FuNGI

A0A437AK94

Protein Details

Accession

A0A437AK94

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
98-119	LSEEKNKEPEKKNKLDDEKERV	Acidic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 12.833, cyto 6.5, cyto_mito 5.166

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR007083 RNA_pol_Rpb1_4 IPR007081 RNA_pol_Rpb1_5 IPR007073 RNA_pol_Rpb1_7 IPR038593 RNA_pol_Rpb1_7_sf IPR038120 Rpb1_funnel_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF05000 RNA_pol_Rpb1_4 PF04998 RNA_pol_Rpb1_5 PF04990 RNA_pol_Rpb1_7

Amino Acid Sequences

NLDKNTLGPSSFSLPDLVGKDHNLILSSFSKLINRYLIKYGFTLRINDLYLNDLGEKERLKEIKNSILQTEALYNLTNQNYTSFNLEKEDSLSQNGDLSEEKNKEPEKKNKLDDEKERVNYLNNNLYWNEEKYEEMSSLFKNTMNKFTTSILNTSMENTLIPFPYNNLSLIVLSGAKGSLVNISQICCLLGQQELEGKRVPLMKNNLTLQILSNNKEGSSIFESEVEKGGFIFDRFLTGIKIHSFFFHCMAGREGLIDTAVKTARSGYLQRCLVKHLEGLVVNYNGTVLNNSYSLISYQSKKESGTPVGLIAAQSIGEPSTQMTLNTFHFAGVAQNVMQGVPRLKELINVIKLIKTPMQKIYLQNGSLEIAKEIGNKMEYTSMHDIIKEIKIIYDPNCMSSVIPEDNDFIDAYYAFLEENESDLGPWVIRMEIFREKLLKKNFSLEYVSDKLKQSFKNDIQIICSDFNAEFLVIRVRIKPKHDEAFAKKVMYEIIKLHLMGIKGINKCYLLLDDKNKKNNQKECKKGNLLKELNERMRLITENTAEDKDVLSKLKLLDEEEMRNQTNHENTSLDIKNTISNSEEEKWMIQTDGTNLSESFLMEGVDSKFIYSNDLIEVYSTLGIEAVREVIMREVQSVIVNSGSYVNNRHLSLLADVMTMKGLRGITRHGVNRASTGALKRASFEETVEILLEAACFAEKNFTSGVTESIMLGQVSKIGTGSTETILDLDMLQSVIPLARKYEFLREIHTPVILSPETLTTPTRMSIAFSPNATKEYAPTTPLYNPTSPVYSPTSPVYSPT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.23
3	0.24
4	0.24
5	0.21
6	0.22
7	0.24
8	0.24
9	0.24
10	0.21
11	0.18
12	0.2
13	0.19
14	0.21
15	0.2
16	0.2
17	0.23
18	0.23
19	0.27
20	0.31
21	0.33
22	0.33
23	0.39
24	0.4
25	0.38
26	0.39
27	0.4
28	0.38
29	0.37
30	0.37
31	0.33
32	0.34
33	0.34
34	0.33
35	0.29
36	0.26
37	0.24
38	0.21
39	0.19
40	0.16
41	0.16
42	0.18
43	0.19
44	0.18
45	0.25
46	0.27
47	0.29
48	0.36
49	0.4
50	0.46
51	0.51
52	0.51
53	0.45
54	0.44
55	0.42
56	0.35
57	0.32
58	0.23
59	0.18
60	0.16
61	0.16
62	0.19
63	0.19
64	0.19
65	0.17
66	0.18
67	0.18
68	0.19
69	0.24
70	0.2
71	0.2
72	0.23
73	0.24
74	0.22
75	0.24
76	0.27
77	0.22
78	0.24
79	0.24
80	0.2
81	0.21
82	0.21
83	0.19
84	0.16
85	0.16
86	0.21
87	0.23
88	0.24
89	0.28
90	0.33
91	0.41
92	0.49
93	0.58
94	0.6
95	0.66
96	0.73
97	0.77
98	0.81
99	0.81
100	0.81
101	0.8
102	0.79
103	0.73
104	0.68
105	0.59
106	0.53
107	0.49
108	0.46
109	0.45
110	0.36
111	0.36
112	0.34
113	0.37
114	0.36
115	0.33
116	0.29
117	0.22
118	0.22
119	0.21
120	0.22
121	0.19
122	0.17
123	0.17
124	0.16
125	0.18
126	0.18
127	0.18
128	0.23
129	0.25
130	0.32
131	0.32
132	0.33
133	0.32
134	0.34
135	0.37
136	0.33
137	0.32
138	0.27
139	0.25
140	0.24
141	0.24
142	0.22
143	0.16
144	0.14
145	0.14
146	0.13
147	0.12
148	0.13
149	0.11
150	0.12
151	0.14
152	0.16
153	0.14
154	0.13
155	0.13
156	0.13
157	0.13
158	0.12
159	0.09
160	0.08
161	0.08
162	0.06
163	0.06
164	0.06
165	0.06
166	0.07
167	0.07
168	0.1
169	0.11
170	0.12
171	0.12
172	0.12
173	0.12
174	0.1
175	0.1
176	0.08
177	0.09
178	0.08
179	0.08
180	0.14
181	0.14
182	0.16
183	0.17
184	0.17
185	0.18
186	0.23
187	0.23
188	0.26
189	0.32
190	0.35
191	0.4
192	0.41
193	0.42
194	0.37
195	0.36
196	0.3
197	0.29
198	0.28
199	0.25
200	0.26
201	0.22
202	0.21
203	0.22
204	0.21
205	0.19
206	0.19
207	0.19
208	0.17
209	0.2
210	0.21
211	0.21
212	0.23
213	0.18
214	0.14
215	0.12
216	0.13
217	0.1
218	0.1
219	0.1
220	0.08
221	0.1
222	0.1
223	0.11
224	0.11
225	0.1
226	0.13
227	0.13
228	0.15
229	0.13
230	0.15
231	0.17
232	0.17
233	0.19
234	0.19
235	0.17
236	0.17
237	0.19
238	0.17
239	0.15
240	0.14
241	0.12
242	0.1
243	0.09
244	0.08
245	0.07
246	0.08
247	0.09
248	0.08
249	0.08
250	0.09
251	0.1
252	0.13
253	0.17
254	0.18
255	0.25
256	0.3
257	0.32
258	0.32
259	0.34
260	0.33
261	0.29
262	0.27
263	0.2
264	0.19
265	0.17
266	0.18
267	0.18
268	0.16
269	0.15
270	0.13
271	0.12
272	0.09
273	0.09
274	0.08
275	0.05
276	0.06
277	0.06
278	0.07
279	0.07
280	0.07
281	0.07
282	0.1
283	0.12
284	0.14
285	0.16
286	0.19
287	0.2
288	0.21
289	0.24
290	0.25
291	0.24
292	0.24
293	0.22
294	0.19
295	0.18
296	0.18
297	0.14
298	0.1
299	0.07
300	0.05
301	0.05
302	0.04
303	0.04
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.07
311	0.09
312	0.1
313	0.12
314	0.12
315	0.1
316	0.1
317	0.1
318	0.09
319	0.07
320	0.07
321	0.05
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.07
328	0.07
329	0.08
330	0.09
331	0.09
332	0.11
333	0.13
334	0.18
335	0.18
336	0.19
337	0.19
338	0.19
339	0.2
340	0.19
341	0.21
342	0.17
343	0.18
344	0.21
345	0.24
346	0.26
347	0.28
348	0.32
349	0.31
350	0.29
351	0.27
352	0.23
353	0.21
354	0.19
355	0.16
356	0.1
357	0.08
358	0.08
359	0.08
360	0.08
361	0.08
362	0.08
363	0.08
364	0.08
365	0.1
366	0.1
367	0.15
368	0.18
369	0.19
370	0.18
371	0.18
372	0.18
373	0.17
374	0.18
375	0.13
376	0.09
377	0.08
378	0.09
379	0.11
380	0.11
381	0.15
382	0.15
383	0.15
384	0.16
385	0.16
386	0.15
387	0.14
388	0.16
389	0.1
390	0.1
391	0.09
392	0.09
393	0.09
394	0.1
395	0.09
396	0.06
397	0.06
398	0.06
399	0.05
400	0.05
401	0.05
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.04
406	0.05
407	0.05
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.06
412	0.05
413	0.05
414	0.04
415	0.04
416	0.04
417	0.04
418	0.08
419	0.13
420	0.14
421	0.15
422	0.2
423	0.21
424	0.28
425	0.34
426	0.34
427	0.3
428	0.36
429	0.35
430	0.33
431	0.34
432	0.28
433	0.28
434	0.27
435	0.28
436	0.24
437	0.25
438	0.25
439	0.29
440	0.3
441	0.29
442	0.35
443	0.35
444	0.4
445	0.41
446	0.39
447	0.36
448	0.34
449	0.33
450	0.24
451	0.22
452	0.15
453	0.12
454	0.12
455	0.1
456	0.09
457	0.06
458	0.06
459	0.08
460	0.08
461	0.09
462	0.12
463	0.17
464	0.2
465	0.24
466	0.3
467	0.34
468	0.38
469	0.41
470	0.46
471	0.47
472	0.51
473	0.5
474	0.44
475	0.38
476	0.33
477	0.31
478	0.24
479	0.2
480	0.13
481	0.14
482	0.14
483	0.14
484	0.14
485	0.14
486	0.13
487	0.12
488	0.14
489	0.17
490	0.18
491	0.18
492	0.19
493	0.17
494	0.17
495	0.17
496	0.16
497	0.15
498	0.18
499	0.27
500	0.35
501	0.41
502	0.49
503	0.54
504	0.59
505	0.64
506	0.68
507	0.7
508	0.71
509	0.75
510	0.74
511	0.77
512	0.79
513	0.76
514	0.75
515	0.75
516	0.67
517	0.64
518	0.64
519	0.63
520	0.57
521	0.54
522	0.46
523	0.37
524	0.36
525	0.31
526	0.25
527	0.21
528	0.19
529	0.19
530	0.2
531	0.2
532	0.19
533	0.18
534	0.16
535	0.14
536	0.14
537	0.13
538	0.12
539	0.13
540	0.14
541	0.16
542	0.17
543	0.16
544	0.18
545	0.2
546	0.23
547	0.24
548	0.27
549	0.26
550	0.25
551	0.25
552	0.24
553	0.25
554	0.23
555	0.21
556	0.18
557	0.17
558	0.25
559	0.25
560	0.22
561	0.19
562	0.18
563	0.2
564	0.2
565	0.2
566	0.14
567	0.14
568	0.18
569	0.19
570	0.2
571	0.18
572	0.18
573	0.18
574	0.17
575	0.16
576	0.12
577	0.11
578	0.12
579	0.16
580	0.16
581	0.16
582	0.15
583	0.16
584	0.16
585	0.14
586	0.13
587	0.08
588	0.07
589	0.06
590	0.09
591	0.09
592	0.1
593	0.1
594	0.1
595	0.11
596	0.11
597	0.15
598	0.13
599	0.13
600	0.12
601	0.13
602	0.12
603	0.11
604	0.11
605	0.09
606	0.09
607	0.08
608	0.06
609	0.06
610	0.06
611	0.06
612	0.06
613	0.06
614	0.05
615	0.05
616	0.06
617	0.07
618	0.09
619	0.09
620	0.1
621	0.1
622	0.11
623	0.12
624	0.12
625	0.11
626	0.1
627	0.1
628	0.09
629	0.12
630	0.12
631	0.12
632	0.15
633	0.18
634	0.21
635	0.22
636	0.22
637	0.2
638	0.21
639	0.2
640	0.19
641	0.15
642	0.12
643	0.12
644	0.11
645	0.11
646	0.1
647	0.08
648	0.09
649	0.09
650	0.1
651	0.12
652	0.16
653	0.2
654	0.27
655	0.31
656	0.33
657	0.35
658	0.35
659	0.36
660	0.33
661	0.3
662	0.27
663	0.26
664	0.27
665	0.27
666	0.26
667	0.26
668	0.26
669	0.27
670	0.24
671	0.22
672	0.21
673	0.18
674	0.18
675	0.17
676	0.15
677	0.12
678	0.11
679	0.1
680	0.06
681	0.05
682	0.05
683	0.04
684	0.05
685	0.11
686	0.11
687	0.13
688	0.13
689	0.14
690	0.16
691	0.17
692	0.18
693	0.14
694	0.14
695	0.12
696	0.13
697	0.13
698	0.11
699	0.11
700	0.09
701	0.1
702	0.1
703	0.09
704	0.09
705	0.07
706	0.08
707	0.1
708	0.12
709	0.1
710	0.11
711	0.11
712	0.11
713	0.11
714	0.11
715	0.09
716	0.07
717	0.07
718	0.06
719	0.06
720	0.05
721	0.06
722	0.07
723	0.09
724	0.1
725	0.12
726	0.13
727	0.17
728	0.2
729	0.29
730	0.33
731	0.33
732	0.38
733	0.4
734	0.42
735	0.4
736	0.38
737	0.29
738	0.23
739	0.28
740	0.22
741	0.18
742	0.16
743	0.16
744	0.16
745	0.18
746	0.19
747	0.15
748	0.17
749	0.17
750	0.18
751	0.16
752	0.18
753	0.22
754	0.27
755	0.28
756	0.28
757	0.32
758	0.32
759	0.33
760	0.32
761	0.27
762	0.23
763	0.26
764	0.26
765	0.24
766	0.24
767	0.26
768	0.29
769	0.35
770	0.38
771	0.34
772	0.34
773	0.35
774	0.38
775	0.34
776	0.34
777	0.35
778	0.31
779	0.33
780	0.34
781	0.35

A0A437AK94

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer