Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409XFI3

Protein Details
Accession A0A409XFI3    Localization Confidence High Confidence Score 19
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
83-102FDGRERPKIKRGSKIGKSGNBasic
520-544EKEAEKTTKTKEKRKAREQTRITGSHydrophilic
650-681DLICDRILTKKRKPVKQSKKPRPANVDIPTRAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
87-105ERPKIKRGSKIGKSGNHPR
531-534EKRK
659-672KKRKPVKQSKKPRP
Subcellular Location(s) cyto 7.5cyto_nucl 7.5, nucl 6.5, mito 5, plas 4, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036279  5-3_exonuclease_C_sf  
IPR041177  GEN1_C  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
IPR006085  XPG_DNA_repair_N  
Gene Ontology GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF18380  GEN1_C  
PF00867  XPG_I  
CDD cd09870  PIN_YEN1  
Amino Acid Sequences MGAPGLWDVLNKVGKSTSIVRLAVVDGFELNRSRRRAYRIGVDASIWFHHATFSKQGESPEARGLFFRLVFLAKLPIIPLFVFDGRERPKIKRGSKIGKSGNHPRERQFKHLLDAFGMEWREARGEAEAELAYLNQKGHIDAVMTDDCDAFLFGARTVIKNISSKLSGNKNNLAKNSNDKADKYHTMVYKIEDIQNDPSISLSRGGMILFALLSGGDYHKGVDRVGKKIAHGLARCGFGIELLEAYENLRDCKDEFRQFLQQWRMRVNIELKENSQGCLLHRTSLSLPDDFPNLDVLEYYTNPVHSGSGGDQGLGSIALRDQKNLNLPKIAQLCEQYFEWGYRAKIMERFVTLMWPCATMHVLRRAALEVDRQNQNASDTSSKAPVPSSQGDVGTPASLVQRYLCFAHREDRYEDVFVNKGTGPRPSAVPVVGANPLICKISGSRQHASTDGLLEYKVEVSPVQLVRIADSGIKGTRQAPPSAEGSNKPKKATETDSLPMWVPASILSVVHPSMVKQFIEKEAEKTTKTKEKRKAREQTRITGSAPDEEDMHTDLQRSQTRPQPQSQLKSMAMGDYDWNTAFEPGHTAVLDPWFTSDALISQAHTERKRSGFFFTLPNPDREDGEQYVNTEAMINNDYDSEVDRPVTGFDLICDRILTKKRKPVKQSKKPRPANVDIPTRAMDERPFKKQRISSRILDALDAPES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.26
3 0.3
4 0.3
5 0.32
6 0.32
7 0.31
8 0.31
9 0.32
10 0.29
11 0.23
12 0.17
13 0.12
14 0.12
15 0.14
16 0.17
17 0.2
18 0.25
19 0.29
20 0.34
21 0.39
22 0.46
23 0.52
24 0.54
25 0.6
26 0.61
27 0.62
28 0.57
29 0.52
30 0.46
31 0.41
32 0.35
33 0.27
34 0.2
35 0.15
36 0.17
37 0.18
38 0.2
39 0.25
40 0.27
41 0.29
42 0.31
43 0.32
44 0.37
45 0.39
46 0.38
47 0.39
48 0.37
49 0.34
50 0.32
51 0.33
52 0.29
53 0.25
54 0.22
55 0.16
56 0.16
57 0.16
58 0.16
59 0.18
60 0.14
61 0.15
62 0.15
63 0.14
64 0.14
65 0.14
66 0.14
67 0.14
68 0.15
69 0.17
70 0.17
71 0.25
72 0.28
73 0.35
74 0.37
75 0.38
76 0.46
77 0.53
78 0.59
79 0.61
80 0.67
81 0.7
82 0.75
83 0.8
84 0.8
85 0.77
86 0.78
87 0.79
88 0.79
89 0.77
90 0.73
91 0.71
92 0.73
93 0.71
94 0.71
95 0.7
96 0.62
97 0.6
98 0.61
99 0.55
100 0.45
101 0.42
102 0.34
103 0.29
104 0.26
105 0.19
106 0.15
107 0.14
108 0.14
109 0.13
110 0.13
111 0.1
112 0.1
113 0.11
114 0.12
115 0.11
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.1
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.09
129 0.14
130 0.13
131 0.13
132 0.13
133 0.12
134 0.12
135 0.11
136 0.11
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.11
142 0.12
143 0.12
144 0.15
145 0.16
146 0.18
147 0.2
148 0.21
149 0.21
150 0.22
151 0.23
152 0.28
153 0.36
154 0.39
155 0.42
156 0.48
157 0.5
158 0.53
159 0.54
160 0.5
161 0.44
162 0.46
163 0.46
164 0.45
165 0.42
166 0.38
167 0.39
168 0.43
169 0.44
170 0.38
171 0.4
172 0.36
173 0.36
174 0.37
175 0.35
176 0.33
177 0.32
178 0.32
179 0.27
180 0.27
181 0.27
182 0.28
183 0.26
184 0.21
185 0.19
186 0.17
187 0.17
188 0.15
189 0.12
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.08
194 0.07
195 0.06
196 0.05
197 0.04
198 0.04
199 0.03
200 0.03
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.09
207 0.1
208 0.1
209 0.16
210 0.19
211 0.22
212 0.27
213 0.27
214 0.25
215 0.3
216 0.34
217 0.33
218 0.3
219 0.32
220 0.3
221 0.3
222 0.3
223 0.25
224 0.2
225 0.14
226 0.14
227 0.09
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.07
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.09
239 0.15
240 0.21
241 0.26
242 0.28
243 0.32
244 0.4
245 0.4
246 0.47
247 0.51
248 0.47
249 0.44
250 0.44
251 0.42
252 0.35
253 0.37
254 0.35
255 0.3
256 0.32
257 0.31
258 0.29
259 0.33
260 0.32
261 0.29
262 0.25
263 0.21
264 0.17
265 0.22
266 0.22
267 0.18
268 0.18
269 0.19
270 0.19
271 0.23
272 0.24
273 0.18
274 0.19
275 0.17
276 0.18
277 0.16
278 0.16
279 0.11
280 0.09
281 0.08
282 0.08
283 0.07
284 0.08
285 0.08
286 0.09
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.08
292 0.06
293 0.07
294 0.07
295 0.11
296 0.11
297 0.1
298 0.1
299 0.09
300 0.09
301 0.08
302 0.07
303 0.03
304 0.04
305 0.09
306 0.09
307 0.1
308 0.11
309 0.13
310 0.21
311 0.24
312 0.25
313 0.22
314 0.22
315 0.27
316 0.29
317 0.28
318 0.22
319 0.21
320 0.21
321 0.21
322 0.2
323 0.16
324 0.13
325 0.13
326 0.12
327 0.12
328 0.11
329 0.12
330 0.12
331 0.13
332 0.15
333 0.17
334 0.17
335 0.16
336 0.17
337 0.14
338 0.17
339 0.16
340 0.15
341 0.13
342 0.13
343 0.12
344 0.11
345 0.12
346 0.09
347 0.13
348 0.17
349 0.18
350 0.17
351 0.18
352 0.18
353 0.18
354 0.18
355 0.2
356 0.16
357 0.2
358 0.21
359 0.21
360 0.21
361 0.2
362 0.21
363 0.17
364 0.16
365 0.13
366 0.13
367 0.14
368 0.16
369 0.15
370 0.14
371 0.14
372 0.13
373 0.16
374 0.16
375 0.17
376 0.16
377 0.17
378 0.16
379 0.16
380 0.15
381 0.11
382 0.09
383 0.07
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.08
390 0.1
391 0.12
392 0.13
393 0.14
394 0.21
395 0.23
396 0.26
397 0.27
398 0.29
399 0.28
400 0.27
