Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A433PDM2

Protein Details
Accession A0A433PDM2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-54YSEWTKIYKPNKKFRKHGLAAHydrophilic
108-129RRSPGDTDKKRKSPRKVLCDDCBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
117-120KRKS
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11, cyto 5.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017884  SANT_dom  
IPR029617  Snt2  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
PS51293  SANT  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MCHNLNQQVPTKSMGDIVRYFYKWKKTDRYEPIYSEWTKIYKPNKKFRKHGLAAENSTETPVIEEEASDSEDSEDESDSDPTIVPNRGAPREGYQCMNCGTMESHIWRRSPGDTDKKRKSPRKVLCDDCGVFWLKYGIARVQAKPRGSGNESEETGEIRIAVPADAVRRVLVPGAIPDAEDVLGVWIVCTYGYGVTHYYYS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.27
3 0.26
4 0.29
5 0.32
6 0.32
7 0.36
8 0.37
9 0.45
10 0.45
11 0.51
12 0.57
13 0.6
14 0.69
15 0.74
16 0.77
17 0.73
18 0.71
19 0.67
20 0.64
21 0.57
22 0.49
23 0.41
24 0.35
25 0.31
26 0.34
27 0.4
28 0.42
29 0.5
30 0.58
31 0.66
32 0.72
33 0.79
34 0.82
35 0.83
36 0.78
37 0.77
38 0.76
39 0.74
40 0.67
41 0.62
42 0.54
43 0.42
44 0.38
45 0.29
46 0.2
47 0.13
48 0.1
49 0.08
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.07
54 0.09
55 0.08
56 0.08
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.06
62 0.06
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.12
73 0.15
74 0.16
75 0.16
76 0.17
77 0.19
78 0.23
79 0.24
80 0.24
81 0.21
82 0.21
83 0.22
84 0.21
85 0.16
86 0.12
87 0.11
88 0.1
89 0.11
90 0.12
91 0.16
92 0.18
93 0.19
94 0.19
95 0.2
96 0.2
97 0.24
98 0.28
99 0.34
100 0.41
101 0.5
102 0.58
103 0.65
104 0.74
105 0.78
106 0.8
107 0.8
108 0.8
109 0.81
110 0.8
111 0.77
112 0.71
113 0.69
114 0.6
115 0.5
116 0.43
117 0.35
118 0.27
119 0.21
120 0.18
121 0.11
122 0.11
123 0.13
124 0.12
125 0.16
126 0.2
127 0.22
128 0.3
129 0.36
130 0.36
131 0.37
132 0.38
133 0.37
134 0.36
135 0.38
136 0.34
137 0.34
138 0.34
139 0.32
140 0.3
141 0.25
142 0.23
143 0.18
144 0.13
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.1
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.11
156 0.11
157 0.12
158 0.11
159 0.1
160 0.1
161 0.12
162 0.12
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.1
168 0.08
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.05
178 0.07
179 0.08
180 0.09
181 0.11