Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409XDP3

Protein Details
Accession A0A409XDP3    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-74LPRLLRNETPKRKSTTQKSRSTNKKSKKSEHKIILQEEKTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
45-63KRKSTTQKSRSTNKKSKKS
Subcellular Location(s) cyto 6.5, extr 6, cyto_nucl 6, nucl 4.5, mito 3, E.R. 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045116  Clp1/Grc3  
IPR032319  CLP1_P  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0051731  F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF16575  CLP1_P  
Amino Acid Sequences MLSAVAARKAALAAQVEQAKDFPIPSGSGTTTPALPRLLRNETPKRKSTTQKSRSTNKKSKKSEHKIILQEEKTVDTFRDQTDIITVESDGDDGSDSAMSGLDAFGQDSLDKNVAGMSTKRAWSPSQPVEDSSDDESVDGDDESANPLDVSSLFPYLSRSLRTPGQTPNDNNVLSTFEPALDQNMFILTEDECHLLGLSGKATLIALDVDDSICVLGICVLVVLHGSISLCGATISGSSAKHRVYAPRSGPLPVIRAGEETGSTSQVDNLPPRLRDALQYRAIVILQELKPDVIGLGRICRTFEGVFEPSRWQKSSVEAPFNIPGLYMIHQQSKECHAFWMPPSWSTALNDLSPNDNMFSGTYIVKGPKNSGKSTFARTLTNHLLSIYKRVAFLECDLGQSEFTPGGMVSLNVVSSPILGPPFTHPTLPNYAHFIGSTTPRSSPSHYLDGVLSLIQAYRLNIQTPAIEIDDDDNDSRISNVIPIVVNTMGWSKGLGFDLTQKIESMLEPTNIFDIHAPVREEYPTSVTPVSIGGQNNGYGAYHDQSTMDATTACVHVLDSVVSSSSVAGYTPADHRALNILSYFHARFPVDAAPGELEQITATEWETSRPLCAEHPYKVDCSIAFDKVVLTGAGSEDVVEEEIGRVLNGAIVGFVRCEPGTMDLDFEPQERSAISTTDIPYTRHLSPPSPLSSTCVGLGLIRGVSSPTVTDSASPQGLSKTFLQLLTPLPHPLLAESRVLVKGEMELPIWGMLDFRNFEGKDVDIGDVADVERDSVPFLQWGKAPDGALGAEKRRVRRNLMRRGQM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.26
3 0.25
4 0.26
5 0.25
6 0.23
7 0.21
8 0.19
9 0.15
10 0.13
11 0.14
12 0.15
13 0.19
14 0.19
15 0.2
16 0.22
17 0.22
18 0.23
19 0.23
20 0.24
21 0.23
22 0.23
23 0.27
24 0.32
25 0.38
26 0.41
27 0.49
28 0.58
29 0.65
30 0.71
31 0.73
32 0.74
33 0.75
34 0.79
35 0.81
36 0.81
37 0.8
38 0.83
39 0.85
40 0.87
41 0.89
42 0.9
43 0.89
44 0.88
45 0.89
46 0.89
47 0.91
48 0.92
49 0.91
50 0.91
51 0.9
52 0.89
53 0.86
54 0.85
55 0.84
56 0.74
57 0.68
58 0.58
59 0.51
60 0.44
61 0.36
62 0.29
63 0.23
64 0.25
65 0.21
66 0.23
67 0.2
68 0.19
69 0.21
70 0.22
71 0.18
72 0.16
73 0.15
74 0.12
75 0.12
76 0.12
77 0.08
78 0.07
79 0.07
80 0.06
81 0.07
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.07
95 0.08
96 0.11
97 0.11
98 0.11
99 0.1
100 0.11
101 0.11
102 0.14
103 0.14
104 0.16
105 0.2
106 0.22
107 0.24
108 0.25
109 0.27
110 0.31
111 0.39
112 0.41
113 0.43
114 0.43
115 0.43
116 0.46
117 0.45
118 0.41
119 0.35
120 0.28
121 0.21
122 0.2
123 0.18
124 0.14
125 0.13
126 0.1
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.09
131 0.09
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.08
136 0.08
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.11
142 0.14
143 0.17
144 0.19
145 0.19
146 0.19
147 0.22
148 0.27
149 0.31
150 0.32
151 0.36
152 0.41
153 0.46
154 0.48
155 0.5
156 0.5
157 0.46
158 0.43
159 0.35
160 0.32
161 0.24
162 0.23
163 0.17
164 0.12
165 0.13
166 0.13
167 0.15
168 0.11
169 0.11
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.06
176 0.08
177 0.09
178 0.1
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.08
183 0.09
184 0.08
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.05
193 0.04
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.05
223 0.07
224 0.08
225 0.1
226 0.14
227 0.14
228 0.17
229 0.19
230 0.25
231 0.27
232 0.35
233 0.36
234 0.38
235 0.39
236 0.38
237 0.38
238 0.33
239 0.31
240 0.25
241 0.24
242 0.18
243 0.18
244 0.17
245 0.15
246 0.13
247 0.13
248 0.11
249 0.11
250 0.11
251 0.1
252 0.11
253 0.12
254 0.14
255 0.14
256 0.19
257 0.21
258 0.21
259 0.23
260 0.25
261 0.23
262 0.26
263 0.29
264 0.31
265 0.32
266 0.32
267 0.31
268 0.28
269 0.28
270 0.22
271 0.18
272 0.18
273 0.13
274 0.14
275 0.14
276 0.13
277 0.13
278 0.13
279 0.12
280 0.05
281 0.07
282 0.06
283 0.1
284 0.11
285 0.12
286 0.12
287 0.12
288 0.15
289 0.13
290 0.14
291 0.15
292 0.16
293 0.16
294 0.18
295 0.22
296 0.23
297 0.26
298 0.26
299 0.23
300 0.22
301 0.25
302 0.33
303 0.34
304 0.35
305 0.32
306 0.34
307 0.33
308 0.32
309 0.28
310 0.19
311 0.14
312 0.1
313 0.11
314 0.12
315 0.13
316 0.16
317 0.17
318 0.17
319 0.19
320 0.23
321 0.24
322 0.21
323 0.2
324 0.17
325 0.19
326 0.2
327 0.25
328 0.2
329 0.19
330 0.2
331 0.2
332 0.2
333 0.19
334 0.2
335 0.14
336 0.14
337 0.15
338 0.14
339 0.14
340 0.14
341 0.13
342 0.11
343 0.09
344 0.09
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.07
349 0.08
350 0.09
351 0.11
352 0.12
353 0.13
354 0.15
355 0.19
356 0.22
357 0.24
358 0.26
359 0.3
360 0.3
361 0.35
362 0.38
363 0.34
364 0.33
365 0.32
366 0.34
367 0.32
368 0.31
369 0.26
370 0.21
371 0.22
372 0.19
373 0.22
374 0.18
375 0.15
376 0.14
377 0.14
378 0.14
379 0.13
380 0.14
381 0.14
382 0.13
383 0.13
384 0.13
385 0.13
386 0.12
387 0.11
388 0.11
389 0.06
390 0.06
391 0.05
392 0.04
393 0.05
394 0.05
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.03
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.05
407 0.05
408 0.08
409 0.13
410 0.14
411 0.15
412 0.15
413 0.17
414 0.24
415 0.25
416 0.23
417 0.22
418 0.22
419 0.21
420 0.21
421 0.18
422 0.14
423 0.15
424 0.17
425 0.14
426 0.14
427 0.16
428 0.18
429 0.21
430 0.25
431 0.26
432 0.28
433 0.27
434 0.27
435 0.24
436 0.23
437 0.2
438 0.14
439 0.09
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.08
446 0.09
447 0.09
448 0.1
449 0.1
450 0.1
451 0.1
452 0.11
453 0.09
454 0.08
455 0.07
456 0.08
457 0.08
458 0.09
459 0.09
460 0.08
461 0.07
462 0.07
463 0.07
464 0.07
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.07
469 0.07
470 0.07
471 0.09
472 0.08
473 0.08
474 0.08
475 0.08
476 0.07
477 0.07
478 0.07
479 0.05
480 0.07
481 0.08
482 0.07
483 0.07
484 0.12
485 0.15
486 0.16
487 0.16
488 0.14
489 0.14
490 0.14
491 0.14
492 0.12
493 0.11
494 0.11
495 0.11
496 0.12
497 0.12
498 0.11
499 0.12
500 0.09
501 0.1
502 0.1
503 0.12
504 0.13
505 0.13
506 0.14
507 0.14
508 0.15
509 0.13
510 0.16
511 0.14
512 0.16
513 0.15
514 0.14
515 0.14
516 0.14
517 0.13
518 0.13
519 0.13
520 0.11
521 0.12
522 0.12
523 0.12
524 0.11
525 0.1
526 0.07
527 0.08
528 0.08
529 0.08
530 0.08
531 0.08
532 0.08
533 0.1
534 0.09
535 0.08
536 0.07
537 0.07
538 0.08
539 0.08
540 0.08
541 0.07
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.06
546 0.05
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.06
551 0.05
552 0.05
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.07
558 0.09
559 0.11
560 0.12
561 0.12
562 0.13
563 0.16
564 0.16
565 0.15
566 0.14
567 0.12
568 0.12
569 0.16
570 0.16
571 0.13
572 0.16
573 0.15
574 0.15
575 0.16
576 0.18
577 0.16
578 0.15
579 0.16
580 0.14
581 0.14
582 0.15
583 0.12
584 0.09
585 0.07
586 0.07
587 0.07
588 0.05
589 0.06
590 0.07
591 0.07
592 0.09
593 0.11
594 0.11
595 0.12
596 0.12
597 0.13
598 0.13
599 0.2
600 0.24
601 0.26
602 0.31
603 0.32
604 0.33
605 0.33
606 0.32
607 0.25
608 0.28
609 0.27
610 0.23
611 0.21
612 0.2
613 0.18
614 0.17
615 0.18
616 0.1
617 0.07
618 0.06
619 0.06
620 0.07
621 0.07
622 0.06
623 0.05
624 0.06
625 0.06
626 0.06
627 0.05
628 0.05
629 0.06
630 0.06
631 0.05
632 0.05
633 0.05
634 0.06
635 0.06
636 0.05
637 0.05
638 0.05
639 0.06
640 0.06
641 0.06
642 0.08
643 0.08
644 0.08
645 0.09
646 0.12
647 0.15
648 0.14
649 0.17
650 0.15
651 0.17
652 0.17
653 0.17
654 0.16
655 0.13
656 0.14
657 0.11
658 0.13
659 0.12
660 0.12
661 0.13
662 0.16
663 0.18
664 0.23
665 0.25
666 0.24
667 0.27
668 0.31
669 0.31
670 0.32
671 0.33
672 0.3
673 0.32
674 0.37
675 0.38
676 0.36
677 0.34
678 0.33
679 0.33
680 0.31
681 0.27
682 0.22
683 0.18
684 0.15
685 0.15
686 0.13
687 0.1
688 0.09
689 0.08
690 0.08
691 0.09
692 0.09
693 0.08
694 0.09
695 0.11
696 0.11
697 0.12
698 0.13
699 0.17
700 0.18
701 0.18
702 0.16
703 0.18
704 0.19
705 0.21
706 0.2
707 0.22
708 0.23
709 0.23
710 0.22
711 0.21
712 0.25
713 0.26
714 0.26
715 0.22
716 0.21
717 0.21
718 0.21
719 0.21
720 0.21
721 0.19
722 0.19
723 0.18
724 0.21
725 0.22
726 0.22
727 0.2
728 0.16
729 0.16
730 0.16
731 0.17
732 0.14
733 0.13
734 0.13
735 0.13
736 0.13
737 0.1
738 0.09
739 0.09
740 0.12
741 0.14
742 0.14
743 0.22
744 0.21
745 0.23
746 0.24
747 0.24
748 0.23
749 0.23
750 0.22
751 0.15
752 0.15
753 0.14
754 0.12
755 0.11
756 0.1
757 0.08
758 0.09
759 0.09
760 0.09
761 0.11
762 0.12
763 0.12
764 0.15
765 0.17
766 0.18
767 0.2
768 0.24
769 0.25
770 0.27
771 0.27
772 0.23
773 0.23
774 0.21
775 0.23
776 0.25
777 0.25
778 0.29
779 0.34
780 0.4
781 0.48
782 0.53
783 0.57
784 0.64
785 0.7
786 0.74