Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

K1VJP6

Protein Details
Accession K1VJP6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-65VSPVSPSHSRIRRRSPSRPRAGSVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
135-174PAKKRRKMAKVDHERLMAPAGLPRLMKIAKSWKVKGKGRE
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012923  Csm3  
IPR040038  TIPIN/Csm3/Swi3  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:0006974  P:DNA damage response  
GO:0000076  P:DNA replication checkpoint signaling  
GO:0031297  P:replication fork processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF07962  Swi3  
Amino Acid Sequences MSLNDLFSANSPSPPPQRAQEESLFFSPGATPLASQRSVRSVSPVSPSHSRIRRRSPSRPRAGSVDAHLNPISNRHGIGELHANVNGREIDIEDDPFTAQDPLGPGPLTHNAFSALPDDNDPLNFGGEGEGGGEPAKKRRKMAKVDHERLMAPAGLPRLMKIAKSWKVKGKGREKEDLGLLVDMYTVWAHGMFPKGDFKYTIGRVEAVCRTNRMINSIAGMKDVFYGRNRSASPGGDIPDDADLDGDFNELPDDLAALESNIVASQPGLKSVVSEPLFAPDEDEDELAALAEAEAEASRAQTQQQRPRPTVVDMGDAPIDIGEEDEW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.36
3 0.38
4 0.45
5 0.47
6 0.51
7 0.52
8 0.5
9 0.52
10 0.5
11 0.44
12 0.36
13 0.32
14 0.26
15 0.2
16 0.17
17 0.12
18 0.12
19 0.15
20 0.2
21 0.22
22 0.22
23 0.23
24 0.27
25 0.29
26 0.29
27 0.3
28 0.28
29 0.29
30 0.34
31 0.35
32 0.35
33 0.37
34 0.41
35 0.45
36 0.5
37 0.56
38 0.58
39 0.66
40 0.72
41 0.75
42 0.82
43 0.84
44 0.87
45 0.88
46 0.86
47 0.78
48 0.74
49 0.69
50 0.61
51 0.54
52 0.53
53 0.43
54 0.4
55 0.36
56 0.31
57 0.27
58 0.27
59 0.26
60 0.17
61 0.17
62 0.15
63 0.17
64 0.16
65 0.18
66 0.22
67 0.2
68 0.2
69 0.21
70 0.21
71 0.18
72 0.21
73 0.18
74 0.11
75 0.1
76 0.09
77 0.1
78 0.11
79 0.12
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.1
85 0.08
86 0.07
87 0.07
88 0.08
89 0.09
90 0.1
91 0.1
92 0.09
93 0.11
94 0.17
95 0.18
96 0.16
97 0.16
98 0.16
99 0.16
100 0.17
101 0.16
102 0.12
103 0.1
104 0.11
105 0.12
106 0.11
107 0.11
108 0.11
109 0.1
110 0.09
111 0.08
112 0.07
113 0.06
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.06
121 0.07
122 0.14
123 0.22
124 0.23
125 0.28
126 0.37
127 0.45
128 0.54
129 0.63
130 0.67
131 0.71
132 0.74
133 0.73
134 0.66
135 0.57
136 0.48
137 0.39
138 0.28
139 0.16
140 0.13
141 0.1
142 0.1
143 0.09
144 0.09
145 0.11
146 0.11
147 0.11
148 0.12
149 0.2
150 0.26
151 0.31
152 0.34
153 0.38
154 0.46
155 0.51
156 0.58
157 0.6
158 0.61
159 0.6
160 0.63
161 0.58
162 0.51
163 0.47
164 0.39
165 0.29
166 0.21
167 0.16
168 0.1
169 0.08
170 0.06
171 0.05
172 0.04
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.05
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.14
182 0.14
183 0.15
184 0.16
185 0.17
186 0.21
187 0.23
188 0.24
189 0.19
190 0.2
191 0.2
192 0.23
193 0.25
194 0.22
195 0.21
196 0.2
197 0.21
198 0.24
199 0.24
200 0.23
201 0.21
202 0.18
203 0.2
204 0.21
205 0.19
206 0.16
207 0.16
208 0.13
209 0.12
210 0.13
211 0.13
212 0.12
213 0.17
214 0.17
215 0.22
216 0.23
217 0.25
218 0.27
219 0.26
220 0.27
221 0.25
222 0.25
223 0.21
224 0.2
225 0.17
226 0.15
227 0.14
228 0.11
229 0.08
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.04
240 0.05
241 0.04
242 0.05
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.05
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.08
253 0.08
254 0.09
255 0.1
256 0.1
257 0.13
258 0.14
259 0.23
260 0.2
261 0.21
262 0.2
263 0.24
264 0.26
265 0.23
266 0.24
267 0.16
268 0.17
269 0.17
270 0.16
271 0.11
272 0.1
273 0.1
274 0.08
275 0.07
276 0.05
277 0.04
278 0.04
279 0.03
280 0.04
281 0.04
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.08
286 0.08
287 0.13
288 0.21
289 0.31
290 0.41
291 0.5
292 0.58
293 0.6
294 0.66
295 0.65
296 0.6
297 0.59
298 0.5
299 0.47
300 0.38
301 0.38
302 0.32
303 0.28
304 0.24
305 0.16
306 0.14
307 0.08