FuNGI

A0A4P9Z330

Protein Details

Accession

A0A4P9Z330

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
16-35	GSVKPHQVAKPKRDLRRAVA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005824 KOW IPR041977 KOW_Spt5_4 IPR041978 KOW_Spt5_5 IPR014722 Rib_L2_dom2 IPR039659 SPT5
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
CDD	cd06084 KOW_Spt5_4 cd06085 KOW_Spt5_5

Amino Acid Sequences

MGAESLAILREDGQVGSVKPHQVAKPKRDLRRAVASDADGNVVRVGDKVKEVGASSREGVILYIHRGSLFVRSREVTKNSGVFIVRGQQVRSMANTGARQVLANEKFARPAPPIDRGHGRYNQRNDRLVGQTVVITQGKDKGLLGIVKECTSTGARVELHSNARVVAVDKAKLHVKTSTGGTIPALEFSPNMPGTSIAPSYTSAIVSGSRPGSGYGSMGAQTPFISSGGRTPNPYASGGSGSRTPAWDAGNRTPAWNPGNRTPAWNAGNRTPAWSGSGGGGGGSSSTTSDNWGAPSHSTSNGSDGWGSVNASSTGHDGWGSTAATPSGSDPWGMPSSSSSGSASNKGWESSSNFPSTPGPMTPAPATPGSTTQTPRFPSTPGPHTPATQAVYMEAGDDRAAGAGGDGHQYEGGGQWTAPNVVVGGGGGVENDIYHTAWPLEGIWVKIIPKHRVNGQPWLHGNEGEEAIITQVHANGNCTIRLLGSQQTIPQVPRDYLAPVTPERKDTVAFLTGKHRGNTGVLMGVDNMDCYVQGSNAVEYNFCKLAMLAKYTTPA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.14
3	0.18
4	0.22
5	0.22
6	0.24
7	0.3
8	0.34
9	0.42
10	0.51
11	0.55
12	0.62
13	0.69
14	0.75
15	0.79
16	0.81
17	0.78
18	0.79
19	0.74
20	0.68
21	0.63
22	0.56
23	0.5
24	0.43
25	0.38
26	0.27
27	0.24
28	0.2
29	0.16
30	0.13
31	0.11
32	0.13
33	0.12
34	0.13
35	0.14
36	0.14
37	0.16
38	0.17
39	0.2
40	0.21
41	0.22
42	0.21
43	0.21
44	0.21
45	0.19
46	0.18
47	0.15
48	0.15
49	0.16
50	0.16
51	0.15
52	0.14
53	0.15
54	0.15
55	0.22
56	0.26
57	0.25
58	0.28
59	0.29
60	0.34
61	0.41
62	0.44
63	0.39
64	0.38
65	0.39
66	0.35
67	0.37
68	0.34
69	0.27
70	0.24
71	0.27
72	0.27
73	0.27
74	0.26
75	0.26
76	0.28
77	0.29
78	0.29
79	0.25
80	0.22
81	0.24
82	0.25
83	0.23
84	0.23
85	0.22
86	0.2
87	0.18
88	0.26
89	0.23
90	0.27
91	0.28
92	0.26
93	0.29
94	0.3
95	0.32
96	0.25
97	0.3
98	0.29
99	0.35
100	0.37
101	0.39
102	0.46
103	0.47
104	0.52
105	0.53
106	0.56
107	0.56
108	0.64
109	0.69
110	0.66
111	0.66
112	0.61
113	0.59
114	0.56
115	0.49
116	0.4
117	0.3
118	0.25
119	0.21
120	0.23
121	0.18
122	0.14
123	0.13
124	0.17
125	0.17
126	0.17
127	0.16
128	0.13
129	0.15
130	0.17
131	0.17
132	0.17
133	0.18
134	0.18
135	0.18
136	0.17
137	0.16
138	0.16
139	0.15
140	0.11
141	0.14
142	0.14
143	0.15
144	0.18
145	0.2
146	0.22
147	0.22
148	0.21
149	0.18
150	0.17
151	0.17
152	0.15
153	0.16
154	0.16
155	0.17
156	0.17
157	0.19
158	0.24
159	0.24
160	0.24
161	0.22
162	0.21
163	0.21
164	0.22
165	0.23
166	0.19
167	0.18
168	0.17
169	0.16
170	0.15
171	0.13
172	0.11
173	0.08
174	0.08
175	0.08
176	0.13
177	0.11
178	0.11
179	0.1
180	0.11
181	0.12
182	0.14
183	0.14
184	0.1
185	0.1
186	0.11
187	0.12
188	0.12
189	0.11
190	0.08
191	0.08
192	0.09
193	0.09
194	0.11
195	0.1
196	0.09
197	0.1
198	0.1
199	0.11
200	0.1
201	0.1
202	0.07
203	0.08
204	0.08
205	0.09
206	0.08
207	0.07
208	0.07
209	0.07
210	0.07
211	0.07
212	0.06
213	0.05
214	0.1
215	0.15
216	0.16
217	0.18
218	0.18
219	0.2
220	0.22
221	0.23
222	0.19
223	0.14
224	0.16
225	0.15
226	0.15
227	0.14
228	0.13
229	0.13
230	0.13
231	0.13
232	0.12
233	0.13
234	0.15
235	0.18
236	0.21
237	0.25
238	0.25
239	0.25
240	0.24
241	0.27
242	0.26
243	0.25
244	0.25
245	0.25
246	0.3
247	0.29
248	0.31
249	0.28
250	0.32
251	0.32
252	0.32
253	0.29
254	0.27
255	0.31
256	0.28
257	0.29
258	0.23
259	0.2
260	0.18
261	0.16
262	0.14
263	0.1
264	0.1
265	0.07
266	0.06
267	0.06
268	0.04
269	0.04
270	0.03
271	0.03
272	0.03
273	0.04
274	0.04
275	0.06
276	0.07
277	0.07
278	0.08
279	0.09
280	0.09
281	0.09
282	0.11
283	0.12
284	0.12
285	0.14
286	0.13
287	0.15
288	0.14
289	0.14
290	0.12
291	0.1
292	0.1
293	0.09
294	0.09
295	0.06
296	0.07
297	0.07
298	0.07
299	0.07
300	0.07
301	0.07
302	0.07
303	0.07
304	0.06
305	0.06
306	0.08
307	0.07
308	0.06
309	0.07
310	0.06
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.07
318	0.11
319	0.12
320	0.12
321	0.11
322	0.1
323	0.13
324	0.13
325	0.14
326	0.11
327	0.13
328	0.14
329	0.17
330	0.17
331	0.17
332	0.17
333	0.16
334	0.16
335	0.15
336	0.18
337	0.21
338	0.24
339	0.24
340	0.23
341	0.24
342	0.25
343	0.25
344	0.22
345	0.16
346	0.17
347	0.15
348	0.17
349	0.17
350	0.17
351	0.17
352	0.16
353	0.17
354	0.14
355	0.16
356	0.16
357	0.19
358	0.21
359	0.21
360	0.26
361	0.27
362	0.3
363	0.29
364	0.28
365	0.33
366	0.36
367	0.4
368	0.38
369	0.41
370	0.38
371	0.38
372	0.38
373	0.34
374	0.3
375	0.25
376	0.2
377	0.16
378	0.15
379	0.14
380	0.13
381	0.09
382	0.07
383	0.06
384	0.06
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.05
392	0.06
393	0.06
394	0.06
395	0.06
396	0.06
397	0.07
398	0.07
399	0.07
400	0.06
401	0.06
402	0.07
403	0.08
404	0.09
405	0.08
406	0.07
407	0.06
408	0.06
409	0.06
410	0.05
411	0.04
412	0.04
413	0.04
414	0.03
415	0.03
416	0.03
417	0.03
418	0.04
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.06
423	0.07
424	0.07
425	0.07
426	0.07
427	0.1
428	0.12
429	0.12
430	0.13
431	0.14
432	0.15
433	0.19
434	0.25
435	0.29
436	0.31
437	0.35
438	0.41
439	0.48
440	0.52
441	0.58
442	0.56
443	0.56
444	0.55
445	0.56
446	0.5
447	0.41
448	0.39
449	0.31
450	0.28
451	0.19
452	0.16
453	0.11
454	0.1
455	0.1
456	0.08
457	0.06
458	0.08
459	0.11
460	0.11
461	0.13
462	0.17
463	0.19
464	0.19
465	0.19
466	0.17
467	0.15
468	0.16
469	0.16
470	0.17
471	0.18
472	0.19
473	0.2
474	0.25
475	0.27
476	0.27
477	0.29
478	0.28
479	0.26
480	0.26
481	0.25
482	0.23
483	0.22
484	0.24
485	0.23
486	0.24
487	0.29
488	0.3
489	0.31
490	0.31
491	0.31
492	0.3
493	0.28
494	0.28
495	0.29
496	0.28
497	0.27
498	0.33
499	0.39
500	0.42
501	0.41
502	0.37
503	0.32
504	0.33
505	0.33
506	0.26
507	0.23
508	0.19
509	0.19
510	0.18
511	0.17
512	0.15
513	0.13
514	0.12
515	0.08
516	0.07
517	0.08
518	0.08
519	0.07
520	0.09
521	0.11
522	0.12
523	0.15
524	0.16
525	0.16
526	0.17
527	0.22
528	0.2
529	0.18
530	0.17
531	0.14
532	0.21
533	0.23
534	0.27
535	0.24

A0A4P9Z330

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer