Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P9YRE1

Protein Details
Accession A0A4P9YRE1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
101-128EKKTEYSKAKYLKRKRQKFSKVFTPIRPHydrophilic
243-266LTEWQRKSMDRRRIRRERISEARDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
113-116KRKR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13, nucl 12.5, cyto 12.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MFSPAHSTISLGKFGSFQADDIIGKPFGLSYEVVGKRELRVIHEMQHQDDAAYDSDANNKDIVQDGSSQQLSYTEIEKMKRDGLEGKIDAEASQRNNQSFEKKTEYSKAKYLKRKRQKFSKVFTPIRPTLHAVCDHFFTKTPSKIMQIRLDTLSQLLTFGNVFAGTRMLVVDEAQGMLVSAVLDRMGGHGQMLAIHHGDNHNFDVMRYLNFPRHYTEPLRTISWEQIYATGEEKDEEEEGDALTEWQRKSMDRRRIRRERISEARDMLAAGNFDGLLVATQMCPISVLDRLLPHVAGSRPVVFYGPCKELLVDLTAHMRRSPDCLNVQLTESWLREHQVLSGRTHPLMNMSSGGGFLVAATKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.26
3 0.19
4 0.17
5 0.16
6 0.18
7 0.18
8 0.18
9 0.21
10 0.15
11 0.15
12 0.14
13 0.12
14 0.11
15 0.12
16 0.11
17 0.1
18 0.2
19 0.22
20 0.23
21 0.25
22 0.26
23 0.25
24 0.3
25 0.29
26 0.24
27 0.28
28 0.29
29 0.34
30 0.41
31 0.42
32 0.39
33 0.41
34 0.36
35 0.29
36 0.28
37 0.24
38 0.17
39 0.16
40 0.14
41 0.11
42 0.18
43 0.2
44 0.19
45 0.18
46 0.16
47 0.16
48 0.18
49 0.19
50 0.14
51 0.15
52 0.15
53 0.19
54 0.2
55 0.19
56 0.16
57 0.16
58 0.16
59 0.15
60 0.16
61 0.16
62 0.19
63 0.22
64 0.24
65 0.25
66 0.27
67 0.26
68 0.27
69 0.27
70 0.27
71 0.32
72 0.31
73 0.3
74 0.27
75 0.26
76 0.24
77 0.21
78 0.21
79 0.17
80 0.23
81 0.25
82 0.25
83 0.28
84 0.3
85 0.35
86 0.36
87 0.37
88 0.39
89 0.38
90 0.4
91 0.46
92 0.5
93 0.47
94 0.51
95 0.54
96 0.56
97 0.64
98 0.71
99 0.73
100 0.78
101 0.84
102 0.86
103 0.88
104 0.9
105 0.89
106 0.86
107 0.85
108 0.85
109 0.8
110 0.77
111 0.74
112 0.67
113 0.6
114 0.55
115 0.48
116 0.4
117 0.37
118 0.34
119 0.28
120 0.25
121 0.25
122 0.23
123 0.2
124 0.19
125 0.2
126 0.22
127 0.23
128 0.24
129 0.23
130 0.28
131 0.32
132 0.36
133 0.38
134 0.34
135 0.34
136 0.33
137 0.32
138 0.27
139 0.23
140 0.18
141 0.11
142 0.1
143 0.07
144 0.06
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.02
168 0.02
169 0.02
170 0.03
171 0.03
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.09
187 0.09
188 0.1
189 0.09
190 0.09
191 0.11
192 0.11
193 0.11
194 0.12
195 0.13
196 0.17
197 0.19
198 0.2
199 0.2
200 0.23
201 0.26
202 0.27
203 0.29
204 0.3
205 0.3
206 0.3
207 0.28
208 0.27
209 0.26
210 0.24
211 0.21
212 0.17
213 0.17
214 0.17
215 0.16
216 0.16
217 0.13
218 0.11
219 0.11
220 0.11
221 0.1
222 0.09
223 0.08
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.06
230 0.08
231 0.13
232 0.12
233 0.14
234 0.15
235 0.17
236 0.27
237 0.36
238 0.44
239 0.49
240 0.59
241 0.68
242 0.78
243 0.85
244 0.85
245 0.83
246 0.83
247 0.83
248 0.78
249 0.72
250 0.64
251 0.56
252 0.46
253 0.39
254 0.29
255 0.21
256 0.15
257 0.1
258 0.08
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.05
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.09
274 0.1
275 0.11
276 0.12
277 0.14
278 0.15
279 0.15
280 0.14
281 0.16
282 0.16
283 0.17
284 0.19
285 0.19
286 0.18
287 0.19
288 0.19
289 0.16
290 0.19
291 0.22
292 0.22
293 0.21
294 0.21
295 0.21
296 0.2
297 0.21
298 0.2
299 0.15
300 0.13
301 0.19
302 0.21
303 0.21
304 0.22
305 0.22
306 0.21
307 0.26
308 0.29
309 0.28
310 0.3
311 0.34
312 0.36
313 0.35
314 0.37
315 0.32
316 0.32
317 0.3
318 0.27
319 0.25
320 0.23
321 0.23
322 0.22
323 0.22
324 0.24
325 0.27
326 0.29
327 0.31
328 0.36
329 0.37
330 0.37
331 0.37
332 0.33
333 0.29
334 0.28
335 0.25
336 0.21
337 0.18
338 0.17
339 0.16
340 0.16
341 0.11
342 0.09
343 0.07