Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P9Z6M1

Protein Details
Accession A0A4P9Z6M1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
289-312IDVAKRFMASRQKQPRRRTRQSRKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
298-312SRQKQPRRRTRQSRK
Subcellular Location(s) mito 15, cyto 5, nucl 4, plas 1, extr 1, pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005119  LysR_subst-bd  
IPR000847  Tscrpt_reg_HTH_LysR  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00126  HTH_1  
PF03466  LysR_substrate  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50931  HTH_LYSR  
CDD cd08414  PBP2_LTTR_aromatics_like  
Amino Acid Sequences MIRPLLPARISYFLAVGETLNFRKAAEQLGIAQPALSRSIRDLEKQLGFALFERSTRRVALTPAGEVLYRESADAMQRLARATMHAERVAQGLSGTVSVGYSTFAATGPMSDIIIEFRKHHPQAQVGLRLLASSEQAAAFDEGTLDLGFMMSNVVVPPQQTLPISRERLVALVPASHAWAANRAISLRTLSTSPLVIGSTRRWRGFRALIDELVTDRGFSLTIAEEADDVPVLLQLVRSGFGCTILDASFIPTLPPGIVSLEIADATATLDISLVWREDHLSPLAARFIDVAKRFMASRQKQPRRRTRQSRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.17
3 0.13
4 0.12
5 0.15
6 0.15
7 0.16
8 0.16
9 0.15
10 0.17
11 0.18
12 0.19
13 0.17
14 0.17
15 0.2
16 0.24
17 0.25
18 0.23
19 0.22
20 0.19
21 0.18
22 0.2
23 0.16
24 0.12
25 0.13
26 0.2
27 0.22
28 0.25
29 0.28
30 0.31
31 0.33
32 0.33
33 0.32
34 0.26
35 0.25
36 0.22
37 0.24
38 0.18
39 0.18
40 0.22
41 0.23
42 0.24
43 0.24
44 0.26
45 0.22
46 0.24
47 0.28
48 0.25
49 0.24
50 0.23
51 0.23
52 0.2
53 0.18
54 0.18
55 0.14
56 0.13
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.13
61 0.14
62 0.12
63 0.12
64 0.13
65 0.13
66 0.13
67 0.12
68 0.11
69 0.15
70 0.18
71 0.2
72 0.2
73 0.19
74 0.19
75 0.2
76 0.19
77 0.15
78 0.1
79 0.07
80 0.07
81 0.06
82 0.06
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.05
91 0.05
92 0.06
93 0.05
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.07
101 0.1
102 0.11
103 0.12
104 0.15
105 0.23
106 0.25
107 0.29
108 0.3
109 0.31
110 0.37
111 0.4
112 0.42
113 0.34
114 0.34
115 0.29
116 0.26
117 0.22
118 0.16
119 0.11
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.04
130 0.05
131 0.04
132 0.04
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.02
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.04
144 0.05
145 0.05
146 0.07
147 0.07
148 0.09
149 0.11
150 0.17
151 0.19
152 0.19
153 0.2
154 0.19
155 0.19
156 0.18
157 0.16
158 0.1
159 0.09
160 0.08
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.08
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.1
172 0.1
173 0.11
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.1
179 0.09
180 0.09
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.09
185 0.13
186 0.21
187 0.26
188 0.28
189 0.29
190 0.31
191 0.36
192 0.4
193 0.4
194 0.38
195 0.36
196 0.34
197 0.34
198 0.32
199 0.27
200 0.23
201 0.18
202 0.11
203 0.09
204 0.08
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.05
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.07
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.1
232 0.09
233 0.1
234 0.09
235 0.11
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.08
240 0.09
241 0.08
242 0.09
243 0.07
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.07
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.06
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.08
264 0.11
265 0.12
266 0.15
267 0.15
268 0.16
269 0.16
270 0.18
271 0.2
272 0.17
273 0.17
274 0.15
275 0.16
276 0.22
277 0.23
278 0.23
279 0.21
280 0.23
281 0.23
282 0.29
283 0.37
284 0.36
285 0.45
286 0.54
287 0.65
288 0.72
289 0.83
290 0.87
291 0.87
292 0.92