401 0.26
402 0.21
403 0.2
404 0.16
405 0.16
406 0.13
407 0.14
408 0.13
409 0.15
410 0.15
411 0.15
412 0.16
413 0.16
414 0.17
415 0.14
416 0.15
417 0.13
418 0.13
419 0.13
420 0.12
421 0.1
422 0.09
423 0.09
424 0.08
425 0.08
426 0.07
427 0.07
428 0.14
429 0.22
430 0.27
431 0.29
432 0.31
433 0.32
434 0.33
435 0.33
436 0.27
437 0.21
438 0.15
439 0.13
440 0.11
441 0.1
442 0.09
443 0.08
444 0.07
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.11
449 0.12
450 0.12
451 0.14
452 0.14
453 0.14
454 0.15
455 0.15
456 0.1
457 0.1
458 0.11
459 0.1
460 0.1
461 0.1
462 0.12
463 0.17
464 0.19
465 0.2
466 0.2
467 0.22
468 0.24
469 0.25
470 0.26
471 0.24
472 0.31
473 0.38
474 0.4
475 0.38
476 0.38
477 0.39
478 0.42
479 0.44
480 0.41
481 0.37
482 0.37
483 0.37
484 0.36
485 0.33
486 0.27
487 0.22
488 0.16
489 0.1
490 0.08
491 0.09
492 0.08
493 0.07
494 0.08
495 0.09
496 0.09
497 0.1
498 0.1
499 0.08
500 0.12
501 0.15
502 0.14
503 0.14
504 0.16
505 0.19
506 0.25
507 0.26
508 0.25
509 0.29
510 0.33
511 0.33
512 0.34
513 0.37
514 0.4
515 0.47
516 0.54
517 0.57
518 0.65
519 0.74
520 0.82
521 0.85
522 0.85
523 0.88
524 0.85
525 0.84
526 0.8
527 0.73
528 0.63
529 0.58
530 0.49
531 0.42
532 0.38
533 0.29
534 0.22
535 0.19
536 0.2
537 0.16
538 0.17
539 0.13
540 0.13
541 0.14
542 0.2
543 0.26
544 0.27
545 0.3
546 0.37
547 0.46
548 0.49
549 0.53
550 0.56
551 0.59
552 0.63
553 0.63
554 0.62
555 0.53
556 0.51
557 0.45
558 0.36
559 0.28
560 0.22
561 0.19
562 0.14
563 0.15
564 0.13
565 0.13
566 0.12
567 0.13
568 0.12
569 0.11
570 0.13
571 0.13
572 0.14
573 0.13
574 0.13
575 0.13
576 0.16
577 0.16
578 0.13
579 0.13
580 0.13
581 0.13
582 0.12
583 0.11
584 0.09
585 0.11
586 0.12
587 0.11
588 0.13
589 0.18
590 0.25
591 0.27
592 0.3
593 0.33
594 0.37
595 0.42
596 0.4
597 0.41
598 0.39
599 0.39
600 0.43
601 0.42
602 0.48
603 0.46
604 0.46
605 0.45
606 0.41
607 0.41
608 0.37
609 0.38
610 0.3
611 0.33
612 0.31
613 0.28
614 0.28
615 0.26
616 0.23
617 0.18
618 0.16
619 0.13
620 0.13
621 0.12
622 0.11
623 0.11
624 0.12
625 0.11
626 0.13
627 0.12
628 0.12
629 0.13
630 0.13
631 0.13
632 0.13
633 0.15
634 0.13
635 0.12
636 0.11
637 0.17
638 0.17
639 0.18
640 0.17
641 0.16
642 0.23
643 0.32
644 0.39
645 0.42
646 0.51
647 0.61
648 0.7
649 0.8
650 0.83
651 0.86
652 0.88
653 0.91
654 0.93
655 0.94
656 0.94
657 0.94
658 0.91
659 0.88
660 0.87
661 0.84
662 0.83
663 0.74
664 0.68
665 0.6
666 0.53
667 0.46
668 0.38
669 0.37
670 0.37
671 0.4
672 0.47
673 0.53
674 0.54
675 0.62
676 0.67
677 0.7
678 0.7
679 0.71
680 0.67
681 0.68
682 0.7
683 0.62
684 0.56
685 0.47