Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P9YXI8

Protein Details
Accession A0A4P9YXI8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
507-530DKSFQDRRRISKIRNKPKHALAGLHydrophilic
607-627LERTRLPRHIHRDKILRNYNEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
520-520R
Subcellular Location(s) cysk 20, cyto 5, cyto_nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015412  Atg2/VPS13_C  
IPR026847  VPS13  
IPR031645  VPS13_DH-like  
IPR009543  VPS13_VAB  
Pfam View protein in Pfam  
PF09333  ATG_C  
PF06650  SHR-BD  
PF16909  VPS13_C  
Amino Acid Sequences MYDVDGQVQLIRVRILMEQATIFIELYKETRQWPYRIENQSDAAVIVYQRPPYSAEHGDTDAGAMTVKRYTIPARSTLDYAWDYPSLPGKLLVLNVNHRERDISLQEIGPSVPLQYPAGGSSGTMAIDVYADGLTQVLHLSEFNPIKSIYRRARQGSIADSFEVANIDSAPNLSVKLRLAGVGVSVINSQVEEIAYVTLRGLEISFVDWSIQQSFHVICQWLQIDNQKFGAIYPIVLYPTMISRRSEDTEHPAFHLALVRSKDTSHGVEYIKYFSVLLQEMSFEIDEDFLYTLIEFANFDTDSTSAKPVVERAIGDESMDIPEPHQVESTTQIYFEVFHIQPIKLNLSYISTDRLDLETDPNRAPSSSNPITFLLGVLKMAIGSISDAPIQMNALLMENLRLTPALLVQLLEHHYRQQAISQIHRFLGSADALGNPVGLFNNITSGVVDIFYEPYQGFIMSDRPQDLGYGLIKGTASFMKKTVFGLSDSVSKVTDTIGKGLTAATFDKSFQDRRRISKIRNKPKHALAGLSQGATSFASSVASGLTGVITQPLSGAENEGVGGFFRGVGKGIVGIVAKPMVGVVDLATNVSEGIRNTTTVFDDTVELERTRLPRHIHRDKILRNYNEREAVGQNLLRNTDDGTYAKEHYLAHLELRGDGIVMILTSTRILAVNIKRSKVDWDVSFAGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.17
3 0.15
4 0.16
5 0.15
6 0.15
7 0.16
8 0.15
9 0.14
10 0.11
11 0.11
12 0.1
13 0.13
14 0.15
15 0.16
16 0.2
17 0.29
18 0.35
19 0.38
20 0.43
21 0.48
22 0.54
23 0.61
24 0.63
25 0.58
26 0.54
27 0.52
28 0.46
29 0.38
30 0.29
31 0.22
32 0.17
33 0.17
34 0.18
35 0.19
36 0.18
37 0.19
38 0.21
39 0.23
40 0.3
41 0.3
42 0.29
43 0.3
44 0.32
45 0.31
46 0.29
47 0.25
48 0.19
49 0.14
50 0.12
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.09
55 0.09
56 0.12
57 0.16
58 0.22
59 0.25
60 0.31
61 0.35
62 0.37
63 0.38
64 0.36
65 0.38
66 0.33
67 0.31
68 0.27
69 0.23
70 0.21
71 0.21
72 0.27
73 0.22
74 0.21
75 0.2
76 0.18
77 0.19
78 0.2
79 0.23
80 0.21
81 0.27
82 0.34
83 0.39
84 0.38
85 0.37
86 0.36
87 0.33
88 0.36
89 0.32
90 0.28
91 0.25
92 0.25
93 0.25
94 0.24
95 0.23
96 0.17
97 0.14
98 0.12
99 0.11
100 0.11
101 0.11
102 0.11
103 0.11
104 0.11
105 0.12
106 0.1
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.08
111 0.08
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.05
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.05
127 0.05
128 0.13
129 0.14
130 0.14
131 0.16
132 0.16
133 0.2
134 0.24
135 0.33
136 0.34
137 0.4
138 0.47
139 0.5
140 0.54
141 0.55
142 0.54
143 0.5
144 0.46
145 0.4
146 0.33
147 0.29
148 0.24
149 0.21
150 0.17
151 0.12
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.07
160 0.07
161 0.09
162 0.09
163 0.11
164 0.11
165 0.1
166 0.11
167 0.1
168 0.09
169 0.09
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.05
178 0.05
179 0.04
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.06
184 0.06
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.04
190 0.05
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.1
198 0.1
199 0.08
200 0.1
201 0.11
202 0.11
203 0.13
204 0.12
205 0.11
206 0.14
207 0.15
208 0.14
209 0.15
210 0.22
211 0.22
212 0.23
213 0.23
214 0.2
215 0.19
216 0.18
217 0.2
218 0.13
219 0.1
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.1
225 0.07
226 0.11
227 0.14
228 0.14
229 0.14
230 0.16
231 0.21
232 0.23
233 0.25
234 0.24
235 0.28
236 0.31
237 0.3
238 0.29
239 0.27
240 0.24
241 0.22
242 0.24
243 0.18
244 0.18
245 0.19
246 0.19
247 0.18
248 0.18
249 0.2
250 0.18
251 0.19
252 0.15
253 0.18
254 0.18
255 0.19
256 0.2
257 0.2
258 0.17
259 0.16
260 0.14
261 0.1
262 0.12
263 0.11
264 0.1
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.09
269 0.08
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.04
277 0.05
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.07
289 0.08
290 0.09
291 0.1
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.11
297 0.11
298 0.1
299 0.11
300 0.13
301 0.13
302 0.13
303 0.12
304 0.1
305 0.1
306 0.1
307 0.08
308 0.05
309 0.08
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.08
314 0.09
315 0.12
316 0.14
317 0.11
318 0.1
319 0.1
320 0.1
321 0.1
322 0.1
323 0.12
324 0.1
325 0.12
326 0.14
327 0.14
328 0.15
329 0.16
330 0.18
331 0.12
332 0.12
333 0.11
334 0.11
335 0.12
336 0.11
337 0.13
338 0.11
339 0.11
340 0.11
341 0.12
342 0.1
343 0.1
344 0.14
345 0.14
346 0.16
347 0.16
348 0.16
349 0.16
350 0.15
351 0.16
352 0.13
353 0.19
354 0.2
355 0.21
356 0.22
357 0.22
358 0.23
359 0.22
360 0.2
361 0.12
362 0.09
363 0.08
364 0.06
365 0.05
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.03
370 0.03
371 0.04
372 0.04
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.04
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.08
397 0.1
398 0.11
399 0.11
400 0.12
401 0.13
402 0.13
403 0.14
404 0.14
405 0.18
406 0.19
407 0.25
408 0.27
409 0.28
410 0.27
411 0.27
412 0.25
413 0.19
414 0.19
415 0.12
416 0.09
417 0.08
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.07
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.04
426 0.05
427 0.04
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.05
437 0.07
438 0.06
439 0.08
440 0.07
441 0.08
442 0.08
443 0.08
444 0.07
445 0.07
446 0.11
447 0.12
448 0.14
449 0.14
450 0.15
451 0.15
452 0.15
453 0.14
454 0.13
455 0.11
456 0.1
457 0.09
458 0.09
459 0.09
460 0.09
461 0.1
462 0.11
463 0.12
464 0.12
465 0.14
466 0.15
467 0.15
468 0.17
469 0.18
470 0.16
471 0.15
472 0.16
473 0.16
474 0.19
475 0.19
476 0.19
477 0.16
478 0.15
479 0.14
480 0.13
481 0.16
482 0.12
483 0.14
484 0.14
485 0.14
486 0.14
487 0.14
488 0.13
489 0.1
490 0.11
491 0.1
492 0.1
493 0.11
494 0.14
495 0.17
496 0.24
497 0.28
498 0.38
499 0.41
500 0.47
501 0.57
502 0.61
503 0.67
504 0.7
505 0.76
506 0.77
507 0.82
508 0.83
509 0.8
510 0.8
511 0.8
512 0.71
513 0.63
514 0.54
515 0.52
516 0.45
517 0.38
518 0.31
519 0.21
520 0.21
521 0.17
522 0.15
523 0.07
524 0.05
525 0.06
526 0.06
527 0.06
528 0.05
529 0.05
530 0.05
531 0.05
532 0.05
533 0.04
534 0.04
535 0.06
536 0.06
537 0.05
538 0.05
539 0.06
540 0.08
541 0.08
542 0.09
543 0.08
544 0.08
545 0.08
546 0.08
547 0.08
548 0.06
549 0.07
550 0.05
551 0.06
552 0.06
553 0.07
554 0.07
555 0.07
556 0.07
557 0.07
558 0.07
559 0.09
560 0.08
561 0.08
562 0.09
563 0.09
564 0.08
565 0.08
566 0.07
567 0.05
568 0.05
569 0.05
570 0.05
571 0.06
572 0.06
573 0.07
574 0.07
575 0.07
576 0.07
577 0.07
578 0.08
579 0.07
580 0.12
581 0.13
582 0.14
583 0.15
584 0.16
585 0.18
586 0.18
587 0.18
588 0.14
589 0.14
590 0.15
591 0.18
592 0.19
593 0.17
594 0.17
595 0.2
596 0.23
597 0.25
598 0.29
599 0.32
600 0.38
601 0.49
602 0.58
603 0.63
604 0.68
605 0.75
606 0.77
607 0.81
608 0.81
609 0.79
610 0.76
611 0.75
612 0.73
613 0.68
614 0.61
615 0.54
616 0.46
617 0.42
618 0.39
619 0.34
620 0.31
621 0.28
622 0.29
623 0.26
624 0.25
625 0.23
626 0.19
627 0.2
628 0.17
629 0.19
630 0.21
631 0.22
632 0.23
633 0.24
634 0.22
635 0.22
636 0.26
637 0.23
638 0.22
639 0.24
640 0.24
641 0.22
642 0.23
643 0.2
644 0.14
645 0.13
646 0.11
647 0.07
648 0.06
649 0.06
650 0.05
651 0.06
652 0.05
653 0.06
654 0.06
655 0.07
656 0.08
657 0.16
658 0.22
659 0.32
660 0.38
661 0.4
662 0.41
663 0.41
664 0.47
665 0.45
666 0.46
667 0.38
668 0.39