Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P9Z0C3

Protein Details
Accession A0A4P9Z0C3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-50PAAPKDKKQAAKDKKATKAAAHydrophilic
211-239FFVGKAQSTTQKQKKKKQTKVVVEIEQRFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
33-110PKDKKQAAKDKKATKAAAATPAAKPAASVEKSRAKPAARPAAEGRNYEAESREANRARRGGAAPRRGARGARGGGRGR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto 11, mito_nucl 8, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MASVASSNPFAFLNDDDEGNNIVPSTAVAPAAPKDKKQAAKDKKATKAAAATPAAKPAASVEKSRAKPAARPAAEGRNYEAESREANRARRGGAAPRRGARGARGGGRGREFDRHSATGLTDSNKKIEQGWGHTGADYSEADKAAAKNTEEVIEEVPAEEQEPATKTLDEYLSERTEKLKLAGIDVPEARKVETVEQWKNTRVLKPEEDHFFVGKAQSTTQKQKKKKQTKVVVEIEQRFVEENSFGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.16
4 0.17
5 0.18
6 0.16
7 0.15
8 0.1
9 0.09
10 0.08
11 0.08
12 0.08
13 0.07
14 0.07
15 0.07
16 0.09
17 0.12
18 0.2
19 0.22
20 0.22
21 0.28
22 0.36
23 0.44
24 0.51
25 0.59
26 0.61
27 0.7
28 0.78
29 0.8
30 0.81
31 0.81
32 0.74
33 0.66
34 0.62
35 0.54
36 0.52
37 0.46
38 0.4
39 0.33
40 0.35
41 0.31
42 0.25
43 0.21
44 0.17
45 0.22
46 0.21
47 0.22
48 0.25
49 0.34
50 0.35
51 0.39
52 0.42
53 0.35
54 0.38
55 0.45
56 0.5
57 0.41
58 0.44
59 0.45
60 0.49
61 0.51
62 0.47
63 0.4
64 0.35
65 0.35
66 0.32
67 0.29
68 0.21
69 0.2
70 0.21
71 0.26
72 0.25
73 0.27
74 0.31
75 0.31
76 0.3
77 0.31
78 0.31
79 0.33
80 0.37
81 0.41
82 0.41
83 0.43
84 0.44
85 0.42
86 0.4
87 0.33
88 0.32
89 0.27
90 0.26
91 0.29
92 0.29
93 0.3
94 0.31
95 0.31
96 0.26
97 0.29
98 0.27
99 0.25
100 0.27
101 0.25
102 0.24
103 0.22
104 0.21
105 0.17
106 0.17
107 0.15
108 0.16
109 0.15
110 0.16
111 0.16
112 0.16
113 0.15
114 0.17
115 0.17
116 0.17
117 0.2
118 0.22
119 0.22
120 0.21
121 0.21
122 0.17
123 0.17
124 0.12
125 0.09
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.09
130 0.09
131 0.1
132 0.11
133 0.11
134 0.11
135 0.12
136 0.13
137 0.12
138 0.13
139 0.11
140 0.1
141 0.09
142 0.08
143 0.08
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.05
148 0.06
149 0.08
150 0.09
151 0.1
152 0.11
153 0.1
154 0.13
155 0.14
156 0.14
157 0.14
158 0.16
159 0.18
160 0.19
161 0.19
162 0.18
163 0.19
164 0.18
165 0.18
166 0.19
167 0.16
168 0.18
169 0.21
170 0.2
171 0.22
172 0.23
173 0.23
174 0.2
175 0.2
176 0.18
177 0.17
178 0.17
179 0.17
180 0.22
181 0.29
182 0.33
183 0.39
184 0.42
185 0.43
186 0.47
187 0.47
188 0.45
189 0.43
190 0.43
191 0.44
192 0.45
193 0.48
194 0.5
195 0.5
196 0.47
197 0.42
198 0.36
199 0.3
200 0.28
201 0.25
202 0.2
203 0.19
204 0.25
205 0.31
206 0.41
207 0.5
208 0.58
209 0.64
210 0.74
211 0.82
212 0.86
213 0.89
214 0.89
215 0.91
216 0.92
217 0.92
218 0.9
219 0.88
220 0.86
221 0.79
222 0.73
223 0.62
224 0.52
225 0.43
226 0.35
227 0.28