Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A409VLI3

Protein Details
Accession A0A409VLI3    Localization Confidence High Confidence Score 24.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
91-118EVHSPGGLRRKQKRIRVVKRLVERPKSVBasic
388-412IELRFSKVRTAKKKKDKAGRKLGKGBasic
900-926EEEIARMKKNQERRLHRKNAKIVKEGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
98-111LRRKQKRIRVVKRL
394-413KVRTAKKKKDKAGRKLGKGG
892-921DKRAKKRLEEEIARMKKNQERRLHRKNAKI
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040240  TAF1  
IPR022591  TAF1_HAT_dom  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0004402  F:histone acetyltransferase activity  
GO:0001091  F:RNA polymerase II general transcription initiation factor binding  
GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF12157  DUF3591  
Amino Acid Sequences MSAQDENDAISALTGFSISHVLGDLALPGTDQLSNRLGISGIPTLNSNQIYSDKWDEDDVVGPEQGQDWEDEIDREMREEEESDETSIKQEVHSPGGLRRKQKRIRVVKRLVERPKSVYERFPAFEKDKILDFSELFKGYAVRKSRLSKRPYQVETVYPRKKENPKGFLDAVVGDAKRQVESKRVEEVVSSGNVEVDLRKALEEREHTSVPVIMPLDDRTFDLVLLSNWEDQIVYEPQHNANVLPPVPSSTTQENDLTTPINKALESGSWTQSIIWNPKAPFRDFTQLEFNHEDDVAPEERPAETVRPRKRLRADGGQIRDKFNLSNDHFYEVAKDGGKHRVRQTFGQLVVEHAYPAQKLQLPFYKTRLSKQEARSFHRPALQFPSNIELRFSKVRTAKKKKDKAGRKLGKGGNVGEGLRKTSDLSLRDTSNFVLWEYSEEHPPIIPNFGMGSVLVNYYRKKDEKDEHVPKGDLGFPFVLEPQDESPFMKFGYVYPGQTIPALYNNLMRAPLFRHKPYPTDFLVVKSTIKGETKYYLREIKNLFVIGQTYPVTEVPGPHSRKITNTIKYRLQIIAFKLLKKSQGERLKISRLMKYFPDQNELQMRQRLKEFMEYHRRGPHQGFWRLKPNWTVPTDAEMLKMVGPEQVVLTESMQVGQRHLQDAGYSHAADVAEGDESNLSVEQQLAPWITTKNFLFATQAKAMLRLHGEGDPSGRGEAFSFIRISMKDIFVKAGEDYEQKMAEAENRPKSAHRYNVAEQQLIYKSEIERIWKAQFDSLSRKDEPQLSDEEDKKDSRKPPSQPSHASGPSGPSNRASPALSRGSSLEREREGSIGPDGSKSVLRIKRLIDGVWQTEIIRDPAVIRAYVRGRQALEEEATLADSLAPTGDADKDKRAKKRLEEEIARMKKNQERRLHRKNAKIVKEGGTPMQLNRPVKPDTTRRCGHCGQMGHMKTNRKCPRWAEFNSGAVPSTPSGSASSPQPANLPNLGFNRGPLNPVFGHPVAVPSPLATSPPMSAMDDDIIPSTPSASGPKIKLTLKRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.05
3 0.06
4 0.08
5 0.07
6 0.07
7 0.08
8 0.08
9 0.08
10 0.08
11 0.08
12 0.07
13 0.07
14 0.07
15 0.06
16 0.08
17 0.1
18 0.1
19 0.13
20 0.15
21 0.16
22 0.16
23 0.17
24 0.15
25 0.14
26 0.17
27 0.18
28 0.16
29 0.16
30 0.17
31 0.18
32 0.23
33 0.24
34 0.2
35 0.18
36 0.2
37 0.22
38 0.27
39 0.31
40 0.27
41 0.27
42 0.28
43 0.27
44 0.26
45 0.28
46 0.25
47 0.21
48 0.2
49 0.18
50 0.17
51 0.17
52 0.16
53 0.12
54 0.11
55 0.1
56 0.12
57 0.13
58 0.14
59 0.14
60 0.17
61 0.17
62 0.17
63 0.16
64 0.15
65 0.16
66 0.17
67 0.17
68 0.18
69 0.2
70 0.2
71 0.2
72 0.19
73 0.19
74 0.2
75 0.18
76 0.14
77 0.19
78 0.2
79 0.23
80 0.26
81 0.26
82 0.32
83 0.42
84 0.47
85 0.5
86 0.56
87 0.63
88 0.69
89 0.76
90 0.8
91 0.81
92 0.87
93 0.88
94 0.89
95 0.87
96 0.88
97 0.89
98 0.88
99 0.85
100 0.79
101 0.73
102 0.72
103 0.71
104 0.64
105 0.61
106 0.57
107 0.54
108 0.52
109 0.5
110 0.48
111 0.44
112 0.44
113 0.41
114 0.37
115 0.34
116 0.35
117 0.34
118 0.29
119 0.27
120 0.27
121 0.29
122 0.27
123 0.24
124 0.22
125 0.22
126 0.22
127 0.28
128 0.3
129 0.28
130 0.35
131 0.43
132 0.53
133 0.59
134 0.64
135 0.67
136 0.71
137 0.78
138 0.75
139 0.73
140 0.66
141 0.66
142 0.67
143 0.68
144 0.66
145 0.58
146 0.59
147 0.62
148 0.68
149 0.7
150 0.71
151 0.69
152 0.67
153 0.71
154 0.67
155 0.6
156 0.52
157 0.41
158 0.33
159 0.29
160 0.23
161 0.16
162 0.17
163 0.16
164 0.16
165 0.19
166 0.18
167 0.22
168 0.27
169 0.31
170 0.35
171 0.36
172 0.35
173 0.32
174 0.33
175 0.28
176 0.24
177 0.21
178 0.14
179 0.13
180 0.13
181 0.13
182 0.11
183 0.09
184 0.09
185 0.08
186 0.09
187 0.1
188 0.12
189 0.17
190 0.21
191 0.24
192 0.28
193 0.29
194 0.28
195 0.28
196 0.29
197 0.23
198 0.22
199 0.18
200 0.13
201 0.14
202 0.16
203 0.16
204 0.15
205 0.15
206 0.15
207 0.14
208 0.13
209 0.13
210 0.11
211 0.1
212 0.13
213 0.14
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.11
218 0.1
219 0.14
220 0.13
221 0.12
222 0.14
223 0.16
224 0.17
225 0.19
226 0.19
227 0.15
228 0.16
229 0.19
230 0.17
231 0.17
232 0.16
233 0.16
234 0.18
235 0.19
236 0.21
237 0.21
238 0.22
239 0.24
240 0.25
241 0.24
242 0.22
243 0.22
244 0.19
245 0.16
246 0.16
247 0.14
248 0.14
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.11
253 0.15
254 0.17
255 0.17
256 0.17
257 0.17
258 0.17
259 0.2
260 0.23
261 0.25
262 0.24
263 0.28
264 0.28
265 0.34
266 0.38
267 0.36
268 0.34
269 0.34
270 0.4
271 0.36
272 0.38
273 0.42
274 0.38
275 0.41
276 0.41
277 0.37
278 0.29
279 0.27
280 0.24
281 0.15
282 0.18
283 0.14
284 0.11
285 0.11
286 0.11
287 0.11
288 0.12
289 0.13
290 0.14
291 0.21
292 0.3
293 0.38
294 0.47
295 0.5
296 0.57
297 0.63
298 0.67
299 0.66
300 0.66
301 0.67
302 0.66
303 0.7
304 0.7
305 0.65
306 0.59
307 0.53
308 0.43
309 0.36
310 0.3
311 0.32
312 0.27
313 0.33
314 0.31
315 0.32
316 0.32
317 0.31
318 0.3
319 0.22
320 0.22
321 0.16
322 0.16
323 0.16
324 0.25
325 0.29
326 0.32
327 0.37
328 0.41
329 0.43
330 0.45
331 0.49
332 0.45
333 0.43
334 0.41
335 0.34
336 0.29
337 0.28
338 0.25
339 0.18
340 0.13
341 0.12
342 0.09
343 0.09
344 0.1
345 0.12
346 0.12
347 0.17
348 0.22
349 0.26
350 0.28
351 0.32
352 0.37
353 0.35
354 0.4
355 0.43
356 0.43
357 0.47
358 0.53
359 0.58
360 0.56
361 0.62
362 0.65
363 0.6
364 0.57
365 0.55
366 0.48
367 0.42
368 0.44
369 0.4
370 0.33
371 0.3
372 0.32
373 0.28
374 0.27
375 0.26
376 0.18
377 0.19
378 0.22
379 0.22
380 0.24
381 0.28
382 0.37
383 0.47
384 0.57
385 0.63
386 0.7
387 0.78
388 0.81
389 0.85
390 0.87
391 0.86
392 0.87
393 0.85
394 0.79
395 0.79
396 0.73
397 0.69
398 0.61
399 0.51
400 0.43
401 0.35
402 0.3
403 0.24
404 0.21
405 0.16
406 0.14
407 0.13
408 0.11
409 0.12
410 0.16
411 0.15
412 0.2
413 0.21
414 0.22
415 0.23
416 0.23
417 0.21
418 0.18
419 0.17
420 0.12
421 0.1
422 0.08
423 0.09
424 0.12
425 0.13
426 0.13
427 0.13
428 0.13
429 0.13
430 0.14
431 0.12
432 0.1
433 0.09
434 0.07
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.06
439 0.06
440 0.05
441 0.06
442 0.06
443 0.08
444 0.09
445 0.11
446 0.16
447 0.17
448 0.19
449 0.26
450 0.31
451 0.38
452 0.48
453 0.54
454 0.54
455 0.55
456 0.53
457 0.46
458 0.41
459 0.36
460 0.25
461 0.18
462 0.14
463 0.11
464 0.11
465 0.12
466 0.1
467 0.07
468 0.08
469 0.08
470 0.09
471 0.09
472 0.1
473 0.1
474 0.1
475 0.1
476 0.09
477 0.07
478 0.06
479 0.12
480 0.13
481 0.13
482 0.13
483 0.14
484 0.14
485 0.14
486 0.14
487 0.08
488 0.09
489 0.1
490 0.09
491 0.1
492 0.1
493 0.11
494 0.11
495 0.1
496 0.09
497 0.12
498 0.18
499 0.2
500 0.22
501 0.27
502 0.28
503 0.32
504 0.35
505 0.35
506 0.3
507 0.3
508 0.28
509 0.25
510 0.26
511 0.23
512 0.19
513 0.15
514 0.14
515 0.13
516 0.14
517 0.13
518 0.12
519 0.15
520 0.17
521 0.19
522 0.21
523 0.27
524 0.26
525 0.31
526 0.31
527 0.28
528 0.28
529 0.26
530 0.23
531 0.16
532 0.16
533 0.11
534 0.11
535 0.1
536 0.08
537 0.09
538 0.08
539 0.09
540 0.08
541 0.09
542 0.12
543 0.2
544 0.22
545 0.23
546 0.26
547 0.25
548 0.27
549 0.34
550 0.37
551 0.37
552 0.41
553 0.44
554 0.46
555 0.46
556 0.47
557 0.4
558 0.34
559 0.3
560 0.25
561 0.29
562 0.27
563 0.27
564 0.27
565 0.27
566 0.29
567 0.28
568 0.29
569 0.29
570 0.35
571 0.38
572 0.4
573 0.44
574 0.45
575 0.48
576 0.48
577 0.43
578 0.37
579 0.36
580 0.33
581 0.32
582 0.33
583 0.29
584 0.31
585 0.26
586 0.29
587 0.33
588 0.34
589 0.34
590 0.32
591 0.32
592 0.29
593 0.3
594 0.28
595 0.23
596 0.28
597 0.27
598 0.31
599 0.41
600 0.42
601 0.44
602 0.49
603 0.49
604 0.44
605 0.43
606 0.42
607 0.4
608 0.46
609 0.47
610 0.44
611 0.53
612 0.51
613 0.52
614 0.49
615 0.45
616 0.42
617 0.39
618 0.38
619 0.29
620 0.31
621 0.31
622 0.26
623 0.22
624 0.16
625 0.15
626 0.12
627 0.12
628 0.08
629 0.07
630 0.07
631 0.06
632 0.06
633 0.06
634 0.06
635 0.07
636 0.07
637 0.07
638 0.07
639 0.08
640 0.11
641 0.11
642 0.12
643 0.15
644 0.16
645 0.16
646 0.16
647 0.15
648 0.12
649 0.13
650 0.15
651 0.13
652 0.12
653 0.11
654 0.12
655 0.12
656 0.11
657 0.1
658 0.07
659 0.06
660 0.06
661 0.06
662 0.04
663 0.04
664 0.05
665 0.05
666 0.04
667 0.04
668 0.05
669 0.05
670 0.05
671 0.07
672 0.07
673 0.07
674 0.09
675 0.1
676 0.1
677 0.14
678 0.13
679 0.15
680 0.15
681 0.15
682 0.17
683 0.18
684 0.23
685 0.21
686 0.23
687 0.2
688 0.23
689 0.22
690 0.21
691 0.2
692 0.15
693 0.16
694 0.14
695 0.15
696 0.13
697 0.14
698 0.12
699 0.12
700 0.11
701 0.1
702 0.08
703 0.08
704 0.11
705 0.1
706 0.11
707 0.11
708 0.11
709 0.13
710 0.13
711 0.15
712 0.15
713 0.17
714 0.17
715 0.17
716 0.18
717 0.16
718 0.17
719 0.14
720 0.13
721 0.12
722 0.12
723 0.13
724 0.14
725 0.14
726 0.13
727 0.13
728 0.12
729 0.16
730 0.22
731 0.28
732 0.32
733 0.33
734 0.35
735 0.37
736 0.43
737 0.45
738 0.45
739 0.42
740 0.43
741 0.45
742 0.53
743 0.53
744 0.47
745 0.4
746 0.37
747 0.35
748 0.29
749 0.26
750 0.2
751 0.18
752 0.22
753 0.23
754 0.23
755 0.23
756 0.26
757 0.28
758 0.29
759 0.29
760 0.28
761 0.28
762 0.29
763 0.35
764 0.36
765 0.38
766 0.37
767 0.38
768 0.38
769 0.41
770 0.38
771 0.32
772 0.31
773 0.31
774 0.36
775 0.37
776 0.37
777 0.35
778 0.35
779 0.35
780 0.38
781 0.39
782 0.42
783 0.47
784 0.51
785 0.59
786 0.67
787 0.73
788 0.72
789 0.7
790 0.7
791 0.63
792 0.57
793 0.47
794 0.42
795 0.4
796 0.37
797 0.34
798 0.27
799 0.27
800 0.27
801 0.28
802 0.25
803 0.2
804 0.23
805 0.28
806 0.26
807 0.25
808 0.25
809 0.27
810 0.31
811 0.31
812 0.3
813 0.26
814 0.29
815 0.28
816 0.27
817 0.24
818 0.21
819 0.2
820 0.18
821 0.16
822 0.14
823 0.14
824 0.15
825 0.15
826 0.15
827 0.22
828 0.24
829 0.27
830 0.3
831 0.31
832 0.36
833 0.37
834 0.36
835 0.33
836 0.34
837 0.33
838 0.31
839 0.3
840 0.23
841 0.23
842 0.24
843 0.19
844 0.15
845 0.12
846 0.11
847 0.15
848 0.17
849 0.15
850 0.14
851 0.19
852 0.23
853 0.27
854 0.29
855 0.28
856 0.27
857 0.29
858 0.3
859 0.27
860 0.25
861 0.21
862 0.19
863 0.16
864 0.15
865 0.13
866 0.11
867 0.08
868 0.06
869 0.06
870 0.05
871 0.05
872 0.04
873 0.06
874 0.09
875 0.13
876 0.15
877 0.23
878 0.32
879 0.38
880 0.47
881 0.55
882 0.59
883 0.65
884 0.72
885 0.75
886 0.77
887 0.76
888 0.75
889 0.78
890 0.78
891 0.71
892 0.63
893 0.6
894 0.56
895 0.6
896 0.61
897 0.6
898 0.64
899 0.72
900 0.81
901 0.85
902 0.87
903 0.87
904 0.88
905 0.88
906 0.85
907 0.8
908 0.75
909 0.69
910 0.66
911 0.58
912 0.51
913 0.46
914 0.4
915 0.35
916 0.38
917 0.4
918 0.37
919 0.37
920 0.39
921 0.37
922 0.39
923 0.45
924 0.47
925 0.49
926 0.56
927 0.6
928 0.6
929 0.64
930 0.64
931 0.62
932 0.59
933 0.53
934 0.5
935 0.53
936 0.51
937 0.51
938 0.53
939 0.57
940 0.55
941 0.62
942 0.66
943 0.61
944 0.65
945 0.65
946 0.69
947 0.69
948 0.7
949 0.69
950 0.64
951 0.64
952 0.59
953 0.53
954 0.44
955 0.34
956 0.31
957 0.22
958 0.19
959 0.15
960 0.13
961 0.15
962 0.16
963 0.17
964 0.19
965 0.25
966 0.24
967 0.24
968 0.27
969 0.27
970 0.3
971 0.31
972 0.29
973 0.29
974 0.31
975 0.35
976 0.31
977 0.3
978 0.31
979 0.28
980 0.29
981 0.24
982 0.26
983 0.23
984 0.24
985 0.3
986 0.25
987 0.26
988 0.23
989 0.26
990 0.22
991 0.22
992 0.2
993 0.14
994 0.17
995 0.15
996 0.16
997 0.14
998 0.15
999 0.15
1000 0.17
1001 0.18
1002 0.17
1003 0.18
1004 0.18
1005 0.19
1006 0.17
1007 0.17
1008 0.16
1009 0.15
1010 0.13
1011 0.13
1012 0.12
1013 0.1
1014 0.12
1015 0.15
1016 0.18
1017 0.24
1018 0.26
1019 0.32
1020 0.37
1021 0.43