FuNGI

A0A4P9YUD3

Protein Details

Accession

A0A4P9YUD3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
339-358	GEDHRTKSKKDTRRGIPKDV	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 12, nucl 10.5, cyto 10.5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005378 Vps35
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0030906 C:retromer, cargo-selective complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
Pfam	View protein in Pfam PF03635 Vps35

Amino Acid Sequences

MSLTALPSQEEQQRLLADALVVVKTQSRLMCKALDESKLMEGLKYCSVMLAELRTSALTPKNYYELYMAIFDALRHLTTFLVESHEAGRHKLSELYELVQYAGNIVPRLYLMITVGAVFMGVPEAPVKELMRDMIEMSRGVQHPTRGLFLRHYLSGMTRDKMPEGSGQGPEGNLRDSINFILINFTEMNKLWVRLQFQGHSRDRERREMERKELRILVGTNLVRLSQLDGVDLPIYQQTILPAILEQIIKCRDVIAQEYLMEVIVQVFQDDFHLWTLRPFLDTCKKLNPRVSVKNIIIGLIDRLTAYATREAEENPVDSDDSDEEGEGEEAEEEEEEAGEDHRTKSKKDTRRGIPKDVPLFDIFWEEITSVIKRPDITIPDVIAMLVSLINLTLSCYPEKLENVDRVLAYARSKLDELRESPDLMHQDTIRNMLALLRAPIQSYPTVMTLMLLPNYEPLLTQQHYSSRRTIAHDIVNSILKHQTLIETTDDVNGILNLCSVLVRDQKDSAMRPGNFTSRQDEEDYIEEQSWMARLI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.27
3	0.22
4	0.16
5	0.16
6	0.16
7	0.13
8	0.12
9	0.11
10	0.12
11	0.13
12	0.17
13	0.19
14	0.22
15	0.25
16	0.28
17	0.31
18	0.3
19	0.37
20	0.38
21	0.37
22	0.34
23	0.33
24	0.32
25	0.32
26	0.3
27	0.24
28	0.21
29	0.21
30	0.22
31	0.21
32	0.18
33	0.16
34	0.16
35	0.16
36	0.16
37	0.16
38	0.14
39	0.13
40	0.14
41	0.13
42	0.14
43	0.17
44	0.21
45	0.21
46	0.23
47	0.26
48	0.3
49	0.29
50	0.3
51	0.28
52	0.23
53	0.21
54	0.2
55	0.17
56	0.13
57	0.13
58	0.12
59	0.13
60	0.12
61	0.11
62	0.1
63	0.1
64	0.1
65	0.1
66	0.12
67	0.1
68	0.14
69	0.13
70	0.14
71	0.16
72	0.21
73	0.21
74	0.21
75	0.23
76	0.19
77	0.2
78	0.23
79	0.22
80	0.22
81	0.23
82	0.23
83	0.22
84	0.21
85	0.2
86	0.17
87	0.16
88	0.13
89	0.12
90	0.12
91	0.11
92	0.11
93	0.1
94	0.09
95	0.11
96	0.09
97	0.08
98	0.07
99	0.07
100	0.07
101	0.07
102	0.07
103	0.06
104	0.05
105	0.05
106	0.04
107	0.04
108	0.03
109	0.04
110	0.04
111	0.05
112	0.06
113	0.08
114	0.09
115	0.09
116	0.1
117	0.11
118	0.12
119	0.12
120	0.13
121	0.12
122	0.13
123	0.12
124	0.13
125	0.17
126	0.17
127	0.19
128	0.2
129	0.2
130	0.22
131	0.23
132	0.26
133	0.22
134	0.23
135	0.23
136	0.25
137	0.26
138	0.23
139	0.22
140	0.2
141	0.19
142	0.25
143	0.25
144	0.22
145	0.22
146	0.22
147	0.23
148	0.23
149	0.22
150	0.18
151	0.19
152	0.21
153	0.19
154	0.19
155	0.18
156	0.18
157	0.18
158	0.16
159	0.13
160	0.1
161	0.1
162	0.09
163	0.1
164	0.1
165	0.11
166	0.1
167	0.08
168	0.1
169	0.09
170	0.11
171	0.1
172	0.1
173	0.11
174	0.11
175	0.14
176	0.13
177	0.14
178	0.14
179	0.17
180	0.19
181	0.22
182	0.24
183	0.25
184	0.29
185	0.37
186	0.39
187	0.42
188	0.44
189	0.48
190	0.49
191	0.54
192	0.54
193	0.54
194	0.6
195	0.59
196	0.64
197	0.64
198	0.62
199	0.57
200	0.54
201	0.45
202	0.38
203	0.33
204	0.25
205	0.23
206	0.21
207	0.18
208	0.16
209	0.16
210	0.13
211	0.12
