Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409VM65

Protein Details
Accession A0A409VM65    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-61KKSKTTSAAARQKQKHKKDETPVNKKVREHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-50RQKQKHKK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003173  PC4_C  
IPR009044  ssDNA-bd_transcriptional_reg  
IPR045125  Sub1/Tcp4-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003713  F:transcription coactivator activity  
GO:0060261  P:positive regulation of transcription initiation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF02229  PC4  
Amino Acid Sequences MPKRKVSDAEEEDFITSEESSASFSGEDSAAEKKSKTTSAAARQKQKHKKDETPVNKKVREEVKEDDDGPSTKLELTESETIPEEVKIRTTSEGDKYIDLGKKKRAVARSFKGVPLIDIREFYGADGQEKPGKKGIALTLEQWQSLKSGASAIDKLLEGLKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.2
3 0.14
4 0.1
5 0.08
6 0.07
7 0.08
8 0.08
9 0.08
10 0.07
11 0.07
12 0.09
13 0.09
14 0.09
15 0.09
16 0.11
17 0.13
18 0.14
19 0.14
20 0.15
21 0.18
22 0.2
23 0.22
24 0.24
25 0.3
26 0.4
27 0.5
28 0.55
29 0.61
30 0.67
31 0.75
32 0.79
33 0.81
34 0.8
35 0.78
36 0.79
37 0.8
38 0.83
39 0.83
40 0.83
41 0.83
42 0.82
43 0.76
44 0.68
45 0.65
46 0.62
47 0.54
48 0.49
49 0.44
50 0.41
51 0.4
52 0.4
53 0.34
54 0.28
55 0.25
56 0.21
57 0.16
58 0.12
59 0.1
60 0.09
61 0.08
62 0.07
63 0.11
64 0.13
65 0.13
66 0.13
67 0.14
68 0.14
69 0.14
70 0.13
71 0.1
72 0.07
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.1
77 0.12
78 0.14
79 0.16
80 0.2
81 0.19
82 0.18
83 0.19
84 0.22
85 0.24
86 0.25
87 0.25
88 0.28
89 0.32
90 0.36
91 0.4
92 0.42
93 0.46
94 0.52
95 0.54
96 0.57
97 0.54
98 0.51
99 0.5
100 0.43
101 0.37
102 0.32
103 0.3
104 0.22
105 0.2
106 0.2
107 0.17
108 0.17
109 0.16
110 0.16
111 0.12
112 0.14
113 0.14
114 0.16
115 0.2
116 0.22
117 0.24
118 0.25
119 0.25
120 0.23
121 0.26
122 0.28
123 0.29
124 0.29
125 0.29
126 0.32
127 0.32
128 0.32
129 0.28
130 0.24
131 0.18
132 0.18
133 0.16
134 0.09
135 0.1
136 0.12
137 0.16
138 0.16
139 0.16
140 0.17
141 0.16
142 0.17
143 0.2