Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K1W6S9

Protein Details
Accession K1W6S9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
223-249HGITPPLRHVRKRRFRKRLSRRTIEVVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
34-55SGRGRGRGRGRGRGRGRGGGRQ
230-243RHVRKRRFRKRLSR
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 13, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037817  TAF7  
IPR006751  TAFII55_prot_cons_reg  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF04658  TAFII55_N  
CDD cd08047  TAF7  
Amino Acid Sequences MDATGLDAGPSAYDANAYSLNSPDAGPSNDPPPSGRGRGRGRGRGRGRGRGGGRQSTRLSTRQAASAGPTKLKISFKASGGAAASGGRMQSFLGEYDRELDDNPEDPLAFEEQFILRVPPSVADGKNGELGLRDLIKGKGRGLDALEFKMLDPRRGVFKIGDTTYTSKLVDLPNIIECQKTLDNRHLFKVADISQMLVVEKPVQNEASVTSTPLNVDDYIWPHGITPPLRHVRKRRFRKRLSRRTIEVVEEQVEELLNKDDDADETNLIDVNPDPDVPDSYYVNWSAEDPYAGWQPEGSEYGGEEYQAQPEGEWYDEEEYPEEDENEMDEDLQAALMDQLEQSESEGEGDEDEDGLSASEDEEEEEAAEDDDPEVAERKQKIKQYTSEIKQLEQLIEKKRAGFTGSGNPIITKRFEETIKGLQDDINNKVSARQALQDAIDERRKEKEAADNPPPSAAEAAEGEAAEESEPDDLFDDDEGDADATPIGTPITPAAPTPGPDEIPDLPSGAGDDDDDEDLFGDDELLDDPAPEAAPAAPAAGEGEFLANEMDDMDEMAELLEASLNQADEEGGGEPMEGVEGADGADGEIGDQAAATAALDEFMMSAEARDPGYGFVEGGVGMRRLATGVDDSSDEESEDSDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.1
3 0.12
4 0.13
5 0.13
6 0.14
7 0.15
8 0.15
9 0.15
10 0.15
11 0.16
12 0.19
13 0.21
14 0.22
15 0.26
16 0.27
17 0.28
18 0.28
19 0.29
20 0.32
21 0.36
22 0.38
23 0.43
24 0.49
25 0.58
26 0.66
27 0.71
28 0.72
29 0.75
30 0.78
31 0.79
32 0.78
33 0.78
34 0.74
35 0.73
36 0.7
37 0.69
38 0.69
39 0.69
40 0.65
41 0.62
42 0.6
43 0.57
44 0.58
45 0.52
46 0.51
47 0.47
48 0.45
49 0.42
50 0.4
51 0.34
52 0.34
53 0.37
54 0.35
55 0.31
56 0.31
57 0.28
58 0.33
59 0.35
60 0.35
61 0.34
62 0.35
63 0.34
64 0.38
65 0.36
66 0.33
67 0.31
68 0.27
69 0.21
70 0.16
71 0.15
72 0.11
73 0.11
74 0.08
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.08
79 0.09
80 0.11
81 0.11
82 0.12
83 0.15
84 0.16
85 0.15
86 0.15
87 0.16
88 0.15
89 0.16
90 0.16
91 0.14
92 0.13
93 0.13
94 0.14
95 0.14
96 0.13
97 0.12
98 0.13
99 0.12
100 0.13
101 0.14
102 0.13
103 0.1
104 0.12
105 0.12
106 0.1
107 0.14
108 0.18
109 0.18
110 0.2
111 0.21
112 0.21
113 0.23
114 0.23
115 0.19
116 0.15
117 0.15
118 0.15
119 0.14
120 0.13
121 0.13
122 0.16
123 0.21
124 0.22
125 0.22
126 0.24
127 0.24
128 0.25
129 0.26
130 0.28
131 0.26
132 0.26
133 0.25
134 0.21
135 0.2
136 0.26
137 0.24
138 0.21
139 0.2
140 0.2
141 0.26
142 0.27
143 0.29
144 0.23
145 0.26
146 0.3
147 0.3
148 0.3
149 0.27
150 0.29
151 0.3
152 0.3
153 0.26
154 0.19
155 0.21
156 0.2
157 0.19
158 0.17
159 0.16
160 0.17
161 0.19
162 0.19
163 0.16
164 0.14
165 0.17
166 0.19
167 0.21
168 0.22
169 0.3
170 0.37
171 0.39
172 0.42
173 0.4
174 0.37
175 0.34
176 0.36
177 0.29
178 0.25
179 0.23
180 0.21
181 0.18
182 0.18
183 0.18
184 0.12
185 0.11
186 0.11
187 0.13
188 0.13
189 0.14
190 0.14
191 0.13
192 0.14
193 0.15
194 0.14
195 0.13
196 0.13
197 0.12
198 0.12
199 0.12
200 0.13
201 0.13
202 0.09
203 0.1
204 0.1
205 0.12
206 0.14
207 0.15
208 0.14
209 0.13
210 0.14
211 0.18
212 0.17
213 0.17
214 0.23
215 0.32
216 0.36
217 0.43
218 0.51
219 0.58
220 0.67
221 0.77
222 0.79
223 0.81
224 0.87
225 0.92
226 0.94
227 0.94
228 0.93
229 0.9
230 0.83
231 0.79
232 0.71
233 0.63
234 0.54
235 0.44
236 0.36
237 0.28
238 0.23
239 0.16
240 0.13
241 0.1
242 0.08
243 0.08
244 0.06
