Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A427YDC7

Protein Details
Accession A0A427YDC7    Localization Confidence High Confidence Score 16.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
261-285APGEGSGEKKKKKKRPAPAQEGAEABasic
324-354TKTKDETAEEKPKPKKKKKKEKAAEAEAEASBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
267-301GEKKKKKKRPAPAQEGAEAPKESKKKKSAAAAAAG
319-346SQKKATKTKDETAEEKPKPKKKKKKEKA
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 9, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MASASGYNHHRFARAVLKKSRKWEPSLIVQLNDKHWRFADSPMNFTYDGPMRPFLLALRAQVIPASLIPFLYDITPPVSLVDGCLVVEIQDFRKSPEVRTRVVMRPAAESLAQTIDVMLERKGEPWDEQLALELESRIIAATSAPLYLGTNILATRNAVLALGLTSPATPNLSADGSFRSASSLTDEPTSSSERMRKLLRAGERSAPFQPNWSILRHKERMESLQRQREREAAARAAMPPQEQLAVGQPVNGATAGPANGAPGEGSGEKKKKKKRPAPAQEGAEAPKESKKKKSAAAAAAGGNAAANSTKTKAEESPESQKKATKTKDETAEEKPKPKKKKKKEKAAEAEAEAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.47
3 0.53
4 0.62
5 0.66
6 0.73
7 0.78
8 0.73
9 0.72
10 0.72
11 0.67
12 0.67
13 0.72
14 0.68
15 0.6
16 0.58
17 0.55
18 0.53
19 0.57
20 0.47
21 0.4
22 0.37
23 0.4
24 0.36
25 0.4
26 0.43
27 0.36
28 0.4
29 0.38
30 0.4
31 0.36
32 0.34
33 0.32
34 0.27
35 0.26
36 0.25
37 0.25
38 0.23
39 0.23
40 0.23
41 0.19
42 0.2
43 0.19
44 0.17
45 0.19
46 0.18
47 0.17
48 0.17
49 0.17
50 0.12
51 0.11
52 0.11
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.09
58 0.09
59 0.08
60 0.08
61 0.1
62 0.1
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.08
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.06
74 0.07
75 0.08
76 0.09
77 0.13
78 0.14
79 0.16
80 0.24
81 0.25
82 0.29
83 0.37
84 0.39
85 0.37
86 0.42
87 0.46
88 0.44
89 0.48
90 0.47
91 0.38
92 0.37
93 0.36
94 0.32
95 0.26
96 0.2
97 0.15
98 0.13
99 0.12
100 0.08
101 0.08
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.07
106 0.08
107 0.08
108 0.1
109 0.11
110 0.12
111 0.12
112 0.14
113 0.17
114 0.15
115 0.15
116 0.15
117 0.14
118 0.14
119 0.13
120 0.1
121 0.07
122 0.06
123 0.06
124 0.05
125 0.04
126 0.03
127 0.03
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.05
146 0.05
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.05
156 0.04
157 0.05
158 0.06
159 0.06
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.09
164 0.1
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.12
170 0.11
171 0.1
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.13
176 0.16
177 0.13
178 0.14
179 0.18
180 0.18
181 0.22
182 0.24
183 0.24
184 0.24
185 0.3
186 0.34
187 0.34
188 0.35
189 0.39
190 0.38
191 0.39
192 0.39
193 0.36
194 0.29
195 0.28
196 0.26
197 0.23
198 0.23
199 0.23
200 0.24
201 0.27
202 0.35
203 0.36
204 0.37
205 0.36
206 0.37
207 0.42
208 0.46
209 0.5
210 0.51
211 0.57
212 0.59
213 0.58
214 0.57
215 0.53
216 0.48
217 0.43
218 0.39
219 0.31
220 0.29
221 0.27
222 0.26
223 0.25
224 0.22
225 0.17
226 0.13
227 0.12
228 0.11
229 0.1
230 0.1
231 0.11
232 0.13
233 0.12
234 0.12
235 0.12
236 0.11
237 0.12
238 0.11
239 0.07
240 0.05
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.05
250 0.07
251 0.07
252 0.11
253 0.18
254 0.26
255 0.34
256 0.42
257 0.52
258 0.6
259 0.7
260 0.77
261 0.81
262 0.85
263 0.89
264 0.91
265 0.89
266 0.84
267 0.75
268 0.68
269 0.59
270 0.51
271 0.4
272 0.32
273 0.29
274 0.32
275 0.34
276 0.4
277 0.45
278 0.47
279 0.53
280 0.61
281 0.63
282 0.62
283 0.63
284 0.57
285 0.51
286 0.45
287 0.39
288 0.29
289 0.2
290 0.14
291 0.09
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.09
296 0.12
297 0.13
298 0.16
299 0.19
300 0.24
301 0.31
302 0.36
303 0.45
304 0.51
305 0.54
306 0.53
307 0.55
308 0.56
309 0.58
310 0.6
311 0.59
312 0.59
313 0.63
314 0.71
315 0.72
316 0.71
317 0.7
318 0.73
319 0.69
320 0.7
321 0.72
322 0.72
323 0.77
324 0.83
325 0.85
326 0.85
327 0.91
328 0.93
329 0.94
330 0.96
331 0.96
332 0.96
333 0.95
334 0.9