212	0.13
213	0.09
214	0.09
215	0.08
216	0.08
217	0.09
218	0.09
219	0.08
220	0.07
221	0.05
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.05
226	0.06
227	0.06
228	0.06
229	0.05
230	0.05
231	0.07
232	0.07
233	0.07
234	0.1
235	0.11
236	0.12
237	0.11
238	0.12
239	0.1
240	0.11
241	0.14
242	0.12
243	0.11
244	0.11
245	0.11
246	0.11
247	0.1
248	0.08
249	0.06
250	0.04
251	0.04
252	0.03
253	0.03
254	0.03
255	0.03
256	0.04
257	0.05
258	0.05
259	0.06
260	0.07
261	0.07
262	0.08
263	0.1
264	0.09
265	0.1
266	0.09
267	0.14
268	0.21
269	0.23
270	0.25
271	0.33
272	0.37
273	0.41
274	0.46
275	0.48
276	0.48
277	0.53
278	0.57
279	0.54
280	0.5
281	0.49
282	0.43
283	0.36
284	0.28
285	0.2
286	0.16
287	0.09
288	0.09
289	0.05
290	0.05
291	0.05
292	0.06
293	0.07
294	0.09
295	0.1
296	0.1
297	0.11
298	0.11
299	0.14
300	0.14
301	0.13
302	0.1
303	0.1
304	0.1
305	0.09
306	0.1
307	0.08
308	0.09
309	0.08
310	0.07
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.05
315	0.05
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.03
321	0.03
322	0.03
323	0.03
324	0.03
325	0.04
326	0.05
327	0.06
328	0.07
329	0.13
330	0.15
331	0.16
332	0.26
333	0.35
334	0.44
335	0.52
336	0.61
337	0.66
338	0.76
339	0.81
340	0.8
341	0.77
342	0.75
343	0.72
344	0.63
345	0.56
346	0.45
347	0.4
348	0.31
349	0.27
350	0.2
351	0.13
352	0.12
353	0.09
354	0.09
355	0.1
356	0.1
357	0.1
358	0.11
359	0.12
360	0.12
361	0.14
362	0.18
363	0.19
364	0.22
365	0.22
366	0.22
367	0.21
368	0.21
369	0.18
370	0.13
371	0.1
372	0.07
373	0.04
374	0.04
375	0.03
376	0.03
377	0.03
378	0.03
379	0.05
380	0.06
381	0.08
382	0.09
383	0.09
384	0.1
385	0.13
386	0.15
387	0.18
388	0.21
389	0.24
390	0.25
391	0.27
392	0.26
393	0.24
394	0.25
395	0.22
396	0.19
397	0.19
398	0.17
399	0.17
400	0.18
401	0.19
402	0.22
403	0.26
404	0.27
405	0.28
406	0.29
407	0.28
408	0.28
409	0.31
410	0.28
411	0.24
412	0.25
413	0.2
414	0.22
415	0.22
416	0.24
417	0.2
418	0.17
419	0.16
420	0.15
421	0.16
422	0.14
423	0.14
424	0.14
425	0.14
426	0.15
427	0.16
428	0.17
429	0.15
430	0.16
431	0.16
432	0.14
433	0.14
434	0.13
435	0.13
436	0.12
437	0.14
438	0.13
439	0.12
440	0.11
441	0.11
442	0.12
443	0.12
444	0.1
445	0.1
446	0.16
447	0.17
448	0.18
449	0.2
450	0.28
451	0.32
452	0.35
453	0.37
454	0.36
455	0.39
456	0.44
457	0.46
458	0.43
459	0.46
460	0.45
461	0.42
462	0.4
463	0.41
464	0.35
465	0.32
466	0.29
467	0.22
468	0.2
469	0.19
470	0.19
471	0.16
472	0.18
473	0.19
474	0.18
475	0.19
476	0.2
477	0.19
478	0.16
479	0.15
480	0.13
481	0.11
482	0.09
483	0.09
484	0.07
485	0.07
486	0.07
487	0.07
488	0.12
489	0.17
490	0.2
491	0.23
492	0.24
493	0.28
494	0.34
495	0.37
496	0.4
497	0.43
498	0.41
499	0.43
500	0.47
501	0.51
502	0.5
503	0.5
504	0.48
505	0.43
506	0.45
507	0.44
508	0.41
509	0.37
510	0.35
511	0.33
512	0.29
513	0.25
514	0.22
515	0.18
516	0.17

A0A4P9YUD3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer