FuNGI

A0A427YNP4

Protein Details

Accession

A0A427YNP4

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-26	MTDASAFLRKRKDKRRVASRPVGVGF	Hydrophilic
696-723	PGDNNARPKDPPRKKKKSSNTPTPGPEE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
9-17	RKRKDKRRV
169-176	PKRRGKKG
526-555	RPSRPPSRGPNAARTSSPSGRPRQPPTPGK
688-713	PSSKRKSEPGDNNARPKDPPRKKKKS

Subcellular Location(s)

mito 14, mito_nucl 11.833, cyto_mito 9.833, nucl 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MTDASAFLRKRKDKRRVASRPVGVGFSAAALAGSSSSASPAASSPQPQPIPPSALAAPAGPSGLKIEPGRDADAEAKARASGQIVEIKLVSSGLGLGADTRFNYPSSDTTQSEATGASSPPTFALDEEGNIIGRYLYDEKGQPVLGPDGRQVVETKERADASLIGGDGPKRRGKKGVKEVFHQDKDVMRLRREEAVPWILESGRPSTSISSSSSSPAPANGEASEGSANHVPEHWVGRLVEASTLPTVLLVNDGTDAGFKVVPMGRTYRFEPERPFKVLDPDAAHKLYEHQTKYKIHDRWAHREGGPDISSPANVSVMPNGLAVPGQPDVKPKIEREGEAQMRQEDRAARMEARMRAMRAAANGRVAGPKVKVERFDDDERKEGRQLTRGMEGGLDEELDYDFNEEFQDDEDVNTFYRDAEEEEEAKLQEERMKKEYKLANANVGDRPQIEEDMSDEEGLFGDHSLTADGKRLRRMMRKRMGSEDLFGDSDDDSDSSEDTVRSEKPKESKDAQADGERSAPGSAERPSRPPSRGPNAARTSSPSGRPRQPPTPGKASTAPPGSGHSLAAQRAFSRGASPRRSRGNSPLGRGTSPETRASPGPSGREASPVPGQSQSQGQGQGRGMSPPAGRAGSPVIRREASPAPGVPGGGIPSPTGSASGSGSRSKQLKRTESPTPGPGAGSAGGTPSSKRKSEPGDNNARPKDPPRKKKKSSNTPTPGPEEIPSFPGMISRDEILAWFRKQPALVPMPNAISAFRQRILDAKERQGDNQNLFLGWVSRLTSTEPGKMLKLKDEFR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.84
2	0.9
3	0.91
4	0.92
5	0.92
6	0.88
7	0.85
8	0.76
9	0.67
10	0.56
11	0.45
12	0.35
13	0.25
14	0.18
15	0.1
16	0.07
17	0.05
18	0.05
19	0.05
20	0.05
21	0.05
22	0.05
23	0.06
24	0.07
25	0.07
26	0.07
27	0.08
28	0.13
29	0.15
30	0.19
31	0.21
32	0.3
33	0.32
34	0.32
35	0.37
36	0.38
37	0.4
38	0.38
39	0.39
40	0.3
41	0.31
42	0.3
43	0.25
44	0.21
45	0.16
46	0.16
47	0.11
48	0.11
49	0.12
50	0.12
51	0.16
52	0.15
53	0.17
54	0.22
55	0.25
56	0.27
57	0.24
58	0.26
59	0.25
60	0.29
61	0.3
62	0.25
63	0.23
64	0.2
65	0.21
66	0.19
67	0.18
68	0.13
69	0.15
70	0.2
71	0.2
72	0.21
73	0.2
74	0.19
75	0.18
76	0.16
77	0.12
78	0.06
79	0.06
80	0.05
81	0.05
82	0.05
83	0.06
84	0.06
85	0.08
86	0.09
87	0.11
88	0.12
89	0.12
90	0.14
91	0.15
92	0.18
93	0.23
94	0.27
95	0.27
96	0.27
97	0.28
98	0.27
99	0.25
100	0.22
101	0.17
102	0.14
103	0.13
104	0.13
105	0.12
106	0.12
107	0.11
108	0.13
109	0.12
110	0.1
111	0.13
112	0.12
113	0.13
114	0.14
115	0.14
116	0.13
117	0.13
118	0.12
119	0.08
120	0.07
121	0.11
122	0.11
123	0.12
124	0.14
125	0.17
126	0.18
127	0.21
128	0.21
129	0.18
130	0.18
131	0.22
132	0.22
133	0.21
134	0.2
135	0.22
136	0.23
137	0.23
138	0.21
139	0.2
140	0.26
141	0.26
142	0.26
143	0.26
144	0.26
145	0.26
146	0.26
147	0.23
148	0.17
149	0.17
150	0.16
151	0.12
152	0.13
153	0.15
154	0.17
155	0.21
156	0.25
157	0.26
158	0.29
159	0.38
160	0.45
161	0.54
162	0.61
163	0.67
164	0.66
165	0.68
166	0.75
167	0.76
168	0.69
169	0.6
170	0.51
171	0.44
172	0.45
173	0.48
174	0.43
175	0.35
176	0.36
177	0.37
178	0.42
179	0.4
180	0.36
181	0.33
182	0.32
183	0.3
184	0.27
185	0.26
186	0.19
187	0.19
188	0.19
189	0.16
190	0.13
191	0.13
192	0.14
193	0.14
194	0.15
195	0.16
196	0.17
197	0.17
198	0.17
199	0.18
200	0.18
201	0.18
202	0.17
203	0.16
204	0.17
205	0.15
206	0.15
207	0.13
208	0.14
209	0.12
210	0.13
211	0.12
212	0.1
213	0.11
214	0.12
215	0.12
216	0.11
217	0.11
218	0.11
219	0.12
220	0.15
221	0.13
222	0.14
223	0.14
224	0.14
225	0.15
226	0.14
227	0.14
228	0.11
229	0.12
230	0.09
231	0.09
232	0.08
233	0.07
234	0.07
235	0.06
236	0.06
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.06
244	0.06
245	0.06
246	0.05
247	0.08
248	0.1
249	0.11
250	0.13
251	0.16
252	0.17
253	0.2
254	0.23
255	0.28
256	0.3
257	0.32
258	0.38
259	0.42
260	0.45
261	0.46
262	0.46
263	0.38
264	0.41
265	0.39
266	0.36
267	0.32
268	0.31
269	0.3
270	0.29
271	0.27
272	0.21
273	0.23
274	0.26
275	0.28
276	0.27
277	0.27
278	0.33
279	0.36
280	0.42
281	0.48
282	0.45
283	0.45
284	0.51
285	0.53
286	0.57
287	0.57
288	0.55
289	0.47
290	0.48
291	0.43
292	0.4
293	0.34
294	0.25
295	0.23
296	0.19
297	0.18
298	0.14
299	0.12
300	0.08
301	0.07
302	0.07
303	0.06
304	0.07
305	0.07
306	0.07
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.05
311	0.06
312	0.07
313	0.08
314	0.08
315	0.11
316	0.14
317	0.18
318	0.21
319	0.2
320	0.27
321	0.28
322	0.28
323	0.29
324	0.35
325	0.35
326	0.34
327	0.35
328	0.3
329	0.28
330	0.28
331	0.26
332	0.19
333	0.17
334	0.18
335	0.18
336	0.16
337	0.18
338	0.22
339	0.22
340	0.24
341	0.24
342	0.21
343	0.2
344	0.2
345	0.19
346	0.17
347	0.18
348	0.15
349	0.14
350	0.14
351	0.14
352	0.14
353	0.13
354	0.13
355	0.11
356	0.13
357	0.16
358	0.18
359	0.2
360	0.22
361	0.25
362	0.29
363	0.36
364	0.38
365	0.36
366	0.4
367	0.39
368	0.37
369	0.35
370	0.33
371	0.28
372	0.28
373	0.28
374	0.25
375	0.25
376	0.24
377	0.22
378	0.19
379	0.17
380	0.12
381	0.09
382	0.07
383	0.04
384	0.04
385	0.04
386	0.04
387	0.04
388	0.05
389	0.04
390	0.05
391	0.05
392	0.04
393	0.05
394	0.05
395	0.06
396	0.05
397	0.06
398	0.06
399	0.07
400	0.07
401	0.07
402	0.07
403	0.05
404	0.06
405	0.06
406	0.06
407	0.08
408	0.09
409	0.1
410	0.1
411	0.11
412	0.11
413	0.11
414	0.1
415	0.09
416	0.12
417	0.15
418	0.18
419	0.22
420	0.25
421	0.25
422	0.32
423	0.36
424	0.37
425	0.41
426	0.38
427	0.4
428	0.38
429	0.4
430	0.34
431	0.31
432	0.26
433	0.19
434	0.2
435	0.14
436	0.12
437	0.1
438	0.09
439	0.09
440	0.11
441	0.11
442	0.09
443	0.08
444	0.08
445	0.08
446	0.07
447	0.06
448	0.04
449	0.04
450	0.04
451	0.04
452	0.04
453	0.05
454	0.05
455	0.1
456	0.14
457	0.16
458	0.2
459	0.24
460	0.3
461	0.39
462	0.47
463	0.53
464	0.59
465	0.64
466	0.64
467	0.66
468	0.65
469	0.57
470	0.49
471	0.4
472	0.33
473	0.25
474	0.22
475	0.17
476	0.11
477	0.1
478	0.09
479	0.07
480	0.06
481	0.06
482	0.06
483	0.06
484	0.07
485	0.06
486	0.07
487	0.09
488	0.11
489	0.14
490	0.17
491	0.21
492	0.27
493	0.3
494	0.36
495	0.38
496	0.43
497	0.45
498	0.46
499	0.44
500	0.43
501	0.4
502	0.35
503	0.33
504	0.25
505	0.2
506	0.16
507	0.13
508	0.09
509	0.11
510	0.13
511	0.17
512	0.19
513	0.23
514	0.28
515	0.33
516	0.35
517	0.39
518	0.44
519	0.46
520	0.54
521	0.54
522	0.58
523	0.58
524	0.58
525	0.52
526	0.49
527	0.48
528	0.42
529	0.46
530	0.43
531	0.44
532	0.5
533	0.57
534	0.58
535	0.59
536	0.64
537	0.65
538	0.64
539	0.66
540	0.6
541	0.57
542	0.54
543	0.5
544	0.46
545	0.41
546	0.36
547	0.28
548	0.29
549	0.28
550	0.24
551	0.21
552	0.18
553	0.18
554	0.18
555	0.19
556	0.17
557	0.14
558	0.15
559	0.16
560	0.13
561	0.15
562	0.21
563	0.28
564	0.36
565	0.4
566	0.45
567	0.54
568	0.58
569	0.58
570	0.59
571	0.62
572	0.58
573	0.58
574	0.59
575	0.53
576	0.49
577	0.46
578	0.42
579	0.37
580	0.35
581	0.34
582	0.28
583	0.28
584	0.29
585	0.31
586	0.32
587	0.29
588	0.29
589	0.28
590	0.29
591	0.27
592	0.3
593	0.27
594	0.26
595	0.27
596	0.25
597	0.24
598	0.24
599	0.24
600	0.21
601	0.24
602	0.22
603	0.2
604	0.25
605	0.24
606	0.26
607	0.27
608	0.29
609	0.26
610	0.25
611	0.23
612	0.21
613	0.2
614	0.17
615	0.19
616	0.17
617	0.16
618	0.16
619	0.21
620	0.23
621	0.27
622	0.28
623	0.3
624	0.3
625	0.3
626	0.34
627	0.33
628	0.3
629	0.29
630	0.27
631	0.26
632	0.25
633	0.25
634	0.2
635	0.16
636	0.15
637	0.12
638	0.12
639	0.09
640	0.09
641	0.1
642	0.1
643	0.1
644	0.08
645	0.09
646	0.1
647	0.13
648	0.15
649	0.18
650	0.19
651	0.24
652	0.31
653	0.34
654	0.4
655	0.46
656	0.52
657	0.56
658	0.6
659	0.64
660	0.65
661	0.66
662	0.63
663	0.57
664	0.49
665	0.42
666	0.36
667	0.29
668	0.22
669	0.17
670	0.13
671	0.1
672	0.11
673	0.11
674	0.13
675	0.18
676	0.23
677	0.24
678	0.27
679	0.33
680	0.4
681	0.5
682	0.59
683	0.61
684	0.67
685	0.72
686	0.8
687	0.77
688	0.71
689	0.64
690	0.63
691	0.64
692	0.64
693	0.68
694	0.69
695	0.76
696	0.83
697	0.91
698	0.93
699	0.93
700	0.93
701	0.93
702	0.91
703	0.88
704	0.85
705	0.8
706	0.71
707	0.62
708	0.53
709	0.46
710	0.39
711	0.33
712	0.28
713	0.23
714	0.19
715	0.2
716	0.2
717	0.18
718	0.18
719	0.16
720	0.16
721	0.15
722	0.16
723	0.17
724	0.22
725	0.21
726	0.24
727	0.26
728	0.28
729	0.28
730	0.31
731	0.36
732	0.38
733	0.39
734	0.38
735	0.39
736	0.39
737	0.4
738	0.36
739	0.28
740	0.25
741	0.28
742	0.29
743	0.27
744	0.26
745	0.26
746	0.32
747	0.37
748	0.42
749	0.43
750	0.47
751	0.53
752	0.53
753	0.57
754	0.6
755	0.6
756	0.55
757	0.53
758	0.46
759	0.38
760	0.36
761	0.33
762	0.25
763	0.19
764	0.17
765	0.13
766	0.13
767	0.14
768	0.17
769	0.24
770	0.25
771	0.3
772	0.31
773	0.31
774	0.35
775	0.4
776	0.39
777	0.4

A0A427YNP4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer