FuNGI

K1WH38

Protein Details

Accession

K1WH38

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
3-45	GDAFFLKKKSRPRQLGAAKPGAGAGPSRPVRPRPATRPPAKLV	Hydrophilic
159-182	GTAPGQTNKRRGKRNTKEVFHQDL	Hydrophilic
598-623	PSTGEDGQQKKKKKSNRGSATPVPEY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
9-45	KKKSRPRQLGAAKPGAGAGPSRPVRPRPATRPPAKLV
470-588	REREKEKEKEKEKEERNGSRAGSAQPGERSSNSPNKKAMPKAGAGAALLAKRAASRGASPSVRSRAGSPLARGSSPDGRASSPVGRAGSPAARAGSPAARAGSPAARAGSPAVHGKRKA
607-612	KKKKKS

Subcellular Location(s)

nucl 18, mito 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MAGDAFFLKKKSRPRQLGAAKPGAGAGPSRPVRPRPATRPPAKLVGLAAAKAKQEEEAKAVKAENVVEIQIVSAEPGSGLRYNLMKMNMLRDVDPSQIASPMLLNRKQPGPKAPPQFAHDAEGKIIGRYVYDENGKPVLDDEGKPKIEIKQEMDMSLVGTAPGQTNKRRGKRNTKEVFHQDLEVIKLRREEANPWVLEAKNPTEGSELPEFWVGRMQEPSTLPTVLLVNEGEGATFTMVPMGRTYRFDPQRRFKMLDPDQANRYFELQDKHHVHDRWGLRTDDTGNLKVDEQNFIKNSNRVKRFEAKVEEGLSLPGEEMKPSLRARSQPKAAKGYYDSSYFDDYKAENRQMGRALEGGFDEELDYDVNEDFQDDEDSNTFYVNREEEEEKKLQEERQKEEYKLANRNVGDRPQLEENSDDDDEEDPFALTSEGRRLRRMMRKRGEEERDLYGSDSDDDSDSELEELERDREREKEKEKEKEKEERNGSRAGSAQPGERSSNSPNKKAMPKAGAGAALLAKRAASRGASPSVRSRAGSPLARGSSPDGRASSPVGRAGSPAARAGSPAARAGSPAARAGSPAVHGKRKATESPMRDTPPSTGEDGQQKKKKKSNRGSATPVPEYEPFPDMLTREEVIRWFKPRGSVHMKDAVNAFIPRIKRGAHDVQQKNQSLLLYYIRQMTMATDPGQGKNKKLQLRPEYNV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.68
2	0.76
3	0.81
4	0.86
5	0.84
6	0.81
7	0.7
8	0.61
9	0.55
10	0.44
11	0.35
12	0.26
13	0.19
14	0.21
15	0.23
16	0.28
17	0.33
18	0.37
19	0.46
20	0.54
21	0.62
22	0.62
23	0.7
24	0.76
25	0.79
26	0.82
27	0.78
28	0.76
29	0.68
30	0.6
31	0.5
32	0.47
33	0.4
34	0.33
35	0.31
36	0.26
37	0.26
38	0.25
39	0.24
40	0.21
41	0.23
42	0.24
43	0.26
44	0.28
45	0.28
46	0.3
47	0.3
48	0.27
49	0.26
50	0.24
51	0.21
52	0.18
53	0.16
54	0.14
55	0.13
56	0.12
57	0.1
58	0.09
59	0.07
60	0.06
61	0.05
62	0.05
63	0.06
64	0.09
65	0.09
66	0.1
67	0.12
68	0.14
69	0.15
70	0.2
71	0.21
72	0.23
73	0.23
74	0.27
75	0.29
76	0.29
77	0.28
78	0.28
79	0.28
80	0.26
81	0.25
82	0.22
83	0.18
84	0.18
85	0.17
86	0.14
87	0.14
88	0.17
89	0.24
90	0.26
91	0.28
92	0.3
93	0.38
94	0.42
95	0.45
96	0.49
97	0.5
98	0.56
99	0.62
100	0.64
101	0.62
102	0.61
103	0.62
104	0.54
105	0.5
106	0.44
107	0.36
108	0.31
109	0.3
110	0.27
111	0.21
112	0.2
113	0.16
114	0.12
115	0.14
116	0.16
117	0.15
118	0.19
119	0.2
120	0.22
121	0.25
122	0.24
123	0.21
124	0.2
125	0.21
126	0.19
127	0.2
128	0.22
129	0.27
130	0.28
131	0.29
132	0.3
133	0.3
134	0.33
135	0.37
136	0.36
137	0.36
138	0.37
139	0.37
140	0.36
141	0.31
142	0.25
143	0.2
144	0.15
145	0.07
146	0.06
147	0.07
148	0.08
149	0.12
150	0.16
151	0.2
152	0.3
153	0.39
154	0.47
155	0.56
156	0.64
157	0.72
158	0.78
159	0.85
160	0.85
161	0.81
162	0.82
163	0.81
164	0.78
165	0.68
166	0.58
167	0.49
168	0.4
169	0.38
170	0.35
171	0.28
172	0.22
173	0.22
174	0.23
175	0.26
176	0.25
177	0.26
178	0.26
179	0.32
180	0.31
181	0.3
182	0.32
183	0.28
184	0.28
185	0.28
186	0.24
187	0.22
188	0.22
189	0.21
190	0.2
191	0.21
192	0.24
193	0.24
194	0.22
195	0.17
196	0.2
197	0.19
198	0.17
199	0.21
200	0.17
201	0.16
202	0.18
203	0.17
204	0.18
205	0.19
206	0.2
207	0.18
208	0.18
209	0.16
210	0.14
211	0.15
212	0.11
213	0.11
214	0.09
215	0.07
216	0.08
217	0.08
218	0.06
219	0.06
220	0.06
221	0.05
222	0.05
223	0.05
224	0.06
225	0.07
226	0.07
227	0.08
228	0.11
229	0.12
230	0.15
231	0.17
232	0.24
233	0.33
234	0.4
235	0.48
236	0.55
237	0.63
238	0.65
239	0.66
240	0.6
241	0.62
242	0.6
243	0.6
244	0.55
245	0.5
246	0.49
247	0.48
248	0.46
249	0.36
250	0.32
251	0.24
252	0.23
253	0.23
254	0.21
255	0.27
256	0.3
257	0.32
258	0.38
259	0.37
260	0.35
261	0.39
262	0.4
263	0.36
264	0.37
265	0.34
266	0.28
267	0.29
268	0.29
269	0.27
270	0.27
271	0.23
272	0.2
273	0.2
274	0.2
275	0.21
276	0.2
277	0.19
278	0.17
279	0.19
280	0.19
281	0.2
282	0.22
283	0.24
284	0.31
285	0.35
286	0.4
287	0.39
288	0.43
289	0.49
290	0.5
291	0.52
292	0.5
293	0.45
294	0.42
295	0.41
296	0.36
297	0.28
298	0.25
299	0.18
300	0.13
301	0.09
302	0.08
303	0.06
304	0.05
305	0.06
306	0.06
307	0.1
308	0.11
309	0.13
310	0.14
311	0.21
312	0.27
313	0.33
314	0.41
315	0.42
316	0.46
317	0.5
318	0.47
319	0.44
320	0.4
321	0.37
322	0.3
323	0.27
324	0.24
325	0.2
326	0.23
327	0.21
328	0.18
329	0.16
330	0.15
331	0.17
332	0.19
333	0.18
334	0.17
335	0.17
336	0.19
337	0.2
338	0.2
339	0.17
340	0.15
341	0.14
342	0.12
343	0.11
344	0.1
345	0.07
346	0.07
347	0.06
348	0.05
349	0.05
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.05
359	0.06
360	0.05
361	0.06
362	0.07
363	0.08
364	0.07
365	0.07
366	0.07
367	0.07
368	0.08
369	0.07
370	0.07
371	0.1
372	0.12
373	0.15
374	0.19
375	0.2
376	0.19
377	0.21
378	0.22
379	0.23
380	0.26
381	0.29
382	0.3
383	0.38
384	0.41
385	0.4
386	0.43
387	0.46
388	0.46
389	0.49
390	0.45
391	0.41
392	0.38
393	0.41
394	0.39
395	0.36
396	0.33
397	0.26
398	0.27
399	0.26
400	0.26
401	0.23
402	0.21
403	0.19
404	0.2
405	0.19
406	0.16
407	0.13
408	0.13
409	0.12
410	0.11
411	0.1
412	0.06
413	0.06
414	0.06
415	0.05
416	0.05
417	0.05
418	0.13
419	0.19
420	0.21
421	0.22
422	0.25
423	0.33
424	0.43
425	0.52
426	0.56
427	0.58
428	0.65
429	0.7
430	0.77
431	0.74
432	0.68
433	0.62
434	0.55
435	0.47
436	0.39
437	0.34
438	0.25
439	0.19
440	0.16
441	0.13
442	0.09
443	0.08
444	0.08
445	0.08
446	0.08
447	0.07
448	0.06
449	0.06
450	0.05
451	0.06
452	0.06
453	0.08
454	0.1
455	0.11
456	0.12
457	0.18
458	0.22
459	0.3
460	0.36
461	0.43
462	0.49
463	0.58
464	0.65
465	0.68
466	0.7
467	0.72
468	0.72
469	0.72
470	0.73
471	0.7
472	0.65
473	0.61
474	0.55
475	0.47
476	0.43
477	0.35
478	0.3
479	0.24
480	0.24
481	0.22
482	0.24
483	0.24
484	0.23
485	0.25
486	0.27
487	0.36
488	0.37
489	0.39
490	0.41
491	0.45
492	0.5
493	0.51
494	0.52
495	0.46
496	0.43
497	0.41
498	0.39
499	0.33
500	0.26
501	0.23
502	0.18
503	0.14
504	0.13
505	0.1
506	0.09
507	0.08
508	0.09
509	0.09
510	0.08
511	0.11
512	0.15
513	0.21
514	0.23
515	0.25
516	0.31
517	0.35
518	0.35
519	0.33
520	0.31
521	0.31
522	0.36
523	0.36
524	0.32
525	0.34
526	0.34
527	0.33
528	0.33
529	0.32
530	0.32
531	0.31
532	0.32
533	0.26
534	0.25
535	0.27
536	0.29
537	0.27
538	0.23
539	0.25
540	0.23
541	0.21
542	0.21
543	0.23
544	0.22
545	0.2
546	0.19
547	0.17
548	0.16
549	0.16
550	0.18
551	0.17
552	0.16
553	0.16
554	0.16
555	0.14
556	0.15
557	0.17
558	0.17
559	0.16
560	0.16
561	0.16
562	0.14
563	0.15
564	0.16
565	0.14
566	0.14
567	0.21
568	0.25
569	0.3
570	0.32
571	0.35
572	0.4
573	0.44
574	0.46
575	0.46
576	0.49
577	0.48
578	0.53
579	0.58
580	0.55
581	0.52
582	0.49
583	0.43
584	0.38
585	0.35
586	0.32
587	0.26
588	0.27
589	0.35
590	0.41
591	0.49
592	0.53
593	0.59
594	0.65
595	0.71
596	0.76
597	0.78
598	0.81
599	0.82
600	0.85
601	0.85
602	0.85
603	0.85
604	0.84
605	0.76
606	0.66
607	0.59
608	0.5
609	0.44
610	0.37
611	0.31
612	0.24
613	0.22
614	0.22
615	0.19
616	0.2
617	0.21
618	0.19
619	0.18
620	0.19
621	0.22
622	0.26
623	0.3
624	0.32
625	0.32
626	0.34
627	0.41
628	0.43
629	0.49
630	0.52
631	0.52
632	0.53
633	0.58
634	0.56
635	0.5
636	0.48
637	0.41
638	0.36
639	0.31
640	0.26
641	0.22
642	0.24
643	0.23
644	0.25
645	0.24
646	0.23
647	0.31
648	0.39
649	0.43
650	0.52
651	0.57
652	0.63
653	0.71
654	0.7
655	0.63
656	0.56
657	0.48
658	0.39
659	0.35
660	0.31
661	0.25
662	0.25
663	0.28
664	0.26
665	0.26
666	0.23
667	0.23
668	0.21
669	0.22
670	0.21
671	0.23
672	0.26
673	0.31
674	0.41
675	0.41
676	0.42
677	0.48
678	0.54
679	0.57
680	0.61
681	0.66
682	0.67

K1WH38

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer