Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VMD6

Protein Details
Accession A0A409VMD6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
238-260LLAIPKNKGKSKAKNKIPKPLGPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
242-271PKNKGKSKAKNKIPKPLGPNPTRPKGRLAR
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 11.333, cyto 8, cyto_mito 7.999, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016159  Cullin_repeat-like_dom_sf  
Amino Acid Sequences MPTLLNHASGSANPATSQSALWAYLQPALDHIIKSPSNDPNGKAPAIDFGLYAGIHSACYNYFTAQSEANAANPSNDDDVQPASGTDIYVQLDKYFEEATRELSLGAPLDDITLIQYIVPSFNRYHAGAQSANRLLSYVNRHYVKRAVDEDRGWLRLSDVLESVAKSISNDDSREIITRKLREKRVDELRKWGYHDGDSSEQVVFAESCAEAASSLDRVVPVASLALRRFRTEFMEPLLAIPKNKGKSKAKNKIPKPLGPNPTRPKGRLARAIKELLETDAVDEEERYRLASGLAKALQIIGVKEENLLRKKLDKYVLSVSSTLIPPPSKSSKI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.17
4 0.16
5 0.14
6 0.14
7 0.15
8 0.16
9 0.17
10 0.16
11 0.19
12 0.2
13 0.17
14 0.16
15 0.19
16 0.2
17 0.18
18 0.18
19 0.21
20 0.21
21 0.24
22 0.29
23 0.31
24 0.37
25 0.4
26 0.4
27 0.42
28 0.45
29 0.43
30 0.37
31 0.31
32 0.28
33 0.27
34 0.25
35 0.16
36 0.12
37 0.14
38 0.13
39 0.13
40 0.1
41 0.08
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.07
46 0.1
47 0.11
48 0.1
49 0.12
50 0.14
51 0.16
52 0.16
53 0.16
54 0.18
55 0.17
56 0.17
57 0.17
58 0.15
59 0.14
60 0.14
61 0.15
62 0.14
63 0.15
64 0.13
65 0.13
66 0.14
67 0.14
68 0.13
69 0.11
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.08
74 0.08
75 0.09
76 0.1
77 0.1
78 0.09
79 0.1
80 0.1
81 0.11
82 0.1
83 0.09
84 0.12
85 0.12
86 0.15
87 0.16
88 0.16
89 0.14
90 0.14
91 0.14
92 0.11
93 0.1
94 0.07
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.04
103 0.05
104 0.05
105 0.07
106 0.07
107 0.09
108 0.09
109 0.11
110 0.14
111 0.15
112 0.16
113 0.16
114 0.19
115 0.19
116 0.2
117 0.23
118 0.22
119 0.21
120 0.19
121 0.18
122 0.15
123 0.16
124 0.21
125 0.19
126 0.24
127 0.27
128 0.27
129 0.29
130 0.34
131 0.31
132 0.29
133 0.31
134 0.28
135 0.29
136 0.29
137 0.32
138 0.3
139 0.29
140 0.25
141 0.2
142 0.17
143 0.16
144 0.16
145 0.12
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.07
152 0.07
153 0.06
154 0.07
155 0.08
156 0.1
157 0.1
158 0.11
159 0.12
160 0.12
161 0.15
162 0.15
163 0.16
164 0.19
165 0.23
166 0.3
167 0.37
168 0.42
169 0.47
170 0.5
171 0.54
172 0.6
173 0.64
174 0.58
175 0.6
176 0.59
177 0.54
178 0.54
179 0.48
180 0.39
181 0.31
182 0.31
183 0.25
184 0.21
185 0.2
186 0.18
187 0.16
188 0.14
189 0.13
190 0.12
191 0.08
192 0.06
193 0.06
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.04
199 0.04
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.09
212 0.1
213 0.16
214 0.17
215 0.19
216 0.2
217 0.21
218 0.25
219 0.25
220 0.26
221 0.24
222 0.26
223 0.24
224 0.24
225 0.27
226 0.23
227 0.2
228 0.21
229 0.24
230 0.27
231 0.31
232 0.39
233 0.44
234 0.53
235 0.64
236 0.72
237 0.76
238 0.81
239 0.83
240 0.85
241 0.82
242 0.79
243 0.76
244 0.75
245 0.74
246 0.7
247 0.74
248 0.71
249 0.74
250 0.73
251 0.66
252 0.65
253 0.64
254 0.65
255 0.65
256 0.64
257 0.61
258 0.62
259 0.64
260 0.55
261 0.49
262 0.42
263 0.34
264 0.28
265 0.21
266 0.16
267 0.14
268 0.14
269 0.12
270 0.11
271 0.11
272 0.11
273 0.11
274 0.11
275 0.1
276 0.1
277 0.11
278 0.16
279 0.16
280 0.2
281 0.21
282 0.2
283 0.2
284 0.2
285 0.2
286 0.16
287 0.15
288 0.13
289 0.13
290 0.13
291 0.15
292 0.19
293 0.25
294 0.28
295 0.3
296 0.3
297 0.35
298 0.39
299 0.45
300 0.49
301 0.44
302 0.46
303 0.52
304 0.54
305 0.5
306 0.46
307 0.4
308 0.36
309 0.34
310 0.29
311 0.25
312 0.22
313 0.22
314 0.28