Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A409XJG1

Protein Details
Accession A0A409XJG1    Localization Confidence High Confidence Score 25
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
55-80SGRFRSPPQYRSRRSPPPRRAHAPLVHydrophilic
206-229RDRDRDRDYRDRDHRRDRDRDFRDBasic
257-281GRYSPEYRRRRSYSRSPPPRGSSPPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
67-73RRSPPPR
199-281SGREGRDRDRDRDRDYRDRDHRRDRDRDFRDRDRDRDRDNYGRDKDWRDRRSPPPSKSGRYSPEYRRRRSYSRSPPPRGSSPP
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12363  RRM_TRA2  
Amino Acid Sequences YNDPAAPAVDPYSDAYNAPPAPAPAERDPLPPRGRSRSRSPVRSAANGNGTNGDSGRFRSPPQYRSRRSPPPRRAHAPLVSPFQHFHSWIIRTNKSKQQPNPSSVLGVFGLSIRTQERDLEDEFSRFGRVEKVTIVYDQRSDRSRGFGFIRMSTVEEATKCIETLNGIELNGRRIRVDYSVTDRPHASTPGEYMGHRRSGREGRDRDRDRDRDYRDRDHRRDRDRDFRDRDRDRDRDNYGRDKDWRDRRSPPPSKSGRYSPEYRRRRSYSRSPPPRGSSPPRASNGGGRDYDAPVSNASAPAPPSESNGTRW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.21
4 0.21
5 0.21
6 0.2
7 0.17
8 0.2
9 0.23
10 0.27
11 0.25
12 0.3
13 0.31
14 0.37
15 0.4
16 0.45
17 0.47
18 0.47
19 0.5
20 0.55
21 0.62
22 0.61
23 0.67
24 0.69
25 0.74
26 0.76
27 0.75
28 0.74
29 0.71
30 0.71
31 0.65
32 0.6
33 0.59
34 0.52
35 0.46
36 0.39
37 0.35
38 0.29
39 0.25
40 0.21
41 0.13
42 0.15
43 0.18
44 0.17
45 0.18
46 0.27
47 0.34
48 0.4
49 0.5
50 0.58
51 0.6
52 0.68
53 0.75
54 0.77
55 0.81
56 0.84
57 0.84
58 0.84
59 0.87
60 0.85
61 0.82
62 0.79
63 0.74
64 0.7
65 0.64
66 0.6
67 0.53
68 0.48
69 0.42
70 0.37
71 0.34
72 0.28
73 0.25
74 0.24
75 0.25
76 0.3
77 0.36
78 0.38
79 0.41
80 0.47
81 0.53
82 0.55
83 0.61
84 0.61
85 0.66
86 0.67
87 0.66
88 0.64
89 0.56
90 0.49
91 0.41
92 0.35
93 0.24
94 0.17
95 0.13
96 0.09
97 0.09
98 0.07
99 0.08
100 0.07
101 0.08
102 0.09
103 0.1
104 0.11
105 0.13
106 0.15
107 0.17
108 0.18
109 0.17
110 0.17
111 0.16
112 0.15
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.12
117 0.13
118 0.13
119 0.15
120 0.15
121 0.16
122 0.18
123 0.14
124 0.17
125 0.17
126 0.18
127 0.19
128 0.21
129 0.2
130 0.23
131 0.22
132 0.22
133 0.23
134 0.26
135 0.25
136 0.22
137 0.23
138 0.19
139 0.19
140 0.16
141 0.15
142 0.11
143 0.09
144 0.1
145 0.1
146 0.09
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.09
156 0.1
157 0.14
158 0.14
159 0.14
160 0.12
161 0.12
162 0.14
163 0.14
164 0.16
165 0.14
166 0.2
167 0.27
168 0.27
169 0.28
170 0.27
171 0.27
172 0.26
173 0.25
174 0.2
175 0.14
176 0.14
177 0.16
178 0.17
179 0.15
180 0.18
181 0.19
182 0.25
183 0.25
184 0.24
185 0.27
186 0.33
187 0.4
188 0.45
189 0.49
190 0.49
191 0.59
192 0.63
193 0.63
194 0.66
195 0.65
196 0.62
197 0.64
198 0.65
199 0.64
200 0.66
201 0.7
202 0.71
203 0.76
204 0.78
205 0.8
206 0.81
207 0.8
208 0.83
209 0.81
210 0.81
211 0.78
212 0.79
213 0.77
214 0.77
215 0.78
216 0.75
217 0.76
218 0.74
219 0.73
220 0.68
221 0.68
222 0.66
223 0.64
224 0.63
225 0.65
226 0.6
227 0.59
228 0.59
229 0.59
230 0.62
231 0.64
232 0.64
233 0.61
234 0.65
235 0.69
236 0.75
237 0.77
238 0.72
239 0.72
240 0.74
241 0.74
242 0.72
243 0.71
244 0.67
245 0.64
246 0.67
247 0.68
248 0.7
249 0.73
250 0.74
251 0.75
252 0.75
253 0.77
254 0.78
255 0.78
256 0.79
257 0.8
258 0.84
259 0.83
260 0.84
261 0.83
262 0.82
263 0.8
264 0.78
265 0.77
266 0.75
267 0.75
268 0.7
269 0.67
270 0.61
271 0.59
272 0.55
273 0.51
274 0.42
275 0.36
276 0.35
277 0.33
278 0.34
279 0.29
280 0.24
281 0.19
282 0.21
283 0.2
284 0.18
285 0.17
286 0.17
287 0.16
288 0.17
289 0.2
290 0.18
291 0.21
292 0.27