Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1J1V2

Protein Details
Accession A0A4V1J1V2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
160-195NKDSDKSEESSKKKKKHKAHHTESETPKKKKKKSKHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
170-195SKKKKKHKAHHTESETPKKKKKKSKH
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MHARVNNDNDDKSAFDADTLEACTDDKELWLIRIPDNVKVSDLDGTTLAMPDGAGTATVRVGEDKYNVQCVGADASTAVGGREMRSMHCLVPSEDRLVLAPLPFAQYITLTHAVDIPSSKDLAEEIQSQTIKKRPHPEGLKMQFPLSYAMMVIAEEEPANKDSDKSEESSKKKKKHKAHHTESETPKKKKKKSKH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.15
3 0.15
4 0.14
5 0.14
6 0.14
7 0.12
8 0.1
9 0.11
10 0.11
11 0.11
12 0.1
13 0.09
14 0.1
15 0.1
16 0.11
17 0.16
18 0.18
19 0.18
20 0.24
21 0.25
22 0.29
23 0.3
24 0.29
25 0.26
26 0.24
27 0.24
28 0.2
29 0.19
30 0.14
31 0.12
32 0.12
33 0.11
34 0.1
35 0.09
36 0.06
37 0.06
38 0.04
39 0.05
40 0.04
41 0.04
42 0.04
43 0.04
44 0.05
45 0.05
46 0.05
47 0.06
48 0.07
49 0.08
50 0.09
51 0.13
52 0.14
53 0.17
54 0.17
55 0.16
56 0.15
57 0.15
58 0.15
59 0.11
60 0.09
61 0.06
62 0.07
63 0.07
64 0.06
65 0.06
66 0.04
67 0.05
68 0.05
69 0.07
70 0.08
71 0.08
72 0.11
73 0.12
74 0.12
75 0.13
76 0.14
77 0.13
78 0.17
79 0.17
80 0.16
81 0.15
82 0.15
83 0.13
84 0.13
85 0.12
86 0.08
87 0.07
88 0.05
89 0.07
90 0.07
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.07
95 0.11
96 0.13
97 0.11
98 0.11
99 0.13
100 0.13
101 0.13
102 0.13
103 0.1
104 0.08
105 0.09
106 0.08
107 0.07
108 0.07
109 0.08
110 0.1
111 0.11
112 0.11
113 0.15
114 0.16
115 0.16
116 0.19
117 0.24
118 0.26
119 0.29
120 0.37
121 0.37
122 0.47
123 0.53
124 0.57
125 0.62
126 0.64
127 0.64
128 0.56
129 0.52
130 0.42
131 0.37
132 0.32
133 0.22
134 0.17
135 0.11
136 0.1
137 0.09
138 0.08
139 0.09
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.08
145 0.09
146 0.11
147 0.1
148 0.11
149 0.12
150 0.17
151 0.19
152 0.2
153 0.28
154 0.36
155 0.43
156 0.54
157 0.62
158 0.66
159 0.74
160 0.81
161 0.83
162 0.85
163 0.89
164 0.89
165 0.9
166 0.92
167 0.9
168 0.9
169 0.9
170 0.9
171 0.88
172 0.86
173 0.85
174 0.84
175 0.86