FuNGI

A0A427YVE3

Protein Details

Accession

A0A427YVE3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
109-128	GVAPRAKMNQQRSRRFRAAQ	Hydrophilic
679-705	AERVEGKRGKKKGKRGKKRKYDEAEED	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
684-698	GKRGKKKGKRGKKRK

Subcellular Location(s)

mito 12.5, cyto_mito 11, cyto 8.5, nucl 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSKKYPKIVSRVVEETPTKVRNSDGEIVEVPVRYEGQNPNGFEVDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPAPETEEDMMVEIFNYTERVVNMARPRKVLMMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQEAADKEEERKEAIKLFEAMGHPVSEETKNQKSWDSNAITPGTPFMDLLSASLKYWVSYKLTNDPGWKDLKVIISDASVPGEGEHKIVDWIRRQRSYPDWEPNTSHVIYGLDADLIMLSLATHEPYFRVLREDVFFQGSKDPQACRKCGEKGHFSANCKGEKKMKDPNVVEKAKPVDPKPFIFLDVACLREYLAVELNLPNVPFPFDLELAIDDWIFMIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDVLLKIWRAELPRMGGYLTNHGKVDLARAQVILEGLAKSEDEIFQRRKEDEERQDNNAKRRRIEDHRRQDEAKAKREGTTVLNGQEFVAVTPAATARGGALHPSLPQRPGFDLVPKEEAEAVGDAKAATAAGGAAAAAPSPPGKKLNKTERAAEAIKQGREQGLAALQGSNEDIVKNRRAIRMANLSAAEKLKAELEGRATIADGEKSGPETVVMQRTEDEEQVEMTREEAREVLEEQGEEGGVDEEIVPREIQPDSEDGEAEVDRPGSEPMEAETETEPPSRASRVDGTTEADGDVGDVEVVGETETQTEAERVEGKRGKKKGKRGKKRKYDEAEEDLTSSSESESEAPPDIEADQPVPKKKLKFNPDGTVEGYEDDVKLWEPGYRERYYRNKFGVELSDREFVDQITKSYMEGLCWVLEYYYQGVPAWDWYYPYHYAPFAQDFRDVDKMKIEFQPAVPFKPFAQLLGVFPAASRKHLPSPLQSLMIDEDSPILDFYPEDFDIDMNGKKMAWQGVALLPFIDQTRLLDALRSKEEHLTDDEKRRNTWGDNIMFISEGHPLYDPFCQLYTLKAVTKPVPLDMRLSQGTNGAVLADPSCVPNSAFDSPLATIDECPDIENNASLSVRYYFPRQSHKHRSILLRGFRPPPPRLTESDKDWVRRGGGGGRNGPRNSNGHGHHQHQQRHTGGPGVARNGGNGGYGNGNSGYNSGTSTPRNGPGPGGPGGPPRGGGGYPNPREMAGYGVHSAPPQSAYGYGAGSYGGGAYGGPGAGAGAGSYGGGGGYGATATPAYGGYPPPRGPHGAPPNPYGGAPPGSHAGQGGYGGYGASARGAYGGNPYAAQPPRGQQHKRF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.6
2	0.65
3	0.68
4	0.72
5	0.69
6	0.66
7	0.63
8	0.57
9	0.54
10	0.5
11	0.46
12	0.46
13	0.44
14	0.38
15	0.35
16	0.35
17	0.32
18	0.37
19	0.4
20	0.34
21	0.34
22	0.34
23	0.35
24	0.35
25	0.31
26	0.25
27	0.18
28	0.19
29	0.15
30	0.2
31	0.23
32	0.29
33	0.35
34	0.36
35	0.38
36	0.38
37	0.37
38	0.31
39	0.3
40	0.24
41	0.18
42	0.18
43	0.14
44	0.13
45	0.13
46	0.13
47	0.09
48	0.08
49	0.08
50	0.08
51	0.09
52	0.1
53	0.12
54	0.17
55	0.2
56	0.2
57	0.27
58	0.33
59	0.36
60	0.41
61	0.4
62	0.4
63	0.39
64	0.42
65	0.36
66	0.33
67	0.28
68	0.24
69	0.22
70	0.17
71	0.15
72	0.11
73	0.09
74	0.07
75	0.08
76	0.07
77	0.09
78	0.1
79	0.13
80	0.14
81	0.21
82	0.3
83	0.38
84	0.41
85	0.41
86	0.43
87	0.42
88	0.43
89	0.4
90	0.33
91	0.29
92	0.27
93	0.25
94	0.24
95	0.21
96	0.21
97	0.18
98	0.15
99	0.1
100	0.13
101	0.2
102	0.26
103	0.37
104	0.46
105	0.55
106	0.66
107	0.74
108	0.8
109	0.81
110	0.78
111	0.74
112	0.75
113	0.72
114	0.68
115	0.69
116	0.62
117	0.58
118	0.57
119	0.51
120	0.43
121	0.4
122	0.34
123	0.28
124	0.27
125	0.26
126	0.26
127	0.28
128	0.29
129	0.26
130	0.25
131	0.27
132	0.26
133	0.26
134	0.23
135	0.2
136	0.17
137	0.16
138	0.18
139	0.15
140	0.19
141	0.24
142	0.29
143	0.32
144	0.33
145	0.38
146	0.38
147	0.4
148	0.45
149	0.43
150	0.39
151	0.41
152	0.42
153	0.37
154	0.34
155	0.31
156	0.23
157	0.18
158	0.16
159	0.11
160	0.1
161	0.1
162	0.11
163	0.12
164	0.11
165	0.11
166	0.14
167	0.13
168	0.12
169	0.14
170	0.16
171	0.17
172	0.2
173	0.24
174	0.3
175	0.35
176	0.38
177	0.42
178	0.42
179	0.42
180	0.42
181	0.39
182	0.32
183	0.3
184	0.31
185	0.27
186	0.25
187	0.21
188	0.18
189	0.19
190	0.18
191	0.16
192	0.12
193	0.1
194	0.1
195	0.11
196	0.1
197	0.09
198	0.09
199	0.08
200	0.11
201	0.14
202	0.19
203	0.25
204	0.34
205	0.41
206	0.45
207	0.47
208	0.5
209	0.55
210	0.59
211	0.59
212	0.61
213	0.58
214	0.58
215	0.59
216	0.56
217	0.54
218	0.45
219	0.36
220	0.27
221	0.22
222	0.18
223	0.16
224	0.14
225	0.08
226	0.07
227	0.07
228	0.06
229	0.05
230	0.05
231	0.03
232	0.03
233	0.04
234	0.04
235	0.05
236	0.05
237	0.06
238	0.06
239	0.1
240	0.12
241	0.12
242	0.16
243	0.16
244	0.19
245	0.21
246	0.23
247	0.21
248	0.23
249	0.23
250	0.2
251	0.24
252	0.22
253	0.23
254	0.24
255	0.25
256	0.3
257	0.36
258	0.37
259	0.36
260	0.41
261	0.44
262	0.48
263	0.52
264	0.52
265	0.5
266	0.58
267	0.59
268	0.57
269	0.59
270	0.56
271	0.56
272	0.5
273	0.5
274	0.49
275	0.49
276	0.51
277	0.54
278	0.57
279	0.59
280	0.61
281	0.67
282	0.69
283	0.66
284	0.6
285	0.55
286	0.51
287	0.47
288	0.48
289	0.41
290	0.4
291	0.4
292	0.42
293	0.4
294	0.37
295	0.34
296	0.3
297	0.27
298	0.24
299	0.23
300	0.22
301	0.19
302	0.18
303	0.16
304	0.16
305	0.16
306	0.12
307	0.12
308	0.1
309	0.11
310	0.12
311	0.13
312	0.13
313	0.12
314	0.11
315	0.09
316	0.1
317	0.09
318	0.1
319	0.11
320	0.11
321	0.11
322	0.11
323	0.12
324	0.11
325	0.11
326	0.09
327	0.06
328	0.06
329	0.06
330	0.05
331	0.04
332	0.04
333	0.03
334	0.04
335	0.04
336	0.05
337	0.05
338	0.06
339	0.07
340	0.07
341	0.08
342	0.08
343	0.08
344	0.08
345	0.09
346	0.12
347	0.13
348	0.13
349	0.12
350	0.12
351	0.12
352	0.11
353	0.11
354	0.07
355	0.05
356	0.06
357	0.07
358	0.07
359	0.06
360	0.07
361	0.09
362	0.11
363	0.13
364	0.14
365	0.17
366	0.18
367	0.19
368	0.18
369	0.18
370	0.17
371	0.23
372	0.23
373	0.22
374	0.21
375	0.21
376	0.21
377	0.19
378	0.23
379	0.18
380	0.17
381	0.15
382	0.15
383	0.15
384	0.15
385	0.15
386	0.11
387	0.08
388	0.06
389	0.06
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.07
394	0.08
395	0.09
396	0.15
397	0.18
398	0.21
399	0.24
400	0.25
401	0.28
402	0.32
403	0.39
404	0.42
405	0.5
406	0.51
407	0.54
408	0.62
409	0.62
410	0.66
411	0.64
412	0.58
413	0.5
414	0.51
415	0.52
416	0.55
417	0.61
418	0.63
419	0.67
420	0.7
421	0.73
422	0.69
423	0.67
424	0.65
425	0.62
426	0.58
427	0.53
428	0.47
429	0.44
430	0.44
431	0.4
432	0.34
433	0.31
434	0.27
435	0.23
436	0.22
437	0.2
438	0.19
439	0.18
440	0.15
441	0.1
442	0.08
443	0.06
444	0.05
445	0.06
446	0.06
447	0.05
448	0.05
449	0.05
450	0.04
451	0.06
452	0.06
453	0.06
454	0.07
455	0.07
456	0.09
457	0.13
458	0.14
459	0.15
460	0.16
461	0.17
462	0.18
463	0.2
464	0.19
465	0.21
466	0.21
467	0.22
468	0.24
469	0.22
470	0.21
471	0.18
472	0.17
473	0.13
474	0.11
475	0.09
476	0.06
477	0.07
478	0.06
479	0.05
480	0.05
481	0.04
482	0.03
483	0.03
484	0.03
485	0.02
486	0.02
487	0.02
488	0.02
489	0.02
490	0.02
491	0.02
492	0.03
493	0.04
494	0.05
495	0.06
496	0.12
497	0.14
498	0.21
499	0.3
500	0.4
501	0.49
502	0.5
503	0.53
504	0.5
505	0.53
506	0.49
507	0.41
508	0.38
509	0.34
510	0.32
511	0.28
512	0.27
513	0.22
514	0.21
515	0.19
516	0.13
517	0.09
518	0.09
519	0.08
520	0.08
521	0.07
522	0.07
523	0.07
524	0.06
525	0.05
526	0.05
527	0.06
528	0.1
529	0.12
530	0.16
531	0.19
532	0.21
533	0.22
534	0.23
535	0.27
536	0.32
537	0.31
538	0.29
539	0.27
540	0.25
541	0.25
542	0.24
543	0.19
544	0.11
545	0.1
546	0.09
547	0.09
548	0.09
549	0.08
550	0.1
551	0.1
552	0.1
553	0.1
554	0.09
555	0.08
556	0.08
557	0.07
558	0.06
559	0.05
560	0.05
561	0.06
562	0.07
563	0.06
564	0.06
565	0.07
566	0.09
567	0.13
568	0.14
569	0.13
570	0.13
571	0.15
572	0.16
573	0.15
574	0.14
575	0.09
576	0.09
577	0.09
578	0.1
579	0.08
580	0.07
581	0.09
582	0.08
583	0.09
584	0.08
585	0.08
586	0.08
587	0.09
588	0.09
589	0.08
590	0.07
591	0.07
592	0.07
593	0.06
594	0.05
595	0.05
596	0.04
597	0.03
598	0.03
599	0.03
600	0.04
601	0.04
602	0.05
603	0.05
604	0.04
605	0.06
606	0.06
607	0.06
608	0.07
609	0.08
610	0.09
611	0.09
612	0.09
613	0.07
614	0.09
615	0.08
616	0.08
617	0.07
618	0.05
619	0.05
620	0.06
621	0.06
622	0.05
623	0.05
624	0.05
625	0.06
626	0.08
627	0.08
628	0.09
629	0.09
630	0.1
631	0.11
632	0.12
633	0.11
634	0.1
635	0.11
636	0.11
637	0.11
638	0.12
639	0.14
640	0.15
641	0.17
642	0.17
643	0.18
644	0.17
645	0.17
646	0.14
647	0.11
648	0.09
649	0.07
650	0.06
651	0.03
652	0.03
653	0.02
654	0.02
655	0.02
656	0.02
657	0.02
658	0.03
659	0.03
660	0.03
661	0.04
662	0.04
663	0.04
664	0.05
665	0.05
666	0.06
667	0.1
668	0.1
669	0.18
670	0.22
671	0.26
672	0.34
673	0.41
674	0.5
675	0.52
676	0.63
677	0.67
678	0.74
679	0.8
680	0.84
681	0.88
682	0.89
683	0.91
684	0.91
685	0.88
686	0.84
687	0.79
688	0.74
689	0.66
690	0.55
691	0.47
692	0.37
693	0.29
694	0.21
695	0.14
696	0.08
697	0.05
698	0.05
699	0.06
700	0.06
701	0.08
702	0.08
703	0.08
704	0.08
705	0.09
706	0.09
707	0.08
708	0.08
709	0.08
710	0.12
711	0.15
712	0.19
713	0.22
714	0.25
715	0.29
716	0.36
717	0.44
718	0.48
719	0.54
720	0.57
721	0.61
722	0.61
723	0.59
724	0.53
725	0.45
726	0.37
727	0.28
728	0.22
729	0.15
730	0.11
731	0.09
732	0.08
733	0.06
734	0.06
735	0.06
736	0.07
737	0.09
738	0.14
739	0.2
740	0.22
741	0.23
742	0.3
743	0.4
744	0.43
745	0.49
746	0.47
747	0.43
748	0.42
749	0.43
750	0.43
751	0.36
752	0.34
753	0.3
754	0.3
755	0.28
756	0.28
757	0.26
758	0.18
759	0.19
760	0.16
761	0.14
762	0.12
763	0.12
764	0.12
765	0.15
766	0.15
767	0.11
768	0.12
769	0.12
770	0.1
771	0.1
772	0.1
773	0.07
774	0.07
775	0.08
776	0.09
777	0.08
778	0.09
779	0.08
780	0.09
781	0.09
782	0.1
783	0.1
784	0.08
785	0.09
786	0.1
787	0.14
788	0.16
789	0.17
790	0.16
791	0.15
792	0.16
793	0.17
794	0.22
795	0.19
796	0.19
797	0.2
798	0.2
799	0.23
800	0.29
801	0.28
802	0.24
803	0.27
804	0.26
805	0.27
806	0.29
807	0.27
808	0.21
809	0.21
810	0.3
811	0.27
812	0.29
813	0.27
814	0.25
815	0.24
816	0.27
817	0.26
818	0.17
819	0.18
820	0.16
821	0.16
822	0.18
823	0.18
824	0.12
825	0.12
826	0.18
827	0.15
828	0.17
829	0.19
830	0.19
831	0.23
832	0.29
833	0.31
834	0.31
835	0.37
836	0.37
837	0.37
838	0.34
839	0.3
840	0.27
841	0.25
842	0.2
843	0.13
844	0.11
845	0.09
846	0.09
847	0.08
848	0.06
849	0.05
850	0.05
851	0.06
852	0.1
853	0.1
854	0.1
855	0.1
856	0.1
857	0.11
858	0.14
859	0.14
860	0.1
861	0.1
862	0.1
863	0.11
864	0.13
865	0.14
866	0.12
867	0.11
868	0.12
869	0.15
870	0.17
871	0.15
872	0.13
873	0.11
874	0.11
875	0.11
876	0.1
877	0.07
878	0.07
879	0.09
880	0.1
881	0.1
882	0.13
883	0.15
884	0.18
885	0.22
886	0.23
887	0.22
888	0.24
889	0.25
890	0.25
891	0.27
892	0.28
893	0.31
894	0.39
895	0.44
896	0.42
897	0.42
898	0.43
899	0.42
900	0.39
901	0.4
902	0.39
903	0.35
904	0.35
905	0.34
906	0.31
907	0.28
908	0.26
909	0.19
910	0.14
911	0.12
912	0.11
913	0.1
914	0.1
915	0.12
916	0.14
917	0.13
918	0.12
919	0.12
920	0.13
921	0.13
922	0.14
923	0.17
924	0.18
925	0.19
926	0.2
927	0.23
928	0.24
929	0.28
930	0.27
931	0.28
932	0.29
933	0.27
934	0.3
935	0.28
936	0.31
937	0.28
938	0.28
939	0.23
940	0.22
941	0.21
942	0.17
943	0.15
944	0.1
945	0.09
946	0.08
947	0.08
948	0.07
949	0.07
950	0.08
951	0.09
952	0.09
953	0.09
954	0.11
955	0.15
956	0.16
957	0.17
958	0.16
959	0.18
960	0.17
961	0.18
962	0.18
963	0.14
964	0.12
965	0.13
966	0.15
967	0.12
968	0.13
969	0.12
970	0.12
971	0.12
972	0.13
973	0.11
974	0.12
975	0.12
976	0.11
977	0.12
978	0.13
979	0.14
980	0.15
981	0.19
982	0.23
983	0.28
984	0.38
985	0.44
986	0.52
987	0.61
988	0.67
989	0.69
990	0.7
991	0.72
992	0.72
993	0.74
994	0.72
995	0.67
996	0.65
997	0.63
998	0.62
999	0.63
1000	0.56
1001	0.54
1002	0.53
1003	0.51
1004	0.51
1005	0.54
1006	0.54
1007	0.52
1008	0.58
1009	0.57
1010	0.53
1011	0.52
1012	0.5
1013	0.42
1014	0.39
1015	0.35
1016	0.33
1017	0.34
1018	0.37
1019	0.42
1020	0.45
1021	0.51
1022	0.51
1023	0.5
1024	0.46
1025	0.43
1026	0.42
1027	0.42
1028	0.39
1029	0.41
1030	0.47
1031	0.49
1032	0.53
1033	0.58
1034	0.61
1035	0.58
1036	0.63
1037	0.56
1038	0.53
1039	0.5
1040	0.47
1041	0.4
1042	0.38
1043	0.37
1044	0.32
1045	0.34
1046	0.3
1047	0.29
1048	0.25
1049	0.24
1050	0.19
1051	0.15
1052	0.14
1053	0.11
1054	0.11
1055	0.12
1056	0.12
1057	0.12
1058	0.11
1059	0.12
1060	0.11
1061	0.09
1062	0.11
1063	0.11
1064	0.14
1065	0.16
1066	0.21
1067	0.24
1068	0.28
1069	0.3
1070	0.3
1071	0.3
1072	0.29
1073	0.32
1074	0.28
1075	0.26
1076	0.24
1077	0.26
1078	0.29
1079	0.27
1080	0.24
1081	0.21
1082	0.21
1083	0.19
1084	0.2
1085	0.24
1086	0.32
1087	0.35
1088	0.37
1089	0.37
1090	0.35
1091	0.36
1092	0.33
1093	0.27
1094	0.19
1095	0.18
1096	0.17
1097	0.17
1098	0.18
1099	0.17
1100	0.18
1101	0.15
1102	0.15
1103	0.13
1104	0.12
1105	0.12
1106	0.13
1107	0.14
1108	0.13
1109	0.12
1110	0.11
1111	0.1
1112	0.09
1113	0.08
1114	0.06
1115	0.05
1116	0.04
1117	0.04
1118	0.04
1119	0.05
1120	0.04
1121	0.04
1122	0.04
1123	0.04
1124	0.04
1125	0.04
1126	0.03
1127	0.03
1128	0.03
1129	0.03
1130	0.03
1131	0.03
1132	0.03
1133	0.03
1134	0.03
1135	0.03
1136	0.03
1137	0.03
1138	0.03
1139	0.04
1140	0.04
1141	0.04
1142	0.05
1143	0.05
1144	0.06
1145	0.08
1146	0.12
1147	0.16
1148	0.22
1149	0.25
1150	0.28
1151	0.31
1152	0.35
1153	0.37
1154	0.43
1155	0.5
1156	0.52
1157	0.54
1158	0.54
1159	0.55
1160	0.5
1161	0.47
1162	0.39
1163	0.32
1164	0.28
1165	0.24
1166	0.24
1167	0.23
1168	0.23
1169	0.23
1170	0.21
1171	0.18
1172	0.14
1173	0.15
1174	0.12
1175	0.09
1176	0.08
1177	0.08
1178	0.07
1179	0.07
1180	0.06
1181	0.06
1182	0.06
1183	0.05
1184	0.07
1185	0.07
1186	0.08
1187	0.13
1188	0.15
1189	0.15
1190	0.16
1191	0.17
1192	0.24
1193	0.26
1194	0.28
1195	0.26
1196	0.31
1197	0.4
1198	0.49

A0A427YVE3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer