FuNGI

A0A427YLJ0

Protein Details

Accession

A0A427YLJ0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
81-104	LEREEERVRRYKEQKEKEDAEKGQ	Acidic
136-155	MDEAPKKKRRWDVEEPQVKQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
142-143	KK

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 12, cyto 11.5, nucl 9.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR021133 HEAT_type_2 IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50077 HEAT_REPEAT

Amino Acid Sequences

MSEEEQPYRTLQTYSAPQELLDEHAEMADEENAPDVFEQTAKSKQVAARQSDYHLRRFNRTDGVGEGEDESYEDRMRRINLEREEERVRRYKEQKEKEDAEKGQGSKTLEGDKTPPRGLIGDETPPRGAKEETPPMDEAPKKKRRWDVEEPQVKQEEKPGEWSEQALEAAPKKRRSRWDQTPAEATTEAAPKKSRWDQTPSSDAVAVTGKTQEFTSTGVMMVEDKRYRRMTDEELDSLLPGKADGYEVVPVPDDYKPLPMVRKMVPVQASEQGFMMQDDADAAKARAAVGGIQGSDEQTEIEGIGTLQFLKPEDTQYFAKVLGEGGGEEEDVHYSLEELKERKIMRLLLKIKNGTPPVRKTALRQITDKARDFGAGPLFDKILPLLMERTLEDQERHLLVKVIDRVLYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDEDYYARVEGREIISNLAKAAGLAHMISTMRPDIDHVDEYVRNTTARAFSVVASALGIPSLLPFLKAVCRSKKSWQARHTGIRIIQQIAVMMGCAVLPHLRNLVDAIADGLQDEQQKVRTMTALALAALAEAAAPYGIESFDNVLKPLWLGIRQHRGKTLAAFIKAIGYIIPLMDPEYAGYYVRECMPILIREFQTSDEEMRRIVLQVIKQCAGTEGVSPTYIRDEVLPDFFRSFWVRRMALDKRNYRQLVETTTELANKAGVSTIVGKICNDLKDESEPFRKMVMDTITKVVANQGAADIDERLEVLLIDGIIFAFQEQTMEDNVMLEGFGTVVNALGGRVKPYLPQIVSMILWRLTNKSAKVRMLAADLTTKLAPIIKSNGEDQLLSKLGVVIFEQLGEEYPDTLGSLIAAEGAIANVVGMTQMNPPVKDLLPRMTPILRNRHEKVQEATINLIGRIADRGAEFVPAKEWMRICFELLDLLKAHKKAIRRAAVNSFGYIAKAIGPQDVLSVLLTNLKVQERQSRVCSTVAIAIVAETCGPFTCIPAILNEYRTPELNVRNGCLKALAWVFEYVGEMSKDYIHSVIGLLEDALTDRDHVHRQTACAIVKHLALGVAGLGYEEALTHLLNLVWPNIFETSPHVIGGVMDAIEAMRVGLGPGVLLSYVLQGLHHPARRVREVYWRMFNTLILGSADAMVPFYPDLGSKSDLAAGQDYTRHHLGYWV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.37
3	0.34
4	0.32
5	0.33
6	0.32
7	0.3
8	0.23
9	0.19
10	0.15
11	0.15
12	0.15
13	0.13
14	0.13
15	0.12
16	0.1
17	0.09
18	0.11
19	0.11
20	0.11
21	0.11
22	0.11
23	0.09
24	0.1
25	0.12
26	0.14
27	0.21
28	0.22
29	0.23
30	0.28
31	0.31
32	0.38
33	0.44
34	0.47
35	0.47
36	0.48
37	0.52
38	0.56
39	0.57
40	0.57
41	0.57
42	0.54
43	0.57
44	0.59
45	0.59
46	0.58
47	0.56
48	0.5
49	0.44
50	0.46
51	0.38
52	0.34
53	0.3
54	0.22
55	0.2
56	0.18
57	0.16
58	0.12
59	0.14
60	0.14
61	0.13
62	0.18
63	0.2
64	0.26
65	0.32
66	0.39
67	0.44
68	0.52
69	0.52
70	0.54
71	0.61
72	0.58
73	0.58
74	0.58
75	0.56
76	0.57
77	0.64
78	0.68
79	0.71
80	0.78
81	0.8
82	0.81
83	0.82
84	0.8
85	0.8
86	0.72
87	0.68
88	0.64
89	0.56
90	0.49
91	0.46
92	0.41
93	0.35
94	0.35
95	0.35
96	0.3
97	0.31
98	0.34
99	0.37
100	0.4
101	0.39
102	0.37
103	0.31
104	0.31
105	0.31
106	0.31
107	0.28
108	0.3
109	0.32
110	0.34
111	0.34
112	0.34
113	0.33
114	0.3
115	0.28
116	0.25
117	0.31
118	0.38
119	0.39
120	0.42
121	0.43
122	0.42
123	0.48
124	0.48
125	0.46
126	0.47
127	0.53
128	0.54
129	0.61
130	0.69
131	0.7
132	0.74
133	0.77
134	0.77
135	0.79
136	0.84
137	0.79
138	0.76
139	0.72
140	0.64
141	0.54
142	0.5
143	0.46
144	0.37
145	0.41
146	0.38
147	0.35
148	0.35
149	0.36
150	0.3
151	0.25
152	0.24
153	0.18
154	0.18
155	0.2
156	0.27
157	0.33
158	0.4
159	0.45
160	0.52
161	0.61
162	0.67
163	0.72
164	0.76
165	0.8
166	0.79
167	0.78
168	0.77
169	0.69
170	0.63
171	0.52
172	0.42
173	0.34
174	0.33
175	0.28
176	0.24
177	0.25
178	0.22
179	0.31
180	0.38
181	0.42
182	0.41
183	0.49
184	0.53
185	0.58
186	0.63
187	0.57
188	0.51
189	0.45
190	0.39
191	0.32
192	0.27
193	0.2
194	0.15
195	0.16
196	0.14
197	0.13
198	0.14
199	0.13
200	0.12
201	0.13
202	0.14
203	0.12
204	0.12
205	0.11
206	0.11
207	0.12
208	0.13
209	0.17
210	0.19
211	0.2
212	0.26
213	0.29
214	0.3
215	0.32
216	0.36
217	0.37
218	0.4
219	0.44
220	0.39
221	0.38
222	0.36
223	0.32
224	0.28
225	0.22
226	0.14
227	0.09
228	0.08
229	0.06
230	0.07
231	0.07
232	0.07
233	0.09
234	0.09
235	0.1
236	0.1
237	0.1
238	0.12
239	0.12
240	0.13
241	0.11
242	0.14
243	0.16
244	0.19
245	0.23
246	0.24
247	0.28
248	0.28
249	0.36
250	0.34
251	0.38
252	0.37
253	0.34
254	0.34
255	0.35
256	0.34
257	0.26
258	0.25
259	0.2
260	0.17
261	0.16
262	0.13
263	0.07
264	0.06
265	0.06
266	0.06
267	0.06
268	0.07
269	0.07
270	0.07
271	0.08
272	0.08
273	0.08
274	0.08
275	0.07
276	0.08
277	0.09
278	0.08
279	0.08
280	0.08
281	0.08
282	0.08
283	0.08
284	0.06
285	0.05
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.04
291	0.05
292	0.05
293	0.05
294	0.06
295	0.06
296	0.07
297	0.1
298	0.1
299	0.14
300	0.15
301	0.18
302	0.19
303	0.2
304	0.21
305	0.18
306	0.18
307	0.14
308	0.13
309	0.1
310	0.09
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.06
319	0.06
320	0.05
321	0.05
322	0.07
323	0.09
324	0.12
325	0.13
326	0.14
327	0.2
328	0.21
329	0.22
330	0.24
331	0.28
332	0.3
333	0.38
334	0.44
335	0.45
336	0.51
337	0.51
338	0.49
339	0.51
340	0.5
341	0.47
342	0.47
343	0.45
344	0.44
345	0.47
346	0.46
347	0.44
348	0.5
349	0.52
350	0.48
351	0.46
352	0.46
353	0.5
354	0.56
355	0.53
356	0.44
357	0.35
358	0.33
359	0.31
360	0.29
361	0.24
362	0.18
363	0.17
364	0.16
365	0.16
366	0.16
367	0.15
368	0.11
369	0.09
370	0.08
371	0.08
372	0.08
373	0.08
374	0.09
375	0.1
376	0.12
377	0.12
378	0.13
379	0.13
380	0.13
381	0.16
382	0.16
383	0.16
384	0.14
385	0.15
386	0.14
387	0.18
388	0.2
389	0.18
390	0.19
391	0.19
392	0.19
393	0.19
394	0.19
395	0.14
396	0.14
397	0.15
398	0.15
399	0.16
400	0.18
401	0.17
402	0.18
403	0.2
404	0.2
405	0.17
406	0.16
407	0.14
408	0.14
409	0.15
410	0.14
411	0.13
412	0.1
413	0.09
414	0.09
415	0.09
416	0.06
417	0.05
418	0.04
419	0.05
420	0.05
421	0.06
422	0.06
423	0.05
424	0.06
425	0.06
426	0.08
427	0.1
428	0.12
429	0.12
430	0.14
431	0.15
432	0.15
433	0.14
434	0.12
435	0.1
436	0.07
437	0.07
438	0.05
439	0.05
440	0.05
441	0.04
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.06
446	0.06
447	0.06
448	0.06
449	0.07
450	0.08
451	0.11
452	0.11
453	0.11
454	0.14
455	0.14
456	0.16
457	0.17
458	0.15
459	0.12
460	0.12
461	0.13
462	0.12
463	0.11
464	0.12
465	0.11
466	0.11
467	0.12
468	0.12
469	0.1
470	0.08
471	0.08
472	0.06
473	0.05
474	0.04
475	0.03
476	0.03
477	0.04
478	0.03
479	0.04
480	0.04
481	0.05
482	0.09
483	0.14
484	0.19
485	0.25
486	0.29
487	0.32
488	0.38
489	0.48
490	0.54
491	0.59
492	0.6
493	0.61
494	0.64
495	0.68
496	0.63
497	0.57
498	0.49
499	0.45
500	0.41
501	0.34
502	0.28
503	0.21
504	0.19
505	0.15
506	0.12
507	0.07
508	0.05
509	0.04
510	0.03
511	0.03
512	0.03
513	0.04
514	0.04
515	0.05
516	0.07
517	0.07
518	0.07
519	0.08
520	0.08
521	0.06
522	0.06
523	0.06
524	0.05
525	0.05
526	0.05
527	0.05
528	0.06
529	0.07
530	0.07
531	0.07
532	0.09
533	0.11
534	0.11
535	0.11
536	0.1
537	0.1
538	0.1
539	0.11
540	0.1
541	0.08
542	0.07
543	0.07
544	0.06
545	0.05
546	0.04
547	0.02
548	0.02
549	0.02
550	0.02
551	0.02
552	0.02
553	0.02
554	0.02
555	0.03
556	0.03
557	0.04
558	0.06
559	0.06
560	0.07
561	0.07
562	0.06
563	0.06
564	0.07
565	0.07
566	0.08
567	0.1
568	0.15
569	0.25
570	0.28
571	0.29
572	0.3
573	0.32
574	0.3
575	0.29
576	0.3
577	0.23
578	0.22
579	0.21
580	0.19
581	0.17
582	0.16
583	0.15
584	0.08
585	0.05
586	0.04
587	0.04
588	0.04
589	0.03
590	0.04
591	0.04
592	0.04
593	0.04
594	0.05
595	0.06
596	0.06
597	0.06
598	0.06
599	0.07
600	0.08
601	0.08
602	0.07
603	0.07
604	0.09
605	0.11
606	0.13
607	0.15
608	0.15
609	0.15
610	0.16
611	0.16
612	0.16
613	0.15
614	0.15
615	0.14
616	0.14
617	0.13
618	0.13
619	0.12
620	0.1
621	0.11
622	0.12
623	0.12
624	0.16
625	0.19
626	0.19
627	0.19
628	0.18
629	0.17
630	0.16
631	0.13
632	0.11
633	0.09
634	0.09
635	0.1
636	0.1
637	0.09
638	0.09
639	0.09
640	0.08
641	0.07
642	0.09
643	0.1
644	0.14
645	0.14
646	0.14
647	0.14
648	0.14
649	0.16
650	0.17
651	0.17
652	0.18
653	0.23
654	0.22
655	0.23
656	0.29
657	0.34
658	0.38
659	0.45
660	0.47
661	0.46
662	0.54
663	0.54
664	0.48
665	0.45
666	0.4
667	0.35
668	0.31
669	0.28
670	0.21
671	0.22
672	0.21
673	0.18
674	0.16
675	0.12
676	0.09
677	0.08
678	0.06
679	0.05
680	0.05
681	0.07
682	0.09
683	0.1
684	0.11
685	0.11
686	0.12
687	0.15
688	0.15
689	0.15
690	0.13
691	0.14
692	0.18
693	0.2
694	0.23
695	0.26
696	0.26
697	0.25
698	0.25
699	0.24
700	0.2
701	0.22
702	0.22
703	0.19
704	0.19
705	0.2
706	0.2
707	0.19
708	0.19
709	0.16
710	0.13
711	0.1
712	0.09
713	0.07
714	0.06
715	0.07
716	0.07
717	0.06
718	0.05
719	0.05
720	0.05
721	0.04
722	0.04
723	0.04
724	0.04
725	0.04
726	0.03
727	0.03
728	0.03
729	0.03
730	0.03
731	0.03
732	0.03
733	0.03
734	0.03
735	0.03
736	0.03
737	0.05
738	0.05
739	0.06
740	0.06
741	0.06
742	0.06
743	0.06
744	0.05
745	0.04
746	0.04
747	0.03
748	0.03
749	0.03
750	0.03
751	0.03
752	0.03
753	0.03
754	0.03
755	0.05
756	0.06
757	0.07
758	0.08
759	0.09
760	0.1
761	0.14
762	0.19
763	0.17
764	0.19
765	0.18
766	0.19
767	0.19
768	0.18
769	0.17
770	0.12
771	0.12
772	0.12
773	0.13
774	0.15
775	0.18
776	0.21
777	0.27
778	0.31
779	0.32
780	0.33
781	0.33
782	0.31
783	0.3
784	0.27
785	0.21
786	0.18
787	0.17
788	0.17
789	0.15
790	0.13
791	0.11
792	0.13
793	0.12
794	0.12
795	0.15
796	0.16
797	0.17
798	0.19
799	0.21
800	0.19
801	0.19
802	0.18
803	0.18
804	0.16
805	0.15
806	0.13
807	0.12
808	0.11
809	0.11
810	0.11
811	0.09
812	0.07
813	0.07
814	0.07
815	0.06
816	0.07
817	0.07
818	0.07
819	0.06
820	0.06
821	0.06
822	0.06
823	0.06
824	0.06
825	0.04
826	0.04
827	0.04
828	0.04
829	0.03
830	0.03
831	0.03
832	0.03
833	0.03
834	0.02
835	0.02
836	0.02
837	0.02
838	0.02
839	0.03
840	0.04
841	0.05
842	0.11
843	0.13
844	0.13
845	0.15
846	0.17
847	0.18
848	0.21
849	0.22
850	0.23
851	0.23
852	0.24
853	0.27
854	0.28
855	0.33
856	0.36
857	0.44
858	0.44
859	0.5
860	0.52
861	0.58
862	0.58
863	0.57
864	0.53
865	0.52
866	0.49
867	0.43
868	0.41
869	0.35
870	0.32
871	0.27
872	0.24
873	0.15
874	0.12
875	0.12
876	0.1
877	0.08
878	0.08
879	0.1
880	0.09
881	0.13
882	0.13
883	0.12
884	0.14
885	0.16
886	0.17
887	0.19
888	0.2
889	0.18
890	0.24
891	0.25
892	0.24
893	0.21
894	0.2
895	0.22
896	0.21
897	0.21
898	0.15
899	0.18
900	0.21
901	0.21
902	0.24
903	0.21
904	0.26
905	0.32
906	0.42
907	0.47
908	0.46
909	0.51
910	0.56
911	0.61
912	0.56
913	0.49
914	0.41
915	0.33
916	0.29
917	0.24
918	0.17
919	0.11
920	0.12
921	0.11
922	0.11
923	0.11
924	0.1
925	0.11
926	0.11
927	0.1
928	0.08
929	0.08
930	0.07
931	0.1
932	0.1
933	0.1
934	0.13
935	0.14
936	0.17
937	0.19
938	0.28
939	0.31
940	0.36
941	0.4
942	0.41
943	0.42
944	0.4
945	0.38
946	0.3
947	0.29
948	0.24
949	0.19
950	0.14
951	0.12
952	0.12
953	0.11
954	0.1
955	0.05
956	0.05
957	0.05
958	0.07
959	0.07
960	0.08
961	0.1
962	0.11
963	0.11
964	0.13
965	0.18
966	0.18
967	0.22
968	0.23
969	0.25
970	0.25
971	0.26
972	0.27
973	0.27
974	0.31
975	0.35
976	0.34
977	0.33
978	0.38
979	0.37
980	0.34
981	0.3
982	0.24
983	0.23
984	0.23
985	0.21
986	0.17
987	0.17
988	0.17
989	0.16
990	0.17
991	0.12
992	0.13
993	0.12
994	0.11
995	0.11
996	0.12
997	0.13
998	0.12
999	0.12
1000	0.1
1001	0.1
1002	0.1
1003	0.1
1004	0.08
1005	0.08
1006	0.07
1007	0.06
1008	0.06
1009	0.06
1010	0.07
1011	0.06
1012	0.07
1013	0.08
1014	0.12
1015	0.18
1016	0.19
1017	0.25
1018	0.26
1019	0.28
1020	0.32
1021	0.37
1022	0.37
1023	0.34
1024	0.35
1025	0.3
1026	0.29
1027	0.27
1028	0.23
1029	0.16
1030	0.13
1031	0.11
1032	0.08
1033	0.06
1034	0.05
1035	0.05
1036	0.04
1037	0.04
1038	0.04
1039	0.03
1040	0.04
1041	0.05
1042	0.05
1043	0.05
1044	0.06
1045	0.06
1046	0.08
1047	0.09
1048	0.11
1049	0.1
1050	0.11
1051	0.13
1052	0.14
1053	0.14
1054	0.12
1055	0.17
1056	0.22
1057	0.22
1058	0.22
1059	0.2
1060	0.18
1061	0.18
1062	0.19
1063	0.14
1064	0.08
1065	0.06
1066	0.07
1067	0.06
1068	0.06
1069	0.06
1070	0.04
1071	0.03
1072	0.03
1073	0.04
1074	0.04
1075	0.04
1076	0.04
1077	0.04
1078	0.05
1079	0.05
1080	0.05
1081	0.05
1082	0.06
1083	0.07
1084	0.07
1085	0.07
1086	0.08
1087	0.15
1088	0.22
1089	0.26
1090	0.29
1091	0.34
1092	0.41
1093	0.48
1094	0.5
1095	0.47
1096	0.5
1097	0.54
1098	0.58
1099	0.63
1100	0.58
1101	0.55
1102	0.52
1103	0.49
1104	0.41
1105	0.34
1106	0.28
1107	0.18
1108	0.16
1109	0.13
1110	0.13
1111	0.13
1112	0.1
1113	0.1
1114	0.08
1115	0.08
1116	0.07
1117	0.08
1118	0.07
1119	0.08
1120	0.11
1121	0.14
1122	0.16
1123	0.16
1124	0.17
1125	0.19
1126	0.2
1127	0.21
1128	0.21
1129	0.19
1130	0.19
1131	0.22
1132	0.23
1133	0.26
1134	0.27
1135	0.25

A0A427YLJ0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer