Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P9YUL2

Protein Details
Accession A0A4P9YUL2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
73-96NATATAKPGQRKKKMRPGDSIDTSHydrophilic
285-305DDEGDYKRKRHHQRGDIDELDAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
82-86QRKKK
Subcellular Location(s) mito 11, cyto 8.5, cyto_nucl 8, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008851  TFIIF-alpha  
IPR011039  TFIIF_interaction  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF05793  TFIIF_alpha  
Amino Acid Sequences MRIFSRDPVEVRDLVPPVRMYRKDPRSMMWEAIRAKAEREAAAAAAVAASGDGATTMETDEAAASTSASAAANATATAKPGQRKKKMRPGDSIDTSVIAPYGGAAVNRRNLFKKRTRQVFLSKETSEVREERRRDNYPWCLEDFDGSHAFTGDLMGNQGSTAKYALFFFSEDGFRVVMADKWYRFTPKPKHRILTAEEAEELLQQQKKKENDRWLMHRFGKKDEEGEEGGGAGGSGGTGGGESSSKASEGGAIWRGGGGYRRDTARRGFRTVDRGESSLFTDDEDDEGDYKRKRHHQRGDIDELDFDIDQDFQDDEEGTQDLEQQDEETKEATRRQKDNYRLAEKSDLEEEDADEMDESSKGKQGEKLSSAGKEMRKI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.32
3 0.29
4 0.3
5 0.37
6 0.39
7 0.4
8 0.48
9 0.57
10 0.61
11 0.62
12 0.6
13 0.58
14 0.59
15 0.59
16 0.53
17 0.51
18 0.44
19 0.46
20 0.46
21 0.4
22 0.38
23 0.36
24 0.34
25 0.27
26 0.27
27 0.23
28 0.18
29 0.18
30 0.16
31 0.11
32 0.08
33 0.07
34 0.05
35 0.03
36 0.03
37 0.02
38 0.02
39 0.03
40 0.03
41 0.03
42 0.04
43 0.04
44 0.05
45 0.05
46 0.05
47 0.05
48 0.05
49 0.06
50 0.06
51 0.05
52 0.05
53 0.05
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.05
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.08
62 0.07
63 0.09
64 0.12
65 0.16
66 0.23
67 0.32
68 0.42
69 0.5
70 0.6
71 0.69
72 0.76
73 0.83
74 0.82
75 0.83
76 0.82
77 0.81
78 0.75
79 0.68
80 0.58
81 0.49
82 0.42
83 0.32
84 0.23
85 0.13
86 0.09
87 0.05
88 0.06
89 0.05
90 0.06
91 0.08
92 0.11
93 0.17
94 0.19
95 0.22
96 0.26
97 0.31
98 0.39
99 0.47
100 0.54
101 0.58
102 0.66
103 0.68
104 0.69
105 0.73
106 0.73
107 0.7
108 0.66
109 0.56
110 0.5
111 0.48
112 0.43
113 0.37
114 0.32
115 0.33
116 0.34
117 0.37
118 0.4
119 0.46
120 0.48
121 0.49
122 0.54
123 0.55
124 0.52
125 0.52
126 0.46
127 0.41
128 0.36
129 0.34
130 0.26
131 0.21
132 0.17
133 0.14
134 0.13
135 0.11
136 0.11
137 0.09
138 0.09
139 0.06
140 0.05
141 0.06
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.05
147 0.05
148 0.06
149 0.05
150 0.06
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.1
166 0.12
167 0.12
168 0.14
169 0.15
170 0.19
171 0.21
172 0.28
173 0.36
174 0.43
175 0.52
176 0.55
177 0.57
178 0.55
179 0.58
180 0.53
181 0.52
182 0.43
183 0.35
184 0.29
185 0.27
186 0.25
187 0.2
188 0.16
189 0.1
190 0.11
191 0.11
192 0.14
193 0.2
194 0.25
195 0.32
196 0.39
197 0.45
198 0.52
199 0.57
200 0.62
201 0.61
202 0.63
203 0.62
204 0.6
205 0.51
206 0.47
207 0.46
208 0.39
209 0.36
210 0.31
211 0.28
212 0.24
213 0.23
214 0.18
215 0.14
216 0.13
217 0.1
218 0.08
219 0.04
220 0.03
221 0.02
222 0.02
223 0.02
224 0.02
225 0.02
226 0.02
227 0.02
228 0.03
229 0.03
230 0.04
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.07
236 0.07
237 0.1
238 0.11
239 0.11
240 0.11
241 0.11
242 0.11
243 0.11
244 0.15
245 0.14
246 0.14
247 0.17
248 0.2
249 0.22
250 0.25
251 0.32
252 0.38
253 0.4
254 0.41
255 0.43
256 0.45
257 0.51
258 0.51
259 0.5
260 0.42
261 0.39
262 0.36
263 0.32
264 0.3
265 0.24
266 0.21
267 0.15
268 0.14
269 0.13
270 0.12
271 0.12
272 0.1
273 0.09
274 0.11
275 0.16
276 0.17
277 0.2
278 0.27
279 0.36
280 0.46
281 0.56
282 0.65
283 0.69
284 0.76
285 0.82
286 0.83
287 0.76
288 0.66
289 0.55
290 0.45
291 0.37
292 0.27
293 0.19
294 0.1
295 0.08
296 0.07
297 0.08
298 0.08
299 0.06
300 0.07
301 0.08
302 0.07
303 0.09
304 0.09
305 0.08
306 0.08
307 0.11
308 0.1
309 0.1
310 0.11
311 0.1
312 0.14
313 0.14
314 0.15
315 0.13
316 0.15
317 0.19
318 0.26
319 0.34
320 0.39
321 0.43
322 0.51
323 0.6
324 0.67
325 0.73
326 0.76
327 0.75
328 0.69
329 0.69
330 0.68
331 0.59
332 0.53
333 0.48
334 0.38
335 0.32
336 0.3
337 0.26
338 0.2
339 0.19
340 0.16
341 0.11
342 0.11
343 0.1
344 0.1
345 0.1
346 0.1
347 0.14
348 0.15
349 0.17
350 0.23
351 0.28
352 0.36
353 0.38
354 0.42
355 0.42
356 0.43
357 0.45
358 0.46