Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P9YXT1

Protein Details
Accession A0A4P9YXT1    Localization Confidence Low Confidence Score 6.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
61-80GPSVYKKEIRKSQRERAHIDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 7.5, cyto_mito 7.5, cyto 6.5, pero 6, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041070  JHD  
IPR003347  JmjC_dom  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0140680  F:histone H3K36me/H3K36me2 demethylase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF17811  JHD  
PF02373  JmjC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51184  JMJC  
PS01359  ZF_PHD_1  
Amino Acid Sequences NEPCPRCAGRDASIWTGSMLETWLACDICDTWFHAACVGLRAQECDQIEEFHCPDCAATHGPSVYKKEIRKSQRERAHIDYRDLVNADVMLPRDRLATLASFAFAPDNFPRVAGEDATVDWARASGLETPVVFTGPTMLGMRMPPATLTVSDIARLVGKHAPMCLLCRLDVTSQADVTGWTLANWEAYFMASGRRTRTLNVISLEVSHTRLAEQIERPQLVRELDWVSLAWPEERRRRNDYPQVQLYCLMSVKDCYTDFHIDFGGSSVFYHILSGQKTFYFIPPTPTNLKKYEKWCKSPEQASTFLAEIARPCYKVDLVAGDTMIIPTGWIHAVYTPADAIVIGGNFLHGLHMGRQLDIYALEKRTAVPQSFRFPYFEQLCWYAAMRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.34
3 0.29
4 0.25
5 0.18
6 0.14
7 0.09
8 0.08
9 0.09
10 0.11
11 0.11
12 0.1
13 0.11
14 0.11
15 0.11
16 0.13
17 0.14
18 0.16
19 0.18
20 0.18
21 0.18
22 0.19
23 0.19
24 0.21
25 0.19
26 0.18
27 0.17
28 0.21
29 0.21
30 0.24
31 0.24
32 0.25
33 0.25
34 0.24
35 0.25
36 0.27
37 0.27
38 0.23
39 0.22
40 0.18
41 0.18
42 0.15
43 0.17
44 0.15
45 0.15
46 0.17
47 0.18
48 0.21
49 0.25
50 0.3
51 0.34
52 0.37
53 0.4
54 0.47
55 0.55
56 0.62
57 0.69
58 0.72
59 0.76
60 0.78
61 0.8
62 0.78
63 0.77
64 0.77
65 0.69
66 0.64
67 0.6
68 0.53
69 0.48
70 0.42
71 0.34
72 0.24
73 0.21
74 0.17
75 0.13
76 0.13
77 0.12
78 0.11
79 0.12
80 0.12
81 0.12
82 0.12
83 0.11
84 0.11
85 0.11
86 0.11
87 0.11
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.09
92 0.12
93 0.11
94 0.13
95 0.13
96 0.13
97 0.13
98 0.14
99 0.16
100 0.12
101 0.11
102 0.1
103 0.1
104 0.14
105 0.13
106 0.11
107 0.1
108 0.09
109 0.08
110 0.08
111 0.09
112 0.08
113 0.09
114 0.1
115 0.1
116 0.11
117 0.12
118 0.12
119 0.1
120 0.07
121 0.08
122 0.06
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.09
128 0.1
129 0.09
130 0.08
131 0.07
132 0.08
133 0.09
134 0.08
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.11
140 0.09
141 0.1
142 0.09
143 0.1
144 0.1
145 0.11
146 0.12
147 0.12
148 0.13
149 0.12
150 0.15
151 0.15
152 0.14
153 0.13
154 0.13
155 0.14
156 0.13
157 0.17
158 0.18
159 0.15
160 0.14
161 0.14
162 0.14
163 0.12
164 0.12
165 0.09
166 0.06
167 0.05
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.08
178 0.09
179 0.11
180 0.13
181 0.16
182 0.16
183 0.17
184 0.22
185 0.22
186 0.23
187 0.23
188 0.22
189 0.19
190 0.19
191 0.19
192 0.15
193 0.14
194 0.1
195 0.09
196 0.08
197 0.1
198 0.11
199 0.13
200 0.14
201 0.18
202 0.21
203 0.22
204 0.22
205 0.21
206 0.23
207 0.2
208 0.18
209 0.15
210 0.13
211 0.13
212 0.13
213 0.12
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.1
218 0.12
219 0.17
220 0.26
221 0.32
222 0.37
223 0.44
224 0.5
225 0.57
226 0.64
227 0.65
228 0.65
229 0.68
230 0.64
231 0.57
232 0.52
233 0.44
234 0.35
235 0.28
236 0.2
237 0.12
238 0.11
239 0.11
240 0.12
241 0.12
242 0.12
243 0.16
244 0.2
245 0.2
246 0.2
247 0.19
248 0.17
249 0.16
250 0.16
251 0.11
252 0.07
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.1
260 0.11
261 0.12
262 0.12
263 0.12
264 0.14
265 0.15
266 0.16
267 0.19
268 0.19
269 0.25
270 0.26
271 0.31
272 0.36
273 0.39
274 0.41
275 0.42
276 0.47
277 0.46
278 0.54
279 0.61
280 0.63
281 0.66
282 0.67
283 0.69
284 0.72
285 0.72
286 0.7
287 0.64
288 0.59
289 0.53
290 0.48
291 0.4
292 0.33
293 0.27
294 0.19
295 0.15
296 0.17
297 0.18
298 0.16
299 0.16
300 0.18
301 0.18
302 0.18
303 0.19
304 0.18
305 0.17
306 0.17
307 0.17
308 0.15
309 0.14
310 0.13
311 0.12
312 0.07
313 0.06
314 0.04
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.07
319 0.07
320 0.1
321 0.1
322 0.11
323 0.1
324 0.09
325 0.09
326 0.08
327 0.08
328 0.07
329 0.07
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.05
337 0.07
338 0.09
339 0.16
340 0.17
341 0.17
342 0.18
343 0.17
344 0.18
345 0.17
346 0.18
347 0.17
348 0.18
349 0.19
350 0.19
351 0.2
352 0.25
353 0.31
354 0.31
355 0.33
356 0.37
357 0.45
358 0.5
359 0.5
360 0.49
361 0.44
362 0.5
363 0.48
364 0.44
365 0.4
366 0.38
367 0.37
368 0.34