FuNGI

A0A427Y3C3

Protein Details

Accession

A0A427Y3C3

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
9-56	SSSKPYSSAKDPSKKSKKHKEHKAHKSHKEDKDGKHHKKSGRDKESGH	Basic
429-466	DERFLSARELKKKRKDDEKKKRDARKSKKEEKQLEEVS	Basic
495-514	KKRKAEDETEGKKKKRKEKA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
18-80	KDPSKKSKKHKEHKAHKSHKEDKDGKHHKKSGRDKESGHDKSKVKSSSSLHAEKEGKGKEKKG
437-458	ELKKKRKDDEKKKRDARKSKKE
495-514	KKRKAEDETEGKKKKRKEKA

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MSAPNALASSSKPYSSAKDPSKKSKKHKEHKAHKSHKEDKDGKHHKKSGRDKESGHDKSKVKSSSSLHAEKEGKGKEKKGPFELHTSRMRLSVPPKYSGDWMAGVRELLDGMVMRYVSQLSGVLLAHWEHEIIDDTVKLINECPFGVFEVEFRSIVWAPKIGQKLSIPGIAPRSPSYTTAPDDQTSAQHDSLLRGRRSLTLVSRVHLPIYTPPISPLALLLTTWFPPFPRSLVFPCRLSELILFPDGTHSLSSPSHLSLLFSKTFNVSIPLQHIPLDEYIFEHTSREDQPDLEDESDISDSEDEDGFGGLGGFGLGTVHEVGRWKSVKDGKLLGEGGKGVKFTVIGMQITNQVLSLTGSLLADPSNPPPPPSPARIPLPPSRSPTPEPMDLDAAPVSKKPNAHWLRVCFRPAVAAPVAATRAEPTEEIDERFLSARELKKKRKDDEKKKRDARKSKKEEKQLEEVSAIGGERLVGVSEEDAVRDVEGLGQAQEGKKRKAEDETEGKKKKRKEKA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.35
3	0.43
4	0.45
5	0.53
6	0.6
7	0.69
8	0.78
9	0.82
10	0.86
11	0.87
12	0.88
13	0.9
14	0.93
15	0.93
16	0.94
17	0.95
18	0.96
19	0.95
20	0.94
21	0.94
22	0.93
23	0.9
24	0.9
25	0.87
26	0.84
27	0.85
28	0.86
29	0.85
30	0.86
31	0.85
32	0.81
33	0.83
34	0.85
35	0.85
36	0.83
37	0.8
38	0.72
39	0.74
40	0.79
41	0.76
42	0.7
43	0.68
44	0.61
45	0.59
46	0.65
47	0.6
48	0.52
49	0.51
50	0.5
51	0.5
52	0.56
53	0.56
54	0.49
55	0.53
56	0.53
57	0.48
58	0.53
59	0.49
60	0.5
61	0.49
62	0.53
63	0.53
64	0.59
65	0.62
66	0.62
67	0.63
68	0.58
69	0.62
70	0.62
71	0.6
72	0.59
73	0.55
74	0.48
75	0.43
76	0.42
77	0.37
78	0.39
79	0.41
80	0.38
81	0.4
82	0.41
83	0.4
84	0.42
85	0.38
86	0.33
87	0.27
88	0.24
89	0.21
90	0.19
91	0.17
92	0.15
93	0.13
94	0.1
95	0.07
96	0.07
97	0.05
98	0.05
99	0.07
100	0.06
101	0.06
102	0.07
103	0.07
104	0.07
105	0.07
106	0.07
107	0.06
108	0.08
109	0.08
110	0.07
111	0.08
112	0.08
113	0.09
114	0.08
115	0.08
116	0.06
117	0.07
118	0.09
119	0.09
120	0.09
121	0.08
122	0.09
123	0.11
124	0.11
125	0.11
126	0.1
127	0.12
128	0.12
129	0.12
130	0.12
131	0.11
132	0.12
133	0.13
134	0.11
135	0.09
136	0.12
137	0.13
138	0.12
139	0.12
140	0.15
141	0.14
142	0.16
143	0.16
144	0.14
145	0.14
146	0.2
147	0.24
148	0.2
149	0.22
150	0.22
151	0.25
152	0.25
153	0.26
154	0.21
155	0.19
156	0.24
157	0.22
158	0.23
159	0.21
160	0.22
161	0.21
162	0.23
163	0.25
164	0.24
165	0.25
166	0.28
167	0.28
168	0.25
169	0.25
170	0.24
171	0.22
172	0.22
173	0.22
174	0.18
175	0.17
176	0.17
177	0.18
178	0.23
179	0.29
180	0.25
181	0.23
182	0.24
183	0.25
184	0.27
185	0.28
186	0.25
187	0.26
188	0.27
189	0.27
190	0.3
191	0.28
192	0.26
193	0.23
194	0.21
195	0.15
196	0.2
197	0.21
198	0.17
199	0.17
200	0.18
201	0.18
202	0.17
203	0.14
204	0.09
205	0.07
206	0.07
207	0.07
208	0.07
209	0.08
210	0.08
211	0.08
212	0.07
213	0.08
214	0.09
215	0.09
216	0.1
217	0.12
218	0.17
219	0.23
220	0.26
221	0.26
222	0.25
223	0.27
224	0.26
225	0.24
226	0.2
227	0.15
228	0.14
229	0.13
230	0.12
231	0.09
232	0.1
233	0.09
234	0.09
235	0.08
236	0.06
237	0.08
238	0.08
239	0.09
240	0.09
241	0.09
242	0.09
243	0.09
244	0.1
245	0.1
246	0.13
247	0.13
248	0.13
249	0.13
250	0.12
251	0.13
252	0.12
253	0.13
254	0.11
255	0.1
256	0.14
257	0.14
258	0.14
259	0.14
260	0.14
261	0.12
262	0.12
263	0.12
264	0.08
265	0.08
266	0.09
267	0.1
268	0.1
269	0.09
270	0.08
271	0.11
272	0.12
273	0.13
274	0.12
275	0.11
276	0.13
277	0.15
278	0.16
279	0.14
280	0.13
281	0.1
282	0.11
283	0.11
284	0.1
285	0.08
286	0.06
287	0.05
288	0.07
289	0.07
290	0.05
291	0.05
292	0.05
293	0.05
294	0.05
295	0.04
296	0.03
297	0.03
298	0.03
299	0.02
300	0.02
301	0.02
302	0.02
303	0.03
304	0.03
305	0.03
306	0.04
307	0.06
308	0.07
309	0.13
310	0.14
311	0.14
312	0.2
313	0.27
314	0.29
315	0.31
316	0.34
317	0.29
318	0.33
319	0.33
320	0.27
321	0.22
322	0.2
323	0.18
324	0.15
325	0.14
326	0.09
327	0.09
328	0.08
329	0.07
330	0.1
331	0.11
332	0.1
333	0.1
334	0.11
335	0.14
336	0.14
337	0.14
338	0.1
339	0.08
340	0.08
341	0.08
342	0.08
343	0.05
344	0.06
345	0.06
346	0.05
347	0.06
348	0.06
349	0.06
350	0.07
351	0.1
352	0.15
353	0.15
354	0.17
355	0.19
356	0.25
357	0.29
358	0.33
359	0.36
360	0.37
361	0.41
362	0.44
363	0.48
364	0.49
365	0.51
366	0.51
367	0.51
368	0.5
369	0.51
370	0.5
371	0.51
372	0.49
373	0.48
374	0.45
375	0.41
376	0.4
377	0.34
378	0.32
379	0.26
380	0.21
381	0.17
382	0.16
383	0.16
384	0.15
385	0.17
386	0.17
387	0.27
388	0.31
389	0.39
390	0.44
391	0.49
392	0.53
393	0.56
394	0.56
395	0.46
396	0.41
397	0.38
398	0.32
399	0.29
400	0.24
401	0.2
402	0.18
403	0.19
404	0.2
405	0.15
406	0.15
407	0.1
408	0.11
409	0.11
410	0.11
411	0.12
412	0.17
413	0.19
414	0.2
415	0.21
416	0.2
417	0.2
418	0.21
419	0.18
420	0.15
421	0.2
422	0.26
423	0.35
424	0.44
425	0.53
426	0.62
427	0.72
428	0.78
429	0.83
430	0.87
431	0.88
432	0.9
433	0.91
434	0.92
435	0.93
436	0.94
437	0.94
438	0.93
439	0.93
440	0.93
441	0.93
442	0.93
443	0.92
444	0.92
445	0.91
446	0.87
447	0.85
448	0.78
449	0.7
450	0.6
451	0.51
452	0.4
453	0.31
454	0.24
455	0.14
456	0.1
457	0.07
458	0.06
459	0.06
460	0.06
461	0.05
462	0.06
463	0.06
464	0.09
465	0.09
466	0.09
467	0.1
468	0.1
469	0.09
470	0.09
471	0.09
472	0.08
473	0.09
474	0.1
475	0.09
476	0.1
477	0.13
478	0.16
479	0.23
480	0.28
481	0.32
482	0.36
483	0.4
484	0.43
485	0.5
486	0.53
487	0.55
488	0.59
489	0.64
490	0.7
491	0.75
492	0.78
493	0.76
494	0.8

A0A427Y3C3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer