FuNGI

A0A427YLH5

Protein Details

Accession

A0A427YLH5

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
411-432	DSSGRQIRKLPNKRFERIKLDN	Hydrophilic
467-493	IVTRGAGFRKEKNKKKRGSYVGGQITL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
307-317	AKAVAGKKRKA
474-483	FRKEKNKKKR

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 12.5, cyto 10.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006594 LisH IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
Pfam	View protein in Pfam PF08513 LisH PF05022 SRP40_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS50896 LISH

Amino Acid Sequences

MAPAAPKTETQLDAAVLAYLAKRGFSRAAKAFEKEAGTKASGAEDLEKAWKLLSGAKNEDVEMESENESDSDSSDSGSDDSDSESSDEEVQVEVKKTESKPVEPSKVPLPPSPSGSGSSSSDSDSESESESSSASSDSDSDSGSSTDDEDEDEDEVKGKSKTSDAIAPALAISASLATESDTVRGDSVPPSAKQLDVESSSSSGSSSSSSSSSSESSSDSDSDSDSESSDSESSEDDEDTSGSSAQDAKAAEGFLDLEAEVSSNEEASSDESESESESESDSDSDSNSESSSSSSSDDEQPSKPSPAKAVAGKKRKAPSPSPSSSSSSSSSSSSASSSSSSSSSSSSSSSSSSSSASSSSSSPAPAAGGKKRKLSTSTSVPIPPTTTTTTTSSSTPGPSGTATPEVQVEVDSSGRQIRKLPNKRFERIKLDNVTYHHDGLRDNSFEARERAGADPNDYGARASRDLIVTRGAGFRKEKNKKKRGSYVGGQITLQTHSIKFDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.17
3	0.11
4	0.11
5	0.09
6	0.1
7	0.09
8	0.1
9	0.1
10	0.13
11	0.2
12	0.23
13	0.31
14	0.35
15	0.43
16	0.46
17	0.48
18	0.48
19	0.46
20	0.47
21	0.41
22	0.37
23	0.34
24	0.31
25	0.28
26	0.26
27	0.23
28	0.2
29	0.19
30	0.18
31	0.15
32	0.15
33	0.19
34	0.19
35	0.17
36	0.16
37	0.16
38	0.15
39	0.22
40	0.26
41	0.28
42	0.33
43	0.36
44	0.37
45	0.36
46	0.36
47	0.29
48	0.25
49	0.2
50	0.17
51	0.14
52	0.13
53	0.14
54	0.12
55	0.12
56	0.11
57	0.1
58	0.1
59	0.09
60	0.09
61	0.09
62	0.1
63	0.1
64	0.1
65	0.1
66	0.08
67	0.1
68	0.1
69	0.1
70	0.1
71	0.11
72	0.11
73	0.12
74	0.11
75	0.1
76	0.1
77	0.11
78	0.13
79	0.14
80	0.13
81	0.14
82	0.2
83	0.2
84	0.28
85	0.31
86	0.32
87	0.4
88	0.48
89	0.54
90	0.49
91	0.52
92	0.5
93	0.51
94	0.5
95	0.44
96	0.42
97	0.37
98	0.41
99	0.4
100	0.35
101	0.33
102	0.31
103	0.31
104	0.26
105	0.26
106	0.22
107	0.2
108	0.19
109	0.17
110	0.16
111	0.15
112	0.13
113	0.13
114	0.12
115	0.12
116	0.11
117	0.11
118	0.1
119	0.09
120	0.08
121	0.06
122	0.06
123	0.06
124	0.08
125	0.08
126	0.08
127	0.08
128	0.09
129	0.09
130	0.09
131	0.09
132	0.08
133	0.08
134	0.08
135	0.08
136	0.08
137	0.08
138	0.08
139	0.09
140	0.08
141	0.09
142	0.09
143	0.11
144	0.11
145	0.11
146	0.11
147	0.12
148	0.14
149	0.15
150	0.2
151	0.19
152	0.2
153	0.19
154	0.18
155	0.17
156	0.14
157	0.12
158	0.07
159	0.05
160	0.03
161	0.03
162	0.03
163	0.03
164	0.03
165	0.05
166	0.05
167	0.07
168	0.07
169	0.07
170	0.08
171	0.08
172	0.09
173	0.08
174	0.12
175	0.13
176	0.13
177	0.17
178	0.17
179	0.17
180	0.17
181	0.17
182	0.17
183	0.16
184	0.17
185	0.14
186	0.14
187	0.14
188	0.13
189	0.11
190	0.09
191	0.07
192	0.07
193	0.07
194	0.07
195	0.08
196	0.09
197	0.09
198	0.11
199	0.11
200	0.11
201	0.11
202	0.11
203	0.11
204	0.12
205	0.11
206	0.11
207	0.1
208	0.1
209	0.1
210	0.1
211	0.09
212	0.08
213	0.08
214	0.07
215	0.08
216	0.08
217	0.07
218	0.06
219	0.06
220	0.07
221	0.08
222	0.07
223	0.07
224	0.07
225	0.06
226	0.06
227	0.06
228	0.06
229	0.05
230	0.05
231	0.06
232	0.06
233	0.08
234	0.08
235	0.08
236	0.08
237	0.08
238	0.08
239	0.07
240	0.07
241	0.04
242	0.05
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.04
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.04
251	0.04
252	0.04
253	0.04
254	0.05
255	0.07
256	0.06
257	0.07
258	0.07
259	0.07
260	0.07
261	0.08
262	0.07
263	0.06
264	0.06
265	0.06
266	0.06
267	0.06
268	0.06
269	0.06
270	0.06
271	0.06
272	0.06
273	0.06
274	0.06
275	0.06
276	0.06
277	0.07
278	0.07
279	0.08
280	0.09
281	0.09
282	0.11
283	0.15
284	0.17
285	0.19
286	0.2
287	0.23
288	0.23
289	0.26
290	0.26
291	0.23
292	0.23
293	0.23
294	0.26
295	0.28
296	0.36
297	0.42
298	0.5
299	0.52
300	0.56
301	0.57
302	0.59
303	0.59
304	0.56
305	0.56
306	0.56
307	0.57
308	0.54
309	0.53
310	0.52
311	0.48
312	0.44
313	0.38
314	0.3
315	0.27
316	0.24
317	0.22
318	0.18
319	0.17
320	0.14
321	0.12
322	0.11
323	0.11
324	0.1
325	0.11
326	0.1
327	0.11
328	0.11
329	0.12
330	0.12
331	0.12
332	0.12
333	0.12
334	0.12
335	0.13
336	0.13
337	0.13
338	0.13
339	0.12
340	0.12
341	0.11
342	0.11
343	0.11
344	0.11
345	0.11
346	0.12
347	0.12
348	0.12
349	0.11
350	0.11
351	0.11
352	0.13
353	0.17
354	0.23
355	0.31
356	0.34
357	0.41
358	0.43
359	0.46
360	0.46
361	0.48
362	0.47
363	0.47
364	0.48
365	0.45
366	0.46
367	0.44
368	0.41
369	0.37
370	0.31
371	0.25
372	0.25
373	0.23
374	0.24
375	0.25
376	0.27
377	0.27
378	0.26
379	0.25
380	0.23
381	0.22
382	0.19
383	0.17
384	0.15
385	0.14
386	0.15
387	0.15
388	0.17
389	0.16
390	0.16
391	0.16
392	0.16
393	0.15
394	0.14
395	0.12
396	0.09
397	0.1
398	0.09
399	0.1
400	0.15
401	0.16
402	0.17
403	0.22
404	0.31
405	0.41
406	0.52
407	0.61
408	0.65
409	0.72
410	0.79
411	0.82
412	0.81
413	0.8
414	0.77
415	0.76
416	0.73
417	0.69
418	0.66
419	0.59
420	0.58
421	0.52
422	0.46
423	0.38
424	0.33
425	0.29
426	0.29
427	0.32
428	0.26
429	0.24
430	0.25
431	0.26
432	0.27
433	0.29
434	0.27
435	0.22
436	0.23
437	0.24
438	0.28
439	0.28
440	0.27
441	0.26
442	0.26
443	0.26
444	0.24
445	0.22
446	0.19
447	0.21
448	0.19
449	0.2
450	0.21
451	0.23
452	0.24
453	0.25
454	0.24
455	0.21
456	0.21
457	0.26
458	0.24
459	0.26
460	0.29
461	0.37
462	0.45
463	0.55
464	0.63
465	0.69
466	0.78
467	0.82
468	0.88
469	0.9
470	0.89
471	0.87
472	0.85
473	0.84
474	0.82
475	0.75
476	0.64
477	0.56
478	0.47
479	0.4
480	0.34
481	0.26
482	0.18

A0A427YLH5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer