Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K1VJW5

Protein Details
Accession K1VJW5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
425-445GQYFNKHKKMRPRELWTKPTAHydrophilic
468-500DEPPPESPRKRARKSSPRRQPPPSPSPRRSTRNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
469-496EPPPESPRKRARKSSPRRQPPPSPSPRR
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 5, cyto 5, cyto_mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MPAPAPGKIQALPVKILYTIDTSPQSYLAVLPERQDVYVHPASQGIMMGSCALKALARGICFASPECVPTRSTLDFSVYNLDPSRAGARSTFHGPAAPSSWAGKGFLSWALAEGGSGSTLARGRLVREYEFSPTCFSEGGGLEGLMAAAAAAEAEGDGKGWGLEVTLTLRQLNPEGKSEFSGRQAFESMLAGGKSTAAAPIAVASSPARPSNANNAVFAKPPPPPPKPTSPLRHVRTMPRSTPGGPSGSASSPSRHSVSSVNSNATVKPEPSRARDTTPPPRTGPRTPPPPSPARAQLMNILKDQGRVSPNMAAKIAYNPFLAKLLKAMPDSPSKSPVRPSPKGANGISGMLSPSPSRRSERVALQHKPASASVLAQASSSGSPWAPTPTPAEQCYNCASTESDQWMTKKLRDGPVCQVCNADCGQYFNKHKKMRPRELWTKPTAASSAAAATPPVRSSPRLNRVRNDEPPPESPRKRARKSSPRRQPPPSPSPRRSTRNTNATQQQNGRTSPTPGENGGTVQPLDFHFPFGLEPLPPSTDGADLESLFLSFDDDANGPPSEAVDLMEIFGQGQDSDAIMDLLRVIESEGDNA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.28
3 0.27
4 0.22
5 0.2
6 0.18
7 0.2
8 0.22
9 0.22
10 0.22
11 0.22
12 0.21
13 0.17
14 0.17
15 0.18
16 0.2
17 0.2
18 0.21
19 0.25
20 0.26
21 0.26
22 0.25
23 0.22
24 0.25
25 0.29
26 0.28
27 0.23
28 0.23
29 0.23
30 0.24
31 0.23
32 0.15
33 0.1
34 0.09
35 0.1
36 0.09
37 0.09
38 0.08
39 0.07
40 0.07
41 0.07
42 0.13
43 0.14
44 0.15
45 0.17
46 0.19
47 0.19
48 0.21
49 0.21
50 0.18
51 0.16
52 0.18
53 0.2
54 0.19
55 0.19
56 0.21
57 0.25
58 0.25
59 0.27
60 0.25
61 0.26
62 0.26
63 0.26
64 0.29
65 0.24
66 0.25
67 0.23
68 0.23
69 0.19
70 0.2
71 0.23
72 0.17
73 0.18
74 0.17
75 0.18
76 0.22
77 0.26
78 0.26
79 0.23
80 0.24
81 0.24
82 0.25
83 0.25
84 0.22
85 0.19
86 0.18
87 0.2
88 0.18
89 0.18
90 0.16
91 0.13
92 0.13
93 0.13
94 0.13
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.1
99 0.1
100 0.09
101 0.07
102 0.06
103 0.06
104 0.05
105 0.06
106 0.08
107 0.08
108 0.11
109 0.12
110 0.14
111 0.2
112 0.23
113 0.23
114 0.25
115 0.26
116 0.3
117 0.31
118 0.29
119 0.27
120 0.24
121 0.23
122 0.2
123 0.18
124 0.16
125 0.14
126 0.15
127 0.12
128 0.11
129 0.1
130 0.1
131 0.09
132 0.05
133 0.05
134 0.02
135 0.02
136 0.02
137 0.02
138 0.02
139 0.02
140 0.02
141 0.02
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.07
153 0.08
154 0.09
155 0.1
156 0.1
157 0.11
158 0.15
159 0.18
160 0.17
161 0.2
162 0.21
163 0.22
164 0.24
165 0.26
166 0.24
167 0.26
168 0.28
169 0.24
170 0.24
171 0.24
172 0.22
173 0.19
174 0.18
175 0.13
176 0.11
177 0.1
178 0.09
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.06
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.04
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.09
194 0.1
195 0.11
196 0.11
197 0.13
198 0.22
199 0.3
200 0.29
201 0.29
202 0.31
203 0.31
204 0.32
205 0.31
206 0.24
207 0.19
208 0.27
209 0.32
210 0.33
211 0.38
212 0.42
213 0.5
214 0.53
215 0.58
216 0.57
217 0.58
218 0.64
219 0.62
220 0.64
221 0.58
222 0.62
223 0.62
224 0.6
225 0.54
226 0.48
227 0.46
228 0.4
229 0.4
230 0.34
231 0.26
