Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4V1J279

Protein Details
Accession A0A4V1J279    Localization Confidence High Confidence Score 20.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-50SSTAGRGRGRGRRDRHRARPRKPRQTNDTANDASHydrophilic
65-87TGEQPSRQHRHARGRGRGRGRGABasic
130-160NSNNAQRGRTRPPRARRPPRRPRRMAEPAGDHydrophilic
222-242WRCPGCQQPREEKPRNYRCFCHydrophilic
696-718DTVCTQRCGKRRPDCKHACQAPCHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-40GRGRGRGRRDRHRARPRKPR
73-86HRHARGRGRGRGRG
136-153RGRTRPPRARRPPRRPRR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11.5, cyto 7.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034078  NFX1_fam  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR000967  Znf_NFX1  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR001841  Znf_RING  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01424  R3H  
PF01422  zf-NF-X1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51061  R3H  
PS50016  ZF_PHD_2  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd06008  NF-X1-zinc-finger  
cd02325  R3H  
Amino Acid Sequences MTSDSAPTAPVDTAATSSTAGRGRGRGRRDRHRARPRKPRQTNDTANDASTATTNSNNDNDSSQTGEQPSRQHRHARGRGRGRGRGAATAASLTRHVRVLGEATPDDSGREEGAGHTSAAASDAGNEGGNSNNAQRGRTRPPRARRPPRRPRRMAEPAGDEDLRATLTRTLSIDTHECMICCEVVYRRQATWSCDRCWAVFHLKCVRKWANNLLQQENATAWRCPGCQQPREEKPRNYRCFCGKHVDPEYSREHMPHSCGEPCGHMQRRAADANGSGQMNPDCRHPCSLPCHPGPCPPCAAMAPTTFCHCGKESYQVRCADYRPEGISCGEICDELLGCGKHTCERECHSGLCAPCGEREQQRCYCGRHSREAACGTGSPRDTVEAEHPEHAFTGYYSCGEQCHRWFDCGKHRCESTCHAETAASVACPFSPELVATCPCGKRPLTSLMDGQAARTACTDPIPTCEQACDRPLVCGHACRAPCHTGKCPPCEERVQVPCACHGSQIAMACHEQQQQQGDEQPRCNRVCGKLKECGKHRCNLRCCTYASDPDVHLCQHVCGKRLRCGVHRCEQLCHRGHCYPCLEATFDELSCPCGRTRLDPPIACGVTLPKCPYPCTRASSSCPHPVVPHECHPDDVACPPCVYLMARRCRCGREMVRNVPCYRDPAKITCGQVCGKLLGCGGHRCKQVCHSGPCDTVCTQRCGKRRPDCKHACQAPCHAPSICPVERVACEESIVVSCECGRLTETRKCAANGTSPVVMPLACDDECARLIRNRKLAEALQIEQFRRPVQESTHSYEDDLVAFSQNHIAFIRKLEIDLATYLDSKSSSPLYLPTMKADQRRAVHMLCQHYSMETTSIDPEPKRSVVVRRTRLSLAPTPLLSQVAGGHFPNPSVGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.12
4 0.12
5 0.16
6 0.17
7 0.2
8 0.22
9 0.27
10 0.35
11 0.42
12 0.51
13 0.56
14 0.63
15 0.71
16 0.79
17 0.84
18 0.86
19 0.9
20 0.92
21 0.93
22 0.94
23 0.95
24 0.95
25 0.95
26 0.94
27 0.92
28 0.92
29 0.91
30 0.86
31 0.83
32 0.73
33 0.63
34 0.54
35 0.45
36 0.34
37 0.25
38 0.21
39 0.14
40 0.16
41 0.17
42 0.19
43 0.22
44 0.23
45 0.23
46 0.23
47 0.24
48 0.22
49 0.25
50 0.23
51 0.24
52 0.27
53 0.29
54 0.3
55 0.37
56 0.45
57 0.46
58 0.51
59 0.56
60 0.61
61 0.7
62 0.76
63 0.78
64 0.78
65 0.82
66 0.86
67 0.86
68 0.84
69 0.78
70 0.76
71 0.68
72 0.62
73 0.53
74 0.45
75 0.37
76 0.32
77 0.27
78 0.2
79 0.21
80 0.18
81 0.18
82 0.17
83 0.17
84 0.15
85 0.16
86 0.18
87 0.18
88 0.22
89 0.2
90 0.2
91 0.21
92 0.2
93 0.19
94 0.18
95 0.16
96 0.11
97 0.11
98 0.1
99 0.1
100 0.13
101 0.13
102 0.12
103 0.11
104 0.1
105 0.1
106 0.11
107 0.1
108 0.07
109 0.06
110 0.07
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.07
115 0.09
116 0.1
117 0.1
118 0.11
119 0.15
120 0.16
121 0.18
122 0.22
123 0.27
124 0.36
125 0.46
126 0.55
127 0.59
128 0.69
129 0.79
130 0.86
131 0.91
132 0.92
133 0.93
134 0.94
135 0.95
136 0.96
137 0.94
138 0.89
139 0.88
140 0.88
141 0.84
142 0.79
143 0.74
144 0.67
145 0.63
146 0.56
147 0.45
148 0.34
149 0.28
150 0.22
151 0.15
152 0.13
153 0.11
154 0.12
155 0.14
156 0.14
157 0.16
158 0.16
159 0.19
160 0.2
161 0.18
162 0.2
163 0.19
164 0.18
165 0.17
166 0.18
167 0.14
168 0.12
169 0.14
170 0.14
171 0.19
172 0.24
173 0.25
174 0.24
175 0.31
176 0.34
177 0.37
178 0.44
179 0.45
180 0.42
181 0.46
182 0.47
183 0.41
184 0.4
185 0.4
186 0.39
187 0.36
188 0.4
189 0.43
190 0.47
191 0.48
192 0.55
193 0.57
194 0.52
195 0.55
196 0.59
197 0.58
198 0.59
199 0.63
200 0.57
201 0.53
202 0.48
203 0.43
204 0.34
205 0.28
206 0.23
207 0.18
208 0.17
209 0.16
210 0.16
211 0.18
212 0.27
213 0.32
214 0.36
215 0.42
216 0.51
217 0.59
218 0.68
219 0.75
220 0.74
221 0.77
222 0.82
223 0.85
224 0.79
225 0.74
226 0.73
227 0.7
228 0.65
229 0.63
230 0.55
231 0.55
232 0.55
233 0.56
234 0.49
235 0.48
236 0.48
237 0.43
238 0.4
239 0.31
240 0.3
241 0.26
242 0.27
243 0.25
244 0.24
245 0.23
246 0.23
247 0.23
248 0.23
249 0.24
250 0.31
251 0.33
252 0.33
253 0.34
254 0.36
255 0.4
256 0.39
257 0.36
258 0.28
259 0.24
260 0.22
261 0.23
262 0.2
263 0.15
264 0.15
265 0.16
266 0.18
267 0.17
268 0.21
269 0.21
270 0.22
271 0.27
272 0.26
273 0.3
274 0.35
275 0.42
276 0.43
277 0.44
278 0.47
279 0.44
280 0.5
281 0.47
282 0.42
283 0.36
284 0.3
285 0.27
286 0.23
287 0.24
288 0.19
289 0.19
290 0.19
291 0.17
292 0.2
293 0.2
294 0.2
295 0.2
296 0.19
297 0.2
298 0.18
299 0.28
300 0.32
301 0.34
302 0.41
303 0.41
304 0.42
305 0.41
306 0.4
307 0.35
308 0.31
309 0.29
310 0.25
311 0.22
312 0.22
313 0.2
314 0.2
315 0.15
316 0.14
317 0.11
318 0.09
319 0.09
320 0.08
321 0.07
322 0.06
323 0.08
324 0.07
325 0.07
326 0.08
327 0.09
328 0.13
329 0.15
330 0.17
331 0.19
332 0.23
333 0.29
334 0.3
335 0.3
336 0.28
337 0.3
338 0.28
339 0.26
340 0.22
341 0.16
342 0.16
343 0.17
344 0.18
345 0.21
346 0.26
347 0.31
348 0.33
349 0.36
350 0.39
351 0.4
352 0.45
353 0.48
354 0.47
355 0.47
356 0.49
357 0.47
358 0.49
359 0.47
360 0.39
361 0.32
362 0.29
363 0.23
364 0.22
365 0.2
366 0.15
367 0.13
368 0.14
369 0.13
370 0.13
371 0.16
372 0.17
373 0.17
374 0.19
375 0.19
376 0.18
377 0.17
378 0.16
379 0.12
380 0.08
381 0.08
382 0.06
383 0.06
384 0.07
385 0.07
386 0.08
387 0.09
388 0.12
389 0.13
390 0.2
391 0.2
392 0.22
393 0.24
394 0.27
395 0.36
396 0.4
397 0.42
398 0.38
399 0.39
400 0.38
401 0.39
402 0.4
403 0.37
404 0.33
405 0.3
406 0.26
407 0.25
408 0.24
409 0.22
410 0.17
411 0.09
412 0.06
413 0.06
414 0.05
415 0.06
416 0.06
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.06
421 0.08
422 0.08
423 0.09
424 0.13
425 0.13
426 0.13
427 0.17
428 0.16
429 0.15
430 0.18
431 0.24
432 0.23
433 0.25
434 0.25
435 0.23
436 0.27
437 0.25
438 0.22
439 0.17
440 0.15
441 0.13
442 0.13
443 0.12
444 0.08
445 0.09
446 0.11
447 0.08
448 0.12
449 0.14
450 0.14
451 0.13
452 0.14
453 0.15
454 0.16
455 0.17
456 0.15
457 0.13
458 0.13
459 0.14
460 0.16
461 0.15
462 0.15
463 0.15
464 0.18
465 0.18
466 0.18
467 0.21
468 0.22
469 0.25
470 0.27
471 0.3
472 0.33
473 0.37
474 0.41
475 0.42
476 0.4
477 0.41
478 0.41
479 0.4
480 0.39
481 0.38
482 0.38
483 0.34
484 0.33
485 0.31
486 0.3
487 0.27
488 0.2
489 0.17
490 0.13
491 0.14
492 0.15
493 0.14
494 0.12
495 0.12
496 0.12
497 0.15
498 0.16
499 0.15
500 0.15
501 0.18
502 0.17
503 0.18
504 0.23
505 0.26
506 0.26
507 0.3
508 0.33
509 0.36
510 0.36
511 0.37
512 0.35
513 0.36
514 0.43
515 0.46
516 0.45
517 0.47
518 0.52
519 0.57
520 0.61
521 0.64
522 0.58
523 0.57
524 0.61
525 0.63
526 0.64
527 0.64
528 0.62
529 0.55
530 0.54
531 0.54
532 0.5
533 0.45
534 0.4
535 0.36
536 0.3
537 0.28
538 0.27
539 0.21
540 0.18
541 0.14
542 0.12
543 0.16
544 0.17
545 0.19
546 0.24
547 0.27
548 0.33
549 0.38
550 0.41
551 0.43
552 0.48
553 0.52
554 0.55
555 0.59
556 0.54
557 0.53
558 0.53
559 0.54
560 0.51
561 0.48
562 0.44
563 0.42
564 0.41
565 0.42
566 0.4
567 0.33
568 0.29
569 0.27
570 0.23
571 0.18
572 0.21
573 0.18
574 0.15
575 0.15
576 0.13
577 0.15
578 0.14
579 0.15
580 0.11
581 0.14
582 0.14
583 0.19
584 0.25
585 0.31
586 0.38
587 0.37
588 0.4
589 0.44
590 0.43
591 0.38
592 0.32
593 0.27
594 0.24
595 0.26
596 0.26
597 0.21
598 0.23
599 0.26
600 0.3
601 0.31
602 0.33
603 0.35
604 0.38
605 0.39
606 0.43
607 0.49
608 0.5
609 0.52
610 0.49
611 0.44
612 0.4
613 0.41
614 0.43
615 0.4
616 0.42
617 0.4
618 0.39
619 0.39
620 0.39
621 0.34
622 0.28
623 0.29
624 0.24
625 0.18
626 0.18
627 0.17
628 0.16
629 0.16
630 0.16
631 0.18
632 0.23
633 0.33
634 0.36
635 0.4
636 0.44
637 0.46
638 0.46
639 0.49
640 0.49
641 0.49
642 0.56
643 0.62
644 0.67
645 0.7
646 0.68
647 0.63
648 0.56
649 0.51
650 0.44
651 0.4
652 0.36
653 0.34
654 0.38
655 0.39
656 0.41
657 0.37
658 0.38
659 0.34
660 0.33
661 0.3
662 0.27
663 0.22
664 0.2
665 0.17
666 0.16
667 0.18
668 0.23
669 0.27
670 0.32
671 0.36
672 0.36
673 0.38
674 0.41
675 0.48
676 0.48
677 0.49
678 0.47
679 0.48
680 0.5
681 0.49
682 0.47
683 0.39
684 0.39
685 0.36
686 0.36
687 0.37
688 0.41
689 0.47
690 0.51
691 0.59
692 0.62
693 0.69
694 0.72
695 0.77
696 0.8
697 0.81
698 0.84
699 0.83
700 0.79
701 0.73
702 0.73
703 0.71
704 0.63
705 0.58
706 0.48
707 0.39
708 0.38
709 0.41
710 0.34
711 0.27
712 0.25
713 0.25
714 0.25
715 0.29
716 0.27
717 0.19
718 0.18
719 0.17
720 0.18
721 0.16
722 0.17
723 0.12
724 0.1
725 0.1
726 0.1
727 0.1
728 0.1
729 0.11
730 0.15
731 0.21
732 0.28
733 0.32
734 0.36
735 0.39
736 0.4
737 0.41
738 0.38
739 0.39
740 0.36
741 0.36
742 0.33
743 0.3
744 0.3
745 0.27
746 0.23
747 0.16
748 0.13
749 0.13
750 0.11
751 0.12
752 0.12
753 0.15
754 0.17
755 0.18
756 0.19
757 0.2
758 0.28
759 0.35
760 0.42
761 0.41
762 0.42
763 0.46
764 0.45
765 0.47
766 0.45
767 0.4
768 0.39
769 0.42
770 0.4
771 0.38
772 0.38
773 0.32
774 0.3
775 0.31
776 0.27
777 0.27
778 0.36
779 0.39
780 0.44
781 0.48
782 0.45
783 0.42
784 0.4
785 0.36
786 0.27
787 0.23
788 0.16
789 0.13
790 0.13
791 0.13
792 0.18
793 0.17
794 0.18
795 0.17
796 0.2
797 0.18
798 0.21
799 0.25
800 0.19
801 0.2
802 0.2
803 0.2
804 0.19
805 0.18
806 0.17
807 0.14
808 0.15
809 0.14
810 0.14
811 0.14
812 0.12
813 0.14
814 0.14
815 0.13
816 0.14
817 0.17
818 0.22
819 0.27
820 0.28
821 0.29
822 0.35
823 0.4
824 0.46
825 0.49
826 0.51
827 0.48
828 0.53
829 0.53
830 0.47
831 0.48
832 0.47
833 0.48
834 0.42
835 0.41
836 0.36
837 0.32
838 0.32
839 0.27
840 0.23
841 0.16
842 0.16
843 0.18
844 0.2
845 0.24
846 0.24
847 0.27
848 0.3
849 0.3
850 0.32
851 0.34
852 0.4
853 0.45
854 0.55
855 0.59
856 0.59
857 0.63
858 0.63
859 0.62
860 0.6
861 0.57
862 0.53
863 0.49
864 0.45
865 0.42
866 0.4
867 0.37
868 0.3
869 0.23
870 0.2
871 0.18
872 0.19
873 0.18
874 0.18
875 0.17
876 0.17
877 0.22