Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A427Y3J7

Protein Details
Accession A0A427Y3J7    Localization Confidence High Confidence Score 21.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-37TMTSRTSTRTRVKSQRAIESEHydrophilic
175-203RSPSPPPGLPPTKKRRTKRESQPVEQSDSHydrophilic
777-799HWEAQARPPRPRPRPRNGTRGTAHydrophilic
998-1018AYWSKQPKPDLVKEKRGRDSAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
81-108KSKGKAGKSQGKGKANAKARGKGKGKGK
186-192TKKRRTK
231-250PKRQRREAEAGGVTKAKKPR
782-793ARPPRPRPRPRN
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR000953  Chromo/chromo_shadow_dom  
IPR023780  Chromo_domain  
IPR008251  Chromo_shadow_dom  
IPR012921  SPOC_C  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004386  F:helicase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00385  Chromo  
PF01393  Chromo_shadow  
PF00628  PHD  
PF07744  SPOC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50013  CHROMO_2  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd00024  CD_CSD  
cd18657  CSD_Swi6  
cd21538  SPOC_TFIIS  
Amino Acid Sequences MADPADPADSAGPSQPTMTSRTSTRTRVKSQRAIESEDTNRLIARAKAAQMQTQSQSETGTGADPLAHAGEGEGTEQNGTKSKGKAGKSQGKGKANAKARGKGKGKGKEEVWCICRSSEADGPMIECGECNDWFHFSCVGLEEDEAERIHKYICPNCEETTGEKSTNVFDITTFRSPSPPPGLPPTKKRRTKRESQPVEQSDSGDNHIERESEASASDASSHASDRSASPPKRQRREAEAGGVTKAKKPRLPSISVAVEKPDAAPRKQSATIKTKTAAALPGPRQFALDKLPAVIKALLVDLSEDDVRTYVAELESGLWLAFKETKDGKDVAGPRYKRASLQQTVRGKEDTAAIRLGRDGFEKVEDVHETELRLLARQEEAARERERRLAEEREREKEEEKTRRESVGAPVHEKPESPRAMQSPMQTQRSTFSATPRRESEVLSPSRTTVALTSAWGGGGDELKDDEPVSYDQDQALDLSDIVPEPEADEDEDMVVDEPEVVTEAQPVWSGGVTTSSATPPAVARLISDVKPSPNSSWSLLLPHSTIALSGRVPTKTSLKYIADSRLNTSREVFVVCFMLDPQAAEEEIKAWENIIEYHVSRDRHAIYHPYGTGKPPRYAAKELYLVPLRPSDPIPDFTSLFDGFALEENRPRSVFLGVFIANRESAEPTPTPMPVPTSTIGVGVGHPLPAAPPAASIPNLPNDQLQALMASLNPSAIQSLLANPPPAPAPAPVFGATPPYLEAPPYPPQGYNAYNPPPPAPYPGHPMPPPPPRANHWEAQARPPRPRPRPRNGTRGTAPPTDSGMVSVTMAGVGGAGDDGDSQLLFPRDLVKLPDTPTTPHRGLLSTLSRFIPGGSPSKPRSTALPGASERQEAEQVQLQEQGQGEVDTQLDADAGANEAGLMPSKEPETEPDVMITVDGEEAQAEGRGPEGEPEVSDEDAEEGAEDEYEVELIVDHRVGKPAGKFVYLVSWKGYGPEHNTWEPEENVEHAQELLHAYWSKQPKPDLVKEKRGRDSAAPSSSRKAARMGQANGSGAGAGASRRKAIPVDDDDDAIELSYAETHVDPVDKFMDVDDWEDLVDNVDSMERVADGSLSIYLTMKTGERVGVKTDVAYKRCPQKILAFYESHLKWSVQTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.18
4 0.22
5 0.24
6 0.24
7 0.25
8 0.32
9 0.38
10 0.44
11 0.52
12 0.56
13 0.63
14 0.71
15 0.78
16 0.8
17 0.8
18 0.82
19 0.76
20 0.75
21 0.69
22 0.66
23 0.61
24 0.58
25 0.52
26 0.42
27 0.38
28 0.31
29 0.31
30 0.25
31 0.26
32 0.24
33 0.25
34 0.32
35 0.34
36 0.38
37 0.38
38 0.42
39 0.41
40 0.38
41 0.37
42 0.31
43 0.29
44 0.25
45 0.22
46 0.17
47 0.13
48 0.11
49 0.1
50 0.09
51 0.08
52 0.09
53 0.09
54 0.08
55 0.07
56 0.07
57 0.08
58 0.08
59 0.1
60 0.09
61 0.09
62 0.1
63 0.11
64 0.12
65 0.16
66 0.19
67 0.23
68 0.25
69 0.33
70 0.39
71 0.42
72 0.5
73 0.56
74 0.62
75 0.65
76 0.73
77 0.74
78 0.74
79 0.77
80 0.74
81 0.72
82 0.71
83 0.71
84 0.69
85 0.68
86 0.65
87 0.67
88 0.67
89 0.65
90 0.66
91 0.68
92 0.66
93 0.64
94 0.64
95 0.61
96 0.63
97 0.63
98 0.57
99 0.5
100 0.47
101 0.4
102 0.4
103 0.33
104 0.32
105 0.28
106 0.27
107 0.25
108 0.24
109 0.25
110 0.22
111 0.22
112 0.16
113 0.11
114 0.11
115 0.12
116 0.12
117 0.14
118 0.15
119 0.17
120 0.18
121 0.21
122 0.19
123 0.17
124 0.17
125 0.17
126 0.17
127 0.14
128 0.13
129 0.13
130 0.13
131 0.14
132 0.14
133 0.13
134 0.12
135 0.12
136 0.13
137 0.14
138 0.2
139 0.24
140 0.29
141 0.34
142 0.37
143 0.38
144 0.4
145 0.4
146 0.37
147 0.38
148 0.36
149 0.31
150 0.29
151 0.28
152 0.26
153 0.26
154 0.23
155 0.16
156 0.13
157 0.16
158 0.21
159 0.25
160 0.25
161 0.23
162 0.26
163 0.27
164 0.33
165 0.36
166 0.33
167 0.33
168 0.4
169 0.5
170 0.53
171 0.62
172 0.66
173 0.69
174 0.77
175 0.82
176 0.84
177 0.83
178 0.87
179 0.87
180 0.88
181 0.87
182 0.85
183 0.87
184 0.8
185 0.78
186 0.68
187 0.59
188 0.51
189 0.43
190 0.38
191 0.31
192 0.26
193 0.21
194 0.21
195 0.19
196 0.16
197 0.17
198 0.15
199 0.12
200 0.12
201 0.11
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.1
212 0.12
213 0.19
214 0.28
215 0.3
216 0.39
217 0.48
218 0.58
219 0.66
220 0.72
221 0.71
222 0.7
223 0.77
224 0.71
225 0.69
226 0.64
227 0.56
228 0.51
229 0.48
230 0.39
231 0.36
232 0.37
233 0.34
234 0.32
235 0.36
236 0.43
237 0.47
238 0.51
239 0.49
240 0.51
241 0.53
242 0.52
243 0.48
244 0.4
245 0.34
246 0.29
247 0.27
248 0.26
249 0.23
250 0.22
251 0.28
252 0.28
253 0.33
254 0.39
255 0.42
256 0.43
257 0.48
258 0.5
259 0.48
260 0.47
261 0.44
262 0.39
263 0.37
264 0.31
265 0.25
266 0.3
267 0.3
268 0.35
269 0.33
270 0.33
271 0.32
272 0.3
273 0.28
274 0.25
275 0.24
276 0.19
277 0.19
278 0.2
279 0.18
280 0.2
281 0.18
282 0.13
283 0.1
284 0.11
285 0.09
286 0.08
287 0.08
288 0.06
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.05
306 0.05
307 0.07
308 0.1
309 0.09
310 0.14
311 0.17
312 0.18
313 0.22
314 0.23
315 0.22
316 0.25
317 0.29
318 0.3
319 0.36
320 0.36
321 0.36
322 0.41
323 0.42
324 0.37
325 0.41
326 0.43
327 0.42
328 0.48
329 0.53
330 0.55
331 0.56
332 0.56
333 0.5
334 0.41
335 0.35
336 0.34
337 0.27
338 0.21
339 0.21
340 0.19
341 0.18
342 0.19
343 0.18
344 0.14
345 0.13
346 0.12
347 0.11
348 0.12
349 0.12
350 0.12
351 0.13
352 0.13
353 0.13
354 0.14
355 0.14
356 0.13
357 0.12
358 0.14
359 0.12
360 0.12
361 0.11
362 0.1
363 0.1
364 0.11
365 0.12
366 0.14
367 0.17
368 0.21
369 0.24
370 0.26
371 0.27
372 0.31
373 0.31
374 0.3
375 0.33
376 0.37
377 0.41
378 0.49
379 0.52
380 0.52
381 0.55
382 0.53
383 0.5
384 0.49
385 0.51
386 0.5
387 0.49
388 0.5
389 0.49
390 0.48
391 0.47
392 0.41
393 0.39
394 0.38
395 0.36
396 0.34
397 0.33
398 0.34
399 0.33
400 0.32
401 0.27
402 0.27
403 0.27
404 0.24
405 0.25
406 0.25
407 0.3
408 0.32
409 0.32
410 0.33
411 0.37
412 0.4
413 0.37
414 0.35
415 0.32
416 0.31
417 0.33
418 0.25
419 0.27
420 0.31
421 0.34
422 0.38
423 0.38
424 0.4
425 0.37
426 0.38
427 0.35
428 0.34
429 0.35
430 0.33
431 0.31
432 0.27
433 0.27
434 0.26
435 0.2
436 0.12
437 0.11
438 0.09
439 0.09
440 0.1
441 0.09
442 0.08
443 0.08
444 0.07
445 0.05
446 0.06
447 0.05
448 0.05
449 0.05
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.07
455 0.07
456 0.11
457 0.11
458 0.11
459 0.11
460 0.11
461 0.12
462 0.1
463 0.1
464 0.06
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.05
471 0.04
472 0.04
473 0.04
474 0.04
475 0.05
476 0.05
477 0.05
478 0.05
479 0.05
480 0.05
481 0.04
482 0.04
483 0.03
484 0.03
485 0.03
486 0.03
487 0.04
488 0.04
489 0.03
490 0.04
491 0.05
492 0.05
493 0.05
494 0.05
495 0.05
496 0.05
497 0.05
498 0.04
499 0.05
500 0.05
501 0.06
502 0.06
503 0.06
504 0.07
505 0.07
506 0.07
507 0.06
508 0.07
509 0.07
510 0.06
511 0.06
512 0.09
513 0.12
514 0.12
515 0.14
516 0.14
517 0.15
518 0.17
519 0.18
520 0.16
521 0.16
522 0.17
523 0.17
524 0.17
525 0.16
526 0.17
527 0.15
528 0.15
529 0.13
530 0.11
531 0.1
532 0.08
533 0.08
534 0.06
535 0.07
536 0.06
537 0.08
538 0.1
539 0.1
540 0.11
541 0.12
542 0.17
543 0.17
544 0.19
545 0.21
546 0.2
547 0.22
548 0.24
549 0.28
550 0.27
551 0.26
552 0.27
553 0.29
554 0.29
555 0.27
556 0.26
557 0.21
558 0.18
559 0.18
560 0.15
561 0.09
562 0.09
563 0.08
564 0.07
565 0.06
566 0.07
567 0.06
568 0.05
569 0.05
570 0.05
571 0.05
572 0.05
573 0.05
574 0.05
575 0.06
576 0.06
577 0.06
578 0.05
579 0.05
580 0.06
581 0.06
582 0.06
583 0.07
584 0.07
585 0.1
586 0.14
587 0.14
588 0.15
589 0.17
590 0.17
591 0.17
592 0.19
593 0.2
594 0.18
595 0.21
596 0.21
597 0.21
598 0.2
599 0.22
600 0.28
601 0.26
602 0.26
603 0.27
604 0.3
605 0.32
606 0.35
607 0.34
608 0.31
609 0.31
610 0.3
611 0.31
612 0.29
613 0.24
614 0.22
615 0.21
616 0.18
617 0.16
618 0.16
619 0.15
620 0.15
621 0.18
622 0.19
623 0.19
624 0.19
625 0.19
626 0.21
627 0.17
628 0.16
629 0.12
630 0.1
631 0.08
632 0.1
633 0.1
634 0.08
635 0.11
636 0.12
637 0.13
638 0.13
639 0.13
640 0.12
641 0.13
642 0.13
643 0.1
644 0.13
645 0.12
646 0.13
647 0.13
648 0.12
649 0.1
650 0.1
651 0.1
652 0.09
653 0.09
654 0.11
655 0.11
656 0.12
657 0.13
658 0.14
659 0.14
660 0.12
661 0.15
662 0.12
663 0.15
664 0.14
665 0.14
666 0.14
667 0.13
668 0.13
669 0.1
670 0.1
671 0.08
672 0.08
673 0.06
674 0.06
675 0.05
676 0.05
677 0.06
678 0.06
679 0.05
680 0.05
681 0.06
682 0.07
683 0.08
684 0.09
685 0.09
686 0.13
687 0.14
688 0.14
689 0.13
690 0.13
691 0.12
692 0.12
693 0.1
694 0.06
695 0.06
696 0.06
697 0.05
698 0.05
699 0.05
700 0.05
701 0.05
702 0.05
703 0.05
704 0.05
705 0.05
706 0.05
707 0.07
708 0.1
709 0.11
710 0.12
711 0.12
712 0.12
713 0.13
714 0.13
715 0.12
716 0.1
717 0.12
718 0.12
719 0.14
720 0.14
721 0.14
722 0.14
723 0.16
724 0.15
725 0.12
726 0.12
727 0.11
728 0.11
729 0.11
730 0.12
731 0.13
732 0.17
733 0.2
734 0.2
735 0.19
736 0.21
737 0.25
738 0.27
739 0.26
740 0.27
741 0.28
742 0.29
743 0.29
744 0.28
745 0.26
746 0.24
747 0.26
748 0.24
749 0.23
750 0.29
751 0.31
752 0.35
753 0.33
754 0.36
755 0.38
756 0.42
757 0.46
758 0.41
759 0.42
760 0.41
761 0.48
762 0.49
763 0.45
764 0.43
765 0.45
766 0.43
767 0.49
768 0.54
769 0.5
770 0.53
771 0.59
772 0.63
773 0.65
774 0.75
775 0.75
776 0.77
777 0.85
778 0.84
779 0.86
780 0.8
781 0.78
782 0.7
783 0.69
784 0.63
785 0.56
786 0.5
787 0.4
788 0.38
789 0.31
790 0.27
791 0.2
792 0.15
793 0.12
794 0.1
795 0.09
796 0.07
797 0.05
798 0.05
799 0.04
800 0.03
801 0.02
802 0.02
803 0.02
804 0.02
805 0.02
806 0.02
807 0.03
808 0.03
809 0.03
810 0.03
811 0.06
812 0.07
813 0.07
814 0.08
815 0.11
816 0.12
817 0.13
818 0.16
819 0.16
820 0.19
821 0.21
822 0.26
823 0.24
824 0.26
825 0.29
826 0.33
827 0.31
828 0.3
829 0.29
830 0.25
831 0.25
832 0.29
833 0.32
834 0.27
835 0.28
836 0.27
837 0.26
838 0.25
839 0.24
840 0.21
841 0.16
842 0.19
843 0.2
844 0.26
845 0.29
846 0.34
847 0.36
848 0.33
849 0.35
850 0.37
851 0.41
852 0.37
853 0.41
854 0.38
855 0.4
856 0.41
857 0.37
858 0.31
859 0.25
860 0.26
861 0.19
862 0.2
863 0.2
864 0.2
865 0.2
866 0.23
867 0.21
868 0.21
869 0.21
870 0.19
871 0.14
872 0.13
873 0.13
874 0.1
875 0.1
876 0.07
877 0.07
878 0.06
879 0.06
880 0.05
881 0.05
882 0.04
883 0.05
884 0.05
885 0.04
886 0.04
887 0.05
888 0.05
889 0.06
890 0.06
891 0.06
892 0.07
893 0.08
894 0.09
895 0.1
896 0.13
897 0.17
898 0.19
899 0.19
900 0.18
901 0.18
902 0.17
903 0.17
904 0.13
905 0.08
906 0.06
907 0.06
908 0.05
909 0.04
910 0.04
911 0.05
912 0.05
913 0.05
914 0.05
915 0.06
916 0.06
917 0.06
918 0.08
919 0.1
920 0.1
921 0.1
922 0.13
923 0.15
924 0.14
925 0.14
926 0.13
927 0.11
928 0.11
929 0.11
930 0.07
931 0.06
932 0.06
933 0.06
934 0.05
935 0.05
936 0.05
937 0.05
938 0.05
939 0.04
940 0.04
941 0.05
942 0.06
943 0.06
944 0.08
945 0.09
946 0.12
947 0.13
948 0.16
949 0.18
950 0.24
951 0.24
952 0.24
953 0.24
954 0.22
955 0.31
956 0.3
957 0.29
958 0.24
959 0.24
960 0.23
961 0.25
962 0.26
963 0.21
964 0.26
965 0.31
966 0.35
967 0.36
968 0.38
969 0.38
970 0.4
971 0.36
972 0.32
973 0.27
974 0.23
975 0.22
976 0.21
977 0.18
978 0.14
979 0.14
980 0.12
981 0.13
982 0.11
983 0.13
984 0.13
985 0.14
986 0.21
987 0.29
988 0.32
989 0.35
990 0.38
991 0.42
992 0.5
993 0.59
994 0.63
995 0.64
996 0.72
997 0.75
998 0.81
999 0.81
1000 0.76
1001 0.7
1002 0.64
1003 0.64
1004 0.61
1005 0.61
1006 0.56
1007 0.51
1008 0.52
1009 0.55
1010 0.52
1011 0.45
1012 0.41
1013 0.39
1014 0.43
1015 0.49
1016 0.48
1017 0.47
1018 0.49
1019 0.48
1020 0.43
1021 0.37
1022 0.28
1023 0.19
1024 0.16
1025 0.1
1026 0.08
1027 0.12
1028 0.13
1029 0.15
1030 0.16
1031 0.18
1032 0.19
1033 0.22
1034 0.28
1035 0.3
1036 0.33
1037 0.32
1038 0.32
1039 0.31
1040 0.29
1041 0.26
1042 0.18
1043 0.12
1044 0.07
1045 0.06
1046 0.06
1047 0.06
1048 0.07
1049 0.07
1050 0.08
1051 0.09
1052 0.12
1053 0.11
1054 0.14
1055 0.15
1056 0.14
1057 0.14
1058 0.14
1059 0.16
1060 0.14
1061 0.17
1062 0.15
1063 0.13
1064 0.13
1065 0.14
1066 0.13
1067 0.11
1068 0.11
1069 0.08
1070 0.07
1071 0.08
1072 0.08
1073 0.07
1074 0.08
1075 0.06
1076 0.06
1077 0.07
1078 0.06
1079 0.06
1080 0.07
1081 0.08
1082 0.08
1083 0.08
1084 0.09
1085 0.09
1086 0.09
1087 0.11
1088 0.1
1089 0.11
1090 0.13
1091 0.17
1092 0.19
1093 0.21
1094 0.25
1095 0.26
1096 0.26
1097 0.26
1098 0.34
1099 0.37
1100 0.37
1101 0.41
1102 0.45
1103 0.52
1104 0.57
1105 0.57
1106 0.53
1107 0.55
1108 0.6
1109 0.62
1110 0.61
1111 0.52
1112 0.48
1113 0.55
1114 0.51
1115 0.45
1116 0.39
1117 0.31