Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P9Z280

Protein Details
Accession A0A4P9Z280    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
64-88DQGGANNKKKDKPKKKEVKAEEPVEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-54NEAKRQAKLAKFAAKQAKL
66-81GGANNKKKDKPKKKEV
Subcellular Location(s) cyto 16.5, cyto_nucl 11.5, nucl 5.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001412  aa-tRNA-synth_I_CS  
IPR002300  aa-tRNA-synth_Ia  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR002303  Valyl-tRNA_ligase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004832  F:valine-tRNA ligase activity  
GO:0006438  P:valyl-tRNA aminoacylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00133  tRNA-synt_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00178  AA_TRNA_LIGASE_I  
Amino Acid Sequences MTDPSTAAAAASNAAKDAATEPAAQPEAKSKNADKNEAKRQAKLAKFAAKQAKLQAAGGGAAADQGGANNKKKDKPKKKEVKAEEPVEVDMTPEGEKKGTYVVPIPPPNITGALHIGHALTVAIQDCLVRWNRMKGKTVLYNPGCDHAGISAQVVVEKKLWNEGRKPRHDLGRDAFVDKVWEWRHAYGDRIYTQLKRLGASYDWTRARFTMDPELSKAVVEAFVRLHEEGVIYRAVRLVNWCVHLNTTLSNLEVESKELTGRTMLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.09
4 0.1
5 0.12
6 0.12
7 0.14
8 0.14
9 0.19
10 0.21
11 0.2
12 0.19
13 0.24
14 0.27
15 0.29
16 0.33
17 0.33
18 0.41
19 0.47
20 0.55
21 0.56
22 0.61
23 0.68
24 0.74
25 0.72
26 0.65
27 0.68
28 0.68
29 0.63
30 0.61
31 0.57
32 0.56
33 0.55
34 0.6
35 0.61
36 0.55
37 0.53
38 0.52
39 0.5
40 0.42
41 0.4
42 0.33
43 0.24
44 0.21
45 0.18
46 0.13
47 0.07
48 0.06
49 0.06
50 0.04
51 0.03
52 0.04
53 0.09
54 0.14
55 0.18
56 0.23
57 0.28
58 0.35
59 0.45
60 0.56
61 0.62
62 0.68
63 0.75
64 0.81
65 0.87
66 0.91
67 0.9
68 0.89
69 0.86
70 0.79
71 0.71
72 0.61
73 0.52
74 0.42
75 0.33
76 0.22
77 0.14
78 0.11
79 0.09
80 0.08
81 0.08
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.1
86 0.09
87 0.1
88 0.12
89 0.16
90 0.22
91 0.24
92 0.25
93 0.22
94 0.23
95 0.22
96 0.21
97 0.17
98 0.11
99 0.11
100 0.11
101 0.1
102 0.1
103 0.09
104 0.07
105 0.07
106 0.06
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.07
115 0.09
116 0.1
117 0.11
118 0.18
119 0.24
120 0.28
121 0.32
122 0.31
123 0.35
124 0.39
125 0.41
126 0.43
127 0.38
128 0.38
129 0.34
130 0.34
131 0.29
132 0.22
133 0.2
134 0.11
135 0.11
136 0.08
137 0.07
138 0.06
139 0.05
140 0.07
141 0.08
142 0.08
143 0.09
144 0.1
145 0.1
146 0.16
147 0.2
148 0.22
149 0.3
150 0.39
151 0.47
152 0.52
153 0.59
154 0.55
155 0.6
156 0.6
157 0.58
158 0.52
159 0.51
160 0.46
161 0.41
162 0.37
163 0.29
164 0.27
165 0.22
166 0.25
167 0.18
168 0.2
169 0.21
170 0.22
171 0.27
172 0.26
173 0.29
174 0.25
175 0.28
176 0.25
177 0.26
178 0.27
179 0.24
180 0.27
181 0.28
182 0.26
183 0.22
184 0.22
185 0.21
186 0.2
187 0.23
188 0.23
189 0.27
190 0.29
191 0.3
192 0.3
193 0.28
194 0.32
195 0.29
196 0.3
197 0.32
198 0.32
199 0.33
200 0.34
201 0.37
202 0.32
203 0.29
204 0.25
205 0.16
206 0.15
207 0.13
208 0.12
209 0.1
210 0.11
211 0.13
212 0.13
213 0.13
214 0.11
215 0.11
216 0.11
217 0.12
218 0.13
219 0.1
220 0.11
221 0.12
222 0.12
223 0.13
224 0.16
225 0.19
226 0.21
227 0.25
228 0.26
229 0.25
230 0.27
231 0.27
232 0.25
233 0.22
234 0.21
235 0.19
236 0.17
237 0.17
238 0.15
239 0.18
240 0.17
241 0.17
242 0.15
243 0.15
244 0.16
245 0.16
246 0.16