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.09
250 0.09
251 0.08
252 0.08
253 0.09
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.08
264 0.08
265 0.1
266 0.09
267 0.1
268 0.12
269 0.12
270 0.12
271 0.11
272 0.11
273 0.1
274 0.1
275 0.09
276 0.08
277 0.09
278 0.11
279 0.11
280 0.1
281 0.09
282 0.09
283 0.1
284 0.11
285 0.09
286 0.06
287 0.06
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.07
292 0.06
293 0.07
294 0.08
295 0.08
296 0.06
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.1
308 0.1
309 0.09
310 0.07
311 0.06
312 0.06
313 0.07
314 0.06
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.03
322 0.03
323 0.03
324 0.03
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.03
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.05
334 0.04
335 0.04
336 0.05
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.03
347 0.03
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.05
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.06
362 0.06
363 0.1
364 0.13
365 0.17
366 0.22
367 0.27
368 0.33
369 0.37
370 0.41
371 0.46
372 0.53
373 0.53
374 0.56
375 0.52
376 0.46
377 0.45
378 0.41
379 0.33
380 0.28
381 0.3
382 0.27
383 0.32
384 0.33
385 0.3
386 0.3
387 0.29
388 0.26
389 0.23
390 0.2
391 0.23
392 0.25
393 0.25
394 0.25
395 0.24
396 0.24
397 0.23
398 0.22
399 0.14
400 0.14
401 0.15
402 0.16
403 0.18
404 0.21
405 0.26
406 0.27
407 0.26
408 0.25
409 0.23
410 0.26
411 0.27
412 0.26
413 0.22
414 0.21
415 0.2
416 0.22
417 0.22
418 0.2
419 0.18
420 0.17
421 0.15
422 0.16
423 0.17
424 0.17
425 0.17
426 0.2
427 0.24
428 0.23
429 0.23
430 0.26
431 0.28
432 0.27
433 0.27
434 0.32
435 0.34
436 0.41
437 0.48
438 0.47
439 0.45
440 0.45
441 0.42
442 0.32
443 0.26
444 0.18
445 0.11
446 0.09
447 0.09
448 0.08
449 0.08
450 0.08
451 0.07
452 0.07
453 0.06
454 0.05
455 0.04
456 0.05
457 0.05
458 0.05
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.07
464 0.06
465 0.07
466 0.07
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.05
472 0.05
473 0.05
474 0.05
475 0.04
476 0.05
477 0.05
478 0.07
479 0.07
480 0.07
481 0.11
482 0.12
483 0.13
484 0.16
485 0.17
486 0.16
487 0.17
488 0.21
489 0.18
490 0.19
491 0.18
492 0.16
493 0.14
494 0.13
495 0.13
496 0.1
497 0.08
498 0.06
499 0.07
500 0.07
501 0.08
502 0.08
503 0.08
504 0.07
505 0.08
506 0.08
507 0.06
508 0.05
509 0.04
510 0.05
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.05
515 0.06
516 0.06
517 0.06
518 0.06
519 0.06
520 0.05
521 0.06
522 0.06
523 0.06
524 0.06
525 0.06
526 0.07
527 0.06
528 0.06
529 0.05
530 0.06
531 0.05
532 0.06
533 0.06
534 0.05
535 0.05
536 0.05
537 0.05
538 0.04
539 0.05
540 0.04
541 0.04
542 0.04
543 0.04
544 0.04
545 0.04
546 0.04
547 0.04
548 0.04
549 0.05
550 0.07
551 0.07
552 0.06
553 0.07
554 0.07
555 0.06
556 0.07
557 0.07
558 0.06
559 0.06
560 0.06
561 0.06
562 0.06
563 0.06
564 0.05
565 0.04
566 0.04
567 0.04
568 0.04
569 0.04
570 0.04
571 0.04
572 0.04
573 0.04
574 0.04
575 0.05
576 0.05
577 0.04
578 0.04
579 0.04
580 0.04
581 0.04
582 0.04
583 0.04
584 0.04
585 0.04
586 0.04
587 0.04
588 0.04
589 0.05
590 0.06
591 0.05
592 0.06
593 0.07
594 0.09
595 0.09
596 0.1
597 0.1
598 0.11
599 0.13
600 0.13
601 0.12
602 0.1
603 0.1
604 0.1
605 0.11
606 0.12
607 0.1
608 0.09
609 0.09
610 0.09
611 0.09
612 0.09
613 0.1
614 0.11
615 0.12
616 0.13
617 0.14
618 0.16
619 0.18
620 0.18
621 0.17
622 0.14
623 0.13