FuNGI

A0A409XUS6

Protein Details

Accession

A0A409XUS6

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
183-203	VLKSLSFKKNKPQDNKQEYFT	Hydrophilic
654-677	AGINVGKSKKRKKKSPKAMSIFWM	Hydrophilic
849-872	EAEEKSRQEKKLRKERQKDLDSGK	Basic
1059-1080	EFVEITKTPKRQHRQHMAVDDE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
455-461	RKKLKPK
660-670	KSKKRKKKSPK
819-821	KRR
855-866	RQEKKLRKERQK
879-885	RPRMRPR

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MEGMNIRLKNEGKTLENDTGSRLTTRPETLKDRQYLEKPTFGRQKTHVSQGGSRSSSESRGSKFKPVLPEVPRSKNIVSSSSSRSQSSHIRSLIAAKTLEEDENDDDDELDLLSESSQHGSEHDPSSSLKPVNNSRRTNPSVTKHTHISTKTVKSNKSQKQAGRGIDETTGLEYHPQFLPQSVLKSLSFKKNKPQDNKQEYFTPSLSNSTLDVLVSKENKLPGNNGPSSWDLVPEQKGKEKAEILDLTSSPAKGWDDSDAKSPSPLSGKSANSNRPATPSSPSGSYLPLPDRSRYDNNETPKQDSGNARSKMRPRHIPKDRTTLDATENRDRNGRKYTKSIISTTKTVDARSRSESVQIVSPKQKMKGPAKPAPFPVKALDEDLQPRSKPVDKPKKVPGSSTRAPKLFPLFVSGQPGQATDKSNNIKGKGKNKDILNITEDEEEDEGEDSEDERRKKLKPKAFPISKELFSSTNTSRSLGSAGKRLSEASSGDERSSKKSRKGLDNHFAPAKRRSIASQNRQPFDDEGDPLSFGPRVDPSTLCPFCDTPLPSDPTPMLTNLMEMTMKKAKRDPRPSNPLGVKAPLTTYITVCQRHRFETQILPEAESKGWPKNIKWKKVGGRVLKMKDFLKALIEDPGNDLVLEPGSTDWEVLAGINVGKSKKRKKKSPKAMSIFWMEFMGEVEKKGLRAVSGFHGQFASFERAQPGYYGEMGSVIIHQTLYNMFPPEDIEPTLVSPLTPTEFVQRILVPEVALHLIMEDRGLEGEEGVKEALGILRESSTYGVAMFPEDGGESGLTQKHDSQSKMGAGDMIVMERARKRRKELAAEDEKEDEERRLQEELNERIRVQEAEEKSRQEKKLRKERQKDLDSGKLSESVERPRMRPRPIPKDRTAASSMCSESDTDEDNGLSRGNRNRNDIGEHVKRRMGSSDASNSSDREMEQDQDSRRRSRSRSTASDQSDIELGEYNTRRPSSEEWRRSPFATESLNLNTAMPARHPKSPSRDLSRLSLEYDSKSGNEAVVDGGRQHSRSKSRNGARSAMTHSSETHIQVDSSDGDVEFVEITKTPKRQHRQHMAVDDEDTPRPIPTQRLPPLEEARRRSANKTSQPKSGTSKQSLDPEETYSYMFTSSSSQGERC

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.42
3	0.43
4	0.4
5	0.38
6	0.36
7	0.34
8	0.31
9	0.25
10	0.23
11	0.25
12	0.31
13	0.33
14	0.38
15	0.45
16	0.51
17	0.59
18	0.61
19	0.61
20	0.63
21	0.64
22	0.66
23	0.62
24	0.62
25	0.55
26	0.59
27	0.64
28	0.59
29	0.58
30	0.55
31	0.6
32	0.57
33	0.65
34	0.61
35	0.56
36	0.58
37	0.59
38	0.62
39	0.54
40	0.49
41	0.44
42	0.41
43	0.4
44	0.41
45	0.39
46	0.35
47	0.43
48	0.45
49	0.49
50	0.52
51	0.53
52	0.56
53	0.57
54	0.61
55	0.57
56	0.65
57	0.64
58	0.67
59	0.65
60	0.61
61	0.56
62	0.54
63	0.51
64	0.45
65	0.41
66	0.38
67	0.42
68	0.44
69	0.46
70	0.41
71	0.39
72	0.4
73	0.45
74	0.47
75	0.48
76	0.42
77	0.41
78	0.4
79	0.45
80	0.43
81	0.38
82	0.31
83	0.23
84	0.25
85	0.26
86	0.26
87	0.2
88	0.2
89	0.19
90	0.2
91	0.21
92	0.18
93	0.16
94	0.15
95	0.15
96	0.11
97	0.08
98	0.06
99	0.06
100	0.05
101	0.06
102	0.06
103	0.08
104	0.08
105	0.08
106	0.1
107	0.14
108	0.19
109	0.21
110	0.2
111	0.2
112	0.22
113	0.26
114	0.3
115	0.29
116	0.26
117	0.31
118	0.4
119	0.5
120	0.57
121	0.59
122	0.59
123	0.66
124	0.69
125	0.7
126	0.69
127	0.66
128	0.66
129	0.66
130	0.65
131	0.61
132	0.58
133	0.58
134	0.51
135	0.5
136	0.5
137	0.52
138	0.56
139	0.57
140	0.58
141	0.6
142	0.69
143	0.71
144	0.71
145	0.72
146	0.68
147	0.71
148	0.74
149	0.7
150	0.65
151	0.58
152	0.5
153	0.43
154	0.39
155	0.3
156	0.24
157	0.19
158	0.13
159	0.15
160	0.13
161	0.15
162	0.15
163	0.15
164	0.14
165	0.15
166	0.19
167	0.18
168	0.21
169	0.2
170	0.22
171	0.22
172	0.27
173	0.32
174	0.39
175	0.44
176	0.44
177	0.53
178	0.59
179	0.68
180	0.72
181	0.77
182	0.78
183	0.8
184	0.81
185	0.74
186	0.72
187	0.66
188	0.61
189	0.51
190	0.42
191	0.33
192	0.33
193	0.29
194	0.23
195	0.21
196	0.17
197	0.17
198	0.13
199	0.13
200	0.11
201	0.15
202	0.16
203	0.17
204	0.18
205	0.21
206	0.24
207	0.25
208	0.28
209	0.29
210	0.36
211	0.36
212	0.33
213	0.33
214	0.31
215	0.33
216	0.29
217	0.25
218	0.18
219	0.21
220	0.25
221	0.27
222	0.28
223	0.31
224	0.36
225	0.35
226	0.38
227	0.37
228	0.34
229	0.36
230	0.34
231	0.3
232	0.29
233	0.27
234	0.26
235	0.24
236	0.23
237	0.16
238	0.17
239	0.16
240	0.13
241	0.14
242	0.17
243	0.19
244	0.21
245	0.27
246	0.27
247	0.26
248	0.27
249	0.26
250	0.22
251	0.23
252	0.23
253	0.21
254	0.25
255	0.27
256	0.34
257	0.41
258	0.45
259	0.47
260	0.5
261	0.46
262	0.44
263	0.45
264	0.39
265	0.35
266	0.32
267	0.28
268	0.26
269	0.28
270	0.24
271	0.24
272	0.23
273	0.22
274	0.23
275	0.27
276	0.28
277	0.29
278	0.31
279	0.35
280	0.4
281	0.42
282	0.47
283	0.46
284	0.51
285	0.57
286	0.56
287	0.54
288	0.5
289	0.45
290	0.42
291	0.41
292	0.41
293	0.42
294	0.44
295	0.43
296	0.47
297	0.53
298	0.57
299	0.59
300	0.63
301	0.61
302	0.68
303	0.76
304	0.79
305	0.78
306	0.79
307	0.73
308	0.67
309	0.62
310	0.53
311	0.49
312	0.45
313	0.45
314	0.43
315	0.43
316	0.39
317	0.43
318	0.41
319	0.4
320	0.45
321	0.45
322	0.4
323	0.45
324	0.5
325	0.52
326	0.54
327	0.54
328	0.52
329	0.49
330	0.48
331	0.44
332	0.43
333	0.37
334	0.34
335	0.35
336	0.31
337	0.31
338	0.33
339	0.34
340	0.27
341	0.3
342	0.3
343	0.26
344	0.28
345	0.27
346	0.27
347	0.29
348	0.34
349	0.34
350	0.35
351	0.36
352	0.39
353	0.45
354	0.49
355	0.52
356	0.55
357	0.57
358	0.59
359	0.62
360	0.61
361	0.54
362	0.47
363	0.41
364	0.37
365	0.32
366	0.32
367	0.27
368	0.22
369	0.24
370	0.26
371	0.26
372	0.23
373	0.23
374	0.23
375	0.27
376	0.31
377	0.38
378	0.46
379	0.49
380	0.55
381	0.64
382	0.71
383	0.66
384	0.66
385	0.63
386	0.6
387	0.61
388	0.63
389	0.59
390	0.49
391	0.49
392	0.46
393	0.43
394	0.36
395	0.3
396	0.26
397	0.23
398	0.23
399	0.29
400	0.26
401	0.23
402	0.21
403	0.21
404	0.18
405	0.18
406	0.2
407	0.15
408	0.21
409	0.23
410	0.28
411	0.31
412	0.32
413	0.37
414	0.4
415	0.49
416	0.5
417	0.53
418	0.54
419	0.52
420	0.56
421	0.52
422	0.48
423	0.41
424	0.34
425	0.3
426	0.25
427	0.23
428	0.18
429	0.14
430	0.11
431	0.09
432	0.08
433	0.06
434	0.06
435	0.06
436	0.05
437	0.09
438	0.14
439	0.14
440	0.16
441	0.2
442	0.24
443	0.34
444	0.43
445	0.47
446	0.52
447	0.61
448	0.7
449	0.74
450	0.72
451	0.7
452	0.66
453	0.59
454	0.5
455	0.42
456	0.32
457	0.27
458	0.28
459	0.22
460	0.22
461	0.22
462	0.21
463	0.2
464	0.19
465	0.2
466	0.18
467	0.18
468	0.19
469	0.19
470	0.19
471	0.19
472	0.19
473	0.17
474	0.16
475	0.15
476	0.13
477	0.16
478	0.16
479	0.16
480	0.2
481	0.2
482	0.24
483	0.32
484	0.33
485	0.35
486	0.4
487	0.46
488	0.52
489	0.59
490	0.62
491	0.63
492	0.62
493	0.59
494	0.58
495	0.53
496	0.47
497	0.43
498	0.36
499	0.28
500	0.26
501	0.25
502	0.3
503	0.38
504	0.45
505	0.49
506	0.53
507	0.54
508	0.54
509	0.53
510	0.43
511	0.38
512	0.3
513	0.22
514	0.17
515	0.16
516	0.16
517	0.14
518	0.14
519	0.1
520	0.08
521	0.08
522	0.07
523	0.09
524	0.1
525	0.1
526	0.13
527	0.22
528	0.22
529	0.21
530	0.22
531	0.2
532	0.2
533	0.24
534	0.22
535	0.16
536	0.2
537	0.24
538	0.22
539	0.23
540	0.22
541	0.2
542	0.2
543	0.17
544	0.14
545	0.1
546	0.1
547	0.09
548	0.1
549	0.08
550	0.07
551	0.1
552	0.14
553	0.15
554	0.16
555	0.21
556	0.28
557	0.38
558	0.49
559	0.54
560	0.58
561	0.67
562	0.67
563	0.7
564	0.64
565	0.58
566	0.48
567	0.41
568	0.31
569	0.22
570	0.21
571	0.16
572	0.15
573	0.12
574	0.11
575	0.13
576	0.16
577	0.2
578	0.21
579	0.25
580	0.25
581	0.28
582	0.29
583	0.28
584	0.27
585	0.29
586	0.31
587	0.32
588	0.3
589	0.28
590	0.27
591	0.26
592	0.23
593	0.19
594	0.18
595	0.14
596	0.18
597	0.18
598	0.19
599	0.28
600	0.36
601	0.42
602	0.44
603	0.5
604	0.54
605	0.61
606	0.67
607	0.63
608	0.63
609	0.63
610	0.63
611	0.57
612	0.53
613	0.44
614	0.39
615	0.33
616	0.25
617	0.19
618	0.16
619	0.15
620	0.16
621	0.16
622	0.13
623	0.14
624	0.14
625	0.12
626	0.11
627	0.1
628	0.06
629	0.06
630	0.06
631	0.04
632	0.04
633	0.05
634	0.05
635	0.05
636	0.04
637	0.04
638	0.04
639	0.04
640	0.04
641	0.03
642	0.04
643	0.04
644	0.06
645	0.07
646	0.11
647	0.19
648	0.29
649	0.39
650	0.48
651	0.58
652	0.68
653	0.78
654	0.86
655	0.9
656	0.9
657	0.87
658	0.81
659	0.74
660	0.69
661	0.57
662	0.46
663	0.35
664	0.24
665	0.18
666	0.15
667	0.14
668	0.08
669	0.08
670	0.09
671	0.09
672	0.09
673	0.1
674	0.09
675	0.07
676	0.08
677	0.09
678	0.12
679	0.18
680	0.17
681	0.17
682	0.17
683	0.17
684	0.17
685	0.18
686	0.2
687	0.14
688	0.15
689	0.16
690	0.16
691	0.17
692	0.17
693	0.15
694	0.11
695	0.11
696	0.11
697	0.08
698	0.08
699	0.08
700	0.08
701	0.07
702	0.05
703	0.05
704	0.05
705	0.05
706	0.05
707	0.06
708	0.07
709	0.08
710	0.09
711	0.09
712	0.09
713	0.11
714	0.12
715	0.12
716	0.12
717	0.11
718	0.1
719	0.1
720	0.11
721	0.09
722	0.08
723	0.07
724	0.07
725	0.07
726	0.08
727	0.08
728	0.12
729	0.14
730	0.15
731	0.16
732	0.16
733	0.16
734	0.17
735	0.17
736	0.12
737	0.1
738	0.11
739	0.09
740	0.09
741	0.07
742	0.05
743	0.05
744	0.05
745	0.05
746	0.04
747	0.03
748	0.04
749	0.04
750	0.04
751	0.04
752	0.06
753	0.06
754	0.06
755	0.06
756	0.06
757	0.05
758	0.06
759	0.07
760	0.06
761	0.06
762	0.06
763	0.06
764	0.07
765	0.08
766	0.08
767	0.07
768	0.06
769	0.07
770	0.06
771	0.06
772	0.07
773	0.06
774	0.05
775	0.05
776	0.05
777	0.05
778	0.05
779	0.05
780	0.05
781	0.07
782	0.09
783	0.1
784	0.11
785	0.13
786	0.17
787	0.22
788	0.23
789	0.23
790	0.25
791	0.26
792	0.26
793	0.23
794	0.19
795	0.15
796	0.15
797	0.13
798	0.09
799	0.08
800	0.07
801	0.09
802	0.13
803	0.22
804	0.29
805	0.33
806	0.4
807	0.48
808	0.56
809	0.64
810	0.66
811	0.68
812	0.7
813	0.69
814	0.64
815	0.56
816	0.49
817	0.41
818	0.34
819	0.25
820	0.18
821	0.18
822	0.18
823	0.18
824	0.18
825	0.21
826	0.28
827	0.34
828	0.36
829	0.36
830	0.34
831	0.34
832	0.35
833	0.3
834	0.26
835	0.26
836	0.24
837	0.3
838	0.33
839	0.35
840	0.39
841	0.47
842	0.49
843	0.51
844	0.55
845	0.58
846	0.66
847	0.73
848	0.78
849	0.8
850	0.86
851	0.87
852	0.86
853	0.83
854	0.78
855	0.76
856	0.68
857	0.6
858	0.51
859	0.44
860	0.38
861	0.34
862	0.31
863	0.29
864	0.34
865	0.35
866	0.37
867	0.43
868	0.5
869	0.52
870	0.58
871	0.62
872	0.65
873	0.72
874	0.79
875	0.74
876	0.76
877	0.71
878	0.68
879	0.61
880	0.51
881	0.42
882	0.38
883	0.33
884	0.25
885	0.24
886	0.18
887	0.15
888	0.16
889	0.17
890	0.14
891	0.14
892	0.13
893	0.13
894	0.13
895	0.13
896	0.12
897	0.15
898	0.22
899	0.3
900	0.34
901	0.4
902	0.43
903	0.44
904	0.48
905	0.47
906	0.48
907	0.49
908	0.5
909	0.47
910	0.46
911	0.45
912	0.42
913	0.4
914	0.34
915	0.27
916	0.29
917	0.34
918	0.34
919	0.37
920	0.36
921	0.34
922	0.33
923	0.31
924	0.24
925	0.2
926	0.19
927	0.18
928	0.21
929	0.26
930	0.3
931	0.37
932	0.42
933	0.43
934	0.48
935	0.53
936	0.54
937	0.58
938	0.63
939	0.64
940	0.68
941	0.7
942	0.73
943	0.7
944	0.7
945	0.6
946	0.51
947	0.43
948	0.34
949	0.27
950	0.2
951	0.16
952	0.19
953	0.2
954	0.21
955	0.24
956	0.25
957	0.25
958	0.26
959	0.32
960	0.36
961	0.46
962	0.53
963	0.55
964	0.63
965	0.65
966	0.62
967	0.6
968	0.52
969	0.47
970	0.41
971	0.36
972	0.32
973	0.33
974	0.33
975	0.29
976	0.26
977	0.22
978	0.2
979	0.19
980	0.18
981	0.24
982	0.25
983	0.32
984	0.35
985	0.42
986	0.49
987	0.57
988	0.63
989	0.63
990	0.66
991	0.63
992	0.65
993	0.65
994	0.57
995	0.51
996	0.46
997	0.39
998	0.35
999	0.34
1000	0.29
1001	0.23
1002	0.23
1003	0.21
1004	0.17
1005	0.14
1006	0.13
1007	0.12
1008	0.12
1009	0.12
1010	0.11
1011	0.15
1012	0.17
1013	0.18
1014	0.22
1015	0.28
1016	0.36
1017	0.42
1018	0.5
1019	0.57
1020	0.64
1021	0.71
1022	0.72
1023	0.7
1024	0.64
1025	0.63
1026	0.6
1027	0.56
1028	0.49
1029	0.42
1030	0.38
1031	0.36
1032	0.36
1033	0.33
1034	0.29
1035	0.23
1036	0.2
1037	0.19
1038	0.2
1039	0.17
1040	0.15
1041	0.14
1042	0.12
1043	0.11
1044	0.11
1045	0.12
1046	0.1
1047	0.08
1048	0.08
1049	0.08
1050	0.12
1051	0.18
1052	0.24
1053	0.32
1054	0.42
1055	0.52
1056	0.6
1057	0.7
1058	0.78
1059	0.8
1060	0.84
1061	0.85
1062	0.79
1063	0.72
1064	0.64
1065	0.57
1066	0.49
1067	0.41
1068	0.34
1069	0.26
1070	0.22
1071	0.22
1072	0.22
1073	0.26
1074	0.3
1075	0.39
1076	0.45
1077	0.51
1078	0.54
1079	0.59
1080	0.66
1081	0.69
1082	0.7
1083	0.65
1084	0.65
1085	0.68
1086	0.68
1087	0.66
1088	0.66
1089	0.67
1090	0.69
1091	0.73
1092	0.7
1093	0.7
1094	0.7
1095	0.7
1096	0.69
1097	0.68
1098	0.67
1099	0.63
1100	0.64
1101	0.61
1102	0.66
1103	0.63
1104	0.6
1105	0.52
1106	0.47
1107	0.43
1108	0.39
1109	0.34
1110	0.26
1111	0.23
1112	0.19
1113	0.16
1114	0.13
1115	0.14
1116	0.16
1117	0.19

A0A409XUS6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer