22
357 0.24
358 0.26
359 0.3
360 0.3
361 0.35
362 0.38
363 0.34
364 0.33
365 0.32
366 0.34
367 0.32
368 0.31
369 0.26
370 0.21
371 0.22
372 0.19
373 0.22
374 0.18
375 0.15
376 0.14
377 0.14
378 0.14
379 0.13
380 0.14
381 0.14
382 0.13
383 0.13
384 0.13
385 0.13
386 0.12
387 0.11
388 0.11
389 0.06
390 0.06
391 0.05
392 0.04
393 0.05
394 0.05
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.03
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.05
407 0.05
408 0.08
409 0.13
410 0.14
411 0.15
412 0.15
413 0.17
414 0.24
415 0.25
416 0.23
417 0.22
418 0.22
419 0.21
420 0.21
421 0.18
422 0.14
423 0.15
424 0.17
425 0.14
426 0.14
427 0.16
428 0.18
429 0.21
430 0.25
431 0.26
432 0.28
433 0.27
434 0.27
435 0.24
436 0.23
437 0.2
438 0.14
439 0.09
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.08
446 0.09
447 0.09
448 0.1
449 0.1
450 0.1
451 0.1
452 0.11
453 0.09
454 0.08
455 0.07
456 0.08
457 0.08
458 0.09
459 0.09
460 0.08
461 0.07
462 0.07
463 0.07
464 0.07
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.07
469 0.07
470 0.07
471 0.09
472 0.08
473 0.08
474 0.08
475 0.08
476 0.07
477 0.07
478 0.07
479 0.05
480 0.07
481 0.08
482 0.07
483 0.07
484 0.12
485 0.15
486 0.16
487 0.16
488 0.14
489 0.14
490 0.14
491 0.14
492 0.12
493 0.11
494 0.11
495 0.11
496 0.12
497 0.12
498 0.11
499 0.12
500 0.09
501 0.1
502 0.1
503 0.12
504 0.13
505 0.13
506 0.14
507 0.14
508 0.15
509 0.13
510 0.16
511 0.14
512 0.16
513 0.15
514 0.14
515 0.14
516 0.14
517 0.13
518 0.13
519 0.13
520 0.11
521 0.12
522 0.12
523 0.12
524 0.11
525 0.1
526 0.07
527 0.08
528 0.08
529 0.08
530 0.08
531 0.08
532 0.08
533 0.1
534 0.09
535 0.08
536 0.07
537 0.07
538 0.08
539 0.08
540 0.08
541 0.07
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.06
546 0.05
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.06
551 0.05
552 0.05
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.07
558 0.09
559 0.11
560 0.12
561 0.12
562 0.13
563 0.16
564 0.16
565 0.15
566 0.14
567 0.12
568 0.12
569 0.16
570 0.16
571 0.13
572 0.16
573 0.15
574 0.15
575 0.16
576 0.18
577 0.16
578 0.15
579 0.16
580 0.14
581 0.14
582 0.15
583 0.12
584 0.09
585 0.07
586 0.07
587 0.07
588 0.05
589 0.06
590 0.07
591 0.07
592 0.09
593 0.11
594 0.11
595 0.12
596 0.12
597 0.13
598 0.13
599 0.2
600 0.24
601 0.26
602 0.31
603 0.32
604 0.33
605 0.33
606 0.32
607 0.25
608 0.28
609 0.27
610 0.23
611 0.21
612 0.2
613 0.18
614 0.17
615 0.18
616 0.1
617 0.07
618 0.06
619 0.06
620 0.07
621 0.07
622 0.06
623 0.05
624 0.06
625 0.06
626 0.06
627 0.05
628 0.05
629 0.06
630 0.06
631 0.05
632 0.05
633 0.05
634 0.06
635 0.06
636 0.05
637 0.05
638 0.05
639 0.06
640 0.06
641 0.06
642 0.08
643 0.08
644 0.08
645 0.09
646 0.12
647 0.15
648 0.14
649 0.17
650 0.15
651 0.17
652 0.17
653 0.17
654 0.16
655 0.13
656 0.14
657 0.11
658 0.13
659 0.12
660 0.12
661 0.13
662 0.16
663 0.18
664 0.23
665 0.25
666 0.24
667 0.27
668 0.31
669 0.31
670 0.32
671 0.33
672 0.3
673 0.32
674 0.37
675 0.38
676 0.36
677 0.34
678 0.33
679 0.33
680 0.31
681 0.27
682 0.22
683 0.18
684 0.15
685 0.15
686 0.13
687 0.1
688 0.09
689 0.08
690 0.08
691 0.09
692 0.09
693 0.08
694 0.09
695 0.11
696 0.11
697 0.12
698 0.13
699 0.17
700 0.18
701 0.18
702 0.16
703 0.18
704 0.19
705 0.21
706 0.2
707 0.22
708 0.23
709 0.23
710 0.22
711 0.21
712 0.25
713 0.26
714 0.26
715 0.22
716 0.21
717 0.21
718 0.21
719 0.21
720 0.21
721 0.19
722 0.19
723 0.18
724 0.21
725 0.22
726 0.22
727 0.2
728 0.16
729 0.16
730 0.16
731 0.17
732 0.14
733 0.13
734 0.13
735 0.13
736 0.13
737 0.1
738 0.09
739 0.09
740 0.12
741 0.14
742 0.14
743 0.22
744 0.21
745 0.23
746 0.24
747 0.24
748 0.23
749 0.23
750 0.22
751 0.15
752 0.15
753 0.14
754 0.12
755 0.11
756 0.1
757 0.08
758 0.09
759 0.09
760 0.09
761 0.11
762 0.12
763 0.12
764 0.15
765 0.17
766 0.18
767 0.2
768 0.24
769 0.25
770 0.27
771 0.27
772 0.23
773 0.23
774 0.21
775 0.23
776 0.25
777 0.25
778 0.29
779 0.34
780 0.4
781 0.48
782 0.53
783 0.57
784 0.64
785 0.7
786 0.74