Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A409WLR0

Protein Details
Accession A0A409WLR0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
296-320AATQREPKPSPAKKIRGKKAAAFLGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
302-315PKPSPAKKIRGKKA
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 12, cyto 10.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029069  HotDog_dom_sf  
IPR029004  L28e/Mak16  
IPR002672  Ribosomal_L28e  
IPR006683  Thioestr_dom  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF03061  4HBT  
PF01778  Ribosomal_L28e  
CDD cd00586  4HBT  
Amino Acid Sequences MAEPDPKSRTRSDYAFFLSYRTRWSDNDQYSHINNSIYYHLFDSIVNAYLIEKCGLDPASSPLIGLVVFSYCNFFSPLSFPQVLDLGLRVNKLGNSSVSYEVGVFEEGKDAPAAVGGYTHVFVGSVSRKSAPMAKETKEGLGKLLNNQLYSLCSATEPIWPCVRRREARSSENSLKMSSDLQWLLLRKNNSFIVKRVPEGPVFSKEPGNLRNLNSFKFSGLANSKTIDVKEQNGSIKIVTRKTKASPQAVGPAYATTSVRPRSGGRRALGVAAGIAKRGYRSDLRTATLARVSALAATQREPKPSPAKKIRGKKAAAFLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.49
3 0.45
4 0.42
5 0.4
6 0.35
7 0.36
8 0.35
9 0.32
10 0.31
11 0.39
12 0.45
13 0.48
14 0.52
15 0.5
16 0.5
17 0.49
18 0.5
19 0.44
20 0.34
21 0.28
22 0.25
23 0.26
24 0.22
25 0.22
26 0.19
27 0.18
28 0.18
29 0.17
30 0.18
31 0.15
32 0.15
33 0.14
34 0.12
35 0.12
36 0.12
37 0.14
38 0.12
39 0.1
40 0.09
41 0.12
42 0.13
43 0.12
44 0.12
45 0.15
46 0.18
47 0.17
48 0.17
49 0.13
50 0.13
51 0.12
52 0.11
53 0.08
54 0.05
55 0.05
56 0.06
57 0.08
58 0.08
59 0.09
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.14
64 0.17
65 0.2
66 0.21
67 0.2
68 0.19
69 0.2
70 0.19
71 0.15
72 0.13
73 0.1
74 0.11
75 0.11
76 0.1
77 0.1
78 0.11
79 0.12
80 0.13
81 0.12
82 0.13
83 0.15
84 0.17
85 0.16
86 0.16
87 0.14
88 0.13
89 0.12
90 0.11
91 0.08
92 0.07
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.07
97 0.07
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.04
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.06
106 0.06
107 0.05
108 0.04
109 0.04
110 0.08
111 0.11
112 0.11
113 0.12
114 0.13
115 0.14
116 0.15
117 0.2
118 0.18
119 0.21
120 0.25
121 0.26
122 0.29
123 0.29
124 0.31
125 0.28
126 0.27
127 0.21
128 0.2
129 0.19
130 0.18
131 0.23
132 0.21
133 0.19
134 0.19
135 0.18
136 0.15
137 0.15
138 0.13
139 0.07
140 0.06
141 0.07
142 0.08
143 0.12
144 0.13
145 0.14
146 0.19
147 0.2
148 0.21
149 0.27
150 0.34
151 0.34
152 0.38
153 0.45
154 0.47
155 0.53
156 0.57
157 0.59
158 0.57
159 0.57
160 0.52
161 0.43
162 0.36
163 0.31
164 0.26
165 0.19
166 0.16
167 0.11
168 0.12
169 0.14
170 0.15
171 0.16
172 0.18
173 0.19
174 0.16
175 0.2
176 0.23
177 0.25
178 0.26
179 0.26
180 0.31
181 0.31
182 0.31
183 0.31
184 0.29
185 0.25
186 0.27
187 0.29
188 0.25
189 0.25
190 0.26
191 0.25
192 0.24
193 0.27
194 0.26
195 0.28
196 0.26
197 0.26
198 0.33
199 0.33
200 0.33
201 0.32
202 0.3
203 0.26
204 0.23
205 0.21
206 0.19
207 0.21
208 0.22
209 0.2
210 0.2
211 0.21
212 0.22
213 0.22
214 0.21
215 0.19
216 0.2
217 0.22
218 0.24
219 0.25
220 0.25
221 0.26
222 0.21
223 0.26
224 0.27
225 0.31
226 0.33
227 0.33
228 0.36
229 0.4
230 0.48
231 0.5
232 0.51
233 0.48
234 0.46
235 0.51
236 0.48
237 0.45
238 0.36
239 0.29
240 0.24
241 0.22
242 0.19
243 0.12
244 0.17
245 0.19
246 0.2
247 0.21
248 0.25
249 0.31
250 0.4
251 0.45
252 0.4
253 0.43
254 0.43
255 0.42
256 0.38
257 0.3
258 0.22
259 0.19
260 0.18
261 0.13
262 0.13
263 0.12
264 0.12
265 0.13
266 0.18
267 0.19
268 0.24
269 0.33
270 0.37
271 0.39
272 0.41
273 0.42
274 0.41
275 0.38
276 0.33
277 0.24
278 0.21
279 0.18
280 0.15
281 0.15
282 0.15
283 0.14
284 0.16
285 0.25
286 0.26
287 0.32
288 0.34
289 0.41
290 0.48
291 0.54
292 0.62
293 0.64
294 0.72
295 0.76
296 0.85
297 0.87
298 0.86
299 0.85
300 0.81