Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1J2C1

Protein Details
Accession A0A4V1J2C1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MDDGKKRARRRAPGRRVYGRSTGBasic
57-76SDRDRKSRFKGPKPGGRGGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-16KKRARRRAPGRR
59-108RDRKSRFKGPKPGGRGGDRDRERHGERSGKHQGKPQGRPQWRDREARGHA
Subcellular Location(s) mito 14, cyto 9, mito_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029028  Alpha/beta_knot_MTases  
IPR029064  L30e-like  
IPR004441  rRNA_MeTrfase_TrmH  
IPR001537  SpoU_MeTrfase  
IPR013123  SpoU_subst-bd  
IPR029026  tRNA_m1G_MTases_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008173  F:RNA methyltransferase activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00588  SpoU_methylase  
PF08032  SpoU_sub_bind  
CDD cd18103  SpoU-like_RlmB  
Amino Acid Sequences MDDGKKRARRRAPGRRVYGRSTGVKSTNAGTIVTFPFPPSEAGNCHYFSPVGQGRMSDRDRKSRFKGPKPGGRGGDRDRERHGERSGKHQGKPQGRPQWRDREARGHAKGEGPVVLYGWHSVTMALANPERRIRKLFVTENVARRLADEKIDTRVPPELVHPGDIDRRLGPNAVHQGLLAEADPLPGLHLDELPQDGIVLVLDQITDPHNVGAILRSAAAFGVKAIVTTGRHSPEATGVLAKSASGALELVPIIEVPNLHRALGEMNEAGFLTVGLDSEGQGDLSKVPLHAPLALVLGAEGKGLRQLTRETCSVVARMDMPGAIKSLNVSNAAALALYIGTSRLGLMG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.91
2 0.91
3 0.87
4 0.83
5 0.79
6 0.75
7 0.71
8 0.65
9 0.61
10 0.54
11 0.5
12 0.45
13 0.4
14 0.36
15 0.3
16 0.26
17 0.2
18 0.21
19 0.21
20 0.21
21 0.19
22 0.16
23 0.16
24 0.17
25 0.18
26 0.16
27 0.17
28 0.19
29 0.22
30 0.25
31 0.25
32 0.25
33 0.24
34 0.21
35 0.18
36 0.24
37 0.25
38 0.24
39 0.23
40 0.24
41 0.26
42 0.34
43 0.38
44 0.39
45 0.39
46 0.47
47 0.53
48 0.59
49 0.63
50 0.65
51 0.71
52 0.72
53 0.78
54 0.77
55 0.8
56 0.79
57 0.81
58 0.77
59 0.71
60 0.69
61 0.64
62 0.64
63 0.59
64 0.55
65 0.52
66 0.53
67 0.52
68 0.5
69 0.5
70 0.48
71 0.45
72 0.51
73 0.58
74 0.57
75 0.56
76 0.57
77 0.6
78 0.61
79 0.67
80 0.68
81 0.67
82 0.68
83 0.72
84 0.74
85 0.76
86 0.73
87 0.72
88 0.66
89 0.65
90 0.65
91 0.68
92 0.64
93 0.54
94 0.49
95 0.45
96 0.42
97 0.34
98 0.27
99 0.19
100 0.15
101 0.13
102 0.12
103 0.09
104 0.09
105 0.08
106 0.07
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.08
113 0.1
114 0.11
115 0.13
116 0.19
117 0.2
118 0.22
119 0.25
120 0.26
121 0.28
122 0.34
123 0.36
124 0.35
125 0.41
126 0.44
127 0.45
128 0.46
129 0.41
130 0.34
131 0.31
132 0.29
133 0.22
134 0.18
135 0.16
136 0.14
137 0.17
138 0.19
139 0.18
140 0.17
141 0.18
142 0.17
143 0.15
144 0.15
145 0.16
146 0.15
147 0.16
148 0.15
149 0.14
150 0.17
151 0.17
152 0.16
153 0.12
154 0.13
155 0.12
156 0.13
157 0.12
158 0.13
159 0.17
160 0.17
161 0.16
162 0.15
163 0.14
164 0.13
165 0.13
166 0.09
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.04
185 0.04
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.07
214 0.08
215 0.1
216 0.14
217 0.15
218 0.16
219 0.16
220 0.16
221 0.17
222 0.18
223 0.16
224 0.14
225 0.12
226 0.12
227 0.11
228 0.1
229 0.08
230 0.07
231 0.06
232 0.05
233 0.05
234 0.04
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.13
245 0.14
246 0.14
247 0.14
248 0.14
249 0.15
250 0.16
251 0.16
252 0.1
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.08
258 0.06
259 0.05
260 0.04
261 0.04
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.07
267 0.06
268 0.06
269 0.07
270 0.06
271 0.08
272 0.09
273 0.08
274 0.09
275 0.11
276 0.12
277 0.12
278 0.12
279 0.12
280 0.12
281 0.12
282 0.11
283 0.09
284 0.09
285 0.08
286 0.07
287 0.06
288 0.05
289 0.09
290 0.1
291 0.11
292 0.12
293 0.18
294 0.23
295 0.27
296 0.28
297 0.28
298 0.29
299 0.31
300 0.3
301 0.25
302 0.22
303 0.19
304 0.18
305 0.16
306 0.15
307 0.14
308 0.13
309 0.13
310 0.12
311 0.11
312 0.12
313 0.14
314 0.15
315 0.16
316 0.15
317 0.14
318 0.15
319 0.15
320 0.12
321 0.09
322 0.07
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.05