232 0.21
233 0.2
234 0.19
235 0.17
236 0.18
237 0.16
238 0.15
239 0.16
240 0.18
241 0.18
242 0.16
243 0.17
244 0.17
245 0.2
246 0.26
247 0.26
248 0.24
249 0.24
250 0.25
251 0.24
252 0.24
253 0.21
254 0.14
255 0.15
256 0.2
257 0.22
258 0.26
259 0.32
260 0.31
261 0.34
262 0.39
263 0.44
264 0.48
265 0.51
266 0.5
267 0.46
268 0.49
269 0.5
270 0.5
271 0.51
272 0.48
273 0.52
274 0.52
275 0.55
276 0.54
277 0.53
278 0.5
279 0.45
280 0.43
281 0.36
282 0.33
283 0.29
284 0.31
285 0.31
286 0.3
287 0.26
288 0.23
289 0.21
290 0.21
291 0.2
292 0.18
293 0.15
294 0.14
295 0.15
296 0.19
297 0.2
298 0.19
299 0.19
300 0.16
301 0.15
302 0.18
303 0.17
304 0.13
305 0.13
306 0.11
307 0.12
308 0.14
309 0.14
310 0.1
311 0.1
312 0.11
313 0.13
314 0.13
315 0.14
316 0.14
317 0.2
318 0.23
319 0.23
320 0.28
321 0.27
322 0.28
323 0.31
324 0.36
325 0.39
326 0.39
327 0.44
328 0.45
329 0.48
330 0.52
331 0.49
332 0.44
333 0.36
334 0.33
335 0.27
336 0.2
337 0.15
338 0.09
339 0.1
340 0.07
341 0.09
342 0.12
343 0.14
344 0.18
345 0.2
346 0.25
347 0.29
348 0.35
349 0.43
350 0.48
351 0.49
352 0.5
353 0.51
354 0.46
355 0.44
356 0.37
357 0.29
358 0.21
359 0.18
360 0.15
361 0.13
362 0.12
363 0.1
364 0.1
365 0.09
366 0.09
367 0.09
368 0.07
369 0.06
370 0.06
371 0.07
372 0.11
373 0.1
374 0.12
375 0.16
376 0.2
377 0.24
378 0.25
379 0.29
380 0.26
381 0.28
382 0.3
383 0.27
384 0.22
385 0.2
386 0.19
387 0.16
388 0.2
389 0.21
390 0.2
391 0.21
392 0.22
393 0.28
394 0.29
395 0.29
396 0.32
397 0.35
398 0.41
399 0.42
400 0.46
401 0.49
402 0.56
403 0.55
404 0.49
405 0.44
406 0.36
407 0.34
408 0.31
409 0.22
410 0.13
411 0.16
412 0.19
413 0.24
414 0.31
415 0.38
416 0.46
417 0.51
418 0.56
419 0.63
420 0.71
421 0.74
422 0.77
423 0.78
424 0.8
425 0.83
426 0.85
427 0.79
428 0.72
429 0.62
430 0.54
431 0.45
432 0.35
433 0.26
434 0.19
435 0.17
436 0.13
437 0.12
438 0.1
439 0.1
440 0.1
441 0.1
442 0.12
443 0.13
444 0.15
445 0.23
446 0.33
447 0.43
448 0.52
449 0.57
450 0.6
451 0.67
452 0.72
453 0.73
454 0.7
455 0.66
456 0.61
457 0.61
458 0.63
459 0.64
460 0.59
461 0.6
462 0.63
463 0.67
464 0.71
465 0.75
466 0.79
467 0.8
468 0.88
469 0.9
470 0.91
471 0.91
472 0.92
473 0.9
474 0.89
475 0.87
476 0.88
477 0.87
478 0.87
479 0.82
480 0.82
481 0.83
482 0.8
483 0.77
484 0.76
485 0.75
486 0.75
487 0.74
488 0.74
489 0.73
490 0.72
491 0.73
492 0.69
493 0.66
494 0.61
495 0.57
496 0.53
497 0.47
498 0.44
499 0.41
500 0.39
501 0.34
502 0.31
503 0.31
504 0.26
505 0.26
506 0.24
507 0.22
508 0.17
509 0.14
510 0.15
511 0.14
512 0.2
513 0.18
514 0.19
515 0.17
516 0.17
517 0.17
518 0.17
519 0.18
520 0.12
521 0.13
522 0.14
523 0.16
524 0.16
525 0.17
526 0.16
527 0.16
528 0.16
529 0.17
530 0.16
531 0.15
532 0.15
533 0.14
534 0.13
535 0.11
536 0.1
537 0.09
538 0.08
539 0.08
540 0.09
541 0.1
542 0.11
543 0.14
544 0.14
545 0.13
546 0.12
547 0.13
548 0.11
549 0.11
550 0.1
551 0.09
552 0.09
553 0.09
554 0.1
555 0.09
556 0.09
557 0.09
558 0.08
559 0.06
560 0.07
561 0.07
562 0.07
563 0.07
564 0.08
565 0.08
566 0.07
567 0.07
568 0.07
569 0.07
570 0.07
571 0.06
572 0.06
573 0.09