Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A427YDI8

Protein Details
Accession A0A427YDI8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
376-419KYDREERRSSRYEDKERRDRKYEDDRGSRRDRSRSRSPAKRHLVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
382-417RRSSRYEDKERRDRKYEDDRGSRRDRSRSRSPAKRH
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11, nucl 10, cyto 10, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004882  Luc7-rel  
Gene Ontology GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006376  P:mRNA splice site selection  
Pfam View protein in Pfam  
PF03194  LUC7  
Amino Acid Sequences MGRMAEAQRRLLEQMMGAEAMGITQQNVDWWDEKVCRNYLFGTCPHILFGNTKMDLGICPKLHSERILKQFQEHVAANPSDPRVAAFRQEHENSLYGFVDDADRRIRAAQRKLEKTPEENRKTVDLMREIGEIELSIQGATEEMEALGEAGKVEESMQKLATVDALRGEKASKERELQELNENAGASGHQKLRVCEICGAMLSVLDSDKRLADHFGGKLHLGYQELRRLLGEFAEARMTGRNGSAAAVGPGGASSGYGPRAGAPPAGAPSGPSAPPPGPPGPSGPPPPAFAPSSRRESFLSDDRERDGRPHTPSTAPKVPPADEMPVVGHGDKVKREAGELVEDVKEDRERSTRDRSRDGERDRDKERDREERYDKYDREERRSSRYEDKERRDRKYEDDRGSRRDRSRSRSPAKRHLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.19
3 0.17
4 0.14
5 0.13
6 0.1
7 0.09
8 0.09
9 0.07
10 0.05
11 0.06
12 0.06
13 0.08
14 0.1
15 0.12
16 0.13
17 0.14
18 0.19
19 0.24
20 0.28
21 0.32
22 0.35
23 0.34
24 0.34
25 0.36
26 0.35
27 0.35
28 0.33
29 0.34
30 0.31
31 0.3
32 0.29
33 0.27
34 0.24
35 0.22
36 0.24
37 0.25
38 0.23
39 0.23
40 0.22
41 0.21
42 0.21
43 0.23
44 0.26
45 0.19
46 0.2
47 0.24
48 0.27
49 0.29
50 0.33
51 0.36
52 0.38
53 0.46
54 0.51
55 0.49
56 0.49
57 0.52
58 0.48
59 0.47
60 0.39
61 0.33
62 0.32
63 0.31
64 0.29
65 0.27
66 0.26
67 0.21
68 0.2
69 0.19
70 0.16
71 0.17
72 0.24
73 0.23
74 0.26
75 0.33
76 0.35
77 0.35
78 0.34
79 0.35
80 0.28
81 0.27
82 0.23
83 0.15
84 0.14
85 0.12
86 0.14
87 0.12
88 0.14
89 0.14
90 0.14
91 0.15
92 0.19
93 0.25
94 0.29
95 0.37
96 0.44
97 0.51
98 0.58
99 0.61
100 0.66
101 0.64
102 0.62
103 0.64
104 0.66
105 0.62
106 0.58
107 0.55
108 0.5
109 0.48
110 0.44
111 0.4
112 0.31
113 0.27
114 0.26
115 0.24
116 0.22
117 0.19
118 0.16
119 0.11
120 0.09
121 0.07
122 0.06
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.05
128 0.04
129 0.04
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.04
134 0.04
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.04
141 0.07
142 0.08
143 0.09
144 0.09
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.12
149 0.1
150 0.09
151 0.11
152 0.12
153 0.11
154 0.12
155 0.12
156 0.12
157 0.15
158 0.19
159 0.18
160 0.21
161 0.23
162 0.27
163 0.29
164 0.28
165 0.3
166 0.28
167 0.27
168 0.24
169 0.22
170 0.17
171 0.15
172 0.13
173 0.08
174 0.11
175 0.11
176 0.13
177 0.15
178 0.15
179 0.21
180 0.23
181 0.23
182 0.22
183 0.21
184 0.18
185 0.17
186 0.17
187 0.11
188 0.08
189 0.07
190 0.05
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.07
199 0.08
200 0.11
201 0.12
202 0.12
203 0.13
204 0.13
205 0.12
206 0.12
207 0.11
208 0.1
209 0.11
210 0.12
211 0.16
212 0.16
213 0.16
214 0.16
215 0.16
216 0.15
217 0.13
218 0.12
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.08
224 0.09
225 0.09
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.07
230 0.08
231 0.08
232 0.07
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.04
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.08
251 0.09
252 0.1
253 0.11
254 0.1
255 0.09
256 0.1
257 0.12
258 0.12
259 0.11
260 0.13
261 0.13
262 0.15
263 0.19
264 0.19
265 0.18
266 0.19
267 0.22
268 0.24
269 0.28
270 0.3
271 0.29
272 0.29
273 0.3
274 0.3
275 0.29
276 0.26
277 0.25
278 0.28
279 0.29
280 0.35
281 0.34
282 0.35
283 0.33
284 0.35
285 0.37
286 0.38
287 0.42
288 0.37
289 0.38
290 0.38
291 0.39
292 0.37
293 0.34
294 0.32
295 0.3
296 0.32
297 0.35
298 0.35
299 0.39
300 0.43
301 0.49
302 0.52
303 0.47
304 0.47
305 0.46
306 0.44
307 0.42
308 0.4
309 0.35
310 0.27
311 0.26
312 0.22
313 0.21
314 0.2
315 0.17
316 0.15
317 0.15
318 0.18
319 0.18
320 0.2
321 0.21
322 0.2
323 0.22
324 0.23
325 0.21
326 0.22
327 0.22
328 0.21
329 0.19
330 0.19
331 0.18
332 0.18
333 0.18
334 0.15
335 0.17
336 0.21
337 0.26
338 0.32
339 0.42
340 0.47
341 0.51
342 0.59
343 0.6
344 0.63
345 0.68
346 0.69
347 0.69
348 0.69
349 0.69
350 0.66
351 0.72
352 0.68
353 0.66
354 0.67
355 0.67
356 0.66
357 0.69
358 0.71
359 0.7
360 0.72
361 0.73
362 0.67
363 0.65
364 0.66
365 0.63
366 0.64
367 0.65
368 0.62
369 0.62
370 0.67
371 0.65
372 0.68
373 0.71
374 0.74
375 0.74
376 0.8
377 0.82
378 0.84
379 0.86
380 0.84
381 0.78
382 0.76
383 0.77
384 0.76
385 0.76
386 0.78
387 0.76
388 0.77
389 0.81
390 0.81
391 0.77
392 0.78
393 0.77
394 0.75
395 0.79
396 0.81
397 0.83
398 0.84
399 0.86