Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1J0V0

Protein Details
Accession A0A4V1J0V0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
340-361GQAPTPLKTKNKPRQPEQSAENHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
90-113KPGRRRRGGGVGGGSGGGMRGRRP
171-179KKPRRARPK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12.5, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017930  Myb_dom  
IPR006447  Myb_dom_plants  
IPR001005  SANT/Myb  
IPR017884  SANT_dom  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00249  Myb_DNA-binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51294  HTH_MYB  
PS50090  MYB_LIKE  
PS51293  SANT  
CDD cd00167  SANT  
Amino Acid Sequences MSPSAPPPVSVQEEEAMSSAYIAQLLAQEEAYAMSADAYDLYGDYDDYRPSTTTSQDDAWAGAGRKRRPTRADSDWEADDGEDEEDYHPKPGRRRRGGGVGGGSGGGMRGRRPVSGASTPRQPLKTKSLSNESGDAADTGNDATADGSAGHAPGAGSATIDENGDVVPSAKKPRRARPKLEGMNQGAYTPEEEERFLDGLELYGRGWNDISRYIGTRDSHSIRSHAQKYFIRLFRDNKPLPAKVRESGEGYTLSGLALDPESAAARTYLSRYDPTEKTAAAEANALGTSLVVARTSTPLSPLPVSMSASSDNTTTTAAVDEHAAKEGEEEATRSDVIAFGQAPTPLKTKNKPRQPEQSAENAAPTEQETASNDNANNNNDDDGGGGVDEAGKPATAAVKPLM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.25
3 0.2
4 0.14
5 0.13
6 0.1
7 0.08
8 0.08
9 0.07
10 0.07
11 0.08
12 0.1
13 0.1
14 0.1
15 0.09
16 0.09
17 0.1
18 0.1
19 0.07
20 0.06
21 0.05
22 0.06
23 0.06
24 0.06
25 0.06
26 0.05
27 0.05
28 0.06
29 0.06
30 0.06
31 0.09
32 0.1
33 0.11
34 0.12
35 0.14
36 0.14
37 0.17
38 0.19
39 0.2
40 0.23
41 0.25
42 0.25
43 0.26
44 0.25
45 0.23
46 0.22
47 0.22
48 0.2
49 0.2
50 0.26
51 0.29
52 0.38
53 0.45
54 0.51
55 0.54
56 0.59
57 0.64
58 0.66
59 0.69
60 0.64
61 0.62
62 0.55
63 0.49
64 0.42
65 0.34
66 0.25
67 0.18
68 0.13
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.11
73 0.11
74 0.15
75 0.18
76 0.21
77 0.3
78 0.39
79 0.49
80 0.56
81 0.61
82 0.63
83 0.69
84 0.68
85 0.65
86 0.57
87 0.47
88 0.38
89 0.32
90 0.26
91 0.16
92 0.12
93 0.08
94 0.06
95 0.06
96 0.11
97 0.12
98 0.13
99 0.15
100 0.17
101 0.21
102 0.29
103 0.34
104 0.32
105 0.38
106 0.4
107 0.44
108 0.45
109 0.42
110 0.39
111 0.43
112 0.48
113 0.45
114 0.48
115 0.51
116 0.51
117 0.5
118 0.47
119 0.39
120 0.32
121 0.27
122 0.22
123 0.14
124 0.11
125 0.09
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.05
137 0.04
138 0.05
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.05
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.04
153 0.05
154 0.05
155 0.07
156 0.16
157 0.19
158 0.28
159 0.35
160 0.45
161 0.55
162 0.63
163 0.69
164 0.69
165 0.77
166 0.76
167 0.76
168 0.73
169 0.65
170 0.6
171 0.52
172 0.43
173 0.32
174 0.25
175 0.18
176 0.12
177 0.11
178 0.08
179 0.08
180 0.09
181 0.1
182 0.1
183 0.09
184 0.08
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.06
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.07
196 0.08
197 0.1
198 0.09
199 0.1
200 0.12
201 0.15
202 0.16
203 0.17
204 0.2
205 0.22
206 0.25
207 0.25
208 0.26
209 0.26
210 0.33
211 0.36
212 0.33
213 0.36
214 0.34
215 0.39
216 0.45
217 0.45
218 0.42
219 0.42
220 0.45
221 0.46
222 0.54
223 0.49
224 0.48
225 0.49
226 0.48
227 0.47
228 0.49
229 0.45
230 0.38
231 0.4
232 0.36
233 0.33
234 0.3
235 0.27
236 0.22
237 0.18
238 0.15
239 0.12
240 0.1
241 0.07
242 0.06
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.08
255 0.1
256 0.11
257 0.14
258 0.17
259 0.24
260 0.24
261 0.27
262 0.28
263 0.25
264 0.25
265 0.25
266 0.22
267 0.16
268 0.16
269 0.12
270 0.11
271 0.11
272 0.09
273 0.06
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.04
279 0.05
280 0.05
281 0.08
282 0.09
283 0.09
284 0.11
285 0.13
286 0.15
287 0.16
288 0.16
289 0.17
290 0.17
291 0.19
292 0.17
293 0.17
294 0.16
295 0.17
296 0.17
297 0.14
298 0.13
299 0.12
300 0.12
301 0.1
302 0.09
303 0.09
304 0.08
305 0.08
306 0.1
307 0.11
308 0.11
309 0.13
310 0.13
311 0.11
312 0.12
313 0.13
314 0.12
315 0.11
316 0.11
317 0.11
318 0.13
319 0.13
320 0.12
321 0.11
322 0.1
323 0.09
324 0.11
325 0.1
326 0.09
327 0.11
328 0.13
329 0.15
330 0.17
331 0.2
332 0.23
333 0.3
334 0.38
335 0.48
336 0.56
337 0.65
338 0.71
339 0.77
340 0.82
341 0.82
342 0.81
343 0.75
344 0.74
345 0.69
346 0.61
347 0.54
348 0.43
349 0.36
350 0.29
351 0.25
352 0.18
353 0.13
354 0.15
355 0.15
356 0.19
357 0.21
358 0.25
359 0.24
360 0.27
361 0.32
362 0.32
363 0.32
364 0.29
365 0.28
366 0.24
367 0.23
368 0.17
369 0.13
370 0.11
371 0.08
372 0.07
373 0.06
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.08
381 0.13
382 0.12