Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4P9Z3Y6

Protein Details
Accession A0A4P9Z3Y6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
267-286DYGLCYRRKKGSRRFYPTRLHydrophilic
449-471HVQVRAYVQRRKNKSQPTAHGASHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 6, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040662  Tfb2_C  
IPR004598  TFIIH_p52/Tfb2  
Gene Ontology GO:0000439  C:transcription factor TFIIH core complex  
GO:0001671  F:ATPase activator activity  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF03849  Tfb2  
PF18307  Tfb2_C  
Amino Acid Sequences MPTANDEQSHFRTAIDEYLETLPAQTCQRLYQSPASCLAVFRLLPDLAKQLVMSLLYVPTDVSMADMAARCFQECASQFNEGLQKLLRLHIIEQIGDATAAKLRMNAVFGRELRNALTGGGEHGAFGVPCDVLDKHPVDEAFLDQHATQQWEAILHFMIGTAVTKRPGRAALNLLRRSGLMASSATGDADSVSMAITNKGFQFLLQDVNTQMWAFLLQYLDMVQDLGMDLVEVLNFLFQLGTLELGKDYSVEPLTETQRRMLDDLQDYGLCYRRKKGSRRFYPTRLAITLASGNSASLDSEQNENGYIILETNYRVYAYTDSPLQIAVLSLFCTMRSRFQNMVCGAITRESIRSALANGITSDQIVTYLTTHAHPLMRQKIPVLPLTVIDQIRLWEMEKNRLQTTQGFLYQQFARQQDFDTVLQYAQELGVVVWYHPAKRMLVVTDDGHVQVRAYVQRRKNKSQPTAHGAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.24
3 0.2
4 0.2
5 0.21
6 0.22
7 0.2
8 0.2
9 0.17
10 0.16
11 0.18
12 0.18
13 0.18
14 0.2
15 0.25
16 0.27
17 0.32
18 0.38
19 0.41
20 0.41
21 0.43
22 0.44
23 0.39
24 0.36
25 0.33
26 0.28
27 0.23
28 0.21
29 0.22
30 0.19
31 0.19
32 0.2
33 0.21
34 0.17
35 0.18
36 0.16
37 0.13
38 0.14
39 0.13
40 0.12
41 0.1
42 0.1
43 0.09
44 0.1
45 0.09
46 0.08
47 0.08
48 0.07
49 0.06
50 0.06
51 0.05
52 0.08
53 0.09
54 0.1
55 0.13
56 0.14
57 0.14
58 0.14
59 0.14
60 0.19
61 0.19
62 0.22
63 0.22
64 0.24
65 0.24
66 0.27
67 0.33
68 0.25
69 0.26
70 0.22
71 0.22
72 0.21
73 0.23
74 0.21
75 0.17
76 0.18
77 0.22
78 0.22
79 0.19
80 0.18
81 0.17
82 0.15
83 0.13
84 0.12
85 0.07
86 0.08
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.1
91 0.11
92 0.14
93 0.14
94 0.15
95 0.2
96 0.21
97 0.25
98 0.25
99 0.25
100 0.24
101 0.24
102 0.21
103 0.16
104 0.15
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.09
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.06
113 0.07
114 0.06
115 0.05
116 0.05
117 0.07
118 0.08
119 0.09
120 0.14
121 0.15
122 0.15
123 0.17
124 0.17
125 0.16
126 0.16
127 0.16
128 0.13
129 0.12
130 0.13
131 0.1
132 0.12
133 0.13
134 0.14
135 0.13
136 0.12
137 0.12
138 0.11
139 0.12
140 0.1
141 0.09
142 0.07
143 0.07
144 0.06
145 0.06
146 0.05
147 0.05
148 0.06
149 0.07
150 0.1
151 0.11
152 0.12
153 0.14
154 0.18
155 0.19
156 0.21
157 0.27
158 0.32
159 0.41
160 0.42
161 0.41
162 0.37
163 0.35
164 0.33
165 0.26
166 0.18
167 0.1
168 0.08
169 0.08
170 0.09
171 0.09
172 0.08
173 0.07
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.04
178 0.03
179 0.03
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.05
184 0.07
185 0.07
186 0.08
187 0.08
188 0.07
189 0.09
190 0.09
191 0.13
192 0.12
193 0.13
194 0.12
195 0.12
196 0.13
197 0.1
198 0.09
199 0.05
200 0.05
201 0.04
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.02
216 0.02
217 0.02
218 0.02
219 0.02
220 0.02
221 0.02
222 0.02
223 0.02
224 0.02
225 0.02
226 0.03
227 0.03
228 0.04
229 0.04
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.07
240 0.1
241 0.14
242 0.17
243 0.18
244 0.18
245 0.2
246 0.21
247 0.22
248 0.2
249 0.21
250 0.19
251 0.19
252 0.18
253 0.16
254 0.15
255 0.15
256 0.2
257 0.17
258 0.17
259 0.21
260 0.28
261 0.36
262 0.45
263 0.55
264 0.6
265 0.68
266 0.77
267 0.81
268 0.78
269 0.79
270 0.73
271 0.67
272 0.57
273 0.48
274 0.38
275 0.32
276 0.28
277 0.19
278 0.16
279 0.11
280 0.1
281 0.09
282 0.09
283 0.07
284 0.06
285 0.07
286 0.08
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.09
293 0.08
294 0.07
295 0.06
296 0.06
297 0.07
298 0.07
299 0.08
300 0.08
301 0.07
302 0.08
303 0.09
304 0.1
305 0.11
306 0.12
307 0.13
308 0.13
309 0.13
310 0.13
311 0.12
312 0.09
313 0.08
314 0.07
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.1
321 0.11
322 0.17
323 0.2
324 0.25
325 0.28
326 0.3
327 0.38
328 0.35
329 0.38
330 0.31
331 0.28
332 0.24
333 0.22
334 0.21
335 0.14
336 0.15
337 0.12
338 0.12
339 0.12
340 0.12
341 0.11
342 0.13
343 0.13
344 0.12
345 0.12
346 0.13
347 0.12
348 0.12
349 0.11
350 0.08
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.06
355 0.07
356 0.08
357 0.09
358 0.1
359 0.12
360 0.14
361 0.15
362 0.23
363 0.3
364 0.32
365 0.33
366 0.34
367 0.36
368 0.37
369 0.38
370 0.33
371 0.25
372 0.23
373 0.25
374 0.29
375 0.24
376 0.22
377 0.19
378 0.17
379 0.18
380 0.18
381 0.16
382 0.16
383 0.18
384 0.27
385 0.32
386 0.36
387 0.36
388 0.37
389 0.38
390 0.36
391 0.39
392 0.35
393 0.34
394 0.32
395 0.3
396 0.33
397 0.32
398 0.34
399 0.34
400 0.31
401 0.3
402 0.29
403 0.3
404 0.3
405 0.32
406 0.28
407 0.24
408 0.23
409 0.2
410 0.19
411 0.17
412 0.14
413 0.09
414 0.09
415 0.07
416 0.06
417 0.08
418 0.09
419 0.09
420 0.14
421 0.16
422 0.16
423 0.2
424 0.23
425 0.21
426 0.24
427 0.27
428 0.24
429 0.26
430 0.29
431 0.26
432 0.25
433 0.26
434 0.24
435 0.22
436 0.19
437 0.16
438 0.14
439 0.17
440 0.23
441 0.28
442 0.37
443 0.44
444 0.54
445 0.63
446 0.71
447 0.76
448 0.79
449 0.83
450 0.84
451 0.85