FuNGI

A0A409WGU8

Protein Details

Accession

A0A409WGU8

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-30	SMALLFHPKKTPRKDTQAPSPKPGS	Hydrophilic
156-177	KGKAGGAKKRFQRKTRQVFFVP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
151-169	GGAKDKGKAGGAKKRFQRK
578-581	LKKR

Subcellular Location(s)

mito_nucl 11.166, nucl 11, mito 11

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MAPKASMALLFHPKKTPRKDTQAPSPKPGSSTPNNRAKPSQPPKKEDEDEEGLKLPEGPFQEYKLLSSVLNGWRYDVMKFDSRRPVDIFQWTPPIKLNRKDLRRDDSSTNAVPEAVGPMLGADGKPVIGVDGKMVMVDAEGRPIHASGGAGGAKDKGKAGGAKKRFQRKTRQVFFVPDEVRQLRREERYPWVLEDSSPSQNEVWTGQMEDATKAETHALFMPAANQVFKFVPAHRWYKFQKRLKHDLPTDTANVETLYNLNQKRDPQQWLATRKGKAPSSATTAMFKAEAEGRSGGSSSGGQSLGPGGRKLKTVDSGMDHLFDDGEDGDGSQRRRKRELGEEGDLDEQIYEEDFADDDEKMEVDEDDEEAKEIEERLKKEYKNANKQREAGVDESDDDDDEPGQSKQEKAMQKLIRKTEGNDAYDSEDEKNPYFSGEEEEEEEEEVIPTATSAIQEQQQQQVESRSQTPKPTPTPRPVAAVGASAPASRAASPTLSPGHGGHSVVAKRATSPKIPKPKTNISRGNSPLGGQSPLGGSRATSPAADVVNGQKTGMKRKADESPEKATSNNHANGGVPKLKKRKPVAAVFPIAVSSAELESMLVDWLRNTANATTRDCIHHFTPYLTDPDKKQEFSSMVRKHAILKNGTLSIKRAGSSAPSPPGS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.56
2	0.64
3	0.68
4	0.67
5	0.74
6	0.81
7	0.82
8	0.85
9	0.86
10	0.83
11	0.8
12	0.76
13	0.67
14	0.61
15	0.57
16	0.54
17	0.53
18	0.57
19	0.59
20	0.64
21	0.67
22	0.68
23	0.69
24	0.66
25	0.67
26	0.68
27	0.69
28	0.68
29	0.7
30	0.72
31	0.76
32	0.76
33	0.7
34	0.67
35	0.63
36	0.57
37	0.53
38	0.48
39	0.39
40	0.34
41	0.31
42	0.24
43	0.2
44	0.19
45	0.22
46	0.22
47	0.24
48	0.29
49	0.27
50	0.28
51	0.26
52	0.25
53	0.19
54	0.19
55	0.24
56	0.25
57	0.29
58	0.27
59	0.26
60	0.29
61	0.3
62	0.29
63	0.26
64	0.25
65	0.28
66	0.31
67	0.37
68	0.44
69	0.44
70	0.48
71	0.49
72	0.48
73	0.45
74	0.51
75	0.46
76	0.4
77	0.48
78	0.44
79	0.41
80	0.43
81	0.48
82	0.47
83	0.51
84	0.58
85	0.58
86	0.66
87	0.75
88	0.77
89	0.75
90	0.74
91	0.72
92	0.67
93	0.63
94	0.61
95	0.53
96	0.46
97	0.38
98	0.32
99	0.26
100	0.22
101	0.17
102	0.11
103	0.08
104	0.06
105	0.06
106	0.06
107	0.07
108	0.06
109	0.05
110	0.05
111	0.05
112	0.05
113	0.05
114	0.06
115	0.06
116	0.07
117	0.07
118	0.08
119	0.08
120	0.08
121	0.08
122	0.07
123	0.06
124	0.08
125	0.07
126	0.1
127	0.1
128	0.11
129	0.12
130	0.12
131	0.12
132	0.11
133	0.11
134	0.07
135	0.11
136	0.11
137	0.1
138	0.1
139	0.13
140	0.13
141	0.13
142	0.14
143	0.11
144	0.13
145	0.18
146	0.25
147	0.33
148	0.38
149	0.45
150	0.53
151	0.63
152	0.69
153	0.71
154	0.75
155	0.76
156	0.81
157	0.82
158	0.81
159	0.74
160	0.72
161	0.68
162	0.65
163	0.56
164	0.46
165	0.44
166	0.39
167	0.37
168	0.33
169	0.34
170	0.31
171	0.35
172	0.38
173	0.35
174	0.4
175	0.44
176	0.44
177	0.42
178	0.4
179	0.35
180	0.31
181	0.32
182	0.29
183	0.26
184	0.25
185	0.24
186	0.2
187	0.2
188	0.2
189	0.16
190	0.14
191	0.1
192	0.1
193	0.09
194	0.11
195	0.11
196	0.11
197	0.11
198	0.1
199	0.1
200	0.09
201	0.11
202	0.09
203	0.1
204	0.1
205	0.11
206	0.1
207	0.1
208	0.11
209	0.12
210	0.13
211	0.12
212	0.1
213	0.11
214	0.11
215	0.13
216	0.13
217	0.12
218	0.19
219	0.23
220	0.3
221	0.29
222	0.36
223	0.4
224	0.49
225	0.58
226	0.58
227	0.62
228	0.65
229	0.73
230	0.73
231	0.76
232	0.7
233	0.65
234	0.61
235	0.55
236	0.48
237	0.38
238	0.32
239	0.23
240	0.19
241	0.13
242	0.1
243	0.07
244	0.09
245	0.14
246	0.15
247	0.17
248	0.19
249	0.22
250	0.27
251	0.32
252	0.34
253	0.32
254	0.38
255	0.44
256	0.47
257	0.52
258	0.53
259	0.49
260	0.49
261	0.5
262	0.44
263	0.4
264	0.38
265	0.33
266	0.34
267	0.35
268	0.32
269	0.28
270	0.27
271	0.24
272	0.21
273	0.18
274	0.12
275	0.12
276	0.11
277	0.11
278	0.11
279	0.11
280	0.11
281	0.12
282	0.1
283	0.08
284	0.07
285	0.06
286	0.08
287	0.07
288	0.07
289	0.07
290	0.08
291	0.09
292	0.1
293	0.1
294	0.1
295	0.11
296	0.13
297	0.15
298	0.15
299	0.16
300	0.17
301	0.18
302	0.18
303	0.2
304	0.19
305	0.18
306	0.16
307	0.13
308	0.11
309	0.09
310	0.08
311	0.05
312	0.05
313	0.04
314	0.04
315	0.05
316	0.08
317	0.09
318	0.14
319	0.18
320	0.2
321	0.24
322	0.28
323	0.32
324	0.38
325	0.47
326	0.48
327	0.48
328	0.45
329	0.43
330	0.4
331	0.35
332	0.26
333	0.16
334	0.09
335	0.06
336	0.05
337	0.04
338	0.03
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.04
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.05
355	0.06
356	0.05
357	0.06
358	0.05
359	0.06
360	0.1
361	0.14
362	0.15
363	0.2
364	0.26
365	0.26
366	0.34
367	0.42
368	0.48
369	0.55
370	0.64
371	0.68
372	0.67
373	0.69
374	0.65
375	0.59
376	0.52
377	0.42
378	0.34
379	0.25
380	0.2
381	0.19
382	0.16
383	0.12
384	0.09
385	0.08
386	0.06
387	0.06
388	0.07
389	0.06
390	0.08
391	0.09
392	0.09
393	0.11
394	0.18
395	0.22
396	0.24
397	0.34
398	0.38
399	0.43
400	0.49
401	0.51
402	0.5
403	0.47
404	0.46
405	0.46
406	0.46
407	0.42
408	0.36
409	0.33
410	0.29
411	0.29
412	0.28
413	0.21
414	0.17
415	0.17
416	0.17
417	0.17
418	0.14
419	0.14
420	0.13
421	0.11
422	0.13
423	0.13
424	0.13
425	0.14
426	0.15
427	0.14
428	0.14
429	0.14
430	0.1
431	0.08
432	0.08
433	0.06
434	0.05
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.05
439	0.05
440	0.07
441	0.09
442	0.14
443	0.16
444	0.21
445	0.23
446	0.24
447	0.25
448	0.27
449	0.27
450	0.25
451	0.3
452	0.3
453	0.3
454	0.35
455	0.38
456	0.42
457	0.48
458	0.55
459	0.56
460	0.58
461	0.63
462	0.59
463	0.59
464	0.52
465	0.46
466	0.37
467	0.31
468	0.24
469	0.18
470	0.16
471	0.11
472	0.11
473	0.09
474	0.09
475	0.08
476	0.09
477	0.09
478	0.1
479	0.1
480	0.13
481	0.14
482	0.14
483	0.15
484	0.15
485	0.17
486	0.18
487	0.18
488	0.16
489	0.2
490	0.2
491	0.21
492	0.22
493	0.19
494	0.2
495	0.26
496	0.29
497	0.31
498	0.38
499	0.45
500	0.55
501	0.6
502	0.64
503	0.66
504	0.73
505	0.73
506	0.75
507	0.75
508	0.68
509	0.73
510	0.7
511	0.67
512	0.56
513	0.49
514	0.42
515	0.34
516	0.31
517	0.22
518	0.19
519	0.15
520	0.15
521	0.15
522	0.12
523	0.1
524	0.12
525	0.15
526	0.15
527	0.13
528	0.13
529	0.15
530	0.15
531	0.15
532	0.13
533	0.16
534	0.19
535	0.19
536	0.19
537	0.19
538	0.22
539	0.31
540	0.36
541	0.36
542	0.34
543	0.39
544	0.48
545	0.54
546	0.6
547	0.57
548	0.58
549	0.58
550	0.57
551	0.53
552	0.47
553	0.44
554	0.43
555	0.41
556	0.34
557	0.29
558	0.3
559	0.32
560	0.36
561	0.37
562	0.32
563	0.38
564	0.46
565	0.51
566	0.59
567	0.63
568	0.67
569	0.68
570	0.74
571	0.76
572	0.74
573	0.72
574	0.64
575	0.57
576	0.47
577	0.38
578	0.29
579	0.19
580	0.12
581	0.08
582	0.07
583	0.07
584	0.07
585	0.06
586	0.07
587	0.07
588	0.06
589	0.06
590	0.06
591	0.09
592	0.1
593	0.1
594	0.12
595	0.14
596	0.21
597	0.25
598	0.3
599	0.3
600	0.32
601	0.37
602	0.37
603	0.38
604	0.33
605	0.36
606	0.33
607	0.32
608	0.34
609	0.32
610	0.37
611	0.35
612	0.37
613	0.33
614	0.42
615	0.45
616	0.43
617	0.42
618	0.42
619	0.42
620	0.45
621	0.53
622	0.49
623	0.49
624	0.51
625	0.5
626	0.52
627	0.53
628	0.54
629	0.47
630	0.46
631	0.46
632	0.48
633	0.51
634	0.44
635	0.42
636	0.4
637	0.39
638	0.35
639	0.3
640	0.25
641	0.27
642	0.3
643	0.34

A0A409WGU8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer