Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P9YU62

Protein Details
Accession A0A4P9YU62    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
305-396DRDVDRHRRHDRSRDRHHRRDRSREASRHERRRDRDRDRDRHRDRSRDRHSRHRDERRRRRSPSPRGSHGRSVTPIHKRKRKLNNWDVPPPGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
290-386RERDRDRDRDHERSRDRDVDRHRRHDRSRDRHHRRDRSREASRHERRRDRDRDRDRHRDRSRDRHSRHRDERRRRRSPSPRGSHGRSVTPIHKRKRK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, mito_nucl 10, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003034  SAP_dom  
IPR036361  SAP_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF02037  SAP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50800  SAP  
CDD cd12230  RRM1_U2AF65  
Amino Acid Sequences MDPTKLKVTELRAELTARGITPKGLKADLIRQLKAALEGEPESDAAVATEVAAADQAADQAEVAAVAADSEEAPATKEEPTAPAADTATAGDEAVTTAQEKKEEEEIAQPSVDTLPAETAAVEAAAAVEEVTVPSAMEEEPAKPAVEATPASVAEAPVPVDSAQPPLAEATPSSVAEAPVDHMEEVEAPNVTEEQTSINVAIEQITPEQQHAETDIVMHSPSMQQQQQQQHVQANGDSSKPDEHAQVAADDPMDVESNKRAEADAAAAHPPKDSEAATAHERHSQPSRERERDRDRDRDHERSRDRDVDRHRRHDRSRDRHHRRDRSREASRHERRRDRDRDRDRHRDRSRDRHSRHRDERRRRRSPSPRGSHGRSVTPIHKRKRKLNNWDVPPPGYEHLTAEQAKLSGAFGLRGLMTNGAFPSVMVPQNALGGGPDAGAPASSAGALAARQSRRLYVGNLPYHITEGTLVEFLNHSAREMNLVTREEEDAVLAAHINVEKNFAFVDFRTPELATAGMGLDGAPCQGQALKVRRPKDYFPVIGTEAGYARIHCNKLEQGI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.33
3 0.29
4 0.21
5 0.22
6 0.19
7 0.21
8 0.24
9 0.28
10 0.28
11 0.27
12 0.29
13 0.3
14 0.38
15 0.43
16 0.45
17 0.41
18 0.38
19 0.38
20 0.37
21 0.36
22 0.29
23 0.21
24 0.18
25 0.18
26 0.18
27 0.17
28 0.16
29 0.13
30 0.12
31 0.11
32 0.07
33 0.07
34 0.06
35 0.05
36 0.06
37 0.05
38 0.05
39 0.05
40 0.05
41 0.05
42 0.05
43 0.06
44 0.05
45 0.05
46 0.05
47 0.05
48 0.05
49 0.05
50 0.04
51 0.04
52 0.03
53 0.03
54 0.03
55 0.04
56 0.04
57 0.04
58 0.05
59 0.05
60 0.06
61 0.07
62 0.09
63 0.09
64 0.11
65 0.11
66 0.13
67 0.15
68 0.16
69 0.16
70 0.16
71 0.16
72 0.15
73 0.14
74 0.12
75 0.11
76 0.1
77 0.09
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.06
84 0.09
85 0.11
86 0.13
87 0.14
88 0.16
89 0.21
90 0.21
91 0.21
92 0.25
93 0.26
94 0.26
95 0.25
96 0.22
97 0.18
98 0.17
99 0.17
100 0.1
101 0.08
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.07
106 0.06
107 0.06
108 0.05
109 0.05
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.05
123 0.05
124 0.06
125 0.07
126 0.08
127 0.1
128 0.11
129 0.11
130 0.1
131 0.11
132 0.1
133 0.12
134 0.12
135 0.11
136 0.13
137 0.12
138 0.14
139 0.14
140 0.13
141 0.11
142 0.11
143 0.1
144 0.07
145 0.08
146 0.07
147 0.08
148 0.08
149 0.11
150 0.11
151 0.1
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.11
159 0.11
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.11
164 0.12
165 0.1
166 0.09
167 0.1
168 0.08
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.08
193 0.09
194 0.09
195 0.1
196 0.09
197 0.09
198 0.1
199 0.1
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.09
209 0.12
210 0.13
211 0.16
212 0.23
213 0.29
214 0.35
215 0.37
216 0.37
217 0.36
218 0.36
219 0.34
220 0.28
221 0.24
222 0.19
223 0.16
224 0.14
225 0.12
226 0.11
227 0.12
228 0.12
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.11
234 0.1
235 0.09
236 0.08
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.06
243 0.07
244 0.08
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.09
251 0.07
252 0.08
253 0.1
254 0.1
255 0.11
256 0.1
257 0.1
258 0.09
259 0.1
260 0.09
261 0.08
262 0.09
263 0.12
264 0.14
265 0.16
266 0.17
267 0.21
268 0.21
269 0.22
270 0.26
271 0.28
272 0.3
273 0.38
274 0.46
275 0.48
276 0.51
277 0.58
278 0.63
279 0.68
280 0.69
281 0.69
282 0.64
283 0.65
284 0.69
285 0.7
286 0.65
287 0.64
288 0.63
289 0.58
290 0.59
291 0.58
292 0.54
293 0.51
294 0.56
295 0.58
296 0.6
297 0.65
298 0.68
299 0.67
300 0.71
301 0.74
302 0.76
303 0.75
304 0.79
305 0.8
306 0.83
307 0.86
308 0.91
309 0.91
310 0.89
311 0.89
312 0.88
313 0.86
314 0.85
315 0.81
316 0.78
317 0.79
318 0.8
319 0.79
320 0.79
321 0.78
322 0.75
323 0.8
324 0.82
325 0.81
326 0.82
327 0.82
328 0.83
329 0.84
330 0.88
331 0.85
332 0.86
333 0.83
334 0.83
335 0.8
336 0.81
337 0.82
338 0.81
339 0.79
340 0.79
341 0.83
342 0.83
343 0.85
344 0.86
345 0.86
346 0.87
347 0.93
348 0.93
349 0.92
350 0.88
351 0.88
352 0.88
353 0.88
354 0.87
355 0.85
356 0.83
357 0.81
358 0.8
359 0.77
360 0.69
361 0.62
362 0.54
363 0.5
364 0.49
365 0.51
366 0.54
367 0.56
368 0.61
369 0.64
370 0.7
371 0.77
372 0.79
373 0.8
374 0.82
375 0.82
376 0.82
377 0.83
378 0.76
379 0.66
380 0.57
381 0.49
382 0.39
383 0.31
384 0.24
385 0.19
386 0.17
387 0.21
388 0.21
389 0.18
390 0.17
391 0.16
392 0.15
393 0.13
394 0.12
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.07
399 0.08
400 0.08
401 0.08
402 0.09
403 0.09
404 0.08
405 0.09
406 0.09
407 0.09
408 0.08
409 0.08
410 0.09
411 0.11
412 0.12
413 0.11
414 0.12
415 0.11
416 0.12
417 0.13
418 0.11
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.06
423 0.06
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.05
435 0.07
436 0.13
437 0.14
438 0.18
439 0.19
440 0.21
441 0.24
442 0.27
443 0.28
444 0.3
445 0.38
446 0.38
447 0.39
448 0.39
449 0.36
450 0.35
451 0.31
452 0.23
453 0.15
454 0.12
455 0.11
456 0.1
457 0.1
458 0.09
459 0.09
460 0.1
461 0.13
462 0.12
463 0.11
464 0.12
465 0.12
466 0.15
467 0.16
468 0.18
469 0.19
470 0.21
471 0.22
472 0.22
473 0.23
474 0.2
475 0.19
476 0.16
477 0.12
478 0.1
479 0.09
480 0.08
481 0.06
482 0.07
483 0.08
484 0.1
485 0.1
486 0.13
487 0.12
488 0.13
489 0.13
490 0.13
491 0.13
492 0.12
493 0.2
494 0.19
495 0.2
496 0.22
497 0.22
498 0.22
499 0.21
500 0.21
501 0.12
502 0.12
503 0.1
504 0.07
505 0.07
506 0.06
507 0.06
508 0.06
509 0.06
510 0.05
511 0.05
512 0.06
513 0.07
514 0.1
515 0.19
516 0.26
517 0.35
518 0.42
519 0.48
520 0.55
521 0.6
522 0.63
523 0.64
524 0.65
525 0.61
526 0.56
527 0.58
528 0.51
529 0.47
530 0.42
531 0.34
532 0.25
533 0.24
534 0.22
535 0.17
536 0.2
537 0.25
538 0.27
539 0.26
540 0.31