Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1J0W6

Protein Details
Accession A0A4V1J0W6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
346-369ASSASKKRNRNSTAAPRPRKKTGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
351-367KKRNRNSTAAPRPRKKT
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029005  LIM-bd/SEUSS  
Pfam View protein in Pfam  
PF01803  LIM_bind  
Amino Acid Sequences MACCADLKSKAIAHFYHTNFCCGVQSIQFSVEQIKEFAMANGCLVADCPRVSLYYLFEDGSKGMKIEGLEFDTQQHVELVPRSILQQVSDAATAAAKQPRRKKADQSPLNGDKTAATSVPASLVNEFGIVPDAMQVLEMSDTFHQMSDLFQLSALGGNQSLPIDVMKQYCSLAAEMQQQMATISANTNTANNNNSNNNNGNNGNNVTGNLNDFGSTSNANTAMVPSAPEPASAPLSATPNNYAADINQLLASTMPLTPQQQQALLASVTGMGGAVQPSLNAANHAMMVGVKNELSSHTGMELLQSPVLGGMLSPTISGEPDPIGGAGGAGASGSPKSAQATTTGTASSASKKRNRNSTAAPRPRKKTGSTSKAAAAAAANGGASATSNGATGTATSATAGTETAAHAGHHPALLTGNP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.42
3 0.47
4 0.44
5 0.44
6 0.39
7 0.39
8 0.34
9 0.28
10 0.28
11 0.22
12 0.25
13 0.23
14 0.24
15 0.24
16 0.23
17 0.24
18 0.24
19 0.21
20 0.18
21 0.17
22 0.17
23 0.17
24 0.18
25 0.17
26 0.15
27 0.14
28 0.14
29 0.13
30 0.11
31 0.12
32 0.12
33 0.12
34 0.12
35 0.13
36 0.13
37 0.14
38 0.16
39 0.17
40 0.17
41 0.18
42 0.2
43 0.19
44 0.19
45 0.19
46 0.18
47 0.18
48 0.16
49 0.11
50 0.1
51 0.12
52 0.12
53 0.13
54 0.15
55 0.16
56 0.17
57 0.17
58 0.19
59 0.19
60 0.19
61 0.17
62 0.15
63 0.12
64 0.13
65 0.15
66 0.15
67 0.14
68 0.14
69 0.14
70 0.17
71 0.17
72 0.15
73 0.15
74 0.14
75 0.15
76 0.15
77 0.14
78 0.11
79 0.1
80 0.1
81 0.13
82 0.17
83 0.2
84 0.27
85 0.36
86 0.46
87 0.54
88 0.59
89 0.65
90 0.7
91 0.77
92 0.77
93 0.75
94 0.76
95 0.75
96 0.72
97 0.62
98 0.52
99 0.41
100 0.35
101 0.29
102 0.19
103 0.13
104 0.1
105 0.1
106 0.12
107 0.12
108 0.1
109 0.09
110 0.1
111 0.09
112 0.09
113 0.08
114 0.07
115 0.08
116 0.07
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.04
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.06
128 0.07
129 0.08
130 0.08
131 0.07
132 0.07
133 0.08
134 0.09
135 0.1
136 0.09
137 0.08
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.06
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.06
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.06
151 0.07
152 0.08
153 0.09
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.11
158 0.1
159 0.09
160 0.11
161 0.15
162 0.15
163 0.15
164 0.15
165 0.14
166 0.13
167 0.13
168 0.1
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.06
174 0.07
175 0.08
176 0.09
177 0.12
178 0.13
179 0.15
180 0.17
181 0.18
182 0.21
183 0.22
184 0.21
185 0.22
186 0.21
187 0.19
188 0.17
189 0.18
190 0.15
191 0.13
192 0.12
193 0.1
194 0.09
195 0.1
196 0.08
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.09
218 0.11
219 0.1
220 0.1
221 0.09
222 0.12
223 0.13
224 0.13
225 0.13
226 0.13
227 0.14
228 0.14
229 0.12
230 0.1
231 0.12
232 0.12
233 0.11
234 0.09
235 0.09
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.07
243 0.09
244 0.11
245 0.14
246 0.15
247 0.15
248 0.15
249 0.15
250 0.16
251 0.14
252 0.11
253 0.08
254 0.07
255 0.06
256 0.05
257 0.05
258 0.03
259 0.03
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.05
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.1
286 0.09
287 0.11
288 0.12
289 0.1
290 0.1
291 0.09
292 0.09
293 0.08
294 0.08
295 0.07
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.06
312 0.06
313 0.05
314 0.04
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.03
319 0.03
320 0.04
321 0.04
322 0.06
323 0.08
324 0.09
325 0.1
326 0.12
327 0.16
328 0.17
329 0.18
330 0.17
331 0.15
332 0.16
333 0.17
334 0.21
335 0.23
336 0.31
337 0.37
338 0.46
339 0.54
340 0.63
341 0.67
342 0.67
343 0.71
344 0.74
345 0.78
346 0.8
347 0.83
348 0.82
349 0.83
350 0.85
351 0.8
352 0.74
353 0.74
354 0.74
355 0.73
356 0.69
357 0.66
358 0.61
359 0.59
360 0.53
361 0.43
362 0.33
363 0.24
364 0.19
365 0.15
366 0.11
367 0.07
368 0.07
369 0.06
370 0.06
371 0.05
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.08
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.08
385 0.09
386 0.08
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.09
391 0.09
392 0.09
393 0.11
394 0.14
395 0.15
396 0.15
397 0.14
398 0.13