FuNGI

K1WA03

Protein Details

Accession

K1WA03

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
173-198	MDEYVRQVLKHRKRKHERDNYKDGLV	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
185-186	KR

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 1, plas 1, pero 1, cysk 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015699 DNA-dir_RNA_pol1_lsu_N IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR000722 RNA_pol_asu IPR006592 RNA_pol_N IPR007080 RNA_pol_Rpb1_1 IPR007066 RNA_pol_Rpb1_3 IPR042102 RNA_pol_Rpb1_3_sf IPR007083 RNA_pol_Rpb1_4 IPR044893 RNA_pol_Rpb1_clamp_domain IPR038120 Rpb1_funnel_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04997 RNA_pol_Rpb1_1 PF00623 RNA_pol_Rpb1_2 PF04983 RNA_pol_Rpb1_3 PF05000 RNA_pol_Rpb1_4
CDD	cd01435 RNAP_I_RPA1_N

Amino Acid Sequences

MDIAHPLTSEVTSLSFSFLSSDDIRSISVKKIDNPVLLDNLNLATNGGLYDPKLGPMTARDMCETCGQSYFACPGHYGHIELPSPVFHPLFMNQCYNLLRATCLYCHHFKMPELILRRYIARLRLLDAGCLEEAHTVANFHPVTKDAPKDGDTQEDMDAGVAGETAAEFIQRMDEYVRQVLKHRKRKHERDNYKDGLVFEERKRVLNEFGKKLWAKCSHCQAYGNTFRKEKTIKIIEYDLSPKQKLANSTMGLKKPHASFSSRSIKKPQKGKEEEDEGIEASSASSGSEAEDEGMDVDEVEAEEEESEEEDEGLTAGPARTASGQVKGARGRNERVMAAAEVRSHLRRLFQKEAEACSLLYGRHGGPQAKSGHIPPPPIADMFFMDVVPVPPTRFRPPAKMGDDLFENSQNTLLTAIINTCERIYTVNQTLRDFERQDKSEAVMEALKNLDKTRSFEILLESLIRLQHDVNSFMDSTKNPAVMKQGKLPPQGVKQLLEKKEGLFRKHMMGKRVNYAARSVISPDINIETNEIGIPPVFAKKLTYPEPVTPQNVHEMRQLVINGPKVHPGAALVQNEDGSQISLDRTTLEQRTAIANQLLTPQNDAWAGSSGGPAARNKKVYRHIRDGDIVILNRQPTLHKPSMMCHRVKVLHGEKTIRMHYANCNSYNADFDGDEMNIHFPQNETARAEAQMIANTDNQYLVPTSGNPLRGLIQDHVVAGVWMCNKSSFFTRDEYYQLIYGALRTENNYSGGGRIITLPPAIIKPRPMWTGKQIMSTILVNLTPANAKGLNLTSKNKVQNKLWQRDDSKDENMSEENVIFLDGHLILGVLDKSQYGASAYGLVHSVHELYGPYIANRLLAVLSRLLTKYLQHTGFSCRMDDLILSEEGERLRKQILDDANEDGMRTALQFVGLPHDGDIHNPELQQNLKIRLEEILRDDNLMAGLDAKMQMAFNKTTSKINNDVLPAHLVRPFPDNNMQMMTISGAKGSKVNASQISTLLGQQALEGRRVPTMVSGKTLPAFKAFDTQARAGGYVANRFLTGIRPQEYYFHW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.12
3	0.11
4	0.12
5	0.12
6	0.16
7	0.16
8	0.18
9	0.18
10	0.18
11	0.19
12	0.2
13	0.22
14	0.23
15	0.28
16	0.3
17	0.33
18	0.42
19	0.46
20	0.48
21	0.49
22	0.47
23	0.45
24	0.41
25	0.36
26	0.28
27	0.23
28	0.2
29	0.16
30	0.13
31	0.08
32	0.08
33	0.08
34	0.08
35	0.07
36	0.07
37	0.13
38	0.13
39	0.15
40	0.16
41	0.16
42	0.16
43	0.19
44	0.26
45	0.24
46	0.26
47	0.27
48	0.27
49	0.3
50	0.35
51	0.34
52	0.28
53	0.26
54	0.25
55	0.23
56	0.24
57	0.26
58	0.21
59	0.2
60	0.19
61	0.19
62	0.23
63	0.24
64	0.25
65	0.23
66	0.26
67	0.26
68	0.26
69	0.25
70	0.21
71	0.2
72	0.21
73	0.19
74	0.14
75	0.16
76	0.19
77	0.25
78	0.27
79	0.29
80	0.26
81	0.3
82	0.31
83	0.3
84	0.28
85	0.22
86	0.2
87	0.2
88	0.22
89	0.2
90	0.23
91	0.27
92	0.3
93	0.34
94	0.37
95	0.37
96	0.36
97	0.41
98	0.42
99	0.43
100	0.44
101	0.43
102	0.42
103	0.41
104	0.41
105	0.39
106	0.38
107	0.36
108	0.37
109	0.35
110	0.34
111	0.4
112	0.39
113	0.35
114	0.32
115	0.29
116	0.23
117	0.21
118	0.19
119	0.11
120	0.11
121	0.1
122	0.1
123	0.08
124	0.08
125	0.16
126	0.15
127	0.15
128	0.16
129	0.17
130	0.21
131	0.26
132	0.3
133	0.25
134	0.29
135	0.3
136	0.34
137	0.34
138	0.35
139	0.31
140	0.3
141	0.27
142	0.24
143	0.22
144	0.16
145	0.15
146	0.09
147	0.07
148	0.05
149	0.04
150	0.04
151	0.03
152	0.04
153	0.04
154	0.04
155	0.04
156	0.04
157	0.07
158	0.07
159	0.08
160	0.1
161	0.13
162	0.16
163	0.22
164	0.24
165	0.23
166	0.31
167	0.4
168	0.49
169	0.57
170	0.63
171	0.69
172	0.78
173	0.88
174	0.91
175	0.92
176	0.93
177	0.91
178	0.92
179	0.85
180	0.78
181	0.69
182	0.58
183	0.52
184	0.46
185	0.43
186	0.35
187	0.39
188	0.36
189	0.37
190	0.39
191	0.36
192	0.38
193	0.41
194	0.48
195	0.44
196	0.45
197	0.5
198	0.5
199	0.5
200	0.51
201	0.51
202	0.49
203	0.5
204	0.59
205	0.56
206	0.56
207	0.58
208	0.52
209	0.53
210	0.57
211	0.57
212	0.51
213	0.48
214	0.46
215	0.49
216	0.49
217	0.43
218	0.42
219	0.44
220	0.41
221	0.42
222	0.45
223	0.39
224	0.39
225	0.41
226	0.37
227	0.33
228	0.32
229	0.29
230	0.29
231	0.31
232	0.31
233	0.32
234	0.33
235	0.3
236	0.37
237	0.43
238	0.43
239	0.42
240	0.41
241	0.41
242	0.36
243	0.39
244	0.35
245	0.33
246	0.31
247	0.38
248	0.47
249	0.46
250	0.47
251	0.52
252	0.59
253	0.62
254	0.68
255	0.67
256	0.68
257	0.71
258	0.73
259	0.71
260	0.69
261	0.62
262	0.55
263	0.48
264	0.37
265	0.3
266	0.23
267	0.15
268	0.08
269	0.07
270	0.05
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.05
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.05
281	0.06
282	0.05
283	0.05
284	0.04
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.04
290	0.04
291	0.04
292	0.04
293	0.05
294	0.05
295	0.05
296	0.05
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.04
301	0.04
302	0.05
303	0.04
304	0.05
305	0.05
306	0.06
307	0.06
308	0.09
309	0.11
310	0.13
311	0.18
312	0.19
313	0.24
314	0.28
315	0.32
316	0.36
317	0.39
318	0.4
319	0.41
320	0.41
321	0.37
322	0.33
323	0.31
324	0.24
325	0.21
326	0.19
327	0.14
328	0.13
329	0.15
330	0.15
331	0.15
332	0.15
333	0.19
334	0.24
335	0.32
336	0.38
337	0.37
338	0.43
339	0.45
340	0.47
341	0.44
342	0.38
343	0.3
344	0.24
345	0.23
346	0.16
347	0.13
348	0.12
349	0.09
350	0.12
351	0.16
352	0.17
353	0.16
354	0.23
355	0.24
356	0.24
357	0.25
358	0.24
359	0.26
360	0.26
361	0.27
362	0.22
363	0.23
364	0.23
365	0.22
366	0.2
367	0.16
368	0.14
369	0.14
370	0.13
371	0.09
372	0.08
373	0.08
374	0.08
375	0.09
376	0.08
377	0.08
378	0.1
379	0.14
380	0.19
381	0.25
382	0.27
383	0.33
384	0.38
385	0.46
386	0.47
387	0.48
388	0.43
389	0.38
390	0.38
391	0.32
392	0.28
393	0.21
394	0.18
395	0.14
396	0.14
397	0.12
398	0.1
399	0.09
400	0.08
401	0.06
402	0.06
403	0.06
404	0.06
405	0.06
406	0.07
407	0.06
408	0.06
409	0.06
410	0.08
411	0.09
412	0.13
413	0.19
414	0.22
415	0.24
416	0.25
417	0.27
418	0.28
419	0.3
420	0.27
421	0.27
422	0.3
423	0.29
424	0.31
425	0.29
426	0.28
427	0.27
428	0.25
429	0.21
430	0.17
431	0.15
432	0.14
433	0.14
434	0.13
435	0.11
436	0.11
437	0.13
438	0.12
439	0.15
440	0.18
441	0.19
442	0.19
443	0.19
444	0.21
445	0.18
446	0.17
447	0.15
448	0.11
449	0.1
450	0.09
451	0.09
452	0.07
453	0.07
454	0.1
455	0.11
456	0.12
457	0.12
458	0.13
459	0.13
460	0.13
461	0.15
462	0.11
463	0.14
464	0.14
465	0.15
466	0.13
467	0.14
468	0.21
469	0.25
470	0.26
471	0.29
472	0.33
473	0.36
474	0.39
475	0.4
476	0.37
477	0.35
478	0.39
479	0.34
480	0.3
481	0.31
482	0.37
483	0.37
484	0.36
485	0.33
486	0.28
487	0.34
488	0.36
489	0.32
490	0.28
491	0.27
492	0.29
493	0.36
494	0.38
495	0.37
496	0.4
497	0.39
498	0.4
499	0.44
500	0.39
501	0.33
502	0.31
503	0.26
504	0.21
505	0.19
506	0.16
507	0.13
508	0.12
509	0.11
510	0.11
511	0.11
512	0.11
513	0.1
514	0.1
515	0.07
516	0.07
517	0.07
518	0.06
519	0.05
520	0.04
521	0.04
522	0.04
523	0.05
524	0.05
525	0.06
526	0.07
527	0.09
528	0.13
529	0.17
530	0.2
531	0.21
532	0.24
533	0.29
534	0.3
535	0.31
536	0.27
537	0.25
538	0.28
539	0.27
540	0.26
541	0.23
542	0.22
543	0.2
544	0.2
545	0.2
546	0.14
547	0.16
548	0.19
549	0.18
550	0.17
551	0.19
552	0.18
553	0.18
554	0.16
555	0.13
556	0.14
557	0.17
558	0.17
559	0.15
560	0.15
561	0.15
562	0.15
563	0.14
564	0.1
565	0.06
566	0.05
567	0.05
568	0.05
569	0.05
570	0.05
571	0.05
572	0.06
573	0.09
574	0.11
575	0.11
576	0.11
577	0.12
578	0.14
579	0.14
580	0.15
581	0.12
582	0.11
583	0.11
584	0.15
585	0.17
586	0.15
587	0.16
588	0.14
589	0.14
590	0.14
591	0.14
592	0.1
593	0.09
594	0.09
595	0.08
596	0.08
597	0.07
598	0.08
599	0.1
600	0.11
601	0.14
602	0.17
603	0.22
604	0.23
605	0.3
606	0.39
607	0.47
608	0.53
609	0.57
610	0.56
611	0.55
612	0.56
613	0.5
614	0.43
615	0.36
616	0.28
617	0.2
618	0.19
619	0.16
620	0.14
621	0.13
622	0.12
623	0.13
624	0.21
625	0.22
626	0.24
627	0.25
628	0.29
629	0.39
630	0.44
631	0.41
632	0.34
633	0.37
634	0.36
635	0.36
636	0.4
637	0.35
638	0.35
639	0.37
640	0.39
641	0.36
642	0.37
643	0.38
644	0.31
645	0.26
646	0.22
647	0.26
648	0.31
649	0.33
650	0.3
651	0.31
652	0.3
653	0.29
654	0.29
655	0.23
656	0.17
657	0.12
658	0.12
659	0.11
660	0.1
661	0.1
662	0.08
663	0.1
664	0.09
665	0.09
666	0.08
667	0.07
668	0.1
669	0.12
670	0.14
671	0.14
672	0.15
673	0.16
674	0.16
675	0.17
676	0.15
677	0.14
678	0.13
679	0.13
680	0.13
681	0.14
682	0.14
683	0.13
684	0.12
685	0.11
686	0.1
687	0.09
688	0.09
689	0.08
690	0.07
691	0.11
692	0.13
693	0.15
694	0.14
695	0.15
696	0.15
697	0.16
698	0.19
699	0.16
700	0.15
701	0.14
702	0.14
703	0.13
704	0.11
705	0.1
706	0.07
707	0.08
708	0.08
709	0.08
710	0.08
711	0.09
712	0.09
713	0.11
714	0.16
715	0.17
716	0.17
717	0.2
718	0.22
719	0.23
720	0.25
721	0.25
722	0.22
723	0.2
724	0.18
725	0.15
726	0.13
727	0.11
728	0.1
729	0.1
730	0.09
731	0.1
732	0.12
733	0.13
734	0.14
735	0.15
736	0.14
737	0.13
738	0.14
739	0.12
740	0.1
741	0.11
742	0.1
743	0.1
744	0.1
745	0.09
746	0.09
747	0.12
748	0.14
749	0.14
750	0.16
751	0.18
752	0.23
753	0.28
754	0.3
755	0.31
756	0.35
757	0.42
758	0.41
759	0.42
760	0.38
761	0.34
762	0.33
763	0.3
764	0.24
765	0.16
766	0.14
767	0.1
768	0.09
769	0.09
770	0.08
771	0.08
772	0.1
773	0.09
774	0.09
775	0.11
776	0.14
777	0.18
778	0.22
779	0.25
780	0.28
781	0.34
782	0.43
783	0.47
784	0.5
785	0.49
786	0.55
787	0.61
788	0.66
789	0.66
790	0.66
791	0.63
792	0.63
793	0.66
794	0.61
795	0.56
796	0.5
797	0.44
798	0.38
799	0.36
800	0.31
801	0.25
802	0.2
803	0.15
804	0.11
805	0.11
806	0.08
807	0.07
808	0.07
809	0.06
810	0.06
811	0.06
812	0.06
813	0.05
814	0.07
815	0.07
816	0.05
817	0.05
818	0.05
819	0.06
820	0.06
821	0.07
822	0.07
823	0.07
824	0.07
825	0.1
826	0.11
827	0.1
828	0.12
829	0.11
830	0.11
831	0.11
832	0.11
833	0.07
834	0.08
835	0.08
836	0.07
837	0.1
838	0.1
839	0.1
840	0.11
841	0.12
842	0.11
843	0.11
844	0.11
845	0.08
846	0.09
847	0.1
848	0.09
849	0.1
850	0.12
851	0.12
852	0.13
853	0.14
854	0.15
855	0.19
856	0.25
857	0.26
858	0.25
859	0.27
860	0.32
861	0.37
862	0.36
863	0.32
864	0.25
865	0.24
866	0.23
867	0.21
868	0.16
869	0.13
870	0.12
871	0.12
872	0.12
873	0.13
874	0.14
875	0.17
876	0.16
877	0.14
878	0.16
879	0.17
880	0.18
881	0.23
882	0.28
883	0.29
884	0.31
885	0.33
886	0.34
887	0.32
888	0.31
889	0.24
890	0.18
891	0.13
892	0.12
893	0.09
894	0.06
895	0.07
896	0.08
897	0.08
898	0.14
899	0.15
900	0.15
901	0.14
902	0.17
903	0.16
904	0.17
905	0.2
906	0.17
907	0.18
908	0.18
909	0.19
910	0.2
911	0.21
912	0.25
913	0.27
914	0.3
915	0.31
916	0.31
917	0.31
918	0.31
919	0.32
920	0.3
921	0.31
922	0.3
923	0.28
924	0.29
925	0.28
926	0.24
927	0.22
928	0.19
929	0.13
930	0.08
931	0.08
932	0.08
933	0.09
934	0.08
935	0.09
936	0.09
937	0.11
938	0.14
939	0.16
940	0.17
941	0.22
942	0.24
943	0.3
944	0.34
945	0.37
946	0.39
947	0.42
948	0.43
949	0.4
950	0.4
951	0.35
952	0.36
953	0.31
954	0.27
955	0.27
956	0.23
957	0.22
958	0.26
959	0.26
960	0.26
961	0.33
962	0.33
963	0.32
964	0.34
965	0.33
966	0.27
967	0.26
968	0.23
969	0.16
970	0.14
971	0.14
972	0.12
973	0.12
974	0.14
975	0.15
976	0.19
977	0.19
978	0.25
979	0.27
980	0.3
981	0.3
982	0.29
983	0.31
984	0.26
985	0.24
986	0.21
987	0.17
988	0.14
989	0.13
990	0.19
991	0.18
992	0.19
993	0.2
994	0.2
995	0.21
996	0.21
997	0.21
998	0.22
999	0.27
1000	0.26
1001	0.28
1002	0.29
1003	0.3
1004	0.34
1005	0.36
1006	0.3
1007	0.28
1008	0.28
1009	0.25
1010	0.31
1011	0.3
1012	0.32
1013	0.36
1014	0.36
1015	0.35
1016	0.34
1017	0.34
1018	0.26
1019	0.29
1020	0.26
1021	0.25
1022	0.26
1023	0.23
1024	0.21
1025	0.22
1026	0.22
1027	0.22
1028	0.25
1029	0.27
1030	0.28
1031	0.3
1032	0.31

K1WA03

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer