Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409X5X3

Protein Details
Accession A0A409X5X3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
71-95HTIRQMVRIARKTRRKPFKEIGNEVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
83-85TRR
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 10.333, mito 7, cyto 6.5, cyto_pero 4.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR038717  Tc1-like_DDE_dom  
IPR002492  Transposase_Tc1-like  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
GO:0006313  P:DNA transposition  
Pfam View protein in Pfam  
PF13358  DDE_3  
PF01498  HTH_Tnp_Tc3_2  
Amino Acid Sequences MSENRAPGCEHGTPVKNQLVGVIQATGNVAKAARITNMKYSTTRDIWQKYKKFGTTHNRPCSGRPLKVTDHTIRQMVRIARKTRRKPFKEIGNEVVPPLTDTTVRKVLARLGFHRRVARKVPFLTKAHKITRICWARLYKSFTDKNWAQVIWSDEAYVYLGDNRGRVYVTRRSDEEYIEECLVPTFKQSSVRVMIWGCIMDGQKGPLVLLEYPGGKGGGMNSSRYQEQVLEGVLVEFYNKMKKKNTKVIFQQDGAPSHTSKTTQCWFSKHDIPLLFHPPSSPDLNPIEPVWHELKKRLRTLPHPPNTVNQLKAAIQTAWDEMPIEDINKHIKSMSIRVKAILEARGGHTRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.43
3 0.38
4 0.36
5 0.35
6 0.3
7 0.27
8 0.25
9 0.2
10 0.15
11 0.15
12 0.16
13 0.14
14 0.11
15 0.11
16 0.1
17 0.08
18 0.1
19 0.11
20 0.15
21 0.19
22 0.22
23 0.29
24 0.33
25 0.36
26 0.37
27 0.41
28 0.43
29 0.42
30 0.44
31 0.45
32 0.48
33 0.55
34 0.62
35 0.63
36 0.64
37 0.68
38 0.69
39 0.64
40 0.66
41 0.68
42 0.69
43 0.73
44 0.75
45 0.74
46 0.69
47 0.69
48 0.7
49 0.67
50 0.61
51 0.56
52 0.53
53 0.52
54 0.56
55 0.61
56 0.55
57 0.55
58 0.52
59 0.51
60 0.45
61 0.41
62 0.41
63 0.39
64 0.42
65 0.43
66 0.48
67 0.53
68 0.64
69 0.72
70 0.77
71 0.82
72 0.79
73 0.8
74 0.81
75 0.82
76 0.81
77 0.77
78 0.73
79 0.67
80 0.61
81 0.52
82 0.44
83 0.33
84 0.24
85 0.18
86 0.13
87 0.11
88 0.11
89 0.16
90 0.21
91 0.21
92 0.21
93 0.21
94 0.26
95 0.28
96 0.31
97 0.31
98 0.36
99 0.4
100 0.43
101 0.5
102 0.47
103 0.47
104 0.51
105 0.52
106 0.49
107 0.49
108 0.52
109 0.52
110 0.52
111 0.52
112 0.52
113 0.53
114 0.51
115 0.53
116 0.47
117 0.42
118 0.49
119 0.5
120 0.44
121 0.43
122 0.43
123 0.4
124 0.45
125 0.49
126 0.42
127 0.43
128 0.46
129 0.4
130 0.44
131 0.4
132 0.39
133 0.36
134 0.33
135 0.25
136 0.24
137 0.26
138 0.2
139 0.19
140 0.14
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.08
145 0.06
146 0.05
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.08
152 0.08
153 0.09
154 0.13
155 0.19
156 0.22
157 0.24
158 0.25
159 0.28
160 0.29
161 0.28
162 0.27
163 0.21
164 0.2
165 0.18
166 0.17
167 0.13
168 0.12
169 0.12
170 0.09
171 0.08
172 0.07
173 0.08
174 0.13
175 0.14
176 0.17
177 0.2
178 0.21
179 0.22
180 0.2
181 0.2
182 0.15
183 0.14
184 0.11
185 0.1
186 0.1
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.07
194 0.08
195 0.07
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.11
206 0.11
207 0.13
208 0.14
209 0.16
210 0.17
211 0.17
212 0.17
213 0.12
214 0.12
215 0.11
216 0.1
217 0.08
218 0.08
219 0.07
220 0.07
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.14
226 0.16
227 0.2
228 0.28
229 0.37
230 0.46
231 0.56
232 0.61
233 0.62
234 0.7
235 0.76
236 0.72
237 0.65
238 0.62
239 0.55
240 0.51
241 0.45
242 0.38
243 0.28
244 0.24
245 0.25
246 0.21
247 0.18
248 0.23
249 0.26
250 0.31
251 0.33
252 0.36
253 0.39
254 0.43
255 0.5
256 0.46
257 0.46
258 0.42
259 0.42
260 0.44
261 0.46
262 0.4
263 0.32
264 0.31
265 0.27
266 0.27
267 0.28
268 0.23
269 0.21
270 0.24
271 0.25
272 0.26
273 0.24
274 0.23
275 0.2
276 0.24
277 0.24
278 0.25
279 0.25
280 0.32
281 0.41
282 0.46
283 0.53
284 0.56
285 0.59
286 0.62
287 0.71
288 0.75
289 0.75
290 0.73
291 0.68
292 0.67
293 0.67
294 0.65
295 0.55
296 0.46
297 0.4
298 0.35
299 0.35
300 0.32
301 0.23
302 0.19
303 0.19
304 0.19
305 0.16
306 0.15
307 0.14
308 0.11
309 0.15
310 0.14
311 0.14
312 0.12
313 0.15
314 0.22
315 0.21
316 0.22
317 0.19
318 0.22
319 0.25
320 0.34
321 0.42
322 0.43
323 0.43
324 0.45
325 0.46
326 0.46
327 0.45
328 0.39
329 0.31
330 0.26
331 0.3