Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K1W9J2

Protein Details
Accession K1W9J2    Localization Confidence Low Confidence Score 6.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-37ETIRLPAQTRTHRKNPARASTRNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 9.5, cyto_nucl 8.333, cysk 8, cyto_mito 6.166, nucl 5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005378  Vps35  
IPR042491  Vps35_C  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0030906  C:retromer, cargo-selective complex  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
Pfam View protein in Pfam  
PF03635  Vps35  
Amino Acid Sequences MTAPIAGLEHSFIFETIRLPAQTRTHRKNPARASTRNASSTHVSLFQTSDPLVLASASRPVTRWTFPPLITSAIQLARRFKARQSEEKDWEPRISSLFKFIHRLISILYTKVEAPEICLRLFLLAAQVSDECGLEELTYEFFVQAFVIYEESISESRAQLMAITGIISALQGSRVFGADNYDTLITKAALHGSKLLKKGHQATAVLYASHMWWQTGGDERPNPPLRDGKRVLECLQKSLRIATGCIDELTSVQLYVDALDRYIYYFEQGVDAVTPKYINSLVELITSNIDAVHSTDVHPSSASPPGLVDGVNTPDMVVKNTLRYIQNKQRAHRDAPEPSDDAEGEEKPADWSAVDVVGGCLKMGLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.11
3 0.13
4 0.16
5 0.17
6 0.18
7 0.25
8 0.32
9 0.42
10 0.51
11 0.57
12 0.62
13 0.72
14 0.78
15 0.82
16 0.83
17 0.83
18 0.82
19 0.78
20 0.77
21 0.75
22 0.73
23 0.67
24 0.59
25 0.52
26 0.48
27 0.44
28 0.39
29 0.34
30 0.28
31 0.25
32 0.26
33 0.22
34 0.21
35 0.18
36 0.16
37 0.12
38 0.12
39 0.1
40 0.09
41 0.09
42 0.07
43 0.12
44 0.13
45 0.13
46 0.14
47 0.17
48 0.22
49 0.23
50 0.25
51 0.28
52 0.31
53 0.31
54 0.34
55 0.32
56 0.32
57 0.3
58 0.28
59 0.24
60 0.24
61 0.27
62 0.27
63 0.3
64 0.29
65 0.34
66 0.35
67 0.35
68 0.41
69 0.44
70 0.51
71 0.56
72 0.62
73 0.63
74 0.69
75 0.7
76 0.63
77 0.58
78 0.5
79 0.42
80 0.36
81 0.33
82 0.26
83 0.29
84 0.29
85 0.29
86 0.31
87 0.31
88 0.34
89 0.3
90 0.3
91 0.23
92 0.27
93 0.26
94 0.22
95 0.22
96 0.16
97 0.16
98 0.16
99 0.17
100 0.1
101 0.14
102 0.19
103 0.2
104 0.19
105 0.19
106 0.18
107 0.17
108 0.17
109 0.12
110 0.08
111 0.07
112 0.07
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.04
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.06
126 0.06
127 0.05
128 0.05
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.05
150 0.05
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.08
165 0.07
166 0.07
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.13
179 0.15
180 0.19
181 0.23
182 0.24
183 0.23
184 0.27
185 0.32
186 0.32
187 0.32
188 0.29
189 0.26
190 0.31
191 0.29
192 0.25
193 0.2
194 0.16
195 0.13
196 0.14
197 0.13
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.08
202 0.12
203 0.13
204 0.15
205 0.17
206 0.19
207 0.27
208 0.32
209 0.32
210 0.29
211 0.36
212 0.36
213 0.42
214 0.44
215 0.41
216 0.41
217 0.44
218 0.44
219 0.45
220 0.42
221 0.39
222 0.39
223 0.35
224 0.3
225 0.28
226 0.29
227 0.21
228 0.21
229 0.17
230 0.16
231 0.15
232 0.15
233 0.13
234 0.1
235 0.09
236 0.11
237 0.09
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.08
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.09
250 0.08
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.09
255 0.09
256 0.08
257 0.08
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.07
263 0.09
264 0.1
265 0.09
266 0.1
267 0.11
268 0.11
269 0.13
270 0.13
271 0.12
272 0.12
273 0.12
274 0.09
275 0.08
276 0.08
277 0.06
278 0.07
279 0.08
280 0.08
281 0.1
282 0.14
283 0.15
284 0.15
285 0.15
286 0.15
287 0.15
288 0.21
289 0.2
290 0.15
291 0.15
292 0.16
293 0.16
294 0.15
295 0.13
296 0.1
297 0.13
298 0.13
299 0.13
300 0.12
301 0.14
302 0.15
303 0.16
304 0.18
305 0.16
306 0.19
307 0.22
308 0.27
309 0.29
310 0.33
311 0.41
312 0.48
313 0.57
314 0.6
315 0.64
316 0.7
317 0.72
318 0.73
319 0.71
320 0.69
321 0.67
322 0.66
323 0.65
324 0.56
325 0.51
326 0.47
327 0.39
328 0.33
329 0.28
330 0.23
331 0.2
332 0.19
333 0.17
334 0.16
335 0.17
336 0.14
337 0.11
338 0.12
339 0.11
340 0.11
341 0.11
342 0.09
343 0.09
344 0.11
345 0.11
346 0.1