Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409XJU0

Protein Details
Accession A0A409XJU0    Localization Confidence High Confidence Score 19.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-52AESSSKPSKSLKRKKEAEQTENKSEEHydrophilic
56-85IAVFKKAKKDDTRTTKPSKARKTSEDRDIVHydrophilic
434-460PEQTRAAKRLLKRQQERRRKLAKAGINHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-43KPSKSLKRKKEA
58-76VFKKAKKDDTRTTKPSKAR
100-106KANKKKK
427-457EHNKPRTGPEQTRAAKRLLKRQQERRRKLAK
Subcellular Location(s) mito 15, mito_nucl 12.833, nucl 9.5, cyto_mito 8.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MPVTSKITKKTVQKSGAKAPVVAASSAESSSKPSKSLKRKKEAEQTENKSEEKEPIAVFKKAKKDDTRTTKPSKARKTSEDRDIVVEDRVEVTEKVVKEKANKKKKADAPEATTPVPAVVSEEKTVKVTTKSKSSKAPATIVDPASPAPASPVVPKVKSILKKFKPSQAVPTSISRPRKAEASKSKNSKVAVPEPEENEENEDAEAAESNEESDEDDHLHGFSTDDDDSSDEEGAMDDEASAFDVAKLPTIAKDDASVKRKLEKAKEQPIEDTGVLFLGRLPHGFYENQLKAYFSQFGNVTRLRISRNKKTGKSKHYGFIEFDSLAVAKIVAETMDNYLLMGHILRCKLIPREEIHPELWIGANRKWXEFDSLAVAKIVAETMDNYLLMGHILRCKLIPREEIHPELWIGANRKWRVVPKEQVARAEHNKPRTGPEQTRAAKRLLKRQQERRRKLAKAGINYDFDAVSYKKPAEIEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.77
3 0.79
4 0.7
5 0.61
6 0.53
7 0.49
8 0.42
9 0.35
10 0.25
11 0.18
12 0.18
13 0.18
14 0.17
15 0.12
16 0.16
17 0.22
18 0.23
19 0.25
20 0.32
21 0.41
22 0.52
23 0.63
24 0.68
25 0.73
26 0.8
27 0.86
28 0.88
29 0.89
30 0.88
31 0.88
32 0.85
33 0.83
34 0.79
35 0.7
36 0.62
37 0.53
38 0.48
39 0.4
40 0.36
41 0.28
42 0.32
43 0.36
44 0.39
45 0.41
46 0.43
47 0.5
48 0.52
49 0.6
50 0.6
51 0.64
52 0.7
53 0.76
54 0.79
55 0.78
56 0.8
57 0.8
58 0.79
59 0.81
60 0.81
61 0.8
62 0.78
63 0.79
64 0.8
65 0.8
66 0.81
67 0.76
68 0.67
69 0.61
70 0.56
71 0.47
72 0.39
73 0.32
74 0.22
75 0.17
76 0.16
77 0.15
78 0.12
79 0.13
80 0.16
81 0.17
82 0.2
83 0.22
84 0.25
85 0.32
86 0.42
87 0.5
88 0.56
89 0.64
90 0.66
91 0.73
92 0.77
93 0.78
94 0.79
95 0.75
96 0.72
97 0.72
98 0.7
99 0.6
100 0.53
101 0.43
102 0.33
103 0.25
104 0.18
105 0.13
106 0.12
107 0.13
108 0.15
109 0.16
110 0.17
111 0.18
112 0.19
113 0.18
114 0.21
115 0.25
116 0.27
117 0.36
118 0.41
119 0.44
120 0.51
121 0.54
122 0.55
123 0.53
124 0.53
125 0.45
126 0.44
127 0.45
128 0.38
129 0.33
130 0.27
131 0.23
132 0.2
133 0.18
134 0.13
135 0.09
136 0.1
137 0.1
138 0.11
139 0.18
140 0.2
141 0.21
142 0.22
143 0.23
144 0.29
145 0.35
146 0.41
147 0.45
148 0.48
149 0.58
150 0.61
151 0.66
152 0.67
153 0.62
154 0.64
155 0.58
156 0.56
157 0.49
158 0.49
159 0.47
160 0.45
161 0.49
162 0.42
163 0.38
164 0.35
165 0.4
166 0.38
167 0.43
168 0.47
169 0.51
170 0.56
171 0.61
172 0.63
173 0.6
174 0.58
175 0.53
176 0.47
177 0.46
178 0.43
179 0.4
180 0.4
181 0.38
182 0.4
183 0.36
184 0.3
185 0.26
186 0.21
187 0.17
188 0.13
189 0.11
190 0.08
191 0.07
192 0.07
193 0.05
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.05
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.08
216 0.09
217 0.09
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.04
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.04
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.07
237 0.1
238 0.1
239 0.08
240 0.1
241 0.15
242 0.21
243 0.25
244 0.27
245 0.25
246 0.3
247 0.34
248 0.37
249 0.4
250 0.44
251 0.49
252 0.57
253 0.6
254 0.57
255 0.54
256 0.5
257 0.45
258 0.35
259 0.26
260 0.16
261 0.11
262 0.1
263 0.08
264 0.07
265 0.06
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.1
271 0.1
272 0.11
273 0.18
274 0.19
275 0.21
276 0.21
277 0.21
278 0.2
279 0.22
280 0.24
281 0.15
282 0.16
283 0.15
284 0.17
285 0.21
286 0.21
287 0.2
288 0.19
289 0.21
290 0.23
291 0.3
292 0.35
293 0.4
294 0.5
295 0.57
296 0.62
297 0.72
298 0.77
299 0.78
300 0.79
301 0.73
302 0.71
303 0.68
304 0.63
305 0.54
306 0.47
307 0.41
308 0.32
309 0.28
310 0.21
311 0.16
312 0.13
313 0.1
314 0.07
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.05
321 0.06
322 0.07
323 0.07
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.09
331 0.1
332 0.1
333 0.11
334 0.14
335 0.19
336 0.23
337 0.27
338 0.27
339 0.33
340 0.38
341 0.41
342 0.38
343 0.34
344 0.3
345 0.25
346 0.24
347 0.22
348 0.2
349 0.19
350 0.27
351 0.26
352 0.28
353 0.28
354 0.27
355 0.26
356 0.23
357 0.27
358 0.2
359 0.21
360 0.2
361 0.18
362 0.17
363 0.15
364 0.14
365 0.07
366 0.06
367 0.05
368 0.06
369 0.07
370 0.07
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.09
378 0.1
379 0.1
380 0.11
381 0.14
382 0.19
383 0.23
384 0.27
385 0.27
386 0.33
387 0.38
388 0.41
389 0.38
390 0.34
391 0.3
392 0.25
393 0.24
394 0.22
395 0.2
396 0.21
397 0.29
398 0.29
399 0.32
400 0.36
401 0.42
402 0.46
403 0.52
404 0.57
405 0.58
406 0.66
407 0.67
408 0.69
409 0.66
410 0.67
411 0.64
412 0.65
413 0.62
414 0.59
415 0.61
416 0.56
417 0.58
418 0.57
419 0.59
420 0.56
421 0.56
422 0.59
423 0.61
424 0.68
425 0.64
426 0.63
427 0.6
428 0.59
429 0.64
430 0.64
431 0.68
432 0.69
433 0.78
434 0.83
435 0.88
436 0.91
437 0.9
438 0.9
439 0.85
440 0.84
441 0.82
442 0.8
443 0.78
444 0.77
445 0.72
446 0.66
447 0.61
448 0.53
449 0.43
450 0.35
451 0.3
452 0.23
453 0.2
454 0.21
455 0.21
456 0.22