Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K1VMA2

Protein Details
Accession K1VMA2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
159-183TPAEGEEKPKKKRSRWDQMPENETAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
150-156KKRRSRW
160-172PAEGEEKPKKKRS
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10, nucl 9, cyto 9, mito 4, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR015016  SF3b_su1  
IPR038737  SF3b_su1-like  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000245  P:spliceosomal complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF08920  SF3b1  
Amino Acid Sequences MSDDEAYPQLASYTAPKDILEEHERMAEEDTDLTDEIQDRASVRQIAARQSDYQLRRFNRRDGVGEGEDESYADRMRRVNLEREEERVRRYKEQLAKEEEAKGKGEIRERDDKTPERDQIAGDATPPRGAIRDGTPEAKQEPMDDDEASKKRRSRWDITPAEGEEKPKKKRSRWDQMPENETAVASASTSVVETKPAADKMVEDRRYRAITDDELNAVLPGHNDGYQIVAVPDDYHPAPAVRKVVPASSQHAEGFMMQDESSAARAVAAAGGFMGSAEQTEIEGIGTLQFLKAEDSQYFAKVLGEGGGEEDDVNYTYEELKERKIMRLLLKIKNGTPPVRKTALRQITDKAREFGAGPLFDKILPLLMERSLEDQERHLLVKVIDRILYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDEDYYARVEGREIISNLAKAAGLAHMISTMRPDIDHVDEYVRNTTARAFAVVASALGIPALLPFLKAVCRSKKSWQARHTGIRIVQQIAVMMGCAILPHLRNLVDAVAHGLQDDQQKVRTMTALSLAALAESAAPYGIESFDEVLKPLWLGISRHRGKTLAAFLKAIGYIIPLMDPEYAGYYVKECMPTLIREFQTSDEEMRRIVLQVIKQCAGTEGVTPSFIRDEVLPDFFRSFWVRRMALDRRNYKQLVDTTVELANKAGVSDIVGRICNDLKDESEPYRKMVMETITKVVQANGAADIDERLEIQLIDGIIFAFQEQTMEDNVMLDGFGAVVTALGSRVKPYLPQIVSMILWRLTNKSAKVRMLAADLTTKLAPIIKQNDEDALLSKLGVVLFEQLGEEYPDALGSIIAAEASIANVVGMTQMNPPVKDLLPRMTPILRNRHEKVQEATINLIGRIADRGAEFVAAKEWMRICFELLDLLKAHKKAIRRAAVNSFGYIAKAIGPQDVLSVLLTNLKVQERQSRVLSTVAIAIVAETCGPFTCIPAILNEYRTPELNVRNGCLKALAYVFEYVGEMSKDYIHSVVGLLEDSLTDRDHVHRQTACAIVKHLTIGVAGLGYEEALTHLLNLVWPNIFETSPHVIGGVMDAIEAMRIGIGPGVVLSYVLQGLYHPARRVREVYWRMYNTLVLGAVDAMVPFYPALGSAADLASGQDYTRHHLLMWV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.18
3 0.18
4 0.2
5 0.22
6 0.29
7 0.29
8 0.27
9 0.26
10 0.3
11 0.3
12 0.29
13 0.29
14 0.23
15 0.19
16 0.18
17 0.17
18 0.15
19 0.15
20 0.14
21 0.13
22 0.14
23 0.13
24 0.13
25 0.14
26 0.13
27 0.15
28 0.2
29 0.2
30 0.19
31 0.24
32 0.27
33 0.33
34 0.37
35 0.38
36 0.36
37 0.39
38 0.47
39 0.46
40 0.5
41 0.52
42 0.53
43 0.6
44 0.62
45 0.65
46 0.65
47 0.66
48 0.62
49 0.58
50 0.59
51 0.51
52 0.47
53 0.41
54 0.33
55 0.28
56 0.23
57 0.2
58 0.14
59 0.13
60 0.13
61 0.14
62 0.15
63 0.19
64 0.27
65 0.32
66 0.4
67 0.45
68 0.53
69 0.52
70 0.56
71 0.61
72 0.56
73 0.58
74 0.58
75 0.56
76 0.54
77 0.58
78 0.61
79 0.62
80 0.68
81 0.69
82 0.69
83 0.68
84 0.64
85 0.67
86 0.62
87 0.56
88 0.48
89 0.41
90 0.38
91 0.38
92 0.42
93 0.4
94 0.42
95 0.5
96 0.52
97 0.57
98 0.6
99 0.62
100 0.61
101 0.64
102 0.62
103 0.55
104 0.52
105 0.46
106 0.42
107 0.39
108 0.32
109 0.26
110 0.25
111 0.22
112 0.21
113 0.21
114 0.17
115 0.15
116 0.16
117 0.17
118 0.17
119 0.24
120 0.27
121 0.3
122 0.31
123 0.32
124 0.33
125 0.33
126 0.29
127 0.23
128 0.23
129 0.23
130 0.24
131 0.21
132 0.22
133 0.28
134 0.33
135 0.36
136 0.38
137 0.39
138 0.45
139 0.55
140 0.61
141 0.6
142 0.64
143 0.71
144 0.71
145 0.71
146 0.7
147 0.62
148 0.58
149 0.53
150 0.48
151 0.47
152 0.49
153 0.52
154 0.56
155 0.62
156 0.66
157 0.75
158 0.8
159 0.82
160 0.84
161 0.87
162 0.88
163 0.87
164 0.84
165 0.75
166 0.66
167 0.55
168 0.44
169 0.33
170 0.24
171 0.15
172 0.1
173 0.08
174 0.06
175 0.06
176 0.07
177 0.08
178 0.07
179 0.09
180 0.09
181 0.11
182 0.15
183 0.15
184 0.16
185 0.15
186 0.17
187 0.24
188 0.34
189 0.38
190 0.35
191 0.38
192 0.43
193 0.44
194 0.43
195 0.38
196 0.31
197 0.29
198 0.31
199 0.29
200 0.25
201 0.23
202 0.22
203 0.19
204 0.16
205 0.12
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.11
224 0.12
225 0.14
226 0.16
227 0.2
228 0.18
229 0.21
230 0.22
231 0.23
232 0.26
233 0.28
234 0.3
235 0.28
236 0.29
237 0.26
238 0.25
239 0.23
240 0.19
241 0.17
242 0.12
243 0.11
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.08
250 0.07
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.05
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.02
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.08
279 0.09
280 0.11
281 0.11
282 0.14
283 0.15
284 0.16
285 0.16
286 0.14
287 0.13
288 0.11
289 0.11
290 0.08
291 0.08
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.06
297 0.06
298 0.05
299 0.06
300 0.07
301 0.06
302 0.06
303 0.07
304 0.08
305 0.12
306 0.13
307 0.14
308 0.2
309 0.22
310 0.26
311 0.29
312 0.33
313 0.35
314 0.43
315 0.49
316 0.49
317 0.53
318 0.52
319 0.5
320 0.51
321 0.51
322 0.48
323 0.48
324 0.45
325 0.45
326 0.48
327 0.47
328 0.45
329 0.5
330 0.52
331 0.48
332 0.47
333 0.46
334 0.5
335 0.56
336 0.54
337 0.44
338 0.36
339 0.33
340 0.32
341 0.3
342 0.25
343 0.18
344 0.17
345 0.17
346 0.17
347 0.16
348 0.15
349 0.11
350 0.09
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.09
356 0.1
357 0.13
358 0.12
359 0.14
360 0.14
361 0.14
362 0.16
363 0.17
364 0.17
365 0.14
366 0.15
367 0.14
368 0.19
369 0.2
370 0.18
371 0.2
372 0.19
373 0.2
374 0.19
375 0.19
376 0.14
377 0.14
378 0.15
379 0.15
380 0.17
381 0.18
382 0.18
383 0.18
384 0.2
385 0.2
386 0.18
387 0.16
388 0.14
389 0.15
390 0.15
391 0.14
392 0.13
393 0.1
394 0.1
395 0.09
396 0.1
397 0.07
398 0.05
399 0.04
400 0.05
401 0.05
402 0.06
403 0.06
404 0.05
405 0.06
406 0.06
407 0.09
408 0.1
409 0.12
410 0.12
411 0.14
412 0.15
413 0.15
414 0.15
415 0.13
416 0.11
417 0.07
418 0.07
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.07
431 0.08
432 0.11
433 0.12
434 0.11
435 0.14
436 0.15
437 0.16
438 0.17
439 0.15
440 0.12
441 0.12
442 0.12
443 0.12
444 0.11
445 0.11
446 0.09
447 0.09
448 0.09
449 0.09
450 0.08
451 0.06
452 0.06
453 0.05
454 0.04
455 0.04
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.03
460 0.03
461 0.03
462 0.04
463 0.06
464 0.09
465 0.14
466 0.21
467 0.25
468 0.28
469 0.35
470 0.45
471 0.53
472 0.59
473 0.6
474 0.62
475 0.64
476 0.68
477 0.64
478 0.57
479 0.5
480 0.46
481 0.41
482 0.35
483 0.29
484 0.22
485 0.19
486 0.15
487 0.13
488 0.07
489 0.05
490 0.04
491 0.03
492 0.03
493 0.03
494 0.04
495 0.04
496 0.05
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.08
501 0.08
502 0.07
503 0.06
504 0.08
505 0.07
506 0.07
507 0.07
508 0.06
509 0.08
510 0.11
511 0.12
512 0.11
513 0.12
514 0.14
515 0.15
516 0.15
517 0.14
518 0.12
519 0.11
520 0.12
521 0.11
522 0.09
523 0.09
524 0.08
525 0.07
526 0.06
527 0.06
528 0.04
529 0.03
530 0.03
531 0.02
532 0.02
533 0.02
534 0.03
535 0.03
536 0.03
537 0.03
538 0.04
539 0.05
540 0.05
541 0.06
542 0.06
543 0.05
544 0.05
545 0.05
546 0.05
547 0.06
548 0.07
549 0.12
550 0.22
551 0.25
552 0.26
553 0.27
554 0.26
555 0.26
556 0.28
557 0.31
558 0.25
559 0.23
560 0.22
561 0.22
562 0.22
563 0.21
564 0.17
565 0.09
566 0.05
567 0.04
568 0.04
569 0.04
570 0.03
571 0.04
572 0.04
573 0.04
574 0.04
575 0.05
576 0.06
577 0.06
578 0.06
579 0.06
580 0.07
581 0.08
582 0.09
583 0.07
584 0.08
585 0.1
586 0.11
587 0.13
588 0.18
589 0.18
590 0.18
591 0.19
592 0.19
593 0.2
594 0.2
595 0.19
596 0.15
597 0.15
598 0.14
599 0.14
600 0.12
601 0.1
602 0.11
603 0.11
604 0.12
605 0.16
606 0.19
607 0.19
608 0.18
609 0.18
610 0.17
611 0.16
612 0.13
613 0.11
614 0.1
615 0.09
616 0.1
617 0.1
618 0.1
619 0.09
620 0.08
621 0.08
622 0.06
623 0.09
624 0.1
625 0.13
626 0.13
627 0.13
628 0.14
629 0.13
630 0.15
631 0.16
632 0.16
633 0.17
634 0.22
635 0.22
636 0.23
637 0.3
638 0.34
639 0.38
640 0.45
641 0.47
642 0.45
643 0.52
644 0.51
645 0.44
646 0.43
647 0.38
648 0.34
649 0.29
650 0.26
651 0.22
652 0.24
653 0.23
654 0.18
655 0.16
656 0.12
657 0.09
658 0.08
659 0.06
660 0.04
661 0.05
662 0.06
663 0.08
664 0.08
665 0.09
666 0.09
667 0.1
668 0.11
669 0.11
670 0.1
671 0.1
672 0.1
673 0.13
674 0.15
675 0.18
676 0.24
677 0.25
678 0.25
679 0.27
680 0.26
681 0.24
682 0.24
683 0.24
684 0.21
685 0.22
686 0.23
687 0.2
688 0.21
689 0.2
690 0.17
691 0.15
692 0.11
693 0.1
694 0.08
695 0.07
696 0.07
697 0.07
698 0.07
699 0.06
700 0.06
701 0.05
702 0.04
703 0.05
704 0.04
705 0.04
706 0.06
707 0.05
708 0.05
709 0.05
710 0.05
711 0.05
712 0.05
713 0.05
714 0.03
715 0.03
716 0.03
717 0.04
718 0.05
719 0.05
720 0.06
721 0.06
722 0.06
723 0.06
724 0.06
725 0.05
726 0.04
727 0.04
728 0.03
729 0.03
730 0.02
731 0.02
732 0.02
733 0.03
734 0.03
735 0.03
736 0.04
737 0.04
738 0.05
739 0.07
740 0.07
741 0.09
742 0.12
743 0.2
744 0.2
745 0.21
746 0.21
747 0.22
748 0.22
749 0.21
750 0.2
751 0.12
752 0.12
753 0.11
754 0.13
755 0.14
756 0.18
757 0.21
758 0.27
759 0.31
760 0.32
761 0.33
762 0.33
763 0.31
764 0.3
765 0.27
766 0.21
767 0.18
768 0.17
769 0.17
770 0.14
771 0.13
772 0.11
773 0.12
774 0.11
775 0.15
776 0.21
777 0.21
778 0.23
779 0.24
780 0.24
781 0.24
782 0.23
783 0.19
784 0.15
785 0.12
786 0.1
787 0.09
788 0.09
789 0.08
790 0.08
791 0.06
792 0.07
793 0.06
794 0.07
795 0.07
796 0.06
797 0.06
798 0.07
799 0.07
800 0.06
801 0.06
802 0.05
803 0.06
804 0.05
805 0.05
806 0.03
807 0.04
808 0.03
809 0.03
810 0.03
811 0.03
812 0.03
813 0.03
814 0.03
815 0.03
816 0.03
817 0.03
818 0.03
819 0.04
820 0.04
821 0.05
822 0.06
823 0.12
824 0.14
825 0.14
826 0.15
827 0.17
828 0.18
829 0.21
830 0.22
831 0.22
832 0.23
833 0.24
834 0.26
835 0.28
836 0.32
837 0.36
838 0.43
839 0.44
840 0.5
841 0.52
842 0.58
843 0.58
844 0.57
845 0.53
846 0.52
847 0.49
848 0.43
849 0.41
850 0.35
851 0.32
852 0.27
853 0.24
854 0.15
855 0.12
856 0.11
857 0.1
858 0.08
859 0.08
860 0.09
861 0.08
862 0.1
863 0.09
864 0.08
865 0.1
866 0.1
867 0.1
868 0.12
869 0.13
870 0.14
871 0.17
872 0.17
873 0.16
874 0.16
875 0.16
876 0.18
877 0.16
878 0.17
879 0.15
880 0.18
881 0.21
882 0.21
883 0.23
884 0.21
885 0.26
886 0.32
887 0.42
888 0.46
889 0.46
890 0.51
891 0.56
892 0.61
893 0.56
894 0.48
895 0.41
896 0.32
897 0.29
898 0.24
899 0.17
900 0.11
901 0.12
902 0.11
903 0.1
904 0.11
905 0.1
906 0.11
907 0.11
908 0.1
909 0.08
910 0.08
911 0.07
912 0.1
913 0.1
914 0.1
915 0.13
916 0.14
917 0.17
918 0.19
919 0.28
920 0.3
921 0.34
922 0.37
923 0.36
924 0.36
925 0.35
926 0.32
927 0.24
928 0.21
929 0.16
930 0.13
931 0.1
932 0.09
933 0.07
934 0.07
935 0.06
936 0.04
937 0.05
938 0.05
939 0.07
940 0.07
941 0.08
942 0.1
943 0.11
944 0.11
945 0.13
946 0.18
947 0.18
948 0.22
949 0.22
950 0.25
951 0.25
952 0.26
953 0.27
954 0.27
955 0.3
956 0.35
957 0.34
958 0.33
959 0.37
960 0.37
961 0.34
962 0.3
963 0.25
964 0.2
965 0.19
966 0.18
967 0.14
968 0.15
969 0.14
970 0.13
971 0.13
972 0.11
973 0.11
974 0.1
975 0.09
976 0.08
977 0.1
978 0.1
979 0.11
980 0.11
981 0.1
982 0.1
983 0.1
984 0.09
985 0.08
986 0.08
987 0.07
988 0.06
989 0.06
990 0.07
991 0.08
992 0.08
993 0.08
994 0.1
995 0.14
996 0.21
997 0.24
998 0.29
999 0.3
1000 0.31
1001 0.35
1002 0.41
1003 0.4
1004 0.34
1005 0.35
1006 0.3
1007 0.29
1008 0.28
1009 0.23
1010 0.17
1011 0.13
1012 0.12
1013 0.09
1014 0.07
1015 0.06
1016 0.06
1017 0.05
1018 0.05
1019 0.04
1020 0.04
1021 0.05
1022 0.05
1023 0.05
1024 0.05
1025 0.06
1026 0.06
1027 0.08
1028 0.09
1029 0.11
1030 0.1
1031 0.11
1032 0.13
1033 0.14
1034 0.13
1035 0.12
1036 0.17
1037 0.22
1038 0.22
1039 0.22
1040 0.2
1041 0.18
1042 0.18
1043 0.19
1044 0.14
1045 0.08
1046 0.06
1047 0.07
1048 0.06
1049 0.06
1050 0.06
1051 0.04
1052 0.03
1053 0.03
1054 0.04
1055 0.04
1056 0.04
1057 0.04
1058 0.04
1059 0.05
1060 0.05
1061 0.05
1062 0.05
1063 0.06
1064 0.06
1065 0.06
1066 0.06
1067 0.06
1068 0.13
1069 0.19
1070 0.23
1071 0.26
1072 0.32
1073 0.36
1074 0.41
1075 0.44
1076 0.42
1077 0.47
1078 0.49
1079 0.53
1080 0.58
1081 0.57
1082 0.54
1083 0.52
1084 0.49
1085 0.39
1086 0.34
1087 0.26
1088 0.16
1089 0.13
1090 0.11
1091 0.1
1092 0.09
1093 0.08
1094 0.06
1095 0.06
1096 0.06
1097 0.06
1098 0.06
1099 0.05
1100 0.05
1101 0.07
1102 0.06
1103 0.07
1104 0.08
1105 0.08
1106 0.08
1107 0.09
1108 0.09
1109 0.08
1110 0.08
1111 0.08
1112 0.11
1113 0.12
1114 0.19
1115 0.22
1116 0.22