FuNGI

A0A437AM95

Protein Details

Accession

A0A437AM95

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
93-129	MIKCLNCKNYKIRSQKKDEKKSKKKSKEEETESDFNE	Hydrophilic
1177-1196	NPNPHQKKFKQIKVNNSFID	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
105-119	RSQKKDEKKSKKKSK

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 14.5, cyto 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015699 DNA-dir_RNA_pol1_lsu_N IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR000722 RNA_pol_asu IPR006592 RNA_pol_N IPR007080 RNA_pol_Rpb1_1 IPR007066 RNA_pol_Rpb1_3 IPR042102 RNA_pol_Rpb1_3_sf IPR007083 RNA_pol_Rpb1_4 IPR007081 RNA_pol_Rpb1_5 IPR044893 RNA_pol_Rpb1_clamp_domain IPR038120 Rpb1_funnel_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04997 RNA_pol_Rpb1_1 PF00623 RNA_pol_Rpb1_2 PF04983 RNA_pol_Rpb1_3 PF05000 RNA_pol_Rpb1_4 PF04998 RNA_pol_Rpb1_5
CDD	cd01435 RNAP_I_RPA1_N

Amino Acid Sequences

MLFKPKGISFDLYTDEELLNICTVEITENVSLDNLGHPIKNGLHDERMGPLSQGSFCHSCKQGYFSCPGHFGYIKTDEYIKPLTVDLVMNVLMIKCLNCKNYKIRSQKKDEKKSKKKSKEEETESDFNEKEKLSELEEFAEKEKLSEEEDLSEEYQSDKNVESLTIYELIKETEKFNLSAVKRLRKLIGIKKCMHCLTQTRSIHKINNELFIKEEKLLVEKIKEILGKKFDKCFSKVVLVTPNKFRPLNFMGNKVYEDSKNGLYSKILKEKNVSLISQIDLCIKSLIEKKEGIFRQNVXGKRVNFSARSVISPDPNLETGEIGLPLIFAKKLSFPERVNEFNFNRLFLAVINGNKYPGATHLSCDDTKIDLSFLDENRRKSLAYQLKLGNKVVHRHVSDKDYLLVNRQPSLHKPSLMAHKVKVLQGEKTIRMHYANCNSYNADFDGDEMNLHLVQDYLAMSEAKNILSTDNNYKSDTNNKPIRGLVQDHIVGATLLTMKDSFFTQSEYFYLISSSEKKNKKIKSAILRPVILFTGKQVVSNLLINLNTKITFTLKSKVELEEVNFKNSHLLTGVLDKNTLGPSSFSLPDLVGKDHNLILSSFSKLINRYLIKYGFTLRINDLYLNDLGEKERLKEIKNSILQTEALYNLTNQNYTSFNLEKEDSLSQNGDLSEEKNKEPEKKNKLDDEKERVNYLNNNLYWNEEKYEEMSSLFKNTMNKFTTSILNTSMENTLIPFPYNNLSLIVLSGAKGSLVNISQICCLLGQQELEGKRVPLMKNNLTLQILSNNKEGSSIFESEVEKGGFIFDRFLTGIKIHSFFFHCMAGREGLIDTAVKTARSGYLQRCLVKHLEGLVVNYNGTVLNNSYSLISYQSKKESGTPVGLIAAQSIGEPSTQMTLNTFHLAGVGSKNVTLGIPRLREILMVNRTNKKYVVVKNTNFNSFFTKLKEILKKVEIQESFEERKIVKVKLELKEKIVEEVCAILNEKFLLLLNKKIKKVIQERVSIEANIVKEEQNEEINEEEDVFNENSEKSESVSEESSLSFNDEELNEENNFREKRIKVEENKKLKGKIVNKLKLSSSDDCIFLECVVLNNSELILYPFIIDTLESIKLKESEVTNVIKDTKEGITTVEGCGLNYMTKFVLENIKYDKENDSEDFLVNNSNEEVLKEVEEIIKVMNPNPHQKKFKQIKVNNSFIDLIDKIFLTTYSNDIQSVNTVLGLEAGRTVLIKELKNVFDCYGISIDINHLNLIGDYMCRSGNIKAFNRNSFKDEDCLIQRMSFESTYSVLKNSLKKNIKINGPSSKQLIGGIIKEECEIIYDLNN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.26
3	0.22
4	0.19
5	0.17
6	0.13
7	0.1
8	0.09
9	0.07
10	0.08
11	0.09
12	0.09
13	0.12
14	0.12
15	0.12
16	0.13
17	0.13
18	0.13
19	0.12
20	0.13
21	0.12
22	0.12
23	0.13
24	0.13
25	0.17
26	0.19
27	0.23
28	0.28
29	0.29
30	0.32
31	0.33
32	0.33
33	0.34
34	0.34
35	0.3
36	0.25
37	0.22
38	0.2
39	0.2
40	0.2
41	0.22
42	0.24
43	0.25
44	0.31
45	0.32
46	0.33
47	0.33
48	0.38
49	0.38
50	0.38
51	0.44
52	0.41
53	0.42
54	0.42
55	0.41
56	0.4
57	0.36
58	0.32
59	0.32
60	0.34
61	0.31
62	0.3
63	0.33
64	0.28
65	0.31
66	0.33
67	0.27
68	0.23
69	0.22
70	0.21
71	0.19
72	0.19
73	0.14
74	0.13
75	0.13
76	0.11
77	0.12
78	0.1
79	0.09
80	0.09
81	0.09
82	0.12
83	0.18
84	0.24
85	0.27
86	0.34
87	0.43
88	0.52
89	0.61
90	0.68
91	0.73
92	0.77
93	0.84
94	0.88
95	0.9
96	0.92
97	0.93
98	0.93
99	0.93
100	0.95
101	0.95
102	0.95
103	0.95
104	0.94
105	0.94
106	0.93
107	0.91
108	0.88
109	0.85
110	0.8
111	0.72
112	0.66
113	0.55
114	0.45
115	0.4
116	0.31
117	0.24
118	0.22
119	0.21
120	0.2
121	0.23
122	0.23
123	0.24
124	0.26
125	0.26
126	0.24
127	0.26
128	0.22
129	0.19
130	0.19
131	0.17
132	0.18
133	0.2
134	0.19
135	0.18
136	0.19
137	0.21
138	0.2
139	0.19
140	0.16
141	0.15
142	0.16
143	0.14
144	0.15
145	0.13
146	0.14
147	0.14
148	0.14
149	0.13
150	0.12
151	0.14
152	0.16
153	0.15
154	0.15
155	0.15
156	0.16
157	0.18
158	0.18
159	0.17
160	0.18
161	0.21
162	0.2
163	0.21
164	0.28
165	0.26
166	0.34
167	0.4
168	0.44
169	0.46
170	0.49
171	0.5
172	0.48
173	0.56
174	0.58
175	0.6
176	0.59
177	0.64
178	0.65
179	0.7
180	0.66
181	0.59
182	0.54
183	0.52
184	0.5
185	0.52
186	0.53
187	0.51
188	0.56
189	0.59
190	0.59
191	0.55
192	0.57
193	0.49
194	0.53
195	0.49
196	0.43
197	0.41
198	0.38
199	0.36
200	0.28
201	0.27
202	0.18
203	0.19
204	0.22
205	0.22
206	0.21
207	0.2
208	0.21
209	0.23
210	0.26
211	0.25
212	0.29
213	0.34
214	0.38
215	0.4
216	0.46
217	0.49
218	0.51
219	0.52
220	0.5
221	0.46
222	0.47
223	0.45
224	0.42
225	0.46
226	0.46
227	0.48
228	0.51
229	0.52
230	0.5
231	0.49
232	0.45
233	0.43
234	0.44
235	0.49
236	0.44
237	0.45
238	0.44
239	0.45
240	0.46
241	0.4
242	0.37
243	0.27
244	0.27
245	0.25
246	0.24
247	0.25
248	0.25
249	0.23
250	0.22
251	0.28
252	0.31
253	0.37
254	0.37
255	0.36
256	0.39
257	0.42
258	0.49
259	0.45
260	0.38
261	0.31
262	0.31
263	0.29
264	0.26
265	0.23
266	0.18
267	0.16
268	0.16
269	0.14
270	0.12
271	0.16
272	0.22
273	0.24
274	0.23
275	0.25
276	0.26
277	0.34
278	0.37
279	0.36
280	0.32
281	0.32
282	0.39
283	0.42
284	0.47
285	0.42
286	0.42
287	0.42
288	0.45
289	0.5
290	0.42
291	0.39
292	0.4
293	0.37
294	0.36
295	0.36
296	0.32
297	0.28
298	0.27
299	0.26
300	0.22
301	0.22
302	0.21
303	0.17
304	0.15
305	0.13
306	0.12
307	0.11
308	0.08
309	0.06
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.05
315	0.06
316	0.1
317	0.15
318	0.19
319	0.24
320	0.25
321	0.32
322	0.37
323	0.4
324	0.4
325	0.43
326	0.4
327	0.42
328	0.41
329	0.35
330	0.3
331	0.26
332	0.23
333	0.15
334	0.17
335	0.13
336	0.14
337	0.16
338	0.16
339	0.16
340	0.16
341	0.16
342	0.13
343	0.12
344	0.16
345	0.14
346	0.15
347	0.17
348	0.22
349	0.22
350	0.22
351	0.21
352	0.17
353	0.17
354	0.16
355	0.13
356	0.09
357	0.12
358	0.15
359	0.15
360	0.24
361	0.28
362	0.3
363	0.33
364	0.34
365	0.31
366	0.28
367	0.37
368	0.36
369	0.34
370	0.38
371	0.41
372	0.46
373	0.49
374	0.49
375	0.44
376	0.38
377	0.41
378	0.4
379	0.4
380	0.36
381	0.37
382	0.39
383	0.38
384	0.37
385	0.34
386	0.31
387	0.28
388	0.26
389	0.27
390	0.27
391	0.24
392	0.24
393	0.24
394	0.24
395	0.26
396	0.34
397	0.32
398	0.3
399	0.3
400	0.33
401	0.41
402	0.45
403	0.42
404	0.35
405	0.37
406	0.39
407	0.39
408	0.4
409	0.32
410	0.27
411	0.32
412	0.35
413	0.33
414	0.33
415	0.33
416	0.28
417	0.28
418	0.28
419	0.29
420	0.32
421	0.34
422	0.32
423	0.33
424	0.33
425	0.31
426	0.31
427	0.24
428	0.18
429	0.13
430	0.12
431	0.12
432	0.11
433	0.1
434	0.08
435	0.08
436	0.07
437	0.07
438	0.06
439	0.05
440	0.04
441	0.05
442	0.05
443	0.04
444	0.05
445	0.06
446	0.06
447	0.08
448	0.09
449	0.08
450	0.09
451	0.08
452	0.09
453	0.1
454	0.13
455	0.19
456	0.23
457	0.25
458	0.26
459	0.27
460	0.28
461	0.35
462	0.38
463	0.39
464	0.4
465	0.39
466	0.39
467	0.39
468	0.4
469	0.34
470	0.33
471	0.25
472	0.23
473	0.23
474	0.21
475	0.2
476	0.17
477	0.13
478	0.09
479	0.09
480	0.05
481	0.05
482	0.05
483	0.05
484	0.05
485	0.06
486	0.07
487	0.08
488	0.07
489	0.11
490	0.11
491	0.11
492	0.12
493	0.13
494	0.13
495	0.12
496	0.11
497	0.09
498	0.1
499	0.14
500	0.18
501	0.25
502	0.29
503	0.36
504	0.44
505	0.48
506	0.54
507	0.57
508	0.6
509	0.63
510	0.68
511	0.69
512	0.67
513	0.63
514	0.55
515	0.49
516	0.41
517	0.31
518	0.21
519	0.14
520	0.15
521	0.13
522	0.14
523	0.13
524	0.13
525	0.14
526	0.15
527	0.15
528	0.1
529	0.1
530	0.1
531	0.11
532	0.1
533	0.09
534	0.08
535	0.09
536	0.09
537	0.11
538	0.13
539	0.19
540	0.19
541	0.21
542	0.23
543	0.23
544	0.23
545	0.22
546	0.22
547	0.25
548	0.25
549	0.25
550	0.24
551	0.23
552	0.23
553	0.22
554	0.2
555	0.11
556	0.11
557	0.08
558	0.14
559	0.16
560	0.13
561	0.13
562	0.13
563	0.14
564	0.13
565	0.13
566	0.08
567	0.06
568	0.07
569	0.11
570	0.11
571	0.1
572	0.11
573	0.1
574	0.12
575	0.13
576	0.13
577	0.1
578	0.11
579	0.11
580	0.11
581	0.12
582	0.1
583	0.09
584	0.1
585	0.11
586	0.11
587	0.11
588	0.11
589	0.13
590	0.13
591	0.14
592	0.17
593	0.17
594	0.18
595	0.21
596	0.22
597	0.21
598	0.21
599	0.22
600	0.21
601	0.21
602	0.21
603	0.18
604	0.18
605	0.18
606	0.18
607	0.15
608	0.13
609	0.12
610	0.1
611	0.09
612	0.08
613	0.08
614	0.09
615	0.09
616	0.09
617	0.13
618	0.14
619	0.15
620	0.2
621	0.22
622	0.28
623	0.32
624	0.31
625	0.28
626	0.27
627	0.26
628	0.22
629	0.2
630	0.13
631	0.09
632	0.08
633	0.08
634	0.1
635	0.1
636	0.1
637	0.09
638	0.1
639	0.1
640	0.11
641	0.14
642	0.12
643	0.12
644	0.14
645	0.14
646	0.13
647	0.14
648	0.15
649	0.12
650	0.12
651	0.12
652	0.1
653	0.11
654	0.11
655	0.09
656	0.08
657	0.09
658	0.13
659	0.14
660	0.15
661	0.18
662	0.2
663	0.27
664	0.35
665	0.43
666	0.47
667	0.52
668	0.57
669	0.6
670	0.65
671	0.65
672	0.64
673	0.62
674	0.6
675	0.54
676	0.51
677	0.43
678	0.38
679	0.33
680	0.29
681	0.28
682	0.21
683	0.22
684	0.2
685	0.22
686	0.22
687	0.2
688	0.18
689	0.13
690	0.13
691	0.13
692	0.13
693	0.11
694	0.1
695	0.11
696	0.1
697	0.11
698	0.11
699	0.12
700	0.16
701	0.17
702	0.23
703	0.23
704	0.24
705	0.24
706	0.25
707	0.27
708	0.23
709	0.23
710	0.18
711	0.17
712	0.16
713	0.16
714	0.15
715	0.11
716	0.1
717	0.1
718	0.09
719	0.08
720	0.08
721	0.07
722	0.07
723	0.09
724	0.1
725	0.09
726	0.09
727	0.09
728	0.09
729	0.09
730	0.08
731	0.06
732	0.06
733	0.05
734	0.04
735	0.04
736	0.04
737	0.04
738	0.05
739	0.05
740	0.07
741	0.07
742	0.08
743	0.08
744	0.09
745	0.09
746	0.07
747	0.07
748	0.06
749	0.06
750	0.06
751	0.06
752	0.1
753	0.11
754	0.13
755	0.13
756	0.12
757	0.14
758	0.19
759	0.19
760	0.21
761	0.27
762	0.28
763	0.32
764	0.33
765	0.34
766	0.29
767	0.29
768	0.23
769	0.23
770	0.23
771	0.2
772	0.21
773	0.18
774	0.18
775	0.18
776	0.17
777	0.15
778	0.16
779	0.16
780	0.14
781	0.17
782	0.18
783	0.18
784	0.2
785	0.15
786	0.12
787	0.1
788	0.1
789	0.08
790	0.08
791	0.08
792	0.06
793	0.08
794	0.08
795	0.09
796	0.09
797	0.09
798	0.11
799	0.11
800	0.13
801	0.11
802	0.13
803	0.15
804	0.15
805	0.16
806	0.16
807	0.15
808	0.15
809	0.16
810	0.15
811	0.13
812	0.12
813	0.11
814	0.09
815	0.08
816	0.07
817	0.06
818	0.08
819	0.08
820	0.08
821	0.08
822	0.08
823	0.09
824	0.12
825	0.16
826	0.17
827	0.24
828	0.28
829	0.31
830	0.3
831	0.32
832	0.31
833	0.28
834	0.26
835	0.2
836	0.18
837	0.16
838	0.17
839	0.17
840	0.16
841	0.14
842	0.13
843	0.12
844	0.09
845	0.08
846	0.08
847	0.05
848	0.06
849	0.06
850	0.07
851	0.07
852	0.07
853	0.08
854	0.1
855	0.13
856	0.14
857	0.17
858	0.2
859	0.21
860	0.22
861	0.25
862	0.26
863	0.26
864	0.26
865	0.23
866	0.2
867	0.19
868	0.19
869	0.15
870	0.11
871	0.08
872	0.06
873	0.05
874	0.05
875	0.04
876	0.04
877	0.04
878	0.04
879	0.06
880	0.07
881	0.07
882	0.08
883	0.1
884	0.12
885	0.13
886	0.12
887	0.1
888	0.1
889	0.11
890	0.1
891	0.09
892	0.09
893	0.08
894	0.08
895	0.08
896	0.08
897	0.07
898	0.07
899	0.1
900	0.14
901	0.15
902	0.15
903	0.17
904	0.17
905	0.17
906	0.18
907	0.23
908	0.25
909	0.29
910	0.34
911	0.4
912	0.42
913	0.43
914	0.42
915	0.38
916	0.39
917	0.41
918	0.46
919	0.48
920	0.5
921	0.56
922	0.59
923	0.6
924	0.53
925	0.47
926	0.43
927	0.35
928	0.34
929	0.29
930	0.3
931	0.28
932	0.34
933	0.4
934	0.37
935	0.4
936	0.41
937	0.43
938	0.41
939	0.46
940	0.39
941	0.36
942	0.37
943	0.39
944	0.39
945	0.35
946	0.35
947	0.27
948	0.32
949	0.33
950	0.3
951	0.26
952	0.3
953	0.37
954	0.42
955	0.51
956	0.47
957	0.46
958	0.5
959	0.47
960	0.45
961	0.38
962	0.3
963	0.22
964	0.22
965	0.19
966	0.14
967	0.15
968	0.1
969	0.1
970	0.1
971	0.09
972	0.08
973	0.08
974	0.13
975	0.13
976	0.21
977	0.3
978	0.36
979	0.37
980	0.41
981	0.42
982	0.46
983	0.53
984	0.55
985	0.54
986	0.55
987	0.56
988	0.57
989	0.57
990	0.47
991	0.39
992	0.33
993	0.25
994	0.19
995	0.18
996	0.14
997	0.13
998	0.15
999	0.15
1000	0.15
1001	0.15
1002	0.14
1003	0.14
1004	0.14
1005	0.13
1006	0.13
1007	0.11
1008	0.09
1009	0.12
1010	0.11
1011	0.1
1012	0.11
1013	0.11
1014	0.11
1015	0.12
1016	0.12
1017	0.1
1018	0.12
1019	0.13
1020	0.15
1021	0.16
1022	0.15
1023	0.15
1024	0.15
1025	0.14
1026	0.12
1027	0.13
1028	0.1
1029	0.09
1030	0.11
1031	0.1
1032	0.12
1033	0.14
1034	0.16
1035	0.15
1036	0.16
1037	0.17
1038	0.22
1039	0.23
1040	0.21
1041	0.27
1042	0.25
1043	0.32
1044	0.41
1045	0.49
1046	0.51
1047	0.62
1048	0.7
1049	0.73
1050	0.79
1051	0.78
1052	0.72
1053	0.68
1054	0.67
1055	0.64
1056	0.64
1057	0.65
1058	0.65
1059	0.63
1060	0.64
1061	0.6
1062	0.57
1063	0.56
1064	0.5
1065	0.44
1066	0.38
1067	0.35
1068	0.32
1069	0.32
1070	0.26
1071	0.19
1072	0.17
1073	0.11
1074	0.1
1075	0.11
1076	0.11
1077	0.1
1078	0.09
1079	0.09
1080	0.09
1081	0.09
1082	0.09
1083	0.08
1084	0.07
1085	0.08
1086	0.07
1087	0.07
1088	0.07
1089	0.07
1090	0.06
1091	0.08
1092	0.13
1093	0.12
1094	0.13
1095	0.16
1096	0.16
1097	0.17
1098	0.2
1099	0.19
1100	0.19
1101	0.24
1102	0.26
1103	0.24
1104	0.26
1105	0.27
1106	0.24
1107	0.23
1108	0.21
1109	0.19
1110	0.17
1111	0.16
1112	0.15
1113	0.18
1114	0.19
1115	0.19
1116	0.21
1117	0.2
1118	0.18
1119	0.19
1120	0.18
1121	0.16
1122	0.14
1123	0.15
1124	0.1
1125	0.1
1126	0.11
1127	0.12
1128	0.21
1129	0.2
1130	0.23
1131	0.28
1132	0.32
1133	0.32
1134	0.34
1135	0.35
1136	0.29
1137	0.32
1138	0.3
1139	0.29
1140	0.27
1141	0.26
1142	0.25
1143	0.22
1144	0.24
1145	0.19
1146	0.19
1147	0.14
1148	0.13
1149	0.13
1150	0.13
1151	0.15
1152	0.11
1153	0.12
1154	0.11
1155	0.12
1156	0.13
1157	0.13
1158	0.13
1159	0.11
1160	0.13
1161	0.14
1162	0.16
1163	0.22
1164	0.25
1165	0.36
1166	0.44
1167	0.52
1168	0.57
1169	0.59
1170	0.67
1171	0.71
1172	0.76
1173	0.76
1174	0.74
1175	0.76
1176	0.78
1177	0.83
1178	0.73
1179	0.67
1180	0.58
1181	0.47
1182	0.45
1183	0.34
1184	0.26
1185	0.19
1186	0.18
1187	0.14
1188	0.14
1189	0.13
1190	0.11
1191	0.12
1192	0.15
1193	0.17
1194	0.17
1195	0.18
1196	0.18
1197	0.18
1198	0.17
1199	0.18
1200	0.14
1201	0.11
1202	0.1
1203	0.09
1204	0.11
1205	0.11
1206	0.09
1207	0.08
1208	0.08
1209	0.08
1210	0.08
1211	0.08
1212	0.12
1213	0.17
1214	0.18
1215	0.23
1216	0.29
1217	0.33
1218	0.35
1219	0.38
1220	0.33
1221	0.3
1222	0.3
1223	0.26
1224	0.22
1225	0.19
1226	0.16
1227	0.14
1228	0.17
1229	0.17
1230	0.18
1231	0.15
1232	0.13
1233	0.13
1234	0.13
1235	0.13
1236	0.1
1237	0.08
1238	0.09
1239	0.1
1240	0.1
1241	0.1
1242	0.13
1243	0.16
1244	0.21
1245	0.29
1246	0.33
1247	0.42
1248	0.48
1249	0.57
1250	0.62
1251	0.61
1252	0.61
1253	0.57
1254	0.54
1255	0.48
1256	0.44
1257	0.41
1258	0.38
1259	0.38
1260	0.35
1261	0.31
1262	0.29
1263	0.27
1264	0.3
1265	0.23
1266	0.2
1267	0.18
1268	0.19
1269	0.21
1270	0.22
1271	0.21
1272	0.22
1273	0.27
1274	0.34
1275	0.38
1276	0.47
1277	0.52
1278	0.56
1279	0.63
1280	0.66
1281	0.7
1282	0.7
1283	0.71
1284	0.71
1285	0.68
1286	0.68
1287	0.63
1288	0.56
1289	0.48
1290	0.42
1291	0.38
1292	0.31
1293	0.27
1294	0.27
1295	0.24
1296	0.22
1297	0.22
1298	0.21
1299	0.16
1300	0.16
1301	0.15

A0A437AM